演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA8CARP

carbonic anhydrase 8 (inactive)

CA8 編碼 carbonic anhydrase 8 (inactive),屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族;與該家族的催化酵素不同,CA8 不具有碳酸酐酶催化活性。

Homo sapiens8q12.1UniProt P35219
OFFICIAL SYMBOL
CA8
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P35219
PDB / ALPHAFOLD
2W2J
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CA8 是人類的蛋白質編碼基因,正式名稱為 carbonic anhydrase 8 (inactive)。其產物屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,蛋白質長 290 個胺基酸。序列註解指出,蛋白質 N 端第 1 至 26 個胺基酸為無序區域,第 27 至 289 個胺基酸則屬於 Alpha-carbonic anhydrase 結構域。名稱中的 inactive 與其家族身分並存;來源明確指出,CA8 不具有碳酸酐酶催化活性。

Official symbol
CA8
Gene name
carbonic anhydrase 8 (inactive)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1382
UniProt
P35219
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CARPCA-RPCA-VIIICALS

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q12.1
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegCA8pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr8:60,185,412–60,281,573
Gene span
96,162 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000317995 ★60,185,412–60,281,4009
ENST0000086978460,185,412–60,281,5738
ENST0000086978560,185,412–60,281,5735
ENST0000094361860,185,412–60,281,5736
ENST0000094361960,185,412–60,281,5739
ENST0000113852060,185,412–60,281,5739
ENST0000094361760,187,348–60,281,5739
ENST0000093921860,204,973–60,281,5737
ENST0000093921960,204,973–60,281,5734
ENST0000111542560,204,973–60,281,5739

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CA8 的已知功能特徵之一,是不具有碳酸酐酶催化活性。雖然其蛋白質屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,不能因此將家族成員常見的催化作用歸於 CA8;目前提供的功能資料僅支持這項活性缺失,未說明 CA8 以何種分子方式參與其他生物學過程。

因此,依據現有資料,CA8 的功能描述應限於其與碳酸酐酶家族的關係,以及缺乏碳酸酐酶催化活性這項特徵。來源沒有提供其他功能機制、作用對象或生理效應,故不進一步推定其參與的途徑或生物學角色。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 60281400 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA8 ENST00000317995 GRCh38 chr8:60281300-60282400 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATAAAAAACAAATTGTACTTAAGGTCCTAACTCGAGTTTATTGTGCACATATATCTTCTAAAAATGTGG
AGTTAACCTACTTAGGGGTTACTGACCAGGGCTTTTAAAAGGCACAGGAACAGAGGGCTGAAGTCGTTAA
CACTAGACTGAGAAGCACGTTTAAGGGTAACAATGCCACCTCTTTGGATCAGAAGAGTTCCTGTTTGTTA
TGCAATGTGTGCACTTCATTATTTACACGATTTCACTAGGTGAATGGGAGCTGTGTACACAGCCAGGTGA
GCCTGCAGCAGCGCCCCAGACTCTGACAGCGAACACCCTCTGTCTACTGCCTTCTGCTAGCCCTGCTTTG
AAACAATACCCTTTTCTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAACACAACCCTAAATCATAGCTACTTCTCTAGATA
ACAACCATTTTCTTTTCTTAAACGTTTTTAGGAATTAATAGAACTTTCTTGGAAAAATTTCCAAACTCGT
TTCCACTGCGCTGAACGGACGATTTAAAAAGTAAATACTCAGAAGATACTAAGAAGATTCCGCTGGAGAG
TCTCTTTTTATTGTGTTACGGGGTCTCCTAGCCCTCTCCTTTCTCCTACCCACGGCAGCCCATCTCTCTC
CTCCAGGACCCCTTCTTTTTGGTATTTCCTGGAGTACGGATGAAAATGAATAGGTGAGCAGCCTCTGGGC
TAGGCCAGGCACACAGGGGTCCCGAGTGACCTTGGGAGACTTGCGGGCTTCTGGAAGGAAGGCTCGGGCG
GCCAAGCAGGAGTCGCCGCAGCGAGGAAGCGCCAGGAGGCGGCGGGGGCGACCCCGGGGGAAGGGCGGGC
GGGGATGCGCCGAGGTTTCCGTGACTTGGGACTAGTCGCCCCGAGGCGCATTCTAACTGTCGGCTCCCCT
GGCCCCAACGGCCAGAGAGAGAAGGGGGCGGATCCTCGCGTACCAGACACGCCCCGGTCGGGTATAAAAT
TCGCCAGGCGCTCGCTCCCCAGGCCACAGCCGCTCCCTCGCTCTGCTGGGGCCTCCGGACGCGCTTCCCA
CGCGGGTCTCTGGAACACTCGGTCCGAACGCACGCCTGCTTGCACTCACAC
CA8 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA8_1 ↗8:60,281,400負股60,281,390–60,281,449

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_5J6SB2 · CTCF_binding_site · 60281275–60281296 · regulatory

ENSR8_9TX2L · promoter · 60281390–60281890 · regulatory

· motif · 60281277–60281293 · motif

· motif · 60285033–60285046 · motif

· motif · 60285033–60285046 · motif

· motif · 60285308–60285314 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:290 aa

1 aa290 aa結構域功能區域
依 P35219 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CA8 蛋白質長 290 個胺基酸,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。其第 1 至 26 個胺基酸被註記為無序區域;第 27 至 289 個胺基酸則具有 Alpha-carbonic anhydrase 結構域註記。這些序列特徵不改變其缺乏碳酸酐酶催化活性的描述。

結構域Alpha-carbonic anhydrase27–289 aa
功能區域Disordered1–26 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2W2J…

PDB · 2W2J

X-ray · 1.60 A · A=1-290

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CARPCA8CRXGGA2HSD17B14INTS7KLHL8LMNB2LNX1MAGED1RAB34SPDL1TBX3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CA8 相關變異被指出會導致常染色體隱性脊髓小腦性共濟失調 34(SCAR34)。此病屬於臨床與遺傳異質性較高的脊髓小腦性共濟失調,與小腦退化有關,腦幹及脊髓受累程度不一。SCAR34 的描述包括先天性小腦性共濟失調、構音障礙、四足步態及智能障礙。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CA8 不具有碳酸酐酶催化活性。資料庫紀錄
證據與來源

Does not have a carbonic anhydrase catalytic activity

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯常染色體隱性脊髓小腦性共濟失調 34(SCAR34)屬於臨床與遺傳異質性較高的脊髓小腦性共濟失調,與小腦退化有關,腦幹及脊髓可能不同程度受累。其特徵包括先天性小腦性共濟失調、構音障礙、四足步態及智能障礙;此病由影響該條目所代表基因的變異所致。含實驗來源
證據與來源

Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, 34 SCAR34 A form of spinocerebellar ataxia, a clinically and genetically heterogeneous group of cerebellar disorders due to degeneration of the cerebellum with variable involvement of the brainstem and spinal cord. SCAR34 is characterized by congenital cerebellar ataxia associated with dysarthia, quadrupedal gait and intellectual disability. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613227

PMID 19461874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000317995 · 5,735 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGGCCACAGCCGCTCCCTCGCTCTGCTGGGGCCTCCGGAC40
41GCGCTTCCCACGCGGGTCTCTGGAACACTCGGTCCGAACG80
81CACGCCTGCTTGCACTCACACTGCGGTTCACACCCGGAGG120
121CGCTCTCGCACTCACACTGCCGCTCACGCGTGCTCACACT160
161CCCCCACGCGCGCTCCGCTCCGGCTCCAGCCCCGCGCCCA200
201GCGAAGGCGCAGGCACTGCTGCCGAGAGCGCCGAGGGGCC240
241CCGCGGCCTTCCCATGGCGGACCTGAGCTTCATCGAAGAT280
281ACCGTCGCCTTCCCCGAGAAGGAAGAGGATGAGGAGGAAG320
321AAGAGGAGGGTGTGGAGTGGGGCTACGAGGAAGGTGTTGA360
361GTGGGGTCTGGTGTTTCCTGATGCTAATGGGGAATACCAG400
401TCTCCTATTAACCTAAACTCAAGAGAGGCTAGGTATGACC440
441CCTCGCTGTTGGATGTCCGCCTCTCCCCAAATTATGTGGT480
481GTGCCGAGACTGTGAAGTCACCAATGATGGACATACCATT520
521CAGGTTATCCTGAAGTCAAAATCAGTTCTTTCGGGAGGAC560
561CATTGCCTCAAGGGCATGAATTTGAACTGTACGAAGTGAG600
601ATTTCACTGGGGAAGAGAAAACCAGCGTGGTTCTGAGCAC640
641ACGGTTAATTTCAAAGCTTTTCCCATGGAGCTCCATCTGA680
681TCCACTGGAACTCCACTCTGTTTGGCAGCATTGATGAGGC720
721TGTGGGGAAGCCGCACGGAATCGCCATCATTGCTCTGTTT760
761GTTCAGATAGGAAAGGAACATGTTGGCTTGAAGGCTGTGA800
801CTGAAATCCTCCAAGATATTCAGTATAAGGGGAAGTCCAA840
841AACAATACCTTGCTTTAATCCTAACACTTTATTACCAGAC880
881CCTCTGCTGCGGGATTACTGGGTGTATGAAGGCTCTCTCA920
921CCATCCCACCTTGCAGTGAAGGTGTCACCTGGATATTATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。