演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA2Car2

carbonic anhydrase 2

CA2 編碼 carbonic anhydrase 2,屬於 α-carbonic anhydrase 家族,催化二氧化碳與碳酸氫根之間的可逆轉換,並參與骨吸收及多種生理調節。

Homo sapiens8q21.2UniProt P00918
OFFICIAL SYMBOL
CA2
CHROMOSOME
8
UNIPROT
P00918
PDB / ALPHAFOLD
12CA
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CA2(carbonic anhydrase 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 α-carbonic anhydrase 家族。成熟蛋白長 260 個胺基酸,主要結構區域為 Alpha-carbonic anhydrase domain,涵蓋第 3 至 259 個胺基酸。這類酵素以催化二氧化碳相關反應為核心特性;CA2 的酵素作用具有可逆性,並能在特定條件下催化其他底物反應。除酵素功能外,來源也指出 CA2 參與骨吸收、眼前房液體分泌調節及十二指腸上段絨毛上皮的細胞內 pH 調節,顯示其作用不只限於單一生理情境。

Official symbol
CA2
Gene name
carbonic anhydrase 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1373
UniProt
P00918
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Car2CA-IICAII

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q21.2
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegCA2pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:85,463,860–85,481,493
Gene span
17,634 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000285379 ★85,464,007–85,481,4937
ENST0000096003085,464,005–85,481,4937
ENST0000113329285,464,005–85,481,4937

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CA2 的主要酵素作用是催化二氧化碳的可逆水合反應。反應可朝不同方向進行:碳酸氫根與氫離子可轉變為二氧化碳與水,反向則為二氧化碳水合。這項可逆反應使 CA2 能參與細胞內酸鹼相關化學轉換;來源並指出,CA2 對十二指腸上段絨毛上皮在質子耦合胜肽吸收期間的細胞內 pH 調節有所貢獻。

CA2 也能催化氰胺水合生成尿素,這是不同於二氧化碳轉換的另一項酵素活性。其金屬需求以鋅為主;鈷(II)可在較低效率下取代鋅,而銅(II)、鎳(II)及錳(II)不能作為替代金屬。這些底物與金屬使用特性描述了 CA2 催化反應的範圍與條件。

在膜運輸相關作用中,CA2 會促進 SLC26A6 的氯離子-碳酸氫根交換活性。CA2 與 SLC26A6 在細胞膜表面共定位,形成碳酸氫根運輸代謝體;兩者關聯不只涉及位置,也與運輸活性相連。CA2 亦與 SLC4A7 的運輸活性調節有關,並與 SLC4A4 互作。

CA2 對骨吸收與破骨細胞分化是必要的。來源將其與骨吸收相連,並指出此酵素亦參與眼前房液體分泌的調節。這些功能使 CA2 的作用延伸至骨組織相關過程及體液調節,但來源未進一步描述其中的分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 85464007 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA2 ENST00000285379 GRCh38 chr8:85463007-85464107 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTGAATGATTCCTAGGTATGCCAGATGCCAATTTTTCTTGGCCAGCCAGGGAACGTCTCATGTCTTTGGA
AGAAATTATCTTTCTCTTACTGGATTCTTCTGAGAAAAGTGATTTGTTAAAAGTTTTGGTTATTTCAAAT
CAATATGTACTCAACTAGGACGTCTCCTCACCCACGTTAATTTTTTAAAGAGGAGGAAAGTAGGAGAAGA
TGAGCGCTTCATGTAAGGCTCTGCCAGCCTACGAGGAAATGCAATCCTCCAGGCTCGCCCGAGCGTGGGC
TGCGGGCAGGGGACTGTGGGGCCGTTGTCTCGTTTTATTCCACGGCCGTGCAGCAGAGGGCGCGTGCCTC
TCAGCACTCATGCTGCGCGCTCCCCTGCGCCTCTAGGATCGTATCCCTATTTGCCCCAAGGTCATAGCTC
CTAACCCAGCTTGCCAGCCCCAGGCCGGGGACACCAGAGACTGAGCCCTTCGCGCTGGAGACCCCGGCGC
GGGTGGGGCGGGAGGGCTCCGGGGCCAAGAGACAGGTCACAATGGGGACAGGGGACGAAAGGCGCCGGGG
GTCCGGGTCCCGAGCAGTCCCCGCCGCCGCCAGACTCCGCAGCCGGGAGGGGGATGGGGTGCGCGTAGAG
GCTCCGCGGCCCGGGTTGGACGGAGGAGCCCAGGAGCCACCGCAGCCGCCGCACGCCCAGAGCTCCGAGC
TTCGCTGCCAGCCCAGGACACCGGGGCCCTGCCGTGGGCCGAGGGGAGCCGGGCGGCGGGAGAGGAGCCC
CGGAGCCCCGGAGCCCCGGAGCCCCGCCGGGCGCCAGCCGAGAGGGCGTTTTCCCCGCCCCCGGAGACTC
GCCCGCCCGGCCCGCCCCGCCCCGAGCGCGGGGAGTTCACCTCCGCCCGTCACCACCTCCCCTTGTCGCC
TAGGTCCACCCGAGCCCCCTCCCCCGGGCCGCCCCCGAGCACGAAGTTGGCGGGAGCCTATAAAAGCTGG
TGCCGGCGCGACCCGCGGACACACAGTGCAGGCGCCCAAGCCGCCGCCGCCAGATCGGTGCCGATTCCTG
CCCTGCCCCGACCGCCAGCGCGACCATGTCCCATCACTGGGGGTACGGCAA
CA2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA2_2 ↗8:85,463,349正股85,463,300–85,463,359
CA2_3 ↗8:85,463,765正股85,463,716–85,463,775
CA2_1 ↗8:85,464,007正股85,463,958–85,464,017

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_938WST · enhancer · 85459368–85459762 · regulatory

ENSR8_938WTJ · enhancer · 85461723–85462009 · regulatory

ENSR8_938WTX · enhancer · 85463006–85463457 · regulatory

ENSR8_5Q4Q7L · CTCF_binding_site · 85463332–85463353 · regulatory

ENSR8_BLXXJ · promoter · 85463458–85464017 · regulatory

ENSR8_938WW8 · enhancer · 85464018–85464409 · regulatory

ENSR8_938WWC · promoter · 85464410–85464910 · regulatory

· motif · 85462094–85462109 · motif

· motif · 85462095–85462109 · motif

· motif · 85462096–85462109 · motif

· motif · 85463334–85463350 · motif

· motif · 85463412–85463424 · motif

· motif · 85467025–85467038 · motif

· motif · 85467025–85467038 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:260 aa

1 aa260 aa結構域
依 P00918 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CA2 蛋白長 260 個胺基酸,屬於 α-carbonic anhydrase 家族。其 Alpha-carbonic anhydrase domain 位於第 3 至 259 個胺基酸,幾乎涵蓋整條蛋白序列。

結構域Alpha-carbonic anhydrase3–259 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 12CA…

PDB · 12CA

X-ray · 2.40 A · A=1-260

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cell membrane

CA2 位於細胞質與細胞膜;在細胞膜表面與 SLC26A6 共定位,形成碳酸氫根運輸代謝體。 於 phorbol myristate acetate(PMA)誘導的細胞中,PKC 會使 CA2 離開細胞膜的細胞質側。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Car2CA2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

CA2 與 SLC4A4 互作,並與 SLC4A7 互作以調節其運輸活性。CA2 也透過 C 端細胞質區域與 SLC26A6 isoform 4 互作;CA2 和 SLC26A6 在細胞膜表面共定位並形成碳酸氫根運輸代謝體,CA2 亦能促進 SLC26A6 的氯離子-碳酸氫根交換活性。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CA2 基因變異可導致常染色體隱性遺傳骨硬化症 3 型(OPTB3)。此罕見疾病與未成熟骨吸收缺陷及骨密度異常增高有關;來源並指出 OPTB3 可伴隨腎小管性酸中毒、腦鈣化,部分病例也有智能障礙。隱性骨硬化症常在嬰兒早期發病,可能出現巨頭、餵食困難、逐漸發生的失明與失聰、骨髓衰竭、嚴重貧血及肝脾腫大;失明與失聰通常被認為是神經受壓所致。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

7 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 7 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CA2 催化二氧化碳的可逆水合,也可催化氰胺水合生成尿素。它能促進 SLC26A6 的氯離子-碳酸氫根交換活性,且對骨吸收與破骨細胞分化不可或缺;另參與眼前房液體分泌調節,以及質子耦合胜肽吸收期間十二指腸上段絨毛上皮的細胞內 pH 調節。含實驗來源
證據與來源

Catalyzes the reversible hydration of carbon dioxide. Can also hydrate cyanamide to urea. Stimulates the chloride-bicarbonate exchange activity of SLC26A6. Essential for bone resorption and osteoclast differentiation. Involved in the regulation of fluid secretion into the anterior chamber of the eye. Contributes to intracellular pH regulation in the duodenal upper villous epithelium during proton-coupled peptide absorption

PMID 10550681 ↗ · PMID 11015219 ↗ · PMID 11327835 ↗ · PMID 11802772 ↗ · PMID 11831900 ↗ · PMID 12056894 ↗ · PMID 12171926 ↗ · PMID 1336460 ↗ · PMID 14736236 ↗ · PMID 15300855 ↗ · PMID 15453828 ↗ · PMID 15667203 ↗ · PMID 15865431 ↗ · PMID 15990874 ↗ · PMID 16106378 ↗ · PMID 16214338 ↗ · PMID 16290146 ↗ · PMID 16686544 ↗ · PMID 16759856 ↗ · PMID 16807956 ↗ · PMID 17127057 ↗ · PMID 17251017 ↗ · PMID 17314045 ↗ · PMID 17330962 ↗ · PMID 17346964 ↗ · PMID 17540563 ↗ · PMID 17588751 ↗ · PMID 17705204 ↗ · PMID 18024029 ↗ · PMID 18162396 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O含實驗來源
證據與來源

hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O

PMID 11327835 ↗ · PMID 11802772 ↗ · PMID 11831900 ↗ · PMID 12056894 ↗ · PMID 12171926 ↗ · PMID 1336460 ↗ · PMID 14736236 ↗ · PMID 15300855 ↗ · PMID 15453828 ↗ · PMID 15667203 ↗ · PMID 15865431 ↗ · PMID 16106378 ↗ · PMID 16214338 ↗ · PMID 16290146 ↗ · PMID 16686544 ↗ · PMID 16759856 ↗ · PMID 16807956 ↗ · PMID 17127057 ↗ · PMID 17251017 ↗ · PMID 17314045 ↗ · PMID 17330962 ↗ · PMID 17346964 ↗ · PMID 17540563 ↗ · PMID 17588751 ↗ · PMID 17705204 ↗ · PMID 18024029 ↗ · PMID 18162396 ↗ · PMID 18266323 ↗ · PMID 18374572 ↗ · PMID 18481843 ↗

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分子活性urea = cyanamide + H2O含實驗來源
證據與來源

urea = cyanamide + H2O

PMID 10550681 ↗ · PMID 11015219 ↗

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分子活性CA2 的金屬需求以鋅為主;鈷(II)可在較低效率下替代鋅,但銅(II)、鎳(II)與錳(II)不能作為替代金屬。資料庫紀錄
證據與來源

Zinc. Can also use cobalt(II) with lower efficiency, but not copper(II), nickel(II) and manganese(II).

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交互作用CA2 與 SLC4A4 互作,也與 SLC4A7 互作並調節其運輸活性。CA2 另透過其 C 端細胞質區域與 SLC26A6 isoform 4 互作。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SLC4A4. Interaction with SLC4A7 regulates SLC4A7 transporter activity. Interacts with SLC26A6 isoform 4 (via C-terminus cytoplasmic domain)

PMID 14567693 ↗ · PMID 14736710 ↗ · PMID 15218065 ↗ · PMID 15990874 ↗

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細胞定位CA2 位於細胞質及細胞膜,並在細胞膜表面與 SLC26A6 共定位以形成碳酸氫根運輸代謝體。在 PMA 誘導的細胞中,PKC 會使 CA2 從細胞膜的細胞質側移開。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Cell membrane; Colocalized with SLC26A6 at the surface of the cell membrane in order to form a bicarbonate transport metabolon. Displaced from the cytosolic surface of the cell membrane by PKC in phorbol myristate acetate (PMA)-induced cells

PMID 15990874 ↗

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疾病關聯CA2 基因變異可造成常染色體隱性遺傳骨硬化症 3 型(OPTB3),其特徵包括未成熟骨吸收缺陷與骨密度異常增高。此病可伴隨腎小管性酸中毒、腦鈣化,部分病例有智能障礙;隱性骨硬化症常於嬰兒早期出現,可能伴有巨頭、餵食困難、漸進性失明與失聰、骨髓衰竭、嚴重貧血及肝脾腫大。失明與失聰通常被認為與神經受壓有關。含實驗來源
證據與來源

Osteopetrosis, autosomal recessive 3 OPTB3 A rare genetic disease characterized by abnormally dense bone, due to defective resorption of immature bone. Osteopetrosis occurs in two forms: a severe autosomal recessive form occurring in utero, infancy, or childhood, and a benign autosomal dominant form occurring in adolescence or adulthood. Recessive osteopetrosis commonly manifests in early infancy with macrocephaly, feeding difficulties, evolving blindness and deafness, bone marrow failure, severe anemia, and hepatosplenomegaly. Deafness and blindness are generally thought to represent effects of pressure on nerves. OPTB3 is associated with renal tubular acidosis, cerebral calcification (marble brain disease) and in some cases with intellectual disability. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 259730

PMID 15300855 ↗ · PMID 1542674 ↗ · PMID 1928091 ↗ · PMID 8834238 ↗ · PMID 9143915 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 7 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000285379 · 1,562 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACACAGTGCAGGCGCCCAAGCCGCCGCCGCCAGATCGGTG40
41CCGATTCCTGCCCTGCCCCGACCGCCAGCGCGACCATGTC80
81CCATCACTGGGGGTACGGCAAACACAACGGACCTGAGCAC120
121TGGCATAAGGACTTCCCCATTGCCAAGGGAGAGCGCCAGT160
161CCCCTGTTGACATCGACACTCATACAGCCAAGTATGACCC200
201TTCCCTGAAGCCCCTGTCTGTTTCCTATGATCAAGCAACT240
241TCCCTGAGGATCCTCAACAATGGTCATGCTTTCAACGTGG280
281AGTTTGATGACTCTCAGGACAAAGCAGTGCTCAAGGGAGG320
321ACCCCTGGATGGCACTTACAGATTGATTCAGTTTCACTTT360
361CACTGGGGTTCACTTGATGGACAAGGTTCAGAGCATACTG400
401TGGATAAAAAGAAATATGCTGCAGAACTTCACTTGGTTCA440
441CTGGAACACCAAATATGGGGATTTTGGGAAAGCTGTGCAG480
481CAACCTGATGGACTGGCCGTTCTAGGTATTTTTTTGAAGG520
521TTGGCAGCGCTAAACCGGGCCTTCAGAAAGTTGTTGATGT560
561GCTGGATTCCATTAAAACAAAGGGCAAGAGTGCTGACTTC600
601ACTAACTTCGATCCTCGTGGCCTCCTTCCTGAATCCTTGG640
641ATTACTGGACCTACCCAGGCTCACTGACCACCCCTCCTCT680
681TCTGGAATGTGTGACCTGGATTGTGCTCAAGGAACCCATC720
721AGCGTCAGCAGCGAGCAGGTGTTGAAATTCCGTAAACTTA760
761ACTTCAATGGGGAGGGTGAACCCGAAGAACTGATGGTGGA800
801CAACTGGCGCCCAGCTCAGCCACTGAAGAACAGGCAAATC840
841AAAGCTTCCTTCAAATAAGATGGTCCCATAGTCTGTATCC880
881AAATAATGAATCTTCGGGTGTTTCCCTTTAGCTAAGCACA920
921GATCTACCTTGGTGATTTGGACCCTGGTTGCTTTGTGTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。