演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CACNA1ICav3.3

calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I

CACNA1I 編碼電壓敏感型鈣離子通道的 α1I 次單元,形成低電壓活化的 T 型鈣電流;其通道在較負電位即可開啟,並具有電壓依賴性失活。

Homo sapiens22q13.1UniProt Q9P0X4
OFFICIAL SYMBOL
CACNA1I
CHROMOSOME
22
UNIPROT
Q9P0X4
PDB / ALPHAFOLD
7WLI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I 是電壓敏感型鈣離子通道的 α1 次單元,屬於 calcium channel alpha-1 subunit 家族中的 CACNA1I subfamily。此基因產生的蛋白質是多次跨膜膜蛋白,由四個重複區構成;每個重複區包含多段跨膜螺旋,並由細胞內與細胞外區段連接。這種架構構成通道蛋白的基本骨幹,使其能作為電壓敏感型鈣離子通道的一部分。

Official symbol
CACNA1I
Gene name
calcium voltage-gated channel subunit alpha1 I
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1396
UniProt
Q9P0X4
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Cav3.3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.1
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegCACNA1Ipq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:39,570,753–39,689,735
Gene span
118,983 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000402142 ★39,570,753–39,689,73537
ENST0000040767339,570,753–39,684,52835
ENST0000040162439,570,753–39,685,21136
ENST0000040489839,570,753–39,689,73036

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CACNA1I 產物形成 T 型鈣電流,屬於低電壓活化(LVA)通道。通道可在相當負的膜電位下開啟,並隨電壓變化而失活;其開啟電壓範圍與 α1G 或 α1H 相近,但較高。T 型通道可被鎳離子與 mibefradil 強烈阻斷。通道開啟時,鈣離子進入可興奮細胞,並提供鈣依賴性過程所需的訊號。

在生理功能上,T 型通道參與中樞神經元及心臟節律細胞的起搏活動,也支持分泌細胞與血管平滑肌中的鈣訊號。電壓敏感型鈣通道介導的鈣離子進入,亦與肌肉收縮、荷爾蒙或神經傳遞物質釋放、基因表現、細胞移動、細胞分裂及細胞死亡等過程相關。

此外,T 型通道可能調節神經元的放電模式,進而與資訊處理有關,也可能參與細胞生長過程。這些資料描述 CACNA1I 通道與多種鈣依賴性活動的關聯;其中神經元放電模式及細胞生長的角色以可能參與表述,並非來源所述的確定作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39570753 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CACNA1I ENST00000402142 GRCh38 chr22:39569753-39570853 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGCCAGGTTGGCCTCAAACTCCTGACCTCAGGTGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATT
ACAGGTGTGAGTCACGTGCCTGGCCTTTGACTGGAATTCTATTTCTGCTGTTACTCTGCTACATGTCTGT
CCTGTCCCTTCTCTGGGCCTCGGTTTCTTCATCTGTAAGGCAAGGAGGTTAGACTCTAAGATTCCTGGGT
TCTCAGCCTTGTAAGGCAGTGGCTGGGAGGTCCCTGGGTCAAGGGCTCAGCTGTAGGTCTCAGCTCAGGG
GTTACTTCCTCAGGGAAGCCAACTGTGATTCCCTCCTGGCTTGCCAGCGTTCCCCCAGTCTCTGATTCTG
CAGCACCCCAACATTGCCTTTGTAACCTGCATTGTCCTGGCAATAATGTCTGTCTTTACAATCACCTCTT
TTTTCTTGCAAGTTTTCTTTACCTTTGATGGTGCAATAAATACATAGCTCTAGTCTTGTAAAAAAGTTAA
GATCCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTTCTTCCCTCCCTCCCTCCCTCTCTCC
CTCTCTCCCTCCCTTCCGTCTTTCTTTTCTGTCTATAATTACTTAAACATTTTTTCTCTTAAATAATGAA
AGATTTCAAATACAGAAAATTGCCAATAGACAAAAAAAAAAGAGTTAATATCACAATTATATTCTAAGAA
GGCTTTATTCTCCCCACTATCTTCGTTTGCCAAAACTGAGGCTCAGCCAGGGTGAGCAGACTTGCCCCAT
GATCACCCAGCTTGGAAGCAGATTCCAAGTTGGGTGCAGCTGGGCCCTCAGCTGTTTCGTAATCCTCATG
CAAGAGTGAGGGTGAGGGGCCTGTGGGGCTCAGGTGGGGCTGTCAGAGCTGCATCCGTCCACTTATTGGT
GGAGAGGCAGGTTGGGGAGCATGTACCAGGCCTGTCCCCACCACGTGCCACCCTCTCTGTCTTCCCCAGG
GCTCCCAGCTCAGTGTGGACATGGCTGAGAGCGCCTCCCCGCCCTCCTCATCTGCAGCAGCCCCAGCCGC
TGAGCCAGGAGTCACCACGGAGCAGCCCGGACCCCGGAGCCCCCCATCCTC
CACNA1I 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_9KP2Z · enhancer · 39567398–39567845 · regulatory

