演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C8B

complement C8 beta chain

C8B 編碼 complement C8 beta chain,是補體膜攻擊複合體的組成成分,參與其組裝並協助複合體插入目標細胞膜。

Homo sapiens1p32.2UniProt P07358
OFFICIAL SYMBOL
C8B
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P07358
PDB / ALPHAFOLD
8B0F
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C8B 是一個蛋白質編碼基因,其產物 complement C8 beta chain 屬於 complement C6/C7/C8/C9 family。它是 C8 三鏈異源三聚體中的 beta chain,與 alpha chain(C8A)及 gamma chain(C8G)共同構成 C8;其中 alpha 與 gamma chain 以雙硫鍵連結。C8B 也是膜攻擊複合體(MAC)的組成成分。其蛋白質具有多種已註釋的結構區域,包括 TSP type-1、LDL-receptor class A、MACPF、EGF-like 等結構域,並含有多段 beta-stranded 跨膜區域註記。

Official symbol
C8B
Gene name
complement C8 beta chain
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1353
UniProt
P07358
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p32.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegC8Bpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:56,928,282–56,974,383
Gene span
46,102 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000371237 ★56,929,207–56,966,01512
ENST0000069584256,929,099–56,966,18711
ENST0000069616456,929,099–56,974,38313
ENST0000087529856,929,099–56,966,21413
ENST0000087529956,929,099–56,966,18711
ENST0000087530056,929,099–56,966,18711
ENST0000087530156,929,099–56,966,21413
ENST0000087530256,929,099–56,966,21413
ENST0000087530356,929,099–56,966,21413
ENST0000087530456,929,099–56,966,1879
ENST0000087530556,929,099–56,966,18711
ENST0000114376356,929,099–56,966,18712

顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

C8B 的產物參與膜攻擊複合體(MAC)的組裝。補體級聯反應可由 classical、alternative、lectin 及 GZMK pathways 啟動;這些路徑促使 C5 經蛋白水解切割形成 complement C5b,進而啟動 MAC 的形成。補體反應由一連串蛋白質作用構成,與吞噬及分解病原體有關,也可透過訊號增強適應性免疫系統。

在 MAC 組裝過程中,C8B 與 C5b、C6 及 C7 結合,形成 C5b8 中間複合體。此中間複合體插入目標細胞膜並穿越脂雙層,增加膜的剛性。之後,C8B 與 C8A、C8G 一同插入目標膜;不過,這三者本身不會形成孔洞。

MAC 是由多種補體成分組成的複合體,可插入目標細胞膜並形成孔洞,導致膜破裂及細胞裂解。C8B 因此參與 MAC 對目標膜的組裝與插入,但來源未指出 C8B 單獨形成孔洞;孔洞形成與細胞裂解是整個 MAC 的作用結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 56966015 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C8B ENST00000371237 GRCh38 chr1:56965915-56967015 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAGTATTTGGTCTGACTCTCCCAACTGTGAGTGGTAAGTTGTCATAGTCCTCCTAATTTTACATATGAAG
AAACAGAATCAGAGACAGTCAATAAAAATACCAGCTCACTTATAGAGAGTGCACATAGAATGTGCCAGGC
AATGTTCAACATGTTTTGAACATGTTGTGAAGATTAAATAAATCTAATTTATTTAATAATAATAATTATA
ATTAATTATAATTACAATAATAATTAATAATAATCTAATTTATTTAATCTTCACAACAACCCGGTGAGGT
TGGTATTATTATTATCCCTGTTTTATTGATGAAGGAACTTAGGCCCAGAGAGGGTTAGTAATTTTCTCTG
GCCACACAGCTGGTGAATCATACAGAAGCAATTTGAAGTCAGGTAGATGGGTTCTAGAGCCCTACAGCCT
CTTACTGACTTGCTCAACATCATGTAACTGGAAAGAGGCAAACATGGAATTCAAACCTTGGCCTGTCTGA
CTCCAAACCCTGAATTCTACTAAGTAATAATAGCTGACATATCTGAGCGCTGAACATAGGCCTGTTCTAA
ACATTTCCTTATATTAACGTGTTTAATTCTCACCACTTAGCAAGTAAGGAGAGTAAGGCACAGAAGTAAA
GCAACTTGCCCATAGTCCAAAGCTGTTAGGTTGGTGCAAAAGTAATTGTGGTTTTTGCCATTAAAAGCAA
TGACAAAAACTGCAATTACTTTTGCACCAACCTAGTCAGTGGCAGAGAATGTACTTGAACCCAGGCTGTC
TAGACCTAGATCCCACAGTCCTTGCCACCTCACTAATAGCCTGTCCACTTGGCAGCTTACCCTAAAGTTA
CAGAGGAATAAACACCATGCTGCTACAGATTTTTCATTATTCTGGTTGGTTTCCAGAGTGACAGGTAAGT
TTTTGGTCTGTGCAAAGTCTGTTTCCAGTCACTAGTGGCTTTCTGTTTACTTTGCAGAGCTATTTGCTCT
TGGGGACAGAAGCTGACAGTGGCACTCACAGCACAGGCTTGTTATGGGTCTAGCAGCCTCTGTGGCATCT
CCTGTCACATTGGGAAAATGAAGAATTCCAGGACATGGGCTTGGAGGGCGC
C8B 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C8B_1 ↗1:56,966,015負股56,966,005–56,966,064

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_9SLHW · enhancer · 56968256–56968536 · regulatory

ENSR1_5HDR8Q · CTCF_binding_site · 56968427–56968448 · regulatory

· motif · 56961842–56961857 · motif

· motif · 56966083–56966098 · motif

· motif · 56966083–56966098 · motif

· motif · 56967484–56967499 · motif

· motif · 56967491–56967505 · motif

· motif · 56968028–56968043 · motif

· motif · 56968030–56968043 · motif

· motif · 56968162–56968175 · motif

· motif · 56968429–56968445 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:591 aa

1 aa591 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區
依 P07358 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

complement C8 beta chain 的蛋白質長度為 591 個胺基酸。註釋包含 TSP type-1、LDL-receptor class A、MACPF、EGF-like 等結構域;其中 MACPF 區域位於胺基酸 158–504。另有四段 beta-stranded 跨膜區域註記,分別位於 252–259、262–269、379–386 及 392–399。蛋白質 N 端另有訊號序列註記。

訊號胜肽1–32 aa
跨膜區Beta stranded252–259 aa
跨膜區Beta stranded262–269 aa
跨膜區Beta stranded379–386 aa
跨膜區Beta stranded392–399 aa
結構域TSP type-1 164–117 aa
結構域LDL-receptor class A120–157 aa
結構域MACPF158–504 aa
結構域EGF-like505–535 aa
結構域TSP type-1 2545–591 aa
功能區域Disordered568–591 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8B0F…

PDB · 8B0F

EM · 3.00 A · D=1-591

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Target cell membrane

C8B 蛋白質以可溶形式分泌,並在 MAC 組裝時插入目標細胞膜;因此,來源描述的膜定位是其進入目標膜後的狀態,不是單指分泌時的可溶形式。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C8BC8B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C8B 與 C8A、C8G 組成三鏈異源三聚體,其中 C8A 與 C8G 之間有雙硫鍵。C8 也是 MAC 的一部分;該複合體包含 C5b、C6、C7、C8A、C8B、C8G,以及多個具成孔作用的 C9。另在 MAC 組裝期間,C8B 與 C5b、C6、C7 形成 C5b8 中間複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Complement component 8 deficiency, 2(C8D2)是一種罕見的補體 classical pathway 缺陷,與嚴重且反覆感染的易感性相關,感染主要涉及 Neisseria gonorrhoeae 或 Neisseria meningitidis。此疾病易感性與影響 C8B 基因的變異相關;來源描述的是關聯,並未指出所有相關變異均會造成相同結果。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能C8B 是膜攻擊複合體(MAC)的組成成分。補體 classical、alternative、lectin 與 GZMK pathways 可促使 C5 切割形成 C5b,啟動 MAC 組裝。補體級聯反應與吞噬、分解病原體及增強適應性免疫系統的訊號有關。C8B 與 C8A、C8G 一同插入目標膜,但本身不形成孔洞;組裝時,C8B 與 C5b、C6、C7 形成會插入膜並穿越脂雙層、增加膜剛性的 C5b8 中間複合體。含實驗來源
證據與來源

Component of the membrane attack complex (MAC), a multiprotein complex activated by the complement cascade, which inserts into a target cell membrane and forms a pore, leading to target cell membrane rupture and cell lysis. The MAC is initiated by proteolytic cleavage of C5 into complement C5b in response to the classical, alternative, lectin and GZMK complement pathways. The complement pathways consist in a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. C8B, together with C8A and C8G, inserts into the target membrane, but does not form pores by itself. During MAC assembly, associates with C5b, C6 and C7 to form the C5b8 intermediate complex that inserts into the target membrane and traverses the bilayer increasing membrane rigidity

PMID 22832194 ↗ · PMID 26841837 ↗ · PMID 27052168 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 39814882 ↗ · PMID 39914456 ↗ · PMID 6833260 ↗ · PMID 7440581 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用C8 是由 alpha(C8A)、beta(C8B)及 gamma(C8G)三條鏈構成的異源三聚體,alpha 與 gamma chain 以雙硫鍵相連。C8B 也屬於膜攻擊複合體(MAC);該複合體包含 complement C5b、C6、C7、C8A、C8B、C8G,以及多個具成孔作用的 C9。含實驗來源
證據與來源

Heterotrimer of 3 chains: alpha (C8A), beta (C8B) and gamma (C8G); the alpha and gamma chains are disulfide bonded. Component of the membrane attack complex (MAC), composed of complement C5b, C6, C7, C8A, C8B, C8G and multiple copies of the pore-forming subunit C9

PMID 21454577 ↗ · PMID 22832194 ↗ · PMID 26841837 ↗ · PMID 27052168 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 31061395 ↗ · PMID 7440581 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位C8B 以可溶蛋白質形式分泌,並可插入目標細胞的細胞膜。來源也將其描述為目標細胞膜上的多次跨膜蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Target cell membrane / Multi-pass membrane protein; Secreted as soluble protein. Inserts into the cell membrane of target cells

PMID 2820472 ↗ · PMID 7440581 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 31061395 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Complement component 8 deficiency, 2(C8D2)是罕見的補體 classical pathway 缺陷,與嚴重、反覆感染的易感性相關,感染主要由 Neisseria gonorrhoeae 或 Neisseria meningitidis 引起。疾病易感性與影響此條目所代表基因的變異相關;這是易感性關聯的描述。含實驗來源
證據與來源

Complement component 8 deficiency, 2 C8D2 A rare defect of the complement classical pathway associated with susceptibility to severe recurrent infections, predominantly by Neisseria gonorrhoeae or Neisseria meningitidis. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613789

PMID 19434484 ↗ · PMID 7594510 ↗ · PMID 8098723 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000371237 · 2,040 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCACTCACAGCACAGGCTTGTTATGGGTCTAGCAGCCTC40
41TGTGGCATCTCCTGTCACATTGGGAAAATGAAGAATTCCA80
81GGACATGGGCTTGGAGGGCGCCGGTGGAGCTATTTCTTCT120
121CTGTGCTGCCCTGGGCTGTCTCAGTTTGCCTGGCTCCAGA160
161GGTGAAAGGCCACATTCCTTTGGGTCAAATGCAGTCAACA200
201AGAGCTTTGCTAAGAGCAGACAGATGCGGAGTGTGGATGT240
241TACCCTGATGCCCATTGATTGTGAGCTGTCTAGTTGGTCC280
281TCTTGGACCACATGTGACCCCTGTCAGAAGAAAAGGTACA320
321GGTATGCCTACTTGCTCCAGCCCTCTCAGTTCCATGGGGA360
361ACCGTGCAACTTCTCTGACAAGGAAGTCGAAGACTGTGTT400
401ACCAACAGACCATGCGGAAGTCAAGTGCGATGTGAAGGCT440
441TTGTGTGTGCACAGACAGGAAGGTGTGTAAACCGCAGACT480
481TCTTTGCAATGGGGACAATGACTGTGGAGACCAGTCAGAT520
521GAAGCAAACTGTAGAAGGATTTATAAAAAATGTCAGCATG560
561AAATGGACCAATACTGGGGAATTGGCAGTCTGGCCAGTGG600
601GATAAATTTGTTCACAAACAGTTTTGAGGGCCCAGTTCTT640
641GATCACAGGTATTATGCAGGTGGATGCTCCCCGCATTACA680
681TCCTGAACACGAGGTTTAGGAAGCCCTACAATGTGGAAAG720
721CTACACGCCACAGACCCAAGGCAAATACGAATTCATATTA760
761AAAGAGTATGAATCATACTCAGATTTTGAACGCAATGTCA800
801CAGAGAAAATGGCAAGCAAGTCTGGTTTCAGTTTTGGTTT840
841TAAAATACCTGGAATATTTGAACTTGGCATCAGTAGTCAA880
881AGTGATCGAGGCAAACACTATATTAGGAGAACCAAACGAT920
921TCTCTCATACTAAAAGCGTATTTCTGCATGCACGCTCTGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。