演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CACNA1CCav1.2

calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C

CACNA1C 編碼電壓閘控鈣離子通道的成孔 α1C 次單元,形成 L 型鈣電流,參與心臟與平滑肌的活動。

Homo sapiens12p13.33UniProt Q13936
OFFICIAL SYMBOL
CACNA1C
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q13936
PDB / ALPHAFOLD
8FHS
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CACNA1C 是蛋白質編碼基因,產物屬於 calcium channel alpha-1 subunit 家族的 CACNA1C 次家族。其蛋白質為電壓閘控鈣離子通道的 α1C 次單元,是通道的成孔部分,能形成 L 型鈣電流。蛋白質全長 2,221 個胺基酸,具有多次穿越膜的結構;序列包含四組重複區段,每組可見 S1 至 S6 的跨膜螺旋,以及位於細胞質側的區域。這些結構特色構成大型膜蛋白的基本架構,並使其成為鈣離子通道複合體的核心次單元。

Official symbol
CACNA1C
Gene name
calcium voltage-gated channel subunit alpha1 C
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1390
UniProt
Q13936
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Cav1.2CACH2CACN2TSLQT8CCHL1A1CACNL1A1CACNA1C-IT2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212p13.33
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegCACNA1Cpq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr12:1,970,690–2,697,950
Gene span
727,261 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000399655 ★2,052,987–2,697,95047
ENST000006837811,970,690–2,697,95047
ENST000006824621,970,690–2,697,95047
ENST000006838401,970,690–2,697,95047
ENST000006839561,970,690–2,697,95047
ENST000006825441,970,772–2,691,19950
ENST000006838241,971,063–2,691,19948
ENST000003996342,052,987–2,697,95047
ENST000004064542,052,987–2,697,95048
ENST000003277022,052,987–2,697,95048
ENST000003475982,052,987–2,697,95049
ENST000003996032,052,987–2,697,95047

顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CACNA1C 所編碼的 α1C 次單元構成電壓閘控鈣離子通道的孔道,產生 L 型鈣電流。這類長效型通道被認為屬於高電壓活化群;通道開啟時,鈣離子由細胞外進入細胞質。此鈣離子流可進一步觸發肌漿中的鈣離子釋放,但這項作用依據相似性推定。

在心臟,CACNA1C 參與興奮-收縮耦合,並是正常心臟發育及心律調節所必需。其作用將膜上的電訊號與細胞內鈣離子變化連結,支持心肌收縮相關過程。來源指出這些是其生理角色,並未在此提供更細的分子步驟。

在血管與腸道,CACNA1C 對平滑肌細胞正常收縮有所必要;在動脈平滑肌的收縮中,它也對正常血壓調節至關重要。因此,鈣離子通道的活動不只關係心臟,也參與血管張力及腸道平滑肌功能。

