基因總覽
CABP5 的正式名稱為 calcium binding protein 5,屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物描述為參與鈣離子相關調控的蛋白質,並列出與光訊號傳遞、神經傳導物質囊泡運輸及神經突延伸相關的可能功能。這些功能資訊均標示為依相似性推定;因此,對其生物學角色的描述應保留推論性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000293255 ★ | 48,029,383–48,044,079 | 6 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CABP5 的功能註解指出,它可抑制 L 型鈣離子通道的鈣依賴性失活,並使通道活化的電壓依賴性移向較去極化的膜電位。這表示 CABP5 與通道對鈣離子及膜電位變化的反應調節有關;來源未提供更詳細的作用步驟,且此功能是依相似性推定。
CABP5 也被註記為參與光訊號傳遞,同樣屬於相似性推定。資料未進一步說明它在訊號傳遞中的位置或具體分子機制,因此不能據此推演其與其他光訊號因子的關係。
此外,CABP5 可能以依賴鹽條件的方式正向調節神經傳導物質囊泡的內吞與胞吐。這項註記指出調節方向及其條件,但沒有列出鹽的種類、實驗系統或囊泡運輸的具體變化;其可能性亦為依相似性推定。
資料另指出 CABP5 可能參與神經突的延伸及網絡組織。此描述涉及神經突形態與網絡形成,但未提供相關細胞情境或作用機制,且仍屬相似性推定。整體而言,現有功能註解涵蓋離子通道調節、光訊號傳遞、囊泡運輸及神經突組織等面向,來源所列功能均不應視為已在此處直接確立。
Promoter 與基因調控
>CABP5 ENST00000293255 GRCh38 chr19:48043979-48045079 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCCACCATCTCCAGCCCCAACACCCTGGGTCATGCTGCCCCTCTATGTGGACTTCTCCTCACCCCACTA CCCCACTGGAATGCTGGCTCTCCACGCCAGATGGCCCCCAGCCCCCTCCTCCCCTAACCCTACCTAGTGT GGAGTCGCAAAACCCCTTTGGGCTTTGACACCACCATAACTTCACACCCTCCCTGACACCCCCACCTTGC TTTTTCCCTCTAAATCATTCAGGAAAGACAGAAGGAAAGAGATGAACAGAGGAAGAGCAAATGCCATGCT CTTAGTCACCGTGTACGCCCACTTCCTGAAGTCCATGCTTGCATCCTGCTCACTCTCACACATTCCCGAC TCACCCAGGAAAACTCCCTGAGGCCAGGGGTGCTGAGCTCTCCATCTCACTGCCCAGAGGCCAGTGTTGG AGTGACCCTTCACATGCTTGTTGGAACATTGAATAAATGATGCCGTCTGCTCTAATCCTCCATTTTCTTT TCTTTTTTTTCTTTTTTTTTCTTTTTTTCGAGACAGGGTCTCACTATGTCAGCCAGGCTGGAGTACAATG GTGCAATCGTAGTTCACTGCAGCCTGGAGTGCAATGGTACAATCATAGCTCACTGCAGCCTTGAACTCCT GGGCTCAAGCAATCCTCCCATCTCTGCCTTTGGAGCAGCTGGGACTACAGGTGTGTGCCACCATGCACGG CTAATTTTTTTATTTTTTGTAAAGACAGCCTCTCCGTATGTTGCTCAGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTC AAGCAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGCGCTGGGACTACAGACATGAGCACCACATCCAGCCTCTAA TCCCCATTTATAAAATGCACTTTCCAATTCCACTCTGGGGATAAAGGCGTCACAGAACCTGACTCTGCAT TTCCCCACCCATATCATTCAAGCCAGATGGGGAGGCAGGGACAGCTCTGGTCCCTCCCCAACCCGGGTAG AGATTTCCAGCCCAGCTGTCACAGCTCTAAGACACCGGGACCGAAGGAGAAGCCAAGAGAGGCAGGAAGA GGTGGCAAAGGAGTGCTGGAGAAGATAAGGAGGCTGAGCTCCGACAGGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CABP5_1 ↗ | 19:48,044,069 | 負股 | 48,044,059–48,044,118 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:173 aa
calcium binding protein 5 的蛋白質長度為 173 個胺基酸,序列註解列有四個 EF-hand 結構域:EF-hand 1 位於第 28–63 個胺基酸,EF-hand 2 位於第 82–99 個胺基酸,EF-hand 3 位於第 105–140 個胺基酸,EF-hand 4 位於第 142–173 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 CABP5 的細胞內定位標示為細胞質;來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 36 個夥伴
- ACOT11Q8WXI4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANKRD55Q3KP44 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CADPSA2RRN7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CT55Q8WUE5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IKZF3Q9UKT9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- INCA1Q0VD86 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LZTS2Q9BRK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEI4A8MW99 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NME4O00746 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAX4Q3KNR5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSMA1P25786 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RELQ04864 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SQORQ9Y6N5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TLE5Q08117-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TNNI1P19237 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VPS52Q8N1B4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB42B2RXF5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZC2HC1CQ53FD0-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZKSCAN4Q969J2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ZNF169Q14929 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
CABP5 與 CACNA1C 的互作為鈣依賴性,並透過 CACNA1C 的 C 端 CDB motif 發生。資料也列出 CABP5 與 STXBP1 及 MYO6 互作,但未說明這兩項互作的條件或機制。來源僅描述互作,未指出這些蛋白形成共同複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CABP5 被描述為可抑制 L 型鈣離子通道的鈣依賴性失活,並使通道活化的電壓依賴性移向較去極化的膜電位;資料亦指出它參與光訊號傳遞。CABP5 可能依鹽條件正向調節神經傳導物質囊泡的內吞與胞吐,並可能參與神經突延伸及網絡組織。上述功能均為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Inhibits calcium-dependent inactivation of L-type calcium channel and shifts voltage dependence of activation to more depolarized membrane potentials (By similarity). Involved in the transmission of light signals (By similarity). May positively regulate neurotransmitter vesicle endocytosis and exocytosis in a salt-dependent manner (By similarity). May play a role in the extension and network organization of neurites (By similarity) |
| 交互作用 | CABP5 與 CACNA1C 的互作具有鈣依賴性,並透過 CACNA1C 的 C 端 CDB motif 發生。資料另列出 CABP5 與 STXBP1 及 MYO6 的互作;這些互作資訊為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with CACNA1C (via C-terminal CDB motif) in a calcium-dependent manner (By similarity). Interacts with STXBP1 (By similarity). Interacts with MYO6 (By similarity) |
| 細胞定位 | CABP5 的細胞內定位註記為細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACAGCTCTAAGACACCGGGACCGAAGGAGAAGCCAAGAGA40GGCAGGAAGAGGTGGCAAAGGAGTGCTGGAGAAGATAAGG80AGGCTGAGCTCCGACAGGGAGCAGGGAGGAGGGGCCATCT120TGAGACTGGTGCCCTGCGAGCTCCACCCCACCCCTCCATG160CAGTTCCCCATGGGCCCCGCCTGCATCTTCTTGAGGAAAG200GCATTGCTGAGAAACAGCGGGAAAGACCACTGGGACAAGA240TGAGATTGAAGAGCTGCGGGAAGCATTTCTTGAGTTCGAT280AAGGACCGAGATGGGTTCATCTCTTGTAAGGATCTGGGGA320ATCTCATGAGGACGATGGGTTACATGCCCACGGAGATGGA360ACTGATTGAGCTCGGCCAGCAAATCCGCATGAACCTGGGT400GGCCGTGTAGACTTTGATGACTTTGTGGAGCTGATGACCC440CCAAATTGCTTGCAGAAACAGCTGGGATGATCGGTGTCCA480GGAGATGCGGGATGCCTTCAAGGAGTTTGACACGAATGGA520GATGGGGAGATCACCCTGGTGGAGCTACAGCAGGCCATGC560AGAGACTCCTGGGGGAGCGGCTCACCCCCCGGGAGATCTC600TGAGGTTGTCCGGGAGGCTGATGTTAATGGAGACGGCACA640GTTGACTTTGAAGAGTTTGTGAAGATGATGTCTCGCTGAG680GAGGTCCTGGAAGCTCCAGACCCTCTCCACCTGGTCAACA720TGGAGCAAGCGCTTGTGGAGAACCAAAGCCCAAAAGCCCC760AGATCCCCTTAAAGCAGAGAGGGAGGGCAGGCGGGAGGGA800GGGCATTGGCATGCGGCGCTGTGCATGGGGTGAGACCCAG840AGCGGTATCTTTGCCAGGATGGGGGCGTCTGCAGAACTAG880ATTAAGAAGGAAGAGTCTGTGGATGGAAATAGGAAGCGTG920GGAGGGTCCAGTTGCCACCCCCAAAAATTCCAATGATTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。