基因總覽
CA7 是蛋白質編碼基因,其產物為 carbonic anhydrase 7,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。此蛋白質長 264 個胺基酸,序列中第 5 至 262 位標註為 Alpha-carbonic anhydrase 結構域。現有資料將其主要角色概述為可逆催化二氧化碳水合;細胞定位資料則記載於細胞質。來源未提供更詳細的蛋白質結構或家族特性,故不延伸描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338437 ★ | 66,844,414–66,854,147 | 7 |
| ENST00001138313 | 66,844,414–66,854,153 | 7 |
| ENST00000394069 | 66,844,932–66,854,153 | 7 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
carbonic anhydrase 7 催化二氧化碳的可逆水合反應。反應可朝兩個方向進行:二氧化碳與水形成氫碳酸根及氫離子,或由氫碳酸根與氫離子生成二氧化碳和水。資料列出的反應式為 hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O,呈現該反應物與產物的轉換關係。
因此,CA7 的來源支持功能聚焦於這項可逆反應本身;現有資料未進一步說明其在特定生理過程中的作用、反應方向偏好或調控條件,也未提供更細緻的分子機制,故不據此推演其他功能意義。
Promoter 與基因調控
>CA7 ENST00000338437 GRCh38 chr16:66843414-66844514 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACCCTTGTACCCAGCACCAAGGAGAAATGGTAAAGACCCCAGTGTCAGGCCAGGAGTGGTGGCTCACTC CTCTAATCCCAACACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATTACTTGAGGCCAGAAGTTCAAGACCAGCCCA GGCAACATGGTGAAACCCCCATCTCTACAAAAAACACAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCACACACCTGT AATCCCAGCTACTTGGAAGGCTGAAGCAGAAGAATCACTTGAATCAAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCT GATATAGCACCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGACTCTGTCTAAAAACAAACAAGCAAACAAACAAACAAAC AAACAAATCCCACAAAACCCCCAGTGTCTGGAGTAAGAACCCCAGCTAATGAACCCTTTACCCCCTGGCT AGATGACCTTGGGCAAGTCACTTCACTTCTCTGGGCCTCACTCCCCTCCTCTGTCAGATAGGGCTGATGG AAGCACCCAACCTTGTAGGGTAACAGAGAGGGTTATACCATAGGAAGGACCCAAAGCTTGGTCCAGCGCC TGCAACAGCCTCTGGCAAACAGTGGAAGCTCCAGTTTTGGACACTTGATGGTCAGTGTAGTTTGCAGTTT AAAGGGGACTTTCCAACCCCAAAAGATTCAGGACCCAGAGCTCAGGTCTCTGGTGGTGGCATTTGCAGGT CTGGGGCAAGCCTAGGGAAGGGACGCCATGTGCGGCACGGGCATCTAGTGTCCCAGAGTCCGCACGGGTT GCTGGGGGAAAAAGAGGGATAGTCGCCCAGCCAGGGCAGGGGTGGGAGTTGGGGGGAGAGGGTTACTTCC TCCTGCCCTGAATCTCCGCTCGGGGTTCAACTGGCTCGCCGGCGGGCGAGGGCGGGGCAGGCCGGCCTCT CTGGCCCTGCTGGGGGGTGGGGGGCGGGTCCCCCGGGAACTGCTCCTCCCGCCAGCCGCTGCTTTAAGAG GCTGCTCCGCGGTAGCGAGCGGGGCCGGAGCCGCAGCCCGAACGAGCGGACCGAGCCGACCGGGCAGGTG CACGGCTGCGGGGACGGCAGCGGCATGACCGGCCACCACGGCTGGGGCTAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CA7_1 ↗ | 16:66,844,417 | 正股 | 66,844,368–66,844,427 |
| CA7_2 ↗ | 16:66,844,929 | 正股 | 66,844,880–66,844,939 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_9ZJCH · promoter · 66844110–66844424 · regulatory
· motif · 66841054–66841067 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:264 aa
carbonic anhydrase 7 長 264 個胺基酸,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。序列第 5 至 262 位標註為 Alpha-carbonic anhydrase 結構域;來源未提供其他功能區域或結構註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
carbonic anhydrase 7 的定位資料記載於細胞質。 來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CA7 可催化二氧化碳的可逆水合反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Reversible hydration of carbon dioxide PMID 15686895 ↗ · PMID 16686544 ↗ · PMID 16807956 ↗ · PMID 17127057 ↗ · PMID 17314045 ↗ · PMID 17705204 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗ |
| 分子活性 | hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O | 含實驗來源 | 證據與來源hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O PMID 15686895 ↗ · PMID 16686544 ↗ · PMID 16807956 ↗ · PMID 17127057 ↗ · PMID 17314045 ↗ · PMID 17705204 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗ |
| 細胞定位 | CA7 定位於細胞質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGGGCCGGAGCCGCAGCCCGAACGAGCGGACCGAGCCGAC40CGGGCAGGTGCACGGCTGCGGGGACGGCAGCGGCATGACC80GGCCACCACGGCTGGGGCTACGGCCAGGACGACGGCCCCT120CGCATTGGCACAAGCTGTATCCCATTGCCCAGGGAGATCG160CCAATCACCCATCAATATCATCTCCAGCCAGGCTGTGTAC200TCTCCCAGCCTGCAACCACTGGAGCTTTCCTATGAGGCCT240GCATGTCCCTCAGCATCACCAACAATGGCCACTCTGTCCA280GGTAGACTTCAATGACAGCGATGACCGAACCGTGGTGACT320GGGGGCCCCCTGGAAGGGCCCTACCGCCTCAAGCAGTTTC360ACTTCCACTGGGGCAAGAAGCACGATGTGGGTTCTGAGCA400CACGGTGGACGGCAAGTCCTTCCCCAGCGAGCTGCATCTG440GTTCACTGGAATGCCAAGAAGTACAGCACTTTTGGGGAGG480CGGCCTCAGCACCTGATGGCCTGGCTGTGGTTGGTGTTTT520TTTGGAGACAGGAGACGAGCACCCCAGCATGAATCGTCTG560ACAGATGCGCTCTACATGGTCCGGTTCAAGGGCACCAAAG600CCCAGTTCAGCTGCTTCAACCCCAAGTGCCTCCTGCCTGC640CAGCCGGCACTACTGGACCTACCCGGGCTCTCTGACGACT680CCCCCACTCAGTGAGAGTGTCACCTGGATTGTGCTCCGGG720AGCCCATCTGCATCTCTGAAAGGCAGATGGGGAAGTTCCG760GAGCCTGCTTTTTACCTCGGAGGACGATGAGAGGATCCAC800ATGGTGAACAACTTCCGGCCACCACAGCCACTGAAGGGCC840GCGTGGTAAAGGCCTCCTTCCGGGCCTGAGCTGCCCATCT880GCCTAGCCGGCCACTAGGGCACCATCTTCTCAAGGGCTTC920CATGTCAGCAGACACCAAACCATCTGAGGCTTCCTCCCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。