演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CACNG2stargazin

calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2

CACNG2 編碼 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2,參與 AMPA-selective glutamate receptors 的運輸與通道閘控調節。

Homo sapiens22q12.3UniProt Q9Y698
OFFICIAL SYMBOL
CACNG2
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q9Y698
PDB / ALPHAFOLD
6DLZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CACNG2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2。其產物與 AMPA-selective glutamate receptors(AMPARs)的調控有關,也被描述為鈣通道的輔助次單元。這些資訊指出,CACNG2 蛋白可參與膜受體與離子通道相關的調控;其具體作用方式及功能細節見下方說明。

Official symbol
CACNG2
Gene name
calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1406
UniProt
Q9Y698
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
stargazinMGC138502MGC138504

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q12.3
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegCACNG2pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr22:36,560,857–36,703,779
Gene span
142,923 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000300105 ★36,560,857–36,703,7524
ENST0000113164836,560,857–36,703,7794

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CACNG2 參與 AMPA-selective glutamate receptors(AMPARs)的運輸與閘控調節。它促進 AMPARs 被送往細胞膜及突觸,並調節受體通道開啟與關閉相關的動態,使活化、去活化及脫敏的速率減慢。這些作用涉及受體抵達細胞表面的位置,以及受體對訊號的反應時間特性。

CACNG2 對 AMPARs 的調節沒有顯示次單元特異性;來源指出它調節所有 AMPAR 次單元。因此,所述調節並非限於某一種 AMPAR 次單元。資料將其角色連結至受體運輸及閘控性質,但未進一步提供不同次單元間作用程度的比較。

除了 AMPARs,CACNG2 也被認為可能使鈣通道穩定於失活(關閉)狀態。此項描述帶有推測性,來源未將其表述為已確立的作用。綜合而言,現有功能資料主要指出 CACNG2 與 AMPARs 的膜表面及突觸定位、通道反應速率調節相關,並另有可能影響鈣通道失活狀態的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 36703752 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CACNG2 ENST00000300105 GRCh38 chr22:36703652-36704752 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAGAGGGAGAGAGAAGAAAGTACTGAATAATTGAATTATGGGATTGAAACCTCTCAACTCCCCCTGCCTC
AATAGACTCATCATACTCACATCCTCTCCAGGGTCCCCCCCGCAACACACACACACACAAAATATCAAAA
ACATGAACCCATCTCATGCCTCATGTGCTCTTACTCACTTAACCATAAAAGTGATCAGAGAAAAAAATGT
AATCCGTAGCAGCAGGAATTAATGTGCTTCTTTCTACCAGAGGTCACGTTAAGGAAAAGTTGCACATAAG
AGAAATGAAAGGTGACACTGTAATTAACCCACAAACAATGATTCTTCTGAGAAAGAGGGGAGGGTTTCGG
TGTTCCAGTGTTCATGGAAGGAAGATTTTTTATCTCTTCCCAACCAGTTTATGAATGACATAGGATACTT
AGAAGGATTCACATTTCACCCACTTCCCCTGAGAACATGTTTATCCTTGCAATGAAAATCATTGCCCAAG
CCCCAGCTACGAGTCGCCCTTTTGCACCCTTTTCCACGAATAATCTTCCCAAAATGTCTGCTTGTAGAAG
CAAGATTTGGAATTTCACGGAAAACTACAGAGAGACACAGAGCAATGCACACCCCCTGGTAAGCCAGAGA
GAGACAAAGAGAAGAGAGAGGAAAACCGAAAGAAGATACATCTAACGGACCAACAAAATAAAACAAATCC
CCAGCAAAGCAAAGTGAAAACAATGATTTAAAAAACACATAAAGACGTGTTTGTAATTACCCGTCCAGGT
TACATGTTCGCCGCTTCCAGGCAGAGAAACGGCTGGTTGAAGTTTTGTGCCCGTCTGACTGTGATGGGAG
GGTTGTATTTGAAGCTCTGGGCACGTAGAGATGGAATGAGAAGGAGGCTGAGCTGGAAGAAACACCAAGG
GGGGAGGGAAGGGGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAGAGAGAGCGCGAGCTATCTCTAGCTACGCCTTCCTCTAAGCTCCGGGAGCCCAGGAGAGCGCTCA
TTTTAGGATTTGGGAGAGGGGTAAAAAGAGGAAAGGCGGCCCCCGCTCTGC
CACNG2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CACNG2_1 ↗22:36,703,517負股36,703,507–36,703,566

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_9JKC6 · promoter · 36703087–36703587 · regulatory

ENSR22_8345NJ · enhancer · 36703588–36703741 · regulatory

ENSR22_8345NM · promoter · 36703742–36703919 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:323 aa

1 aa323 aa功能區域跨膜區
依 Q9Y698 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CACNG2 蛋白屬於 PMP-22/EMP/MP20 family 的 CACNG subfamily,長 323 個胺基酸。序列註解標示四段螺旋型跨膜區,位置分別為第 10–30、104–124、134–154 與 182–202 個胺基酸;第 233–261 位另註記為無序區。

跨膜區Helical10–30 aa
跨膜區Helical104–124 aa
跨膜區Helical134–154 aa
跨膜區Helical182–202 aa
功能區域Disordered233–261 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6DLZ…

PDB · 6DLZ

EM · 3.90 A · A/B/C/D=2-208

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Synapse, synaptosome

CACNG2 被註記為多次跨膜蛋白,並與膜及突觸、突觸體相關。 此定位資料的證據標示為 By similarity,因此屬相似性推定,並非此處直接驗證的定位結果。

未繪示構造:Membrane;Synapse, synaptosome。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 22 個夥伴 · 最多顯示 50 個
stargazinCACNG2APBA2DLG1DLG2DLG3DLG4FRMPD2GOPCGRIP1GRIP2IL16LNX1LNX2MAGI1MAGI2MPDZNHERF4PATJPDZK1SCRIBTJP1WHRNWIPF1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CACNG2 與 GRIA1、GRIA2 有互作記錄,並與 DLG4/PSD-95、DLG1/SAP97 的 PDZ domains 互作。它也被描述為 AMPARs 的輔助次單元;另有資料以 By similarity 註記 CACNG2 與 GOPC、MPP2 可能互作,並記錄其與 GRIA1–GRIA4、CNIH2、CNIH3 及 CACNG3–CACNG5、CACNG7、CACNG8 同處一複合體。L-type calcium channel 的組成包含 alpha-1、alpha-2/delta、beta 與 gamma 次單元。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CACNG2 與 autosomal dominant intellectual developmental disorder 10(MRD10)相關。此疾病描述為一般智力功能顯著低於平均,伴隨適應行為受損,並在發育期表現。資料指出,影響 CACNG2 所代表基因的變異會造成此疾病;此處未提供特定變異或其作用機制。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CACNG2 調節 AMPA-selective glutamate receptors(AMPARs)的運輸與閘控性質,促進其定位至細胞膜及突觸,並減慢活化、去活化和脫敏速率。其調節未呈現次單元特異性,涵蓋所有 AMPAR 次單元;另被認為可能使鈣通道穩定在失活(關閉)狀態。含實驗來源
證據與來源

Regulates the trafficking and gating properties of AMPA-selective glutamate receptors (AMPARs). Promotes their targeting to the cell membrane and synapses and modulates their gating properties by slowing their rates of activation, deactivation and desensitization. Does not show subunit-specific AMPA receptor regulation and regulates all AMPAR subunits. Thought to stabilize the calcium channel in an inactivated (closed) state

PMID 20805473 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用L-type calcium channel 由 alpha-1、alpha-2/delta、beta 與 gamma 次單元組成。CACNG2 與 DLG4/PSD-95、DLG1/SAP97 的 PDZ domains 互作,也有依相似性推定的 GOPC、MPP2 互作;它是 AMPARs 的輔助次單元,與 GRIA1、GRIA2 有互作記錄,並被記錄於含多種 GRIA、CNIH 與 CACNG 蛋白的複合體中。含實驗來源
證據與來源

The L-type calcium channel is composed of five subunits: alpha-1, alpha-2/delta, beta and gamma. Interacts with the PDZ domains of DLG4/PSD-95 and DLG1/SAP97. May interact with GOPC (By similarity). Acts as an auxiliary subunit for AMPA-selective glutamate receptors (AMPARs). Found in a complex with GRIA1, GRIA2, GRIA3, GRIA4, CNIH2, CNIH3, CACNG3, CACNG4, CACNG5, CACNG7 and CACNG8 (By similarity). Interacts with GRIA1 and GRIA2. Interacts with MPP2 (By similarity)

PMID 20805473 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CACNG2 被註記為多次跨膜蛋白,與膜、突觸及突觸體相關;定位資訊的證據標示為 By similarity。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein; Synapse, synaptosome

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Autosomal dominant intellectual developmental disorder 10(MRD10)以發育期出現的一般智力功能顯著低於平均及適應行為受損為特徵。資料指出,影響 CACNG2 所代表基因的變異會造成此疾病。含實驗來源
證據與來源

Intellectual developmental disorder, autosomal dominant 10 MRD10 A disorder characterized by significantly below average general intellectual functioning associated with impairments in adaptive behavior and manifested during the developmental period. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614256

PMID 21376300 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000300105 · 5,642 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATCTCTAGCTACGCCTTCCTCTAAGCTCCGGGAGCCCAGG40
41AGAGCGCTCATTTTAGGATTTGGGAGAGGGGTAAAAAGAG80
81GAAAGGCGGCCCCCGCTCTGCGCTGGCCTTGCTGCCCCGG120
121GGAGGGAGGACTCTGGCCAGCGCCCCCCTCCTGGCGGGCG160
161GCCCTGGGAGCCAGCCGGGGAGCGCGCGGAGCGGGCGGCG200
201CAGGGAGCTGTCCGGTTCAGCACCACCCGTAATGCAGTAG240
241GTGGGAGCGCCTCCGCGGGCGCCCAGCCGGTAGCGAGTGG280
281GGGGCAGGCGCGCGGCCCACCCTGCAGCAAGACGCCGGCT320
321CCCTCGTTTCCAGGAGCTTTGCAGATAGGGGGAGGGAAAT360
361CCGCCTCGATTCTCCAGGAGAAACCCCCTCTCTCCCCCAC400
401TTCGCCAACACTACCCCCGCCACCAACAACAATAACCGCC440
441GCCGCTGCTCGTCCTGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCGCCTG480
481CCCGCCCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCCCG520
521GGCAAAACCATGGAAAGCGAGACCCCCGCACCTGTGCAGC560
561TGAGCTCAAGGGCTTACAGAATACTGGGAAGTCTGGTCTG600
601AAACGAAAGCGCCGAGACCCCCCAAGGAAGAGAACTGGCG640
641AAGCAAAGGATTTTCATGGCGCAGGCCGCAGAGCCGAGAA680
681CGAAGACCGAAGGTTGCATCTCGGCTCTCACAGTCTCTAA720
721CTGTCTAGGTCCCGACCATGAGAAATGGTGTTGAGAATTC760
761GGCTGTTCCCTGGTTCACTGTGGAAGCCATCTCCAAATTA800
801ACTATCACATATGGAAACTGGAGACCAGAATTTTAGAAAA840
841AGAGATTAAGGCATCTCACTTGGGGGGGTGGGGGGTGTCT880
881TTTTATTTTTTTTTTCCTTTTCTTTTTAAAAAAAAAACAC920
921TGCAACTGGAACAGTTTCTGATCTCAAAAGGCAAGCCTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。