ENSR22_B9T3J · enhancer · 39574676–39575255 · regulatory

· motif · 39565874–39565888 · motif

· motif · 39567436–39567448 · motif

· motif · 39567528–39567537 · motif

· motif · 39570576–39570585 · motif

· motif · 39574936–39574950 · motif

· motif · 39574936–39574950 · motif

· motif · 39575471–39575485 · motif

· motif · 39575471–39575485 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2223 aa

1 aa2223 aa跨膜區拓樸區域
依 Q9P0X4 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CACNA1I 蛋白長 2223 個胺基酸,屬於 calcium channel alpha-1 subunit 家族的 CACNA1I subfamily。序列註解顯示其含有四組重複的跨膜區,每組包括 S1 至 S6 螺旋;各段之間分布於細胞質側或細胞外側的區域。

拓樸區域Cytoplasmic1–78 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat I79–99 aa
拓樸區域Extracellular100–120 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat I121–141 aa
拓樸區域Cytoplasmic142–148 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat I149–168 aa
拓樸區域Extracellular169–173 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat I174–191 aa
拓樸區域Cytoplasmic192–211 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat I212–232 aa
拓樸區域Extracellular233–377 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat I378–398 aa
拓樸區域Cytoplasmic399–640 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat II641–661 aa
拓樸區域Extracellular662–676 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat II677–697 aa
拓樸區域Cytoplasmic698–702 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat II703–721 aa
拓樸區域Extracellular722–729 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat II730–753 aa
拓樸區域Cytoplasmic754–764 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat II765–785 aa
拓樸區域Extracellular786–841 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat II842–862 aa
拓樸區域Cytoplasmic863–1166 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat III1167–1187 aa
拓樸區域Extracellular1188–1209 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat III1210–1230 aa
拓樸區域Cytoplasmic1231–1244 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat III1245–1265 aa
拓樸區域Extracellular1266–1272 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat III1273–1294 aa
拓樸區域Cytoplasmic1295–1304 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat III1305–1325 aa
拓樸區域Extracellular1326–1410 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat III1411–1431 aa
拓樸區域Cytoplasmic1432–1485 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat IV1486–1506 aa
拓樸區域Extracellular1507–1522 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat IV1523–1543 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7WLI…

PDB · 7WLI

EM · 3.30 A · A=1-2223

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

CACNA1I 是多次跨膜膜蛋白,來源未提供其在特定條件或不同異構型下的定位變化資訊。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Cav3.3CACNA1ICATSPER1CATSPER2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CACNA1I 與 CATSPER1、CATSPER2 有互作;來源指出此互作會抑制 T 型鈣通道活性,但未進一步說明互作是否形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CACNA1I 相關變異被報告與常染色體顯性神經發育障礙有關,患者有語言障礙,可能伴有癲癇,且臨床表現程度不一。嚴重病例可有明顯全面性發育遲緩、肌張力低下、行走延遲或不能行走、無語言、餵食困難、皮質視覺障礙,並在出生後數月或數年出現過度興奮與癲癇。較輕病例則可能有輕至中度認知障礙及輕微語言遲緩,通常沒有癲癇。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能電壓敏感型鈣通道使鈣離子進入可興奮細胞,並參與肌肉收縮、荷爾蒙或神經傳遞物質釋放、基因表現、細胞移動、細胞分裂與細胞死亡等鈣依賴性過程。此通道產生 T 型鈣電流,屬於低電壓活化通道,可在較負電位開啟並呈現電壓依賴性失活,也會受到鎳離子與 mibefradil 強烈阻斷。它參與中樞神經元與心臟節律細胞的起搏,並支持分泌細胞及血管平滑肌的鈣訊號;此外可能調節神經元放電模式及參與細胞生長。其開啟電壓範圍與 α1G 或 α1H 相近但較高。含實驗來源
證據與來源

Voltage-sensitive calcium channels (VSCC) mediate the entry of calcium ions into excitable cells and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. This channel gives rise to T-type calcium currents. T-type calcium channels belong to the 'low-voltage activated (LVA)' group and are strongly blocked by nickel and mibefradil. A particularity of this type of channels is an opening at quite negative potentials, and a voltage-dependent inactivation. T-type channels serve pacemaking functions in both central neurons and cardiac nodal cells and support calcium signaling in secretory cells and vascular smooth muscle. They may also be involved in the modulation of firing patterns of neurons which is important for information processing as well as in cell growth processes. Gates in voltage ranges similar to, but higher than alpha 1G or alpha 1H

PMID 33704440 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能電壓敏感型鈣通道介導鈣離子進入可興奮細胞,並參與肌肉收縮、荷爾蒙或神經傳遞物質釋放、基因表現、細胞移動、細胞分裂與細胞死亡等鈣依賴性過程。CACNA1I 所形成的通道產生 T 型鈣電流。含實驗來源
證據與來源

Voltage-sensitive calcium channels (VSCC) mediate the entry of calcium ions into excitable cells and are also involved in a variety of calcium-dependent processes, including muscle contraction, hormone or neurotransmitter release, gene expression, cell motility, cell division and cell death. This channel gives rise to T-type calcium currents

PMID 10749850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out)含實驗來源
證據與來源

Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out)

PMID 33704440 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用CACNA1I 與 CATSPER1 及 CATSPER2 互作;此互作會抑制 T 型鈣通道活性。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CATSPER1 and CATSPER2, leading to suppress T-type calcium channel activity

PMID 16740636 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CACNA1I 是膜蛋白,具有多次跨膜結構。推論支持
證據與來源

Membrane / Multi-pass membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯CACNA1I 相關變異與常染色體顯性神經發育障礙有關,患者有語言障礙,可能伴有癲癇且表現程度不一。重症可見全面性發育遲緩、肌張力低下、行走延遲或不能行走、無語言、餵食困難、皮質視覺障礙,以及在出生後數月或數年出現過度興奮與癲癇;較輕患者則可能有輕至中度認知障礙和輕微語言遲緩,通常沒有癲癇。含實驗來源
證據與來源

Neurodevelopmental disorder with speech impairment and with or without seizures NEDSIS An autosomal dominant disorder with variable manifestations. Severely affected individuals have profound global developmental delay, hypotonia, delayed or absent walking, absent speech, feeding difficulties, cortical visual impairment, and onset of hyperexcitability and seizures in the first months or years of life. Some patients manifest a milder phenotype characterized by mild to moderate cognitive impairment and mild speech delay, usually without seizures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620114

PMID 33704440 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000402142 · 10,002 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATGGCTGAGAGCGCCTCCCCGCCCTCCTCATCTGCAGCAG40
41CCCCAGCCGCTGAGCCAGGAGTCACCACGGAGCAGCCCGG80
81ACCCCGGAGCCCCCCATCCTCCCCGCCAGGCCTGGAGGAG120
121CCTCTGGATGGAGCTGATCCTCATGTCCCACACCCAGACC160
161TGGCGCCTATTGCCTTCTTCTGCCTGCGACAGACCACCAG200
201CCCCCGGAACTGGTGCATCAAGATGGTGTGCAACCCGTGG240
241TTTGAATGTGTCAGCATGCTGGTGATCCTGCTGAACTGCG280
281TGACACTTGGCATGTACCAGCCGTGCGACGACATGGACTG320
321CCTGTCCGACCGCTGCAAGATCCTGCAGGTCTTTGATGAC360
361TTCATCTTTATCTTCTTTGCCATGGAGATGGTGCTCAAGA400
401TGGTGGCCCTGGGGATTTTTGGCAAGAAGTGCTACCTCGG440
441GGACACATGGAACCGCCTGGATTTCTTCATCGTCATGGCA480
481GGGATGGTCGAGTACTCCCTGGACCTTCAGAACATCAACC520
521TGTCAGCCATCCGCACCGTGCGCGTCCTGAGGCCCCTCAA560
561AGCCATCAACCGCGTGCCCAGTATGCGGATCCTGGTGAAC600
601CTGCTCCTGGACACACTGCCCATGCTGGGGAATGTCCTGC640
641TGCTCTGCTTCTTTGTCTTCTTCATCTTTGGCATCATAGG680
681TGTGCAGCTCTGGGCGGGCCTGCTGCGTAACCGCTGCTTC720
721CTGGAGGAGAACTTCACCATACAAGGGGATGTGGCCTTGC760
761CCCCATACTACCAGCCGGAGGAGGATGATGAGATGCCCTT800
801CATCTGCTCCCTGTCGGGCGACAATGGGATAATGGGCTGC840
841CATGAGATCCCCCCGCTCAAGGAGCAGGGCCGTGAGTGCT880
881GCCTGTCCAAGGACGACGTCTACGACTTTGGGGCGGGGCG920
921CCAGGACCTCAATGCCAGCGGCCTCTGTGTCAACTGGAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。