演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA3Car3

carbonic anhydrase 3

CA3(carbonic anhydrase 3)是 alpha-carbonic anhydrase 家族的蛋白質,參與二氧化碳的可逆水合反應。

Homo sapiens8q21.2UniProt P07451
OFFICIAL SYMBOL
CA3
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P07451
PDB / ALPHAFOLD
1Z93
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CA3(carbonic anhydrase 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。其蛋白質長 260 個胺基酸,主要由 alpha-carbonic anhydrase 結構域構成;來源註記此結構域涵蓋第 3 至第 259 個胺基酸。另有一段與質子轉移有關的區域,位於第 64 至第 67 個胺基酸。這些序列特徵與其參與的可逆二氧化碳水合反應相符。

Official symbol
CA3
Gene name
carbonic anhydrase 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1374
UniProt
P07451
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Car3CAIII

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q21.2
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegCA3pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:85,373,436–85,449,045
Gene span
75,610 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000285381 ★85,438,859–85,449,0407
ENST0000052092185,373,436–85,442,1304
ENST0000096772185,438,858–85,449,0457
ENST0000096772285,438,858–85,449,0456
ENST0000113503585,438,858–85,449,0457

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CA3 的功能與二氧化碳的可逆水合有關。此反應可由兩個方向表述:二氧化碳與水之間可逆轉換,或由碳酸氫根與氫離子生成二氧化碳和水。這些描述指向同一可逆反應,並未提供其他生物學過程或條件的細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 85438859 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA3 ENST00000285381 GRCh38 chr8:85437859-85438959 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATTCTGTAAATCTTTCCCTCTTTCTTTTCTTGCAATCTCTCATTGTATCTTGGAGAGCAAGACCACAGGT
TTTAAGAAATATGACTCATTTTATGTTAGTGGCCTTCCAATACTTCAGAATATTCTTGATTTTTCATGAA
CAGAGGTACAGCTCAGGGAGTGTGGCTAAATCAGTCCCAGTCTCCAGCTCCGCGTGAACCTGGGATCCAG
ACATCTCCTGGATATCTGGCGCTCTCTGAGATCCAGCCCTCGGTTTCCTGCAAGCCAAAAGGATCCGCTA
GGTTGGGAAATGCCGCCTGGTGCGATTCCAGAAAGGGCCATCTCTTTAAGGATAACGGACTTGGAGGGCC
TCTTCACCCTCTCACCCTGCTCCGGACCCTTTCTTCCCATCCTTTGCTCCTAGGATTTTACATGTTGCCT
GCAAAGGGAGTCAAACTTAGGGGGCAGGCAAACAAACGAGTTCTTTCCAGCCTCTGTAACCGGATCGCTA
GAGCGAAATAAACTCGCACAAGTGTCCAGAGATCGTAGCCAGACAGCCAGCCTGCGCTTGAAGCAACTTT
TAAGTGAGGCTGCAAGAGCCGCCGGGATGTAGATTTTAGTTCGTGGCCAAGCACAACTACGACACCCTGT
CCCTGCCCCCACCCCATCCCCAAGAATGCATGGAGGAAGGAGAGAGGACGAGGTGAGGGCCGCCTGCATT
TCTGCACGTCGGCGCCGGTTAGAAACCCTGCAGTTTTGAGAGAGAAGAAGAGGAGATGGAGGGGCCAGGA
GCCACGACTCCCGGGAGAGCGCAGGGAGGGGCGTGGGTGCCCCTTCGCCCACCTCCGCCCCCGTCACCTC
GACAGCTGTCCCGCTCTTGGAATTCATTGGCTTCCTCTACCCGGCCTCCCAAACACCACCCCAATCTAGT
TTAGCCCCCCGCCCCACCCTCGCTGACCTAATAAGGCCATGCAGTGTGCGGGGGAGCTACATAAAAGCGC
GGGCTCGCGGCGACTCTGCACCACGCAGGGGAAGAGAAAGCAGGAGCCGTCCAGCACGGAGGAAGGCGAC
CATGGCCAAGGAGTGGGGCTACGCCAGTCACAACGGTGAGTGCAGGCAGCC
CA3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA3_1 ↗8:85,438,859正股85,438,810–85,438,869

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_84HS74 · enhancer · 85435823–85436007 · regulatory

ENSR8_84HS7X · enhancer · 85437296–85437539 · regulatory

ENSR8_938WLS · promoter · 85438369–85438869 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:260 aa

1 aa260 aa結構域功能區域
依 P07451 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CA3 蛋白質長 260 個胺基酸,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。其 alpha-carbonic anhydrase 結構域涵蓋第 3 至第 259 個胺基酸;第 64 至第 67 個胺基酸則被註記為參與質子轉移的區域。

結構域Alpha-carbonic anhydrase3–259 aa
功能區域Involved in proton transfer64–67 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1Z93…

PDB · 1Z93

X-ray · 2.10 A · A=1-260

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Car3CA3HPCAL1LXN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CA3 參與二氧化碳的可逆水合反應;此描述僅指出反應具有可逆性,未提供額外的作用條件或生物學情境。含實驗來源
證據與來源

Reversible hydration of carbon dioxide

PMID 16042381 ↗ · PMID 17427958 ↗ · PMID 17826101 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O含實驗來源
證據與來源

hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O

PMID 16042381 ↗ · PMID 17427958 ↗ · PMID 17826101 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位CA3 的細胞內定位為細胞質;此定位描述未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

PMID 17826101 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000285381 · 1,721 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCACGCAGGGGAAGAGAAAGCAGGAGCCGTCCAGCACGGA40
41GGAAGGCGACCATGGCCAAGGAGTGGGGCTACGCCAGTCA80
81CAACGGTCCTGACCACTGGCATGAACTTTTCCCAAATGCC120
121AAGGGGGAAAACCAGTCGCCCGTTGAGCTGCATACTAAAG160
161ACATCAGGCATGACCCTTCTCTGCAGCCATGGTCTGTGTC200
201TTATGATGGTGGCTCTGCCAAGACCATCCTGAATAATGGG240
241AAGACCTGCCGAGTTGTATTTGATGATACTTATGATAGGT280
281CAATGCTGAGAGGGGGTCCTCTCCCTGGACCCTACCGACT320
321TCGCCAGTTTCATCTTCACTGGGGCTCTTCGGATGATCAT360
361GGCTCTGAGCACACCGTGGATGGAGTCAAGTATGCAGCGG400
401AGCTTCATTTGGTTCACTGGAACCCGAAGTATAACACTTT440
441TAAAGAAGCCCTGAAGCAGCGCGATGGGATCGCTGTGATT480
481GGCATTTTTCTGAAGATAGGACATGAGAATGGCGAGTTCC520
521AGATTTTCCTTGATGCATTGGACAAGATTAAGACAAAGGG560
561CAAGGAGGCGCCCTTCACAAAGTTTGACCCATCCTGCCTG600
601TTCCCGGCATGCCGGGACTACTGGACCTACCAGGGCTCAT640
641TCACCACGCCGCCCTGCGAGGAATGCATTGTGTGGCTGCT680
681GCTGAAGGAGCCCATGACCGTGAGCTCTGACCAGATGGCC720
721AAGCTGCGGAGCCTCCTCTCCAGTGCTGAGAACGAGCCCC760
761CAGTGCCTCTTGTGAGCAACTGGCGACCTCCACAGCCTAT800
801CAATAACAGGGTGGTGAGAGCTTCCTTCAAATGAGGCTGC840
841TGGATCTTGCCCTCTTCAGGAAAGGAAACCTACCATTGGA880
881GAGCTTGGTTCCTTGCCTCCTTCTGGTGCTCCTTACTCCA920
921AGTCTATTTCATTTTTCCACACTGAGCAATGAATGTGAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。