演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C6orf15STG

chromosome 6 open reading frame 15

C6orf15 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens6p21.33UniProt Q6UXA7
OFFICIAL SYMBOL
C6orf15
CHROMOSOME
6
UNIPROT
Q6UXA7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C6orf15 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 chromosome 6 open reading frame 15。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。

Official symbol
C6orf15
Gene name
chromosome 6 open reading frame 15
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13927
UniProt
Q6UXA7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
STG

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.33
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegC6orf15pq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr6:31,111,223–31,112,582
Gene span
1,360 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000259870 ★31,111,223–31,112,5752
ENST0000114013931,111,223–31,112,5822

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 31112575 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C6orf15 ENST00000259870 GRCh38 chr6:31112475-31113575 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAGATGTCCACATCCTAATCCCTGGAACGTAGGAATTAGGTTACATGGCAAAGGGAAATTAAGGTTCCA
GATGGGATTAAGGTTGCTATTCGGCTGACTTCACAGAGATTATCATGGATTATTCAGGTGGGTCCAGTGT
AGTCACCAGGTCCCTTAATGTGGACATGGGAGGCAGAAGAGGAAGTCTGAGTGATACAGTGTAAGAAATG
GCTGATTTTGGCTTTGGAGATGGAGGAAGGGGACCATGAGCCAAAGAACACAGGATGCCTCTAGAAGGTG
AAAAAGCAGGGAAAGGGATTTTCCCCTGAGGCCCCCAGAAAGAATCACAGCCCTGCTGACACCTTTATTT
TAATCCACTGAGACCTGTTTTAGACTTCTGATCTCCAAAACTGTAAAGTAATAAATCCATGTTGTTGTAA
GCCATTCGGTTCATGGTAATTTGTCACTGCAGCAGCAGGAATTAGTCAGTATCTCATAAGGATGGCATCC
AGGTCCATTTCCCTAGCTAGATCCAGGGTCTCATGTAGGAGCAGCTCCTCAGATGGGGCCACTTCTGCAC
CCCAGAACCTCCTGCAGGTTGGGGCCAAGGTGAAGGAGATATGAGGATGCATGAGAAAGGGGTGCTGGGA
GGAAACAATCCAGCTCCCAAAAAGAAACAAGTGTTTCTGTTGCTGAGAGAGGCAATTAAGAGAGTGGGAC
CCCAGGGTGGAGGTCCTTGTGTATAGAGAAGCAGGGCTGGGGAGGCTGGCAACCAGGGATGAGCTGTGAG
CCAGGACACCTGGGCCAAGAAGGGGCAGGGAGGTCAAGGAAAGGAGCCAGGGCGGGAGACACCCAGCTTC
CTCTGGGACATTCATTCAAGTGACACCTGTTGCCACAGACCACATTAGGAATGAGGGTGGAATGTGGAGG
TTTATTGTCTTCACAACCACTAGCCCAGCCTGTTTCTGCTGTCCCCCACCCCACTACCAGGATAAAGGGC
TGGCTGTCTTGGGGCTGAGGGAGATCGGGTGCTGAGCAGGATGCAGGGCCGCGTGGCAGGGAGCTGCGCT
CCTCTGGGCCTGCTCCTGGTCTGTCTTCATCTCCCAGGTATGGAGGCCGTG
C6orf15 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C6orf15_1 ↗6:31,112,574負股31,112,564–31,112,623

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:325 aa

1 aa325 aa功能區域訊號胜肽
依 Q6UXA7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

C6orf15 蛋白質長 325 個胺基酸,序列註解標示第 1–26 位為訊號序列;第 41–110 位與第 147–189 位則各有一段無序區域。

訊號胜肽1–26 aa
功能區域Disordered41–110 aa
功能區域Disordered147–189 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q6UXA7…

AlphaFold · Q6UXA7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space, extracellular matrix

C6orf15 被註記為分泌至細胞外空間,並位於細胞外基質。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
STGC6orf15KRTAP6-2PROP1UBQLN2VENTXYTHDF1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C6orf15 與多種細胞外基質蛋白質結合。來源未列出具體的結合對象,也未說明結合條件或其功能後果。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
交互作用C6orf15 與多種細胞外基質蛋白質結合;這筆敘述概括其互作對象的範圍,但未指出個別蛋白質,也未提供結合條件或互作造成的功能影響。推論支持
證據與來源

Binds to numerous extracellular matrix proteins

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位C6orf15 的定位註記包括分泌狀態、細胞外空間與細胞外基質;這筆資料未說明定位改變的條件、時間動態或不同異構型的差異。推論支持
證據與來源

Secreted, extracellular space, extracellular matrix

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000259870 · 1,156 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGATCGGGTGCTGAGCAGGATGCAGGGCCGCGTGGCAGG40
41GAGCTGCGCTCCTCTGGGCCTGCTCCTGGTCTGTCTTCAT80
81CTCCCAGGCCTCTTTGCCCGGAGCATCGGTGTTGTGGAGG120
121AGAAAGTTTCCCAAAACTTGGGGACCAACTTGCCTCAGCT160
161CGGACAACCTTCCTCCACTGGCCCCTCTAACTCTGAACAT200
201CCGCAGCCCGCTCTGGACCCTAGGTCTAATGACTTGGCAA240
241GGGTTCCTCTGAAGCTCAGCGTGCCTGCATCAGATGGCTT280
281CCCACCTGCAGGAGGTTCTGCAGTGCAGAGGTGGCCTCCA320
321TCGTGGGGGCTGCCTGCCATGGATTCCTGGCCCCCTGAGG360
361ATCCTTGGCAGATGATGGCTGCTGCGGCTGAGGACCGCCT400
401GGGGGAAGCGCTGCCTGAAGAACTCTCTTACCTCTCCAGT440
441GCTGCGGCCCTCGCTCCGGGCAGTGGCCCTTTGCCTGGGG480
481AGTCTTCTCCCGATGCCACAGGCCTCTCACCCAAGGCTTC520
521ACTCCTCCACCAGGACTCGGAGTCCAGACGACTGCCCCGT560
561TCTAATTCACTGGGAGCCGGGGGAAAAATCCTTTCCCAAC600
601GCCCTCCCTGGTCTCTCATCCACAGGGTTCTGCCTGATCA640
641CCCCTGGGGTACCCTGAATCCCAGTGTGTCCTGGGGAGGT680
681GGAGGCCCTGGGACTGGTTGGGGAACGAGGCCCATGCCAC720
721ACCCTGAGGGAATCTGGGGTATCAATAATCAACCCCCAGG760
761TACCAGCTGGGGAAATATTAATCGGTATCCAGGAGGCAGC800
801TGGGGAAATATTAATCGGTATCCAGGAGGCAGCTGGGGGA840
841ATATTAATCGGTATCCAGGAGGCAGCTGGGGGAATATTCA880
881TCTATACCCAGGTATCAATAACCCATTTCCTCCTGGAGTC920
921CTCCGCCCTCCTGGCTCTTