演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CACNB2MYSB

calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2

CACNB2 編碼電壓依賴性鈣離子通道的 beta 2 輔助次單元,可調節通道電流與活化特性,並參與 CACNA1C 的膜定位。

Homo sapiens10p12UniProt Q08289
OFFICIAL SYMBOL
CACNB2
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q08289
PDB / ALPHAFOLD
8HLP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CACNB2 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2。其產物屬於 calcium channel beta subunit 家族,是電壓依賴性鈣離子通道的輔助次單元。蛋白質全長 660 個胺基酸,含有 SH3 結構域;序列中另有數段被註記為無序區域。這些資訊建立其家族與結構上的基本認識;其對通道活性的調節及與其他分子的關係,見功能與交互作用段落。

Official symbol
CACNB2
Gene name
calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1402
UniProt
Q08289
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MYSBCACNLB2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010p12
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegCACNB2pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr10:18,140,322–18,543,557
Gene span
403,236 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000324631 ★18,140,424–18,543,55714
ENST0000112918718,140,322–18,319,7373
ENST0000114237018,140,322–18,543,55714
ENST0000064528718,140,736–18,543,55714
ENST0000035211518,140,737–18,539,72414
ENST0000037732818,140,737–18,539,7247
ENST0000064309618,140,813–18,539,69214
ENST0000028234318,140,958–18,543,55714
ENST0000037731918,260,722–18,543,55713
ENST0000061578518,260,769–18,543,5576
ENST0000061736318,260,769–18,543,55713
ENST0000039657618,260,769–18,543,55713

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CACNB2 是電壓依賴性鈣離子通道的 beta 輔助次單元。依序列相似性推定,它能促進通道功能,使峰值鈣電流增加;也參與調整通道活化與失活對電壓變化的依賴性。這些描述表示 CACNB2 與通道電流及其電壓反應特性相關,但相關作用的證據包括相似性推定,不能一概視為已在所有情境中直接證實。

來源亦指出,CACNB2 可能調節 G protein 對通道的抑制作用,具體效應仍以「可能」描述。這表示其功能還可能涉及通道受調控的方式;現有資料未進一步說明此調節的分子步驟或適用條件。

在心肌細胞中,CACNB2 可能參與 beta-adrenergic 刺激所伴隨的 Ca(2+) influx 增加,並因此調節心率與收縮力的上升。這項關聯提供了通道調節與心臟生理反應之間的功能脈絡,但來源將其表述為可能的貢獻,並未將 CACNB2 描述為這些反應的唯一決定因素。

此外,CACNB2 參與 alpha-1 次單元 CACNA1C 的膜定位。這項作用連結了輔助次單元與通道主要次單元抵達細胞膜的過程;來源指出其參與膜定位,但未在此處詳述運輸機制或其在不同細胞中的差異。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 18140424 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CACNB2 ENST00000324631 GRCh38 chr10:18139424-18140524 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAAGGAAGTGCTTGTTTTGTCAAAAATGTGACACTAAGACTTTTCACCCCTATAGAAAAACCTCAACCC
TGGCCTGGCGTGGTGTCCCACCCCTGTGATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCCGGTGGATTACTTGAG
GTCAGGAGTTCAAGACCAGCCCGGGCAACATGGTGAAACCCCGTCTGCACTAAAAACACAAAAATTATCT
GGGCTTGGTGGCCTGTGGCTGTAATCCCAGCTATTCGTGAGGCTGAGGCTAGAGAATCGCTTGAACCCAG
GAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGTGAGACTCCGT
CTAAAACAACAACAAGCAACAACAACAACAAACTTCAATTATGTTTGGAAAGAAGTGCTAATTTAATTTG
GCAAAGATGAAGACAGCAGTCATAAAGCAAAACATTCGGTCTCAGGTTGGGTGGATTCCCACCTAGTTGA
CGAGGCCAGCTGCAGATTCAGGTGGGATCACCTGATGATCTTTATCAATGCCATTTCTTTCTCTGGATCC
TTATTACTGACATTAGCAAGGGCTTTCAGCTGCCCAGAAGATGTTCTTTGCAGACATTTGCTCTCCCGGG
CTGCCAGCAGGCTTTACAAATTTAAAACTTTCAGTGTAGGAACCCAGCCTCCGTCGTCCTTCCCCTCCAA
AGTTAAGAGATCTGCTCTAAGGGTTCCTGAGGGGTGGTCTGGGGCCATGGGAACAGGATCAAGGCCCCCT
GAGCGCCGGGCCTGGCTTCTGTGGCTTCGCAAACTTTTCAGCCTGTGTGCCACGGCGACGCGCAGCGGCT
GAGTCGGAGCCCACGCGGCGCGCGCCTCCCGCGAGGAACTTTTCGGCTTGTAGGCTGCTTGTCACTCTCG
CTTTCCGACGCGCCTCCCCCTGGCTCGCGCTCCCGGAGTTCCCTCCCCTCCTGGCGAGGACCTTTCCCGG
CGCCCGCGGCTCCGATCCCCGCCGCGCTGCGCCCGCTCTCCCGGCCCCGGCTGCCCCGCTGAGGGCTCCC
CTCTCCCAGGCACCGCAGCCGCGCCCCCGCGTCCCGCCTCCCGAGCGGCTC
CACNB2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 6 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CACNB2_4 ↗10:18,140,736正股18,140,687–18,140,746
CACNB2_2 ↗10:18,140,844正股18,140,795–18,140,854
CACNB2_3 ↗10:18,260,738正股18,260,689–18,260,748
CACNB2_5 ↗10:18,340,764正股18,340,715–18,340,774
CACNB2_1 ↗10:18,400,551正股18,400,502–18,400,561
CACNB2_6 ↗10:18,400,976正股18,400,927–18,400,986