另有感染相關資料指出,CACNA1C 可作為 Influenzavirus 的受體;當其帶有唾液酸修飾並表現在肺組織時,可能對病毒進入細胞具有關鍵作用。這項敘述限於所述修飾與組織條件,並不表示在其他情境下皆有相同作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 2052987 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CACNA1C ENST00000399655 GRCh38 chr12:2051987-2053087 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTCCCCAAGAGGGAGTTGTAGGCCCCCCTGAAAGGGATCACGAAGCCCCACTGGAGGGGAGCCCGGTC
CTGCAGGGGGTGCCGTGGAACTTGCTGTGGTTGCAGGGAGTGATGGAGGGAAGTGTTTGCTTCTCCGGGA
AGGAGAGGTGCTGGATAGATTCCTGCCGGAGTTGCAGAAATAATTAAGAGAAGTAGGTAAGGATATCCTA
GTAGAACACGTGCTCGGCTGCCTCCAAGGAATTATTAAACCTGGGTCTAGGAATCTGTTCAGACATCTGG
GCACCGCTGCCTCGCCTACCAGGCTCCGCCTCGCTGCCCCTCCCGCTTCCCCTCCCCTCCTCTATCTGTC
ACTTCTACAACCGCTCTGATTATAATTGATCAAACAGAATCACGGAATCACGGCTCATCTTGCCGTTTTG
TTCAGTGGCCCGATCCGAAACGAGACTCTGGTAGTCGGGCAAATTGTATTCCTCCTCCTTGGAATTCCGC
TCACAGAGGCCTTCCCGGCGTGGCCGGCCCAGCAGGGACGCGCCGCCGCAGCGGAGGAGAGAACGCGGGC
GGGGGGCTGCAGGCCGGCGCGGGGGGCGCGACGCCGCCGGCGGGGCGCGAGGGGGTGTGTCCGCGCCGCG
GCCACCGCGGCCACCGCGGCTGGCGCCCGGGTGCGCCGCGCGCCCCGGCCTCCCCGGGGGCTCCTCACGC
CGCCCCTCGCCCGCCGGCGGCCGGGGCCCGCTCCCTTTGACGTCATGCGGGCGGAGGGCTCGCTCGGGCG
GCGCTGCCGCGGGCGCCGGGAGGGGGCCCGACTTCGGGCTCCAGTCCGCCGCCGTGCGCCCCGCGCCGTG
CGCCCGGCTCCCTGCGCGCCGCCGCAGCCACATCTGGAAGCGTTCAGCGCGTCTGCCTCCGGCGCGCCGG
GCGGGCGGGCGGGCGGCGCGGGCAGGGGCGGGCGCGGGCGCGGCGGGGCTGGGCCGGGGGGAGTGAGCGC
GGCGCTCTCGCGCGCCCGGTGTCTCCCTCTCGCTGCCTCTGCAGAAACAGCTCCTGCCAGAGCGGCGCTC
GGCGCGGCGCGGCGGGCCCGGAGCGGCGGCGGCGGCTCTTCCTGCCTCCGC
CACNA1C 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CACNA1C_2 ↗12:1,970,780正股1,970,731–1,970,790
CACNA1C_1 ↗12:2,053,287正股2,053,238–2,053,297

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_83LXF · enhancer · 2050072–2050244 · regulatory

ENSR12_5H2T9 · CTCF_binding_site · 2052052–2052073 · regulatory

ENSR12_C7HH · promoter · 2052497–2053573 · regulatory

ENSR12_C7HL · enhancer · 2053574–2054823 · regulatory

ENSR12_BF2M · enhancer · 2057116–2057675 · regulatory

ENSR12_5H3QX · CTCF_binding_site · 2057381–2057402 · regulatory

· motif · 2052054–2052070 · motif

· motif · 2057383–2057399 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2221 aa

1 aa2221 aa跨膜區拓樸區域
依 Q13936 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CACNA1C 蛋白質長 2,221 個胺基酸,屬 calcium channel alpha-1 subunit 家族的 CACNA1C 次家族。其序列具有四組跨膜區段重複,各含 S1 至 S6 螺旋;多段區域位於細胞質側,並與細胞外區段交替排列。

拓樸區域Cytoplasmic1–124 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat I125–143 aa
拓樸區域Extracellular144–158 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat I159–179 aa
拓樸區域Cytoplasmic180–188 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat I189–209 aa
拓樸區域Extracellular210–232 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat I233–251 aa
拓樸區域Cytoplasmic252–268 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat I269–290 aa
拓樸區域Extracellular291–350 aa
拓樸區域Extracellular373–380 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat I381–401 aa
拓樸區域Cytoplasmic402–524 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat II525–543 aa
拓樸區域Extracellular544–554 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat II555–575 aa
拓樸區域Cytoplasmic576–586 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat II587–606 aa
拓樸區域Extracellular607–615 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat II616–634 aa
拓樸區域Cytoplasmic635–653 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat II654–673 aa
拓樸區域Extracellular674–693 aa
拓樸區域Extracellular716–725 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat II726–745 aa
拓樸區域Cytoplasmic746–900 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat III901–919 aa
拓樸區域Extracellular920–931 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat III932–952 aa
拓樸區域Cytoplasmic953–987 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat III988–1006 aa
拓樸區域Extracellular1007–1013 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat III1014–1032 aa
拓樸區域Cytoplasmic1033–1051 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat III1052–1071 aa
拓樸區域Extracellular1072–1121 aa
拓樸區域Extracellular1143–1159 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat III1160–1181 aa
拓樸區域Cytoplasmic1182–1239 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8FHS…

PDB · 8FHS

EM · 3.30 A · A=1-2221

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Cell membrane, sarcolemma;Perikaryon;Postsynaptic density membrane;Cell projection, dendrite;Cell membrane, sarcolemma, T-tubule

CACNA1C 是多次穿膜蛋白,位於細胞膜及心肌細胞肌膜,也見於 T 小管膜、神經元胞體、樹突及突觸後密度膜。 在連接膜處,它與ryanodine receptors呈簇狀共定位;RRAD 與 CACNB2 的交互作用則會促進 CACNA1C 在細胞膜上的表現。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Perikaryon;Postsynaptic density membrane;Cell projection, dendrite。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 22 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Cav1.2CACNA1CACTN1APLP2C3CABP1CACNB1CACNB2CACNB3CALM3FXR1HNRNPA2B1KIAA1549MEF2CMSI2NSG1PCDHA2PCDHB5PDE4BPICK1RALYSEMA4CSF3B1Calm3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 22 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CACNA1C 與 CACNB1、CACNB2、CACNB3、CACNA2D1、CACNA2D4,以及 CACNG4、CACNG6、CACNG7、CACNG8 等輔助次單元有交互作用,這些輔助次單元可調節通道活性;複合體的 α、β、γ、δ 次單元比例被推定為 1:1:1:1。它也與 CALM1、CABP1、CABP5、CIB1、STAC2、STAC3 和 LRRC7 交互作用。CABP1、STAC2 與 STAC3 可抑制通道失活;LRRC7 在神經元中則與通道運送至樹突膜及突觸後聚集增加有關。感染情境下,CACNA1C 另與 influenzavirus H1 hemagglutinin 交互作用。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CACNA1C 變異會造成 Timothy syndrome,該病可有多器官異常,包括致命性心律不整、指趾蹼狀連合、先天性心臟病、免疫缺陷、間歇性低血糖、認知異常及自閉症。Long QT syndrome 8 也被描述為由影響此基因的變異造成,呈現長 QT 間隔及多形性心室心律不整,遺傳型態符合常染色體顯性且外顯率不全。Brugada syndrome 3 與 CACNA1C 的關係則較不確定:此基因可能參與其致病過程。另有常染色體顯性神經發育障礙與影響 CACNA1C 的變異相關,特徵包括發育遲緩、智能障礙、語言缺損、行為異常及肌張力低下,部分個案有癲癇或輕微骨骼缺陷。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

11 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 11 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CACNA1C 的 α1C 次單元構成電壓閘控鈣離子通道孔道並形成 L 型鈣電流。鈣離子進入細胞質後可觸發肌漿鈣離子釋放,此項依據相似性。它參與心臟興奮-收縮耦合,為正常心臟發育與心律調節所必需;也支持血管及腸道平滑肌正常收縮,並透過動脈平滑肌收縮參與正常血壓調節。L 型通道屬高電壓活化群的判定為可能。含實驗來源
證據與來源

Pore-forming, alpha-1C subunit of the voltage-gated calcium channel that gives rise to L-type calcium currents. Mediates influx of calcium ions into the cytoplasm, and thereby triggers calcium release from the sarcoplasm (By similarity). Plays an important role in excitation-contraction coupling in the heart. Required for normal heart development and normal regulation of heart rhythm. Required for normal contraction of smooth muscle cells in blood vessels and in the intestine. Essential for normal blood pressure regulation via its role in the contraction of arterial smooth muscle cells. Long-lasting (L-type) calcium channels belong to the 'high-voltage activated' (HVA) group (Probable)

PMID 12181424 ↗ · PMID 15454078 ↗ · PMID 15863612 ↗ · PMID 16299511 ↗ · PMID 17224476 ↗ · PMID 20953164 ↗ · PMID 23677916 ↗ · PMID 24728418 ↗ · PMID 25260352 ↗ · PMID 25633834 ↗ · PMID 26253506 ↗ · PMID 27218670 ↗ · PMID 28119464 ↗ · PMID 29078335 ↗ · PMID 29742403 ↗ · PMID 30023270 ↗ · PMID 30172029 ↗ · PMID 31430211 ↗ · PMID 34163037 ↗ · PMID 8099908 ↗

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功能CACNA1C 編碼電壓閘控鈣離子通道的 α1C 成孔次單元,該通道產生 L 型鈣電流。含實驗來源
證據與來源

Pore-forming, alpha-1C subunit of the voltage-gated calcium channel that gives rise to L-type calcium currents

PMID 12176756 ↗ · PMID 7737988 ↗

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功能在微生物感染情境中,CACNA1C 可作為 Influenzavirus 的受體。當 CACNA1C 帶有唾液酸修飾並表現在肺組織時,可能對病毒進入細胞具有關鍵作用;此作用保留來源所述的條件與可能性。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Acts as a receptor for Influenzavirus. May play a critical role in allowing virus entry when sialylated and expressed on lung tissues

PMID 29779930 ↗

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分子活性Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out)含實驗來源
證據與來源

Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out)

PMID 12181424 ↗ · PMID 15454078 ↗ · PMID 15863612 ↗ · PMID 16299511 ↗ · PMID 17224476 ↗ · PMID 20953164 ↗ · PMID 23677916 ↗ · PMID 24728418 ↗ · PMID 25260352 ↗ · PMID 25633834 ↗ · PMID 26253506 ↗ · PMID 27218670 ↗ · PMID 28119464 ↗ · PMID 29078335 ↗ · PMID 30023270 ↗ · PMID 30172029 ↗ · PMID 31430211 ↗ · PMID 34163037 ↗ · PMID 8099908 ↗

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交互作用CACNA1C 是鈣離子通道複合體的成孔 α 次單元,並與 β、γ、δ 輔助次單元組成複合體;四類次單元各一個的 1:1:1:1 比例屬推定。CACNB、CACNA2D 及 CACNG 家族成員可調節通道活性。CACNA1C 也與 CALM1、CABP1、CABP5、CIB1、STAC2、STAC3、LRRC7 等交互作用;CABP1 的結合可抑制鈣依賴性通道失活,且不同結合位點有鈣依賴性差異,IQ 位點與 calmodulin 結合互斥。LRRC7 在神經元中與通道樹突膜運送及突觸後聚集增加相關。含實驗來源
證據與來源

Component of a calcium channel complex consisting of a pore-forming alpha subunit (CACNA1C) and ancillary beta, gamma and delta subunits. The channel complex contains alpha, beta, gamma and delta subunits in a 1:1:1:1 ratio, i.e. it contains only one of each type of subunit (Probable). CACNA1C channel activity is modulated by ancillary subunits, such as CACNB1, CACNB2, CACNB3, CACNA2D1 and CACNA2D4. Interacts with the gamma subunits CACNG4, CACNG6, CACNG7 and CACNG8 (By similarity). Interacts with CACNB1 (By similarity). Interacts with CACNB2. Identified in a complex with CACNA2D4 and CACNB3. Interacts with CACNB3. Interacts with CACNA2D1. Interacts with CACNA2D4. Interacts with CALM1. Interacts (via the N-terminus and the C-terminal C and IQ motifs) with CABP1; this inhibits Ca(2+)-dependent channel inactivation. The binding via the C motif is calcium independent whereas the binding via IQ requires the presence of calcium and is mutually exclusive with calmodulin binding. The binding to the cytoplasmic N-terminal domain is calcium independent but is essential for the channel modulation. Interacts (via C-terminal CDB motif) with CABP5; in a calcium-dependent manner (By similarity). Interacts with CIB1; the interaction increases upon cardiomyocytes hypertrophy (By similarity). Interacts with STAC2 and STAC3; this inhibits channel inactivation. Interacts (via N-terminus) with LRRC7; in neurons, the interaction enhances channel trafficking to the dendritic cell membrane and increases channel postsynaptic clustering, thereby facilitating excitatory calcium signaling (By similarity)

PMID 11741969 ↗ · PMID 12176756 ↗ · PMID 12181424 ↗ · PMID 15140941 ↗ · PMID 15141227 ↗ · PMID 15863612 ↗ · PMID 15980432 ↗ · PMID 16299511 ↗ · PMID 16338416 ↗ · PMID 17224476 ↗ · PMID 19279214 ↗ · PMID 20953164 ↗ · PMID 22518098 ↗ · PMID 24728418 ↗ · PMID 29078335 ↗ · PMID 29742403 ↗

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交互作用在微生物感染情境中,CACNA1C 與 influenzavirus H1 hemagglutinin 交互作用。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with influenzavirus H1 hemagglutinin

PMID 29779930 ↗

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細胞定位CACNA1C 為多次穿膜蛋白,位於細胞膜、心肌細胞肌膜及其 T 小管,也見於神經元胞體、樹突和突觸後密度膜。它在肌膜與肌漿網接近的連接膜處,與ryanodine receptors呈不同簇狀共定位。RRAD 與 CACNB2 的交互作用會促進 CACNA1C 在細胞膜上的表現。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cell membrane, sarcolemma / Multi-pass membrane protein; Perikaryon; Postsynaptic density membrane; Cell projection, dendrite; Cell membrane, sarcolemma, T-tubule; Colocalizes with ryanodine receptors in distinct clusters at the junctional membrane, where the sarcolemma and the sarcoplasmic reticulum are in close contact. The interaction between RRAD and CACNB2 promotes the expression of CACNA1C at the cell membrane

PMID 11741969 ↗ · PMID 12176756 ↗ · PMID 12181424 ↗ · PMID 15454078 ↗ · PMID 15863612 ↗ · PMID 16299511 ↗ · PMID 17071743 ↗ · PMID 17224476 ↗ · PMID 20953164 ↗ · PMID 24728418 ↗ · PMID 26253506 ↗ · PMID 27218670 ↗ · PMID 29078335 ↗ · PMID 29742403 ↗ · PMID 7737988 ↗ · PMID 8099908 ↗ · PMID 8392192 ↗ · PMID 9013606 ↗ · PMID 9087614 ↗ · PMID 9607315 ↗

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疾病關聯Timothy syndrome 是涉及多器官功能異常的疾病,可包括致命性心律不整、指趾蹼狀連合、先天性心臟病、免疫缺陷、間歇性低血糖、認知異常及自閉症。此病由影響 CACNA1C 的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Timothy syndrome TS Disorder characterized by multiorgan dysfunction including lethal arrhythmias, webbing of fingers and toes, congenital heart disease, immune deficiency, intermittent hypoglycemia, cognitive abnormalities and autism. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 601005

PMID 15454078 ↗ · PMID 15863612 ↗ · PMID 25260352 ↗ · PMID 26253506 ↗ · PMID 30023270 ↗ · PMID 30172029 ↗ · PMID 31430211 ↗ · PMID 8099908 ↗

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疾病關聯Brugada syndrome 3 與 QT 間隔縮短相關;Brugada syndrome 的特徵包括心電圖右束支傳導阻滯及 ST 節段上升,並可能造成快速心室心律,使血液循環受阻,嚴重時可昏厥或在數分鐘內死亡。CACNA1C 可能參與其致病過程,來源未將此關聯表述為確定因果。含實驗來源
證據與來源

Brugada syndrome 3 BRGDA3 A heart disease characterized by the association of Brugada syndrome with shortened QT intervals. Brugada syndrome is a tachyarrhythmia characterized by right bundle branch block and ST segment elevation on an electrocardiogram (ECG). It can cause the ventricles to beat so fast that the blood is prevented from circulating efficiently in the body. When this situation occurs, the individual will faint and may die in a few minutes if the heart is not reset. The gene represented in this entry may be involved in disease pathogenesis MIM: 611875

PMID 17224476 ↗ · PMID 20817017 ↗

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疾病關聯Long QT syndrome 8 是長 QT 症候群的一型,具有心電圖 QT 間隔延長及多形性心室心律不整;運動或情緒壓力下可能昏厥或猝死,也可能在嬰兒期以猝死作為首發事件。其遺傳型態符合常染色體顯性且外顯率不全;疾病由影響 CACNA1C 的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Long QT syndrome 8 LQT8 A form of long QT syndrome, a heart disorder characterized by a prolonged QT interval on the ECG and polymorphic ventricular arrhythmias. They cause syncope and sudden death in response to exercise or emotional stress, and can present with a sentinel event of sudden cardiac death in infancy. LQT8 transmission pattern is consistent with autosomal dominant inheritance with incomplete penetrance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618447

PMID 23677916 ↗ · PMID 24728418 ↗ · PMID 25633834 ↗ · PMID 30345660 ↗

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疾病關聯此常染色體顯性神經發育障礙通常自嬰兒期出現全面性發展遲緩,可有智能障礙、言語少或缺失、行為異常,以及肌張力低下伴隨走路延遲或無法行走。其他表現包括癲癇、輕微骨骼缺陷及非特異性外觀特徵;疾病由影響 CACNA1C 的變異造成。含實驗來源
證據與來源

Neurodevelopmental disorder with hypotonia, language delay, and skeletal defects with or without seizures NEDHLSS An autosomal dominant disorder characterized by global developmental delay apparent from infancy, intellectual disability, poor or absent speech, behavioral abnormalities, and hypotonia with delayed walking or inability to walk. Additional features include epilepsy, mild skeletal defects, and non-specific dysmorphic features. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620029

PMID 30513141 ↗ · PMID 34163037 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 11 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000399655 · 13,744 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GTCTCCCTCTCGCTGCCTCTGCAGAAACAGCTCCTGCCAG40
41AGCGGCGCTCGGCGCGGCGCGGCGGGCCCGGAGCGGCGGC80
81GGCGGCTCTTCCTGCCTCCGCGCCCAGGAGTTGCCGGCTC120
121CCTTTGACAGCAGAGAGCCGGGCAGGGGCCTCAGGAGGAC160
161TCGCTGGGAGTGGGCAGAGGCGCCTCGGCCCCTGCCGGCC200
201CAGGCGGGCCCCGCGCGCCCCCCGCCCCTCCTCTCCGCCT240
241CTTCTCGCCCTGCCTCTCCCGATTTATTTTTTCAAATGGT280
281GTAGCCGCCGGAGGTGCGGTGCTCAGTTCTTGGAAGGGGC320
321CCGGATGTACTGAGGATGCGTTACAGTTTCACTCGAGGAG360
361GCAGTAGTGGAAAGGAGCAGTTTTTGGGGTTTGATGCCAT400
401AATGGGAATCAGGTAATCGTCGGCGGGGAAGAAGAAACGC440
441TGCAGACCACGGCTTCCTCGAATCTTGCGCGAAAGCCGCC480
481GGCCTCGGAGGAGGGATTAATCCAGACCCGCCGGGGGGTG520
521TTTTCACATTTCTTCCTCTTCGTGGCTGCTCCTCCTATTA560
561AAACCATTTTTGGTCCATGGTCAATGAGAATACGAGGATG600
601TACATTCCAGAGGAAAACCACCAAGGTTCCAACTATGGGA640
641GCCCACGCCCCGCCCATGCCAACATGAATGCCAATGCGGC680
681AGCGGGGCTGGCCCCTGAGCACATCCCCACCCCGGGGGCT720
721GCCCTGTCGTGGCAGGCGGCCATCGACGCAGCCCGGCAGG760
761CTAAGCTGATGGGCAGCGCTGGCAATGCGACCATCTCCAC800
801AGTCAGCTCCACGCAGCGGAAGCGGCAGCAATATGGGAAA840
841CCCAAGAAGCAGGGCAGCACCACGGCCACACGCCCGCCCC880
881GAGCCCTGCTCTGCCTGACCCTGAAGAACCCCATCCGGAG920
921GGCCTGCATCAGCATTGTCGAATGGAAACCATTTGAAATA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。