演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA6

carbonic anhydrase 6

CA6 編碼 carbonic anhydrase 6,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,可逆催化二氧化碳水合;其在唾液中的角色仍未知。

Homo sapiens1p36.23UniProt P23280
OFFICIAL SYMBOL
CA6
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P23280
PDB / ALPHAFOLD
3FE4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

carbonic anhydrase 6 是由蛋白質編碼基因 CA6 產生的蛋白質,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。來源指出其可逆催化二氧化碳水合,並註明它在唾液中的角色尚不清楚。此蛋白質序列長 308 個胺基酸,含有一段訊號序列與一個 alpha-carbonic anhydrase 結構域。

Official symbol
CA6
Gene name
carbonic anhydrase 6
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1380
UniProt
P23280
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.23
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegCA6pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:8,945,867–8,975,092
Gene span
29,226 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000377443 ★8,945,868–8,975,0928
ENST000005497788,945,867–8,967,7456
ENST000004801868,945,868–8,952,6513
ENST000003774368,945,887–8,974,4448
ENST000003774428,945,887–8,974,7047

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

carbonic anhydrase 6 的功能是可逆催化二氧化碳水合。來源所列反應式為 hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O,表示此反應可朝兩個方向進行:碳酸氫根與氫離子可生成二氧化碳和水,反向則對應二氧化碳的水合。來源沒有提供反應速率或其他反應條件,因此不能進一步描述其催化效率或特定環境下的作用。

雖然此蛋白質被稱為 salivary carbonic anhydrase,但現有資料明確指出,它在唾液中的生理角色仍未知。因而可確認的是其可逆催化反應,而非其在唾液內所參與的特定生物學過程或功能結果;來源也未交代這項反應對唾液性質或其他生理活動的影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 8945868 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA6 ENST00000377443 GRCh38 chr1:8944868-8945968 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACCGCTAACATCCTTGTTGTGAAGGCCTGCTGACGTTTGCCATTCCAGGACCAAGTGGACAATGAGTTA
AGCTAGGCCAGGAGGGGGTTCAGCTCCCCATAACAAGGCAGGGGTGGCCCTTTGTGTCCGGCAGCATGGT
AGCCCCCCCGCAGGAGCTCCGGCTACCCTTTGTGTTTGACCTTGTGGAAGGGCATGGGAAATGCTGGCCT
GTCAGCAGGCATAAACTCAAAAGTTTCTCCTTCAGCTAATTTCAGGGACTGTCTAGCCAAGTGAATACAC
AGGATTAGGTAATCCATGGATCCTGCGAGGGCAATTGGCTGATTGGCTTAGGTGTGCCCAAGAGCCCTGC
AGGTGTCAGAACAAATCCATGTAGAAATGCAGACGCCCACACCAGCTTGAATGGCATAAAGGCACACATT
GGAATGTGGCTCATGAGCTGGGACCCAGGATCAACCACTGGTTTAAGGAGAGGACCGTGAAATGTCCAAA
CATGGAGGCCAGGCCACCTCCCTGGATGCCTGGCTGAGGGCAGCCACATGTCTGCAGCGGTGGCTTGTGT
CCATGACTGAGATGGGCAGGGTTTGCAGGCAGTGGTGATCCCATCAGCAGTCCCCAGATCTCTAATGTCA
GGAGAAAGAGCATGGGAAGTCCGACGTCCAGGAAAGTCTTTCATCCTGCTTCTCCCTGCCTTGGGCCTTT
TCCCATTTCCGCGGTCACCTGTCCACAATGGCTGCACTGTGTGGCTCTTCAGGTGTTCCTAAGACACTGA
ACAACCAAACCCATGGACTGACCGGATATGAAATTGACGTGGGAGGAGATCAGGCAGGTGCTGGGGCTGC
CTGGCGCAATGCACGGAGCCAGAAGTGCTGTTATGGGGAGGGTGTTATTGTTTTAGTGGGTGCAGCAAAG
GGTGGTTTAGCCAGCTGGGCAGATCAATTGTAAATTGTTATTTACAGTTTCTGAGCCTTTAAAAGAAGAG
CTTCGCCGGAATCAGTCTTCATTACAGATGTGCAGCACCATGAGGGCCCTGGTGCTTCTGCTGTCCCTGT
TCCTGCTGGGTGGCCAGGCCCAGCATGTGTCTGACTGGACCTACTCAGGTG
CA6 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA6_1 ↗1:8,945,868正股8,945,819–8,945,878

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_95JSD · enhancer · 8941859–8942142 · regulatory

ENSR1_B3QWX · enhancer · 8943487–8944053 · regulatory

ENSR1_894QT · enhancer · 8947278–8947447 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:308 aa

1 aa308 aa結構域訊號胜肽
依 P23280 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

carbonic anhydrase 6 長 308 個胺基酸。其 N 端第 1–17 位胺基酸被註解為訊號序列;第 21–278 位則構成 Alpha-carbonic anhydrase 結構域。此蛋白質屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。

訊號胜肽1–17 aa
結構域Alpha-carbonic anhydrase21–278 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3FE4…

PDB · 3FE4

X-ray · 1.90 A · A/B=21-290

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

carbonic anhydrase 6 的定位註解為分泌型;來源未提供其他定位資訊或定位改變的條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CA6CA6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能carbonic anhydrase 6 可逆催化二氧化碳水合;但來源指出其在唾液中的角色仍未知,未說明該蛋白質在唾液中的具體功能。含實驗來源
證據與來源

Reversible hydration of carbon dioxide. Its role in saliva is unknown

PMID 17228881 ↗ · PMID 17314045 ↗ · PMID 17705204 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O含實驗來源
證據與來源

hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O

PMID 17228881 ↗ · PMID 17314045 ↗ · PMID 17705204 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

PMID 1899030 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000377443 · 1,334 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTACAGATGTGCAGCACCATGAGGGCCCTGGTGCTTCTG40
41CTGTCCCTGTTCCTGCTGGGTGGCCAGGCCCAGCATGTGT80
81CTGACTGGACCTACTCAGAAGGGGCACTGGACGAAGCGCA120
121CTGGCCACAGCACTACCCCGCCTGTGGGGGCCAGAGACAG160
161TCGCCTATCAACCTACAGAGGACGAAGGTGCGGTACAACC200
201CCTCCTTGAAGGGGCTCAATATGACAGGCTATGAGACCCA240
241GGCAGGGGAGTTCCCCATGGTCAACAATGGCCACACAGTG280
281CAGATCAGCCTGCCCTCCACCATGCGCATGACAGTGGCTG320
321ACGGCACTGTATACATAGCCCAGCAGATGCACTTTCACTG360
361GGGAGGTGCGTCCTCGGAGATCAGCGGCTCTGAGCACACC400
401GTGGACGGGATCAGACATGTGATCGAGATTCACATTGTTC440
441ACTACAATTCTAAATACAAGAGCTATGATATAGCCCAAGA480
481TGCGCCGGATGGTTTGGCTGTACTGGCAGCCTTCGTTGAG520
521GTGAAGAATTACCCTGAAAACACTTATTACAGCAACTTCA560
561TTTCTCATCTGGCCAACATCAAGTACCCAGGACAAAGAAC600
601AACCCTGACTGGCCTTGACGTTCAGGACATGCTGCCCAGG640
641AACCTCCAGCACTACTACACCTACCATGGCTCACTCACCA680
681CGCCTCCCTGCACTGAGAACGTCCACTGGTTTGTGCTGGC720
721AGATTTTGTCAAGCTCTCCAGGACACAGGTTTGGAAGCTG760
761GAGAATTCCTTACTGGATCACCGCAACAAGACCATCCACA800
801ACGATTACCGCAGGACCCAGCCCCTGAACCACAGAGTGGT840
841GGAATCCAACTTCCCGAATCAGGAATACACTCTAGGCTCT880
881GAATTCCAGTTTTACCTACATAAGATTGAGGAAATTCTTG920
921ACTACTTAAGAAGAGCATTGAACTGAGGAAAGCTAAGAGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。