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_8JDPG · enhancer · 18136049–18136274 · regulatory

ENSR10_B5L7H · promoter · 18140010–18140968 · regulatory

ENSR10_997FB · enhancer · 18141360–18141869 · regulatory

ENSR10_997GC · enhancer · 18144997–18145345 · regulatory

· motif · 18136294–18136303 · motif

· motif · 18136294–18136303 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:660 aa

1 aa660 aa結構域功能區域
依 Q08289 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CACNB2 蛋白質全長為 660 個胺基酸,屬於 calcium channel beta subunit 家族。其序列註記包含位於第 114–183 個胺基酸的 SH3 結構域,以及三段無序區域:第 39–101、第 190–261 與第 486–641 個胺基酸。

結構域SH3114–183 aa
功能區域Disordered39–101 aa
功能區域Disordered190–261 aa
功能區域Disordered486–641 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8HLP…

PDB · 8HLP

EM · 3.50 A · C=41-660

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane, sarcolemma

CACNB2 位於細胞膜,並被註記為周邊膜蛋白,定位於膜的細胞質側;來源未提供其他定位條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MYSBCACNB2CTBP2HEXIM2PRMT5TMEM174CACNA1C
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CACNB2 可與 CACNA1C、RRAD、TMIGD2、CAMK2D、CBARP、CAMK2A 及 ZNT1 互作。來源另將 CACNB2 列為鈣離子通道複合體的組成次單元;此複合體包含 alpha、beta、gamma、delta 次單元,比例為 1:1:1:1,beta 次單元為 CACNB1 或 CACNB2 其中之一。RRAD 與 CACNB2 的互作與 CACNA1C 向細胞膜的運送調節相關,也可能參與 beta-adrenergic 對心率及收縮力的調控。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CACNB2 可能與 Brugada syndrome 4(BRGDA4)的疾病致病過程有關,但來源未將此關聯描述為已確立的因果關係。BRGDA4 被描述為與 QT 間期縮短相關的心臟疾病;Brugada syndrome 的特徵包括心電圖上的右束支傳導阻滯及 ST 節段上升,並可能造成心室過速,使血液循環受阻,嚴重時可昏厥或在數分鐘內死亡。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CACNB2 是電壓依賴性鈣離子通道的 beta 次單元;依相似性推定可增加峰值鈣電流並調整通道活化與失活的電壓依賴性,也可能調節 G protein 抑制。它可能參與心肌細胞 beta-adrenergic 刺激所伴隨的 Ca(2+) influx 增加,進而調節心率與收縮力,並參與 CACNA1C 的膜定位。含實驗來源
證據與來源

Beta subunit of voltage-dependent calcium channels which contributes to the function of the calcium channel by increasing peak calcium current (By similarity). Plays a role in shifting voltage dependencies of activation and inactivation of the channel (By similarity). May modulate G protein inhibition (By similarity). May contribute to beta-adrenergic augmentation of Ca(2+) influx in cardiomyocytes, thereby regulating increases in heart rate and contractile force. Involved in membrane targeting of the alpha-1 subunit CACNA1C

PMID 17525370 ↗ · PMID 36424916 ↗

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交互作用鈣離子通道複合體包含成孔 alpha 次單元 CACNA1S,以及 CACNB1 或 CACNB2、CACNG1 與 CACNA2D1;alpha、beta、gamma、delta 次單元比例為 1:1:1:1,且 beta 次單元為 CACNB1 或 CACNB2 其一。CACNB2 亦與多種蛋白質互作;RRAD 互作可調節 CACNA1C 的膜運送,並可能涉及 beta-adrenergic 對心率及收縮力的調控。含實驗來源
證據與來源

Component of a calcium channel complex consisting of a pore-forming alpha subunit (CACNA1S) and the ancillary subunits CACNB1 or CACNB2, CACNG1 and CACNA2D1 (By similarity). The channel complex contains alpha, beta, gamma and delta subunits in a 1:1:1:1 ratio, i.e. it contains either CACNB1 or CACNB2 (By similarity). Interacts with CACNA1C (By similarity). Interacts with RRAD; interaction may be involved in beta-adrenergic regulation of heart rate and contractile force. Interaction with RRAD regulates the trafficking of CACNA1C to the cell membrane. Interacts with TMIGD2. Interacts with CAMK2D (By similarity). Interacts with CBARP (By similarity). Interacts with CAMK2A. Interacts with ZNT1 (By similarity)

PMID 17525370 ↗ · PMID 22419821 ↗ · PMID 28130356 ↗ · PMID 36424916 ↗

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細胞定位CACNB2 位於細胞膜,屬於周邊膜蛋白,定位在細胞膜的細胞質側。推論支持
證據與來源

Cell membrane, sarcolemma / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side

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疾病關聯CACNB2 可能參與 Brugada syndrome 4 的致病過程,來源未指出確立的因果關係。此疾病描述為 Brugada syndrome 與 QT 間期縮短的關聯;Brugada syndrome 可見右束支傳導阻滯與 ST 節段上升,並可能造成心室過速、循環受阻、昏厥,嚴重時可在數分鐘內死亡。含實驗來源
證據與來源

Brugada syndrome 4 BRGDA4 A heart disease characterized by the association of Brugada syndrome with shortened QT intervals. Brugada syndrome is a tachyarrhythmia characterized by right bundle branch block and ST segment elevation on an electrocardiogram (ECG). It can cause the ventricles to beat so fast that the blood is prevented from circulating efficiently in the body. When this situation occurs, the individual will faint and may die in a few minutes if the heart is not reset. The gene represented in this entry may be involved in disease pathogenesis MIM: 611876

PMID 17224476 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000324631 · 6,129 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCGCGCTGCGCCCGCTCTCCCGGCCCCGGCTGCCCCGCT40
41GAGGGCTCCCCTCTCCCAGGCACCGCAGCCGCGCCCCCGC80
81GTCCCGCCTCCCGAGCGGCTCGCTTCGCCCGATGCCCCGG120
121CCCCGTCCCGCGCACTGAGCGCCTGGCAGCAGGGCGCCGA160
161GTCCCGGGGCGCTGCGGGGCGCTGCGCCGAGAACGGCCGG200
201GCCTGAGCCCTGGGCGGCCCCCAGAGCCGATCAGAGCGCG240
241GGGAGGCGGGGGCGAGGAGGAGGGGACCCGCCGCCGGGGG280
281CTGGCTGCTTCGCTCCGAGCCGACTTTTCGCCAATGGTCC320
321AAAGGGACATGTCCAAGTCGCCTCCCACAGCGGCGGCGGC360
361GGTGGCGCAGGAGATCCAGATGGAACTGCTAGAGAACGTG400
401GCTCCCGCGGGGGCGCTCGGAGCCGCCGCACAGTCATATG440
441GAAAAGGAGCCAGAAGGAAAAACAGATTTAAAGGATCTGA480
481TGGAAGCACGTCATCTGATACTACCTCAAATAGTTTTGTT520
521CGCCAGGGTTCGGCAGACTCCTACACTAGCCGTCCATCCG560
561ATTCCGATGTATCTCTGGAGGAGGACCGGGAGGCAGTGCG600
601CAGAGAAGCGGAGCGGCAGGCCCAGGCACAGTTGGAAAAA640
641GCAAAGACAAAGCCCGTTGCATTTGCGGTTCGGACAAATG680
681TCAGCTACAGTGCGGCCCATGAAGATGATGTTCCAGTGCC720
721TGGCATGGCCATCTCATTCGAAGCAAAAGATTTTCTGCAT760
761GTTAAGGAAAAATTTAACAATGACTGGTGGATAGGGCGAT800
801TGGTAAAAGAAGGCTGTGAAATCGGATTCATTCCAAGCCC840
841AGTCAAACTAGAAAACATGAGGCTGCAGCATGAACAGAGA880
881GCCAAGCAAGGGAAATTCTACTCCAGTAAATCAGGAGGAA920
921ATTCATCATCCAGTTTGGGTGACATAGTACCTAGTTCCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。