基因總覽
CA10 是蛋白質編碼基因,其產物為 Carbonic anhydrase-related protein 10,亦稱 Carbonic anhydrase-related protein X 或 Cerebral protein 15。該蛋白屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,蛋白質全長 328 個胺基酸;序列註解標示其中第 31 至 301 位胺基酸為 Alpha-carbonic anhydrase 結構域。其名稱標示為 inactive,資料也指出它不具有催化活性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000451037 ★ | 51,630,320–52,158,714 | 9 |
| ENST00000570565 | 51,630,313–52,160,002 | 9 |
| ENST00000442502 | 51,630,313–52,160,028 | 10 |
| ENST00000285273 | 51,630,313–52,159,801 | 10 |
| ENST00000897800 | 51,630,313–52,159,801 | 10 |
| ENST00000897801 | 51,630,313–52,158,792 | 9 |
| ENST00001134961 | 51,630,313–52,158,792 | 9 |
| ENST00000575181 | 51,633,612–52,159,983 | 9 |
| ENST00000575097 | 51,661,593–51,747,788 | 2 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
CA10 的資料註明其不具有催化活性。因此,儘管它歸屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,現有來源並未支持將其描述為具有催化作用的酵素,也未提供其他分子作用方式、生物學過程或功能意義的資訊。
Promoter 與基因調控
>CA10 ENST00000451037 GRCh38 chr17:52158614-52159714 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGGCTGCCCCTGGCCTCGGCCTGGGTGGGTGGGTGGTGCTCGCGCCGCCCCTACTTTCCCCTGGGGCCC TGGAGAGCCGCGCGCTGGGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGGGTTTGGTGGGGAAATCTCCTTCAGTGGA AGCTGCTGAGTGTCGTTGGCGGAAAGTATCCTGGAGCCCAGCAAAAGCCTCCAAAGCACTAGAGCTTCCC TAAAGAAAAGCAGAATAAAAGAAAGACAAGAAGGGAAGCCCGTTCCTCTAAAGCCCGGGTTTCCAATAGT CCCGGATCCTCCTGGAGTTGGGCGAAGGCGCAGTTGGCAGCAGCCGCTGCTGGCACCCGGACTTGGAAAG GCGGTGTTCCCCCTTTTCGGGAGGAGGGAGGCAGGGACTTGCAGGCAAGAGTTGCACCTGGTCTAGGAAC CTGCAGAGAAAAGAACTCTGGGGTAAGTAGTGTTCTGGCACTGGCACGGAAAGGGGTAAAGGGTGGGGGG CATGAGAGGGACGAAATGGAGAGGGCAGGGAATGAATTATGCAAAAAAATCTCCAATATTTCGCAGCGGA GGGAGAGCACAGCACAGCACTCCCAGGATGAGTCCTGCCTGGGTCTCCCGCGCCGAACCCGCAGCACGAA GTTCTTTTTAAGAAGAGAAACTCGAAAATCCTGGAGGGTAACAGAGGCAGCCAGGGCGGGGCGGAGTGCG GAGGCGGCTGCCAGGGACTGGGGCCGAGGCGGCGGCCAAGGTGGCCTGAAGCTGTGACACCCAGCCTCCT CCTCCTCCTCCTCATGGCCGCGCTCAGCCTCACCTCCCCGCCCGGGCCTCCTGCCTCCGCCCCCGGGTGC CGGGCTGCGGAGCTGACGCTGGGACGCCCGGCGGCGGCGAGGACGCTCACCTGGCCAAGCCTCCTTCTCC TCCTCCCCCTCCCGCCCCCACCTGTCCTCCTCCTCTCTGAGTTGGGAAGCGTAGGGATCCGTAGGCGAGG AAATAACGACCCCTGCAGTTGTATTGCGGAAAATCTCGACAGCGGCGCTAGTTGCGGGCGATGGAAGCCA GGCAACTGGGGGTTCTGGGGAGTTCAGGAAAATAGCAGAGGAGCAGGAAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| CA10_1 ↗ | 17:52,158,132 | 負股 | 52,158,122–52,158,181 |
| CA10_2 ↗ | 17:52,158,685 | 負股 | 52,158,675–52,158,734 |
| CA10_3 ↗ | 17:52,160,008 | 負股 | 52,159,998–52,160,057 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_9QNZ6 · enhancer · 52158438–52158703 · regulatory
ENSR17_9QNZ9 · promoter · 52158704–52159092 · regulatory
ENSR17_5G98JK · CTCF_binding_site · 52158712–52158733 · regulatory
ENSR17_83JDZQ · open_chromatin_region · 52160867–52161058 · regulatory
· motif · 52158015–52158024 · motif
· motif · 52158714–52158730 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:328 aa
CA10 蛋白質長 328 個胺基酸,序列第 31 至 301 位標註為 Alpha-carbonic anhydrase 結構域;此註解依 PROSITE-ProRule 提供。蛋白質家族資料將其歸入 alpha-carbonic anhydrase 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | CA10 不具有催化活性;此項描述未提供其他作用、實驗條件或功能結果,因此不延伸推定其分子機制或生物學效應。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTATTGCGGAAAATCTCGACAGCGGCGCTAGTTGCGGGCG40ATGGAAGCCAGGCAACTGGGGGTTCTGGGGAGTTCAGGAA80AATAGCAGAGGAGCAGGAAGGGCGCGCGCGACCTGGAGAG120TCTGTGTGCCCCCACCGCGCCCCAGTCCCCGGGGCCCAGC160CCTTCCCCTCGGCGCCCTGGACGCACTGCCGGAACCCGGC200TGAGAGGCTGCAGGCTGCGCGCGGACCTGGGGAGCAGGGA240GGGTCGGCGGAGGCTGCCGGCGGCTGGCGGTTTCGGGCAA280TAATCCCTGCCTCTCTTTCTCTGTGTGTCTGCTGTGTCTG320CTCCTTCCCCGCCCCCCGGAAGCAGGAGAAGAACTGCCCC360GGAGCGCAGCAGCCACCCTCCGACCATGCCCCGGTGAGGG400GGGCGGACTTCGAGGGCAACTTGCCGCGGACTGCCTGGGC440TTAGCCAGCGAGCTACGCGCTCCCGGGAGCCCGGAATTGC480ACGGCGCAGCCCGGCGGGGGGCTATCGTCTATGTCTTCTT520GGGGCGCCAGACGAATCGGGGTCTCGTTTTTGCTGGAAGA560GCCCAGTGTTGGTGGCTTCAGGTGGCTGCTGCCGCCGCCG600CCGCCGCCGCCGCTGCTAGTGCGGTTTCCGCCGCTGGTGC640GAAGAGAAGAGACACGCGAGCGGGGAGACCTCCAAGGCAG680CGAGGCATCGGACATGTGTCAGCACATCTGGGGCGCACAT720CCGTCGAGCCCGAGGGGAGATTTGCCGGAACAATTCAAAC760TGCGATATTGATCTTGGGGGTGACTGTCCCTGGCCGGCTG800TCGGGTGGGAGTGCGAGTGTGCACTCGCTCGGAAGTGTGT840GCGAGTGTGTATGTGTGTGTGCCGTGTCGGGCTCCCCCCT880TCCCCCCGTTTTCCCGTCGAGTGATGCACTTGGAATGAGA920ATCAGAGGATGGAAATAGTCTGGGAGGTGCTTTTTCTTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。