演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA11CARP2

carbonic anhydrase 11 (inactive)

CA11(carbonic anhydrase 11 (inactive))屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,但不具有催化活性;其蛋白質具有此家族的結構域,並被註記為分泌型。

Homo sapiens19q13.33UniProt O75493
OFFICIAL SYMBOL
CA11
CHROMOSOME
19
UNIPROT
O75493
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CA11 的正式名稱為 carbonic anhydrase 11 (inactive),是一個蛋白質編碼基因,其產物屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。這個家族歸屬反映其蛋白質具有相關家族的結構特徵;不過,CA11 的產物不具催化活性,因此不能僅憑家族名稱推定它具有活性的碳酸酐酶功能。其序列包含 alpha-carbonic anhydrase 結構域,並帶有 N 端訊號序列。

Official symbol
CA11
Gene name
carbonic anhydrase 11 (inactive)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1370
UniProt
O75493
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CARP2CARPX1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.33
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25CA11pq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr19:48,637,946–48,646,386
Gene span
8,441 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000084798 ★48,637,946–48,646,1879
ENST0000090103348,637,946–48,646,3869
ENST0000090103448,637,946–48,646,3869
ENST0000090103548,637,946–48,646,3869
ENST0000090103648,637,946–48,646,3869
ENST0000090103748,637,946–48,646,3869
ENST0000099496048,637,946–48,646,3869
ENST0000114320448,637,946–48,646,3869
ENST0000059608048,638,022–48,639,4594

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CA11 的蛋白質產物不具有催化活性。這是目前來源所支持的主要功能資訊;資料未進一步說明其是否參與其他生物學過程,或是否具有非催化性的作用,因此不宜由其家族歸屬推論額外功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 48646187 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA11 ENST00000084798 GRCh38 chr19:48646087-48647187 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACCCCATCTCTTCTCCCCAAATACAAAAATGTGGTGTCTCTCTCTGTCTTTGGATCGCTCTTTCTCTCTT
TTTGTCTCTCCCCACCCCATCTGCTGCTTGGTCTCTGAGTTTCTGTCTATCTCTAAGTGTGTGTCTCTAT
GTCTCCATGTCTGTCTCGCTGCGTCTCTGTATCTCCTTTTCTGCCTCTATCTGTATCTCTCTCATTCATT
CCTTCCTCTCTCCCTCCCCCTCCTCCTCTCCCTCCTCCCCCTCCTCTCCCTCCCCCTCCTCTCCCTCCTC
CCCCTCCTCCTTCACCTCCTCCCCCTCCTCCTCACTCCTGCCTGGCGGTTTGTTCTTGCCTCTCTAACCT
TCTGTCCCTCCGCCCTTCCTCTCCGTATCCATCTCAGGCTCCCTTCCCCTCCCCAGCCTACGCAGATGTG
GGTCCTCACCTCCCGCTCTCCGCCTCTGCCCTCCCGGCTCCTCCTCCCCGCCCCTCTCTCCCTCGCCAGG
TCTCTGCCTCCCCCTCCAGGCGAGCAGCCCTCACTGCACTTCAGGCTCCTAGGGGATCCCCCGGCCCCGT
TAAGGCAGCCCCAGGCAGAGACCCAGTGGAGCCCTGGGGCGGGGAAGGGGGGCTGCGGGCGCTGGGGCGG
CTCCAACCTGGGTCCCAGCGAGCAGGGGGACCCTGCATCCGCCAAGGCCGGCGGCCCCCAGCATGGAGAC
TTCCGAAGCCACTCCCAGCTCCACCTTAAGCGCCCCCCCTTCCCCTTGCTGCGGAGGATGGAAACAGCCT
GCTCCCGGCCCCAGGTGTCCCGGCCACCCCCGCCCGCGTGGCCCCAGCGCGGCTGGGAGCCGAGGACCAG
CCCCCTACCTCCTTCCGAATCCTGCCCTTTCGCACATCCCACCCCAAGCCAACCCGAGGAGTGTTTGCCG
CTATGAGATCACCTGCTCCCCCAGCCCAACAACAAAATTAAATAACACCACGGGAGAGGAGAGAGGGAGG
GGGAGGAGGGAGGAAGGGACAAGAGAGAAGAGAGACTGAAACAGGGAGAAGAGGCAGGAGAGGAGGAGGT
GGGGAGAGCACGAAGCTGGAGGCCGACACTGAGGGAGGGCGGGAGGAGGTG
CA11 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA11_1 ↗19:48,646,070負股48,646,060–48,646,119
CA11_2 ↗19:48,646,396負股48,646,386–48,646,445

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9PBBX · promoter · 48646177–48646677 · regulatory

ENSR19_BCMNF · enhancer · 48649247–48649883 · regulatory

· motif · 48645145–48645156 · motif

· motif · 48645170–48645180 · motif

· motif · 48645666–48645676 · motif

· motif · 48645954–48645964 · motif

· motif · 48646343–48646353 · motif

· motif · 48646382–48646395 · motif

· motif · 48646713–48646723 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:328 aa

1 aa328 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 O75493 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CA11 蛋白質長 328 個胺基酸,具有位於第 1–23 個胺基酸的訊號序列,以及位於第 33–303 個胺基酸的 Alpha-carbonic anhydrase 結構域。第 299–328 個胺基酸區段被註記為無序區。

訊號胜肽1–23 aa
結構域Alpha-carbonic anhydrase33–303 aa
功能區域Disordered299–328 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O75493…

AlphaFold · O75493

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

CA11 被註記為分泌型蛋白質;來源未提供其定位變化條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CARP2CA11
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CA11 的蛋白質產物不具有催化活性;此敘述未提供作用條件、實驗系統或其他功能資訊。資料庫紀錄
證據與來源

Does not have a catalytic activity

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000084798 · 1,715 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGAGAGAAGAGAGACTGAAACAGGGAGAAGAGGCAGGAG40
41AGGAGGAGGTGGGGAGAGCACGAAGCTGGAGGCCGACACT80
81GAGGGAGGGCGGGAGGAGGTGAAGAAGGAGAGAGGGGAGA120
121AGAGGCAGGAGCTGGAAAGGAGAGAGGGAGGAGGAGGAGG160
161AGATGCGGGATGGAGACCTGGAGTTAGGTGGCTTGGGAGA200
201GCTTAATGAAAAGAGAACGGAGAGGAGGTGTGGGTTAGGA240
241ACCAAGAGGTAGCCCTGGGGGCAGCAGAAGGCTGAGAGGA280
281GTAGGAAGATCAGGAGCTAGAGGGAGACTGGAGGGTTCCG320
321GGAAAAGAGCAGAGGAAAGAGGAAAGACACAGAGAGACGG360
361GAGAGAGAAGAAGAGTGGGTTTGAAGGGCGGATCTCAGTC400
401CCTGGCTGCTTTGGCATTTGGGGAACTGGGACTCCCTGTG440
441GGGAGGAGAGGAAAGCTGGAAGTCCTGGAGGGACAGGGTC480
481CCAGAAGGAGGGGACAGAGGAGCTGAGAGAGGGGGGCAGG520
521GCGTTGGGCAGGGGTCCCTCGGAGGCCTCCTGGGGATGGG560
561GGCTGCAGCTCGTCTGAGCGCCCCTCGAGCGCTGGTACTC600
601TGGGCTGCACTGGGGGCAGCAGCTCACATCGGACCAGCAC640
641CTGACCCCGAGGACTGGTGGAGCTACAAGGATAATCTCCA680
681GGGAAACTTCGTGCCAGGGCCTCCTTTCTGGGGCCTGGTG720
721AATGCAGCGTGGAGTCTGTGTGCTGTGGGGAAGCGGCAGA760
761GCCCCGTGGATGTGGAGCTGAAGAGGGTTCTTTATGACCC800
801CTTTCTGCCCCCATTAAGGCTCAGCACTGGAGGAGAGAAG840
841CTCCGGGGAACCTTGTACAACACCGGCCGACATGTCTCCT880
881TCCTGCCTGCACCCCGACCTGTGGTCAATGTGTCTGGAGG920
921TCCCCTCCTTTACAGCCACCGACTCAGTGAACTGCGGCTG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。