演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CACNG5

calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5

CACNG5 編碼一種電壓依賴性鈣通道輔助次單元,並可調節 AMPA 型麩胺酸受體的閘控特性。

Homo sapiens17q24.2UniProt Q9UF02
OFFICIAL SYMBOL
CACNG5
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9UF02
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CACNG5 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5。其產物屬於 PMP-22/EMP/MP20 家族的 CACNG 子家族,具有膜蛋白特性,並參與 AMPA 型麩胺酸受體的調節。來源資料描述了其對不同受體次單元的調節特異性;具體閘控變化見功能說明。

Official symbol
CACNG5
Gene name
calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1409
UniProt
Q9UF02
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q24.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCACNG5pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:66,835,117–66,894,751
Gene span
59,635 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000533854 ★66,835,117–66,894,7516
ENST0000067385566,877,269–66,894,7424
ENST0000030713966,877,269–66,885,2785

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CACNG5 可調節 AMPA 型麩胺酸受體(AMPAR)的閘控特性。來源指出,它會加快受體活化、去活化與脫敏的速率;這些變化涵蓋受體由啟動到停止反應,以及對持續刺激逐漸降低反應的過程。此處描述的是對受體閘控動態的調節,而非受體本身的組成變化。

這種調節具有次單元特異性:資料指出 CACNG5 對含 GRIA1、GRIA4,以及 GRIA2 長型異構型的 AMPAR 有特異性。因而,來源支持的調節範圍並非所有 AMPAR 次單元都相同;但沒有提供各種受體組成下調節幅度或比較結果。

此外,資料以「By similarity」標示一項推定:CACNG5 被認為可能使鈣通道穩定於失活(關閉)狀態。這項描述屬相似性推論,並未在來源中列出實驗系統或直接證據細節,因此不宜視為已確立的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 66835117 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CACNG5 ENST00000533854 GRCh38 chr17:66834117-66835217 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTCTTGGTCTGCAGGGATTTTACAGGCCTTTGAGGGGAAGCTGCTGGTCTGTGAGCATCTGCACAAGTG
TGCCGGACAAAGATATCGGTCAGGCTGCCATTTCAAAGCAATAAAAGATATGTGGCTATGCAGGCCAGGA
AGAGTTAGCCCTTGGGTTCCCCTTCCAACCTGGCTGACCACACTGGCTCCAGCTGCCACTTTCAAATTAG
TCATAGATTAACAAACATCTATTGAGCACCTATTGGGTGTCCAGGACCCAGAGACTAAAGGAGACATAGA
ACCTAAGAAAGGAAGAAATGTTTTATTGTTAGTTGCCACCATTTATTGGACATATATTACCATTTTACTG
TTAAGAGGGACAAACACTTTGCTTAAGGCCACACAGTACAAAAGCAGAGTGGGGCTTTAAAGGCTCAGAT
TCTGCACTTAGACAGGCCTGAGCTGCAGTCCTGGCTCTGCCATTTTCCAGCTGTGTGTCCTCAGACTCCT
CACTTAAGCGCCCTGTGCCTCAGTCTTCTCATCTGTAAAATGGGATTCGTGTGAGAATTAAATGACTTAA
TACATGTGAAGCTCATTGAACGCTTACACTAGTAAGTGCTCAATAAATACTAGCTGGCATTGTTGTTCTA
TCACCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCCTTATTTAAAAGCAGCAGCAACGGCAGAGGCTGCA
GCCCCAGCTGCTGGAATTTGAAGGTGAGTCTGACTCCAGGCAGGGTCTCCCAGCCCTATGCGGACTCTGA
AAGCCTCTCCTCTCCCACGCCGGCCCCCAACTCTTCACCTGCCACCCCCACAAGGGTGCTCACCCCAGAG
GTGCTCACCTCCCGGGCTGGGAGACCGCATCTGACCGGTCCCAAACCCCGCCTGCAGCTGGCAGCGCCGG
GGTGGGGAGGCCCCGCCCTCGGCCCCGCCCCCTGCCCGCCCCTCCCTCTCGGGGTCCGGGGCGCGAGCTG
CGGCGGCGGCGGCCACGGTCATTGGCGCCGAGCGGTTCCGGCTGACTGGACGGGGCGGGCGTCCCGGGCA
GCCTAGCGCGGTACCTCCCGCCCCGCGCGCCCAGCCGGCGAGGGACATTGG
CACNG5 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CACNG5_1 ↗17:66,877,297正股66,877,248–66,877,307

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BH94M · enhancer · 66829366–66830212 · regulatory

ENSR17_83Z3HN · promoter · 66834939–66835127 · regulatory

· motif · 66838167–66838178 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:275 aa

1 aa275 aa跨膜區
依 Q9UF02 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CACNG5 蛋白長 275 個胺基酸,屬於 PMP-22/EMP/MP20 家族的 CACNG 子家族。序列註解預測有四段螺旋型跨膜區,分別位於第 8–28、103–123、129–149 與 176–196 個胺基酸位置。

跨膜區Helical8–28 aa
跨膜區Helical103–123 aa
跨膜區Helical129–149 aa
跨膜區Helical176–196 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UF02…

AlphaFold · Q9UF02

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Postsynaptic density membrane

CACNG5 被註記為多次跨膜蛋白,定位於膜及突觸後密度膜。 來源未描述定位隨條件改變的情形,也未提供異構型間的定位差異。

未繪示構造:Membrane;Postsynaptic density membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CACNG5CACNG5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CACNG5 作為 AMPA 型麩胺酸受體(AMPAR)的輔助次單元,並被記載與 GRIA1、GRIA2、GRIA3、GRIA4、CNIH2、CNIH3、CACNG2、CACNG3、CACNG4、CACNG7 及 CACNG8 同處複合體。另有相似性證據指出 CACNG5 與 GRIA1、GRIA2、GRIA3、GRIA4 互作;來源未將此互作細節擴及其餘複合體成員。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CACNG5 可調節 AMPA 型麩胺酸受體的閘控,並加快其活化、去活化與脫敏速率。此調節具有次單元特異性,對 GRIA1、GRIA4 及 GRIA2 長型異構型具有特異性。另依相似性推論,CACNG5 被認為可能使鈣通道穩定於失活的關閉狀態。推論支持
證據與來源

Regulates the gating properties of AMPA-selective glutamate receptors (AMPARs). Modulates their gating properties by accelerating their rates of activation, deactivation and desensitization. Displays subunit-specific AMPA receptor regulation. Shows specificity for GRIA1, GRIA4 and the long isoform of GRIA2. Thought to stabilize the calcium channel in an inactivated (closed) state (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用L 型鈣通道由 alpha-1、alpha-2/delta、beta 與 gamma 次單元構成。CACNG5 是 AMPA 型麩胺酸受體的輔助次單元,並被記載與 GRIA1–4、CNIH2、CNIH3 及 CACNG2–4、CACNG7、CACNG8 同處複合體。另有相似性證據指出它與 GRIA1、GRIA2、GRIA3 及 GRIA4 互作。推論支持
證據與來源

The L-type calcium channel is composed of five subunits: alpha-1, alpha-2/delta, beta and gamma. Acts as an auxiliary subunit for AMPA-selective glutamate receptors (AMPARs). Found in a complex with GRIA1, GRIA2, GRIA3, GRIA4, CNIH2, CNIH3, CACNG2, CACNG3, CACNG4, CACNG7 and CACNG8. Interacts with GRIA1, GRIA2, GRIA3 and GRIA4 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CACNG5 被註記為多次跨膜蛋白,定位於膜及突觸後密度膜。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein; Postsynaptic density membrane

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000533854 · 10,576 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATTGGCGCCGAGCGGTTCCGGCTGACTGGACGGGGCGGGC40
41GTCCCGGGCAGCCTAGCGCGGTACCTCCCGCCCCGCGCGC80
81CCAGCCGGCGAGGGACATTGGACCAGGGTCGGGGGTCGCG120
121GCCGCTCCAGCGAGAGCCGTGGGTACTGCCACCTGCTCAC160
161CCACTCTCCCTAGCCCCAGAGCGCAGTCCGTGCTGGTGGG200
201AGCGTGGCGACTAGTTGCACAGCAACGGTCCAGGAAGATG240
241AGTGCCTGCGGGAGGAAGGCCCTGACCCTGCTGAGCAGTG280
281TCTTTGCTGTCTGTGGCTTGGGCCTCCTGGGTATCGCGGT320
321CAGCACCGACTACTGGCTGTACCTGGAGGAGGGTGTGATT360
361GTGCCCCAGAACCAGAGCACCGAGATCAAGATGTCCCTGC400
401ACTCAGGCCTCTGGCGGGTCTGCTTCCTTGCAGGTGAGGA440
441GCGGGGGCGTTGCTTCACCATAGAATATGTGATGCCCATG480
481AACACCCAGCTGACATCCGAGTCCACGGTCAATGTTCTAA520
521AGATGATCCGCTCAGCCACACCATTCCCTCTGGTCAGCCT560
561CTTCTTCATGTTCATTGGGTTTATCCTGAACAACATCGGA600
601CACATCCGTCCCCACCGGACGATACTGGCCTTTGTCTCTG640
641GCATCTTCTTTATCCTCTCAGGCCTCTCTCTCGTGGTGGG680
681CCTGGTGCTCTACATCTCCAGCATCAACGATGAGATGCTC720
721AACAGGACCAAGGATGCAGAGACCTACTTCAACTACAAGT760
761ATGGGTGGTCGTTTGCCTTCGCCGCCATCTCCTTCCTTTT800
801AACGGAGAGTGCCGGGGTGATGTCTGTGTACCTGTTTATG840
841AAGCGGTACACCGCGGAGGACATGTACAGGCCCCACCCTG880
881GCTTCTACCGCCCTCGGCTGAGCAACTGCTCCGATTACTC920
921AGGCCAGTTCCTACACCCAGACGCCTGGGTCAGGGGCCGC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。