基因總覽
C9（complement C9）是由蛋白質編碼基因產生的補體蛋白，屬於 complement C6/C7/C8/C9 family。它是膜攻擊複合體（MAC）的成員，主要角色是在複合體組裝過程中提供成孔組分。其蛋白質具有多個已註記的結構區域，包括 TSP type-1、LDL-receptor class A、MACPF 與 EGF-like domains；序列中亦有訊號胜肽及數段 β-strand 跨膜區註記。這些結構特徵與 C9 在 MAC 中組成孔道的角色相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263408 ★ | 39,284,140–39,364,495 | 11 |
| ENST00000509186 | 39,283,981–39,371,365 | 11 |
| ENST00000695880 | 39,283,981–39,364,495 | 10 |
| ENST00000884639 | 39,283,981–39,371,305 | 12 |
| ENST00000884640 | 39,283,981–39,364,585 | 10 |
| ENST00000884641 | 39,283,981–39,364,553 | 11 |
| ENST00000884643 | 39,283,981–39,364,495 | 10 |
| ENST00000884644 | 39,283,981–39,364,553 | 10 |
| ENST00000884645 | 39,283,981–39,364,495 | 7 |
| ENST00000884646 | 39,283,981–39,364,495 | 8 |
| ENST00000884647 | 39,283,981–39,364,495 | 7 |
| ENST00000988142 | 39,283,981–39,364,553 | 12 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
C9 是膜攻擊複合體（MAC）的成孔組分。MAC 是由補體級聯反應啟動的多蛋白複合體，組裝後插入目標細胞膜並形成孔洞，造成膜破裂與細胞溶解。補體途徑本身由一連串蛋白質反應構成，可促進吞噬作用及病原體分解，並傳遞能增強適應性免疫系統的訊號；MAC 則是其中直接作用於目標膜的組成部分。
MAC 的形成始於 C5 經蛋白水解切割產生 complement C5b。來源列出的 classical、alternative、lectin 與 GZMK 補體途徑均可啟動這個步驟。隨後複合體逐步組裝，C9 會接合 C5b8 中間複合體，並透過聚合完成孔道。C9 因此不只是複合體中的一個成員，也是形成最終膜孔所需的成孔次單元。
在組裝過程中，多個 C9 分子聚合，形成孔道結構的一部分；其聚合使 MAC 能完成穿越目標細胞膜的孔洞。孔洞形成會破壞膜的完整性，並導致目標細胞溶解。這項作用將補體級聯反應的蛋白質組裝，連結到對目標細胞膜的直接破壞；來源並未指出 C9 單獨即可完成這些效應，而是描述其在 MAC 中與其他組分協同構成孔道。
Promoter 與基因調控
>C9 ENST00000263408 GRCh38 chr5:39364395-39365495 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGAAATGTGAGGGGGAGACTATTTTTCATGGGTAGGAACAAGTTTTTCTGTCTCAGATTCTATCTTGTT GACATGTGTGATGCTGAGATAAGGAGACCACTCTTTCTGGTGGACGCCCTTAATGCCTTCGGGAGTTTAC ATCTCATTCTTCAAAATGTACCACTCGGCCTATAAGGAAAGCCAGGATTGTAAATGCATTTGCTCACGTG GAAATAACCTACCTAGCCCATTTGCAGATTAAAAAAAAAATGAAGCATCTACGTCTGTGCCATCCTTTCC ACTAAGTGCAGTTCTTTACTAACTTTGACTTCATGCCTCCATGAGAAGCATCCACAGGCTTTTTTTTCCC CAAAATTGCATACTCCCTCATCTTCCACCCAACCCCTCGAGTCTTGCAAACTAAGAACTGCTGGGGGTCC TTCATTTTTGTTTCTATTTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTGCCGGAATTTTGCTCTTGT TGCCCAGGCTGGAGTTCAGTGGCCCCACCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCAGATTCAAGCAATTC TCCTGCCTCAGCCTCCAAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCCACCACCATGCCTGGCTAATTTTTTGTATT TTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACGTCAGGTAATCCACCC ACCTCAGCCTCCCAACATGCTGTGATTACAGGCGTGAGCCACTGCGCCCGGCCTTTGTTTCCATTTTCAC ACAGCACTGCTGCCCATCTTAGGGACTTTAGCATTCACAGGCCCATTGCCCCATATCTACTTGTCAATAT GAGAAAGCAGGAGGCCAAGAATTACAAAATGATTCTCCTTTGGTTGGACTTCAGTACCCAGGCCACCCAA ATTGACAAAAACTCTGAATGCAGACAAACAATGCTTGTTCCCTGTCCTCTGGCCCTTTGCAAATAAATGC CTTACCAGACCTGCCCTGCCACCCCACTCGCAGCCACCCAGCAAGAGCAGCATGTCAGCCTGCCGGAGCT TTGCAGTTGCAATCTGCATTTTAGAAATAAGCATCCTCACAGCACAGTACA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C9_1 ↗ | 5:39,364,495 | 負股 | 39,364,485–39,364,544 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 39362824–39362839 · motif
· motif · 39363380–39363390 · motif
· motif · 39363433–39363447 · motif
· motif · 39363433–39363448 · motif
· motif · 39369396–39369406 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：559 aa
C9 蛋白長 559 個胺基酸，N 端具有訊號胜肽（第 1–21 位）。註記的結構域包括 TSP type-1、LDL-receptor class A、MACPF 與 EGF-like。另有四段 β-strand 跨膜區，分別位於第 235–242、265–272、374–381 與 382–390 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C9 以可溶性單體形式分泌；到達目標細胞膜後會聚合並形成前孔。 之後的構形變化使其轉為直徑約 100 Å 的孔道，顯示其由分泌狀態轉為膜上寡聚結構。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- APOEP02649 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SOD1P00441 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
C9 可與自身形成同源寡聚體，約 20 條 C9 鏈聚合成大型 β-barrel，在目標膜形成直徑約 100 Å 的孔。C9 也屬於 MAC；該複合體由 complement C5b、C6、C7、C8A、C8B、C8G 及多個 C9 分子組成。來源描述的是複合體組成與寡聚，不提供各組分間更細的直接結合細節。
疾病與遺傳關聯
C9 缺乏症（C9D）是罕見的補體 classical pathway 缺陷，與嚴重且反覆感染的易感性相關，感染病原以 Neisseria gonorrhoeae 或 Neisseria meningitidis 為主；部分患者可能發生 dermatomyositis。另有 C9 基因變異與年齡相關黃斑部病變易感性相關。該病為多因子眼疾，常見表現包括視網膜色素上皮下及 Bruch membrane 內可見的黃色蛋白質與脂質堆積；來源指出的是易感性關聯，並非變異必然造成疾病。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | C9 是膜攻擊複合體（MAC）的成孔組分。補體級聯反應啟動 MAC，並由 C5 蛋白水解切割產生 complement C5b 開始組裝；classical、alternative、lectin 與 GZMK 補體途徑均可啟動此過程。C9 接合 C5b8 中間複合體並聚合完成孔道，MAC 插入目標細胞膜後可造成膜破裂及細胞溶解。補體級聯亦促進吞噬、病原體分解及增強適應性免疫系統的訊號傳遞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pore-forming component of the membrane attack complex (MAC), a multiprotein complex activated by the complement cascade, which inserts into a target cell membrane and forms a pore, leading to target cell membrane rupture and cell lysis. The MAC is initiated by proteolytic cleavage of C5 into complement C5b in response to the classical, alternative, lectin and GZMK complement pathways. The complement pathways consist in a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. Constitutes the pore-forming subunit of the MAC complex: during MAC assembly, C9 associates with the C5b8 intermediate complex, and polymerizes to complete the pore PMID 22832194 ↗ · PMID 26841837 ↗ · PMID 26841934 ↗ · PMID 27052168 ↗ · PMID 30111885 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 34752492 ↗ · PMID 39814882 ↗ · PMID 39914456 ↗ · PMID 4055801 ↗ · PMID 6177822 ↗ · PMID 9212048 ↗ · PMID 9634479 ↗ |
| 交互作用 | 約 20 條 C9 鏈可形成同源寡聚體，組成大型 β-barrel，並在目標膜形成直徑約 100 Å 的孔。C9 也是膜攻擊複合體（MAC）的成員；該複合體由 complement C5b、C6、C7、C8A、C8B、C8G 與多個具成孔作用的 C9 分子構成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomer; about 20 C9 chains oligomerize to give rise to a huge beta-barrel that forms a 100 Angstrom diameter pore in target membranes. Component of the membrane attack complex (MAC), composed of complement C5b, C6, C7, C8A, C8B, C8G and multiple copies of the pore-forming subunit C9 PMID 22832194 ↗ · PMID 26841837 ↗ · PMID 26841934 ↗ · PMID 27052168 ↗ · PMID 30111885 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 31061395 ↗ · PMID 34752492 ↗ · PMID 6177822 ↗ |
| 細胞定位 | C9 以可溶性單體形式分泌，並在目標細胞膜上聚合形成前孔。其後發生構形改變，形成直徑約 100 Å 的孔道；此描述呈現 C9 從分泌的單體狀態轉變為膜上寡聚結構的過程。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Target cell membrane / Multi-pass membrane protein; Secreted as soluble monomer. Oligomerizes at target membranes, forming a pre-pore. A conformation change then leads to the formation of a 100 Angstrom diameter pore PMID 22832194 ↗ · PMID 26841934 ↗ · PMID 8603752 ↗ · PMID 9212048 ↗ · PMID 9634479 ↗ · PMID 30111885 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 31061395 ↗ · PMID 34752492 ↗ |
| 疾病關聯 | C9 缺乏症是罕見的補體 classical pathway 缺陷，與嚴重、反覆感染的易感性相關，主要涉及 Neisseria gonorrhoeae 或 Neisseria meningitidis；部分患者可能發生 dermatomyositis。疾病易感性與影響 C9 基因的變異相關，來源並未將變異描述為必然造成所有相關表現。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement component 9 deficiency C9D A rare defect of the complement classical pathway associated with susceptibility to severe recurrent infections predominantly by Neisseria gonorrhoeae or Neisseria meningitidis. Some patients may develop dermatomyositis. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613825 PMID 9634479 ↗ |
| 疾病關聯 | 年齡相關黃斑部病變 15 是多因子眼疾，與影響 C9 基因的變異所帶來的疾病易感性相關。多數患者可見視網膜色素上皮下、位於含彈性蛋白的 Bruch membrane 內的黃色蛋白質與脂質堆積；資料描述的是易感性關聯，未指出 C9 變異必然導致此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Macular degeneration, age-related, 15 ARMD15 A form of age-related macular degeneration, a multifactorial eye disease and the most common cause of irreversible vision loss in the developed world. In most patients, the disease is manifest as ophthalmoscopically visible yellowish accumulations of protein and lipid that lie beneath the retinal pigment epithelium and within an elastin-containing structure known as Bruch membrane. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615591 PMID 24036952 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACCCCACTCGCAGCCACCCAGCAAGAGCAGCATGTCAGCC40TGCCGGAGCTTTGCAGTTGCAATCTGCATTTTAGAAATAA80GCATCCTCACAGCACAGTACACGACCAGTTATGACCCAGA120GCTAACAGAAAGCAGTGGCTCTGCATCACACATAGACTGC160AGAATGAGCCCCTGGAGTGAATGGTCACAATGCGATCCTT200GTCTCAGACAAATGTTTCGTTCAAGAAGCATTGAGGTCTT240TGGACAATTTAATGGGAAAAGATGCACCGACGCTGTGGGA280GACAGACGACAGTGTGTGCCCACAGAGCCCTGTGAGGATG320CTGAGGATGACTGCGGAAATGACTTTCAATGCAGTACAGG360CAGATGCATAAAGATGCGACTTCGGTGTAATGGTGACAAT400GACTGCGGAGACTTTTCAGATGAGGATGATTGTGAAAGTG440AGCCCCGTCCCCCCTGCAGAGACAGAGTGGTAGAAGAGTC480TGAGCTGGCACGAACAGCAGGCTATGGGATCAACATTTTA520GGGATGGATCCCCTAAGCACACCTTTTGACAATGAGTTCT560ACAATGGACTCTGTAACCGGGATCGGGATGGAAACACTCT600GACATACTACCGAAGACCTTGGAACGTGGCTTCTTTGATC640TATGAAACCAAAGGCGAGAAAAATTTCAGAACCGAACATT680ACGAAGAACAAATTGAAGCATTTAAAAGTATCATCCAAGA720GAAGACATCAAATTTTAATGCAGCTATATCTCTAAAATTT760ACACCCACTGAAACAAATAAAGCTGAACAATGTTGTGAGG800AAACAGCCTCCTCAATTTCTTTACATGGCAAGGGTAGTTT840TCGGTTTTCATATTCCAAAAATGAAACTTACCAACTATTT880TTGTCATATTCTTCAAAGAAGGAAAAAATGTTTCTGCATG920TGAAAGGAGAAATTCATCTGGGAAGATTTGTAATGAGAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。