演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA12HsT18816

carbonic anhydrase 12

CA12(carbonic anhydrase 12)是 alpha-carbonic anhydrase 家族的膜蛋白,可逆地催化二氧化碳水合。

Homo sapiens15q22.2UniProt O43570
OFFICIAL SYMBOL
CA12
CHROMOSOME
15
UNIPROT
O43570
PDB / ALPHAFOLD
1JCZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CA12 是一種蛋白質編碼基因,其產物 carbonic anhydrase 12 屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。此蛋白質長 354 個胺基酸,具有 Alpha-carbonic anhydrase 結構域,並含有跨膜區段;其結構包含細胞外與細胞質區域。

Official symbol
CA12
Gene name
carbonic anhydrase 12
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1371
UniProt
O43570
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HsT18816

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1515q22.2
chr15 · 101,991,189 bp · GRCh38chr15p13 · 1–4200000 · gvarchr15p12 · 4200001–9700000 · stalkchr15p11.2 · 9700001–17500000 · gvarchr15p11.1 · 17500001–19000000 · acenchr15q11.1 · 19000001–20500000 · acenchr15q11.2 · 20500001–25500000 · gnegchr15q12 · 25500001–27800000 · gpos50chr15q13.1 · 27800001–30000000 · gnegchr15q13.2 · 30000001–30900000 · gpos50chr15q13.3 · 30900001–33400000 · gnegchr15q14 · 33400001–39800000 · gpos75chr15q15.1 · 39800001–42500000 · gnegchr15q15.2 · 42500001–43300000 · gpos25chr15q15.3 · 43300001–44500000 · gnegchr15q21.1 · 44500001–49200000 · gpos75chr15q21.2 · 49200001–52600000 · gnegchr15q21.3 · 52600001–58800000 · gpos75chr15q22.1 · 58800001–59000000 · gnegchr15q22.2 · 59000001–63400000 · gpos25chr15q22.31 · 63400001–66900000 · gnegchr15q22.32 · 66900001–67000000 · gpos25chr15q22.33 · 67000001–67200000 · gnegchr15q23 · 67200001–72400000 · gpos25chr15q24.1 · 72400001–74900000 · gnegchr15q24.2 · 74900001–76300000 · gpos25chr15q24.3 · 76300001–78000000 · gnegchr15q25.1 · 78000001–81400000 · gpos50chr15q25.2 · 81400001–84700000 · gnegchr15q25.3 · 84700001–88500000 · gpos50chr15q26.1 · 88500001–93800000 · gnegchr15q26.2 · 93800001–98000000 · gpos50chr15q26.3 · 98000001–101991189 · gnegCA12pq1 bp101,991,189 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr15:63,321,378–63,382,252
Gene span
60,875 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000178638 ★63,321,378–63,381,84611
ENST0000034436663,321,378–63,382,09710
ENST0000042226363,321,378–63,382,0979
ENST0000090786763,321,378–63,382,09710
ENST0000090786863,321,378–63,382,09710
ENST0000090786963,321,378–63,382,09711
ENST0000090787063,321,378–63,382,09711
ENST0000092504663,321,378–63,382,09710
ENST0000100738863,321,378–63,382,09710
ENST0000100739163,321,378–63,382,0979
ENST0000113531263,321,378–63,382,09711
ENST0000110559063,371,838–63,382,0972

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

carbonic anhydrase 12 催化二氧化碳的可逆水合反應。此反應可表示為 hydrogencarbonate 與 H(+) 生成 CO2 和 H2O;因此,反應方向亦可逆轉,使二氧化碳與水生成 hydrogencarbonate 和 H(+)。來源支持其具有這項催化功能,但未提供更進一步的作用機制或特定生物學情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 63381846 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA12 ENST00000178638 GRCh38 chr15:63381746-63382846 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCAGGAGAATCGCTTGAACCCGTGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGACCATGCCACTGCATTTCAGCC
TGGGCGACAGAGGGAGACTCCGTCTGAACAAACAAACAAACAAACAACTCCCGGAATGCTTGGGGAGACT
GATTTGAGTACTGGAATCCCAGTACTTTAGGAGGCCAAGGTAGGTGGATCATTTGAGGTCAGGAGTTCCA
GACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAATTAGAAAAATTAGCCGGGTGTGGTGGTG
GGCGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCCAAGGCAGGTGAATTATCTGAGGTCGGGAGTTTAAGGCCA
GCCTTAAACTGGCGAAACCCCGCCTCTACTAAAAATACAAAAATTATCTGGGCATGGTGGCATGTGCCTG
TAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGC
CGAGATCACGCTATTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAACAAACAAACAAAGGA
ACGAAAACCTCCGGTCTCCGGCACGGCAAGCTCTGCGTGAATTACTTTCTCCATTGCAACTCCCCTGTCT
TGATAAATGGGCTCTGTCTAAGCAGCGGGCAAGGTGAACTCGTTGGGCTGTTACAGGACCAGTGACAGAC
CAAGGGCATGCCACTGAAGGAATCCCTAGACGCACCCTTCTGGATGTGAGACAGGCGGATCTCACCCACG
CCTGCCAGCAGCTCCTCGGAGAACTGTGTTCCTGGGTCAGCCCTGGCCCAGAGGAGCGCCGGGGACCCGC
AGAGTGCTGCTGAAGTCAAGGCTACAACTCACCTAGGATCTGGGGCGCCAGCCCTCCGGTGGGCAGGGCG
TTCTCCTCCCCCACCCCCTCCCCGCACGATGACATCAAGTGTTTGGCGTTGAGTTGCTCCATAAAAGCTG
CCCGGGGAAGCCAGGAGAGCGAAGGGCGGACGTACTCGCCACGGCACCCAGGCTGCGCGCACGCGGTCCC
GGTGTGCAGCTGGAGAGCGAGCGGCCACCGGGAGCCCCCGGCACAGCCCGC
CA12 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA12_1 ↗15:63,381,846負股63,381,836–63,381,895

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR15_D55WF · enhancer · 63379475–63381824 · regulatory

ENSR15_BGKLT · promoter · 63381825–63382336 · regulatory

ENSR15_5JWHXP · CTCF_binding_site · 63381891–63381912 · regulatory

ENSR15_5JWHZN · CTCF_binding_site · 63382100–63382121 · regulatory

· motif · 63381893–63381909 · motif

· motif · 63382102–63382118 · motif

· motif · 63382272–63382281 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:354 aa

1 aa354 aa結構域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 O43570 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

carbonic anhydrase 12 長 354 個胺基酸,屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。蛋白質含有 Alpha-carbonic anhydrase 結構域,另有訊號區段、細胞外區域、螺旋型跨膜區段及細胞質區域。

訊號胜肽1–24 aa
拓樸區域Extracellular25–301 aa
跨膜區Helical302–322 aa
拓樸區域Cytoplasmic323–354 aa
結構域Alpha-carbonic anhydrase30–289 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1JCZ…

PDB · 1JCZ

X-ray · 1.55 A · A/B=29-291

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane;Cell membrane

carbonic anhydrase 12 是單次穿膜的第一型膜蛋白,定位於膜及細胞膜。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HsT18816CA12
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

carbonic anhydrase 12 以同源二聚體形式存在。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

CA12 相關變異會造成 isolated hyperchlorhidrosis(HYCHL),這是一種自體隱性疾病。患者有過度出汗及汗液氯離子濃度升高的情形,可能發生低血鈉性脫水,並可見汗液中鹽分沉積增加。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能carbonic anhydrase 12 可催化二氧化碳的可逆水合反應;此敘述未限定特定細胞情境或實驗條件。含實驗來源
證據與來源

Reversible hydration of carbon dioxide

PMID 15686894 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗ · PMID 26911677 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O含實驗來源
證據與來源

hydrogencarbonate + H(+) = CO2 + H2O

PMID 15686894 ↗ · PMID 19186056 ↗ · PMID 19206230 ↗ · PMID 26911677 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer含實驗來源
證據與來源

Homodimer

PMID 11493685 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位carbonic anhydrase 12 被註記為膜上的單次穿膜第一型膜蛋白,並定位於細胞膜;資料未指出定位改變的條件或異構型差異。含實驗來源
證據與來源

Membrane / Single-pass type I membrane protein; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

PMID 9636197 ↗ · PMID 26911677 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯isolated hyperchlorhidrosis(HYCHL)為自體隱性疾病,與影響此基因的變異有關。患者有過度出汗、汗液氯離子升高,並可能出現低血鈉性脫水及汗液中可見鹽分沉積增加。含實驗來源
證據與來源

Hyperchlorhidrosis, isolated HYCHL An autosomal recessive disorder characterized by excessive sweating and increased sweat chloride levels. Affected individuals suffer from episodes of hyponatremic dehydration and report increased amounts of visible salt precipitates in sweat. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 143860

PMID 21035102 ↗ · PMID 21184099 ↗ · PMID 26911677 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000178638 · 6,098 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAAGGGCGGACGTACTCGCCACGGCACCCAGGCTGCGCGC40
41ACGCGGTCCCGGTGTGCAGCTGGAGAGCGAGCGGCCACCG80
81GGAGCCCCCGGCACAGCCCGCGCCCGCCCCGCAGGAGCCC120
121GCGAAGATGCCCCGGCGCAGCCTGCACGCGGCGGCCGTGC160
161TCCTGCTGGTGATCTTAAAGGAACAGCCTTCCAGCCCGGC200
201CCCAGTGAACGGTTCCAAGTGGACTTATTTTGGTCCTGAT240
241GGGGAGAATAGCTGGTCCAAGAAGTACCCGTCGTGTGGGG280
281GCCTGCTGCAGTCCCCCATAGACCTGCACAGTGACATCCT320
321CCAGTATGACGCCAGCCTCACGCCCCTCGAGTTCCAAGGC360
361TACAATCTGTCTGCCAACAAGCAGTTTCTCCTGACCAACA400
401ATGGCCATTCAGTGAAGCTGAACCTGCCCTCGGACATGCA440
441CATCCAGGGCCTCCAGTCTCGCTACAGTGCCACGCAGCTG480
481CACCTGCACTGGGGGAACCCGAATGACCCGCACGGCTCTG520
521AGCACACCGTCAGCGGACAGCACTTCGCCGCCGAGCTGCA560
561CATTGTCCATTATAACTCAGACCTTTATCCTGACGCCAGC600
601ACTGCCAGCAACAAGTCAGAAGGCCTCGCTGTCCTGGCTG640
641TTCTCATTGAGATGGGCTCCTTCAATCCGTCCTATGACAA680
681GATCTTCAGTCACCTTCAACATGTAAAGTACAAAGGCCAG720
721GAAGCATTCGTCCCGGGATTCAACATTGAAGAGCTGCTTC760
761CGGAGAGGACCGCTGAATATTACCGCTACCGGGGGTCCCT800
801GACCACACCCCCTTGCAACCCCACTGTGCTCTGGACAGTT840
841TTCCGAAACCCCGTGCAAATTTCCCAGGAGCAGCTGCTGG880
881CTTTGGAGACAGCCCTGTACTGCACACACATGGACGACCC920
921TTCCCCCAGAGAAATGATCAACAACTTCCGGCAGGTCCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。