演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

CA10CARPX

carbonic anhydrase 10 (inactive)

CA10 編碼 carbonic anhydrase 10 (inactive),屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族。資料指出此蛋白不具有催化活性。

Homo sapiens17q21.33-q22UniProt Q9NS85
OFFICIAL SYMBOL
CA10
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q9NS85
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

CA10 是蛋白質編碼基因,其產物為 Carbonic anhydrase-related protein 10,亦稱 Carbonic anhydrase-related protein X 或 Cerebral protein 15。該蛋白屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,蛋白質全長 328 個胺基酸;序列註解標示其中第 31 至 301 位胺基酸為 Alpha-carbonic anhydrase 結構域。其名稱標示為 inactive,資料也指出它不具有催化活性。

Official symbol
CA10
Gene name
carbonic anhydrase 10 (inactive)
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1369
UniProt
Q9NS85
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CARPXCA-RPXHUCEP-15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q21.33-q22
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegCA10pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:51,630,313–52,160,028
Gene span
529,716 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000451037 ★51,630,320–52,158,7149
ENST0000057056551,630,313–52,160,0029
ENST0000044250251,630,313–52,160,02810
ENST0000028527351,630,313–52,159,80110
ENST0000089780051,630,313–52,159,80110
ENST0000089780151,630,313–52,158,7929
ENST0000113496151,630,313–52,158,7929
ENST0000057518151,633,612–52,159,9839
ENST0000057509751,661,593–51,747,7882

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

CA10 的資料註明其不具有催化活性。因此,儘管它歸屬於 alpha-carbonic anhydrase 家族,現有來源並未支持將其描述為具有催化作用的酵素,也未提供其他分子作用方式、生物學過程或功能意義的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 52158714 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>CA10 ENST00000451037 GRCh38 chr17:52158614-52159714 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGGCTGCCCCTGGCCTCGGCCTGGGTGGGTGGGTGGTGCTCGCGCCGCCCCTACTTTCCCCTGGGGCCC
TGGAGAGCCGCGCGCTGGGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCGGGTTTGGTGGGGAAATCTCCTTCAGTGGA
AGCTGCTGAGTGTCGTTGGCGGAAAGTATCCTGGAGCCCAGCAAAAGCCTCCAAAGCACTAGAGCTTCCC
TAAAGAAAAGCAGAATAAAAGAAAGACAAGAAGGGAAGCCCGTTCCTCTAAAGCCCGGGTTTCCAATAGT
CCCGGATCCTCCTGGAGTTGGGCGAAGGCGCAGTTGGCAGCAGCCGCTGCTGGCACCCGGACTTGGAAAG
GCGGTGTTCCCCCTTTTCGGGAGGAGGGAGGCAGGGACTTGCAGGCAAGAGTTGCACCTGGTCTAGGAAC
CTGCAGAGAAAAGAACTCTGGGGTAAGTAGTGTTCTGGCACTGGCACGGAAAGGGGTAAAGGGTGGGGGG
CATGAGAGGGACGAAATGGAGAGGGCAGGGAATGAATTATGCAAAAAAATCTCCAATATTTCGCAGCGGA
GGGAGAGCACAGCACAGCACTCCCAGGATGAGTCCTGCCTGGGTCTCCCGCGCCGAACCCGCAGCACGAA
GTTCTTTTTAAGAAGAGAAACTCGAAAATCCTGGAGGGTAACAGAGGCAGCCAGGGCGGGGCGGAGTGCG
GAGGCGGCTGCCAGGGACTGGGGCCGAGGCGGCGGCCAAGGTGGCCTGAAGCTGTGACACCCAGCCTCCT
CCTCCTCCTCCTCATGGCCGCGCTCAGCCTCACCTCCCCGCCCGGGCCTCCTGCCTCCGCCCCCGGGTGC
CGGGCTGCGGAGCTGACGCTGGGACGCCCGGCGGCGGCGAGGACGCTCACCTGGCCAAGCCTCCTTCTCC
TCCTCCCCCTCCCGCCCCCACCTGTCCTCCTCCTCTCTGAGTTGGGAAGCGTAGGGATCCGTAGGCGAGG
AAATAACGACCCCTGCAGTTGTATTGCGGAAAATCTCGACAGCGGCGCTAGTTGCGGGCGATGGAAGCCA
GGCAACTGGGGGTTCTGGGGAGTTCAGGAAAATAGCAGAGGAGCAGGAAGG
CA10 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
CA10_1 ↗17:52,158,132負股52,158,122–52,158,181
CA10_2 ↗17:52,158,685負股52,158,675–52,158,734
CA10_3 ↗17:52,160,008負股52,159,998–52,160,057

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_9QNZ6 · enhancer · 52158438–52158703 · regulatory

ENSR17_9QNZ9 · promoter · 52158704–52159092 · regulatory

ENSR17_5G98JK · CTCF_binding_site · 52158712–52158733 · regulatory

ENSR17_83JDZQ · open_chromatin_region · 52160867–52161058 · regulatory

· motif · 52158015–52158024 · motif

· motif · 52158714–52158730 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:328 aa

1 aa328 aa結構域
依 Q9NS85 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

CA10 蛋白質長 328 個胺基酸,序列第 31 至 301 位標註為 Alpha-carbonic anhydrase 結構域;此註解依 PROSITE-ProRule 提供。蛋白質家族資料將其歸入 alpha-carbonic anhydrase 家族。

結構域Alpha-carbonic anhydrase31–301 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9NS85…

AlphaFold · Q9NS85

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CARPXCA10
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能CA10 不具有催化活性;此項描述未提供其他作用、實驗條件或功能結果,因此不延伸推定其分子機制或生物學效應。資料庫紀錄
證據與來源

Does not have a catalytic activity

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000451037 · 3,179 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GTATTGCGGAAAATCTCGACAGCGGCGCTAGTTGCGGGCG40
41ATGGAAGCCAGGCAACTGGGGGTTCTGGGGAGTTCAGGAA80
81AATAGCAGAGGAGCAGGAAGGGCGCGCGCGACCTGGAGAG120
121TCTGTGTGCCCCCACCGCGCCCCAGTCCCCGGGGCCCAGC160
161CCTTCCCCTCGGCGCCCTGGACGCACTGCCGGAACCCGGC200
201TGAGAGGCTGCAGGCTGCGCGCGGACCTGGGGAGCAGGGA240
241GGGTCGGCGGAGGCTGCCGGCGGCTGGCGGTTTCGGGCAA280
281TAATCCCTGCCTCTCTTTCTCTGTGTGTCTGCTGTGTCTG320
321CTCCTTCCCCGCCCCCCGGAAGCAGGAGAAGAACTGCCCC360
361GGAGCGCAGCAGCCACCCTCCGACCATGCCCCGGTGAGGG400
401GGGCGGACTTCGAGGGCAACTTGCCGCGGACTGCCTGGGC440
441TTAGCCAGCGAGCTACGCGCTCCCGGGAGCCCGGAATTGC480
481ACGGCGCAGCCCGGCGGGGGGCTATCGTCTATGTCTTCTT520
521GGGGCGCCAGACGAATCGGGGTCTCGTTTTTGCTGGAAGA560
561GCCCAGTGTTGGTGGCTTCAGGTGGCTGCTGCCGCCGCCG600
601CCGCCGCCGCCGCTGCTAGTGCGGTTTCCGCCGCTGGTGC640
641GAAGAGAAGAGACACGCGAGCGGGGAGACCTCCAAGGCAG680
681CGAGGCATCGGACATGTGTCAGCACATCTGGGGCGCACAT720
721CCGTCGAGCCCGAGGGGAGATTTGCCGGAACAATTCAAAC760
761TGCGATATTGATCTTGGGGGTGACTGTCCCTGGCCGGCTG800
801TCGGGTGGGAGTGCGAGTGTGCACTCGCTCGGAAGTGTGT840
841GCGAGTGTGTATGTGTGTGTGCCGTGTCGGGCTCCCCCCT880
881TCCCCCCGTTTTCCCGTCGAGTGATGCACTTGGAATGAGA920
921ATCAGAGGATGGAAATAGTCTGGGAGGTGCTTTTTCTTCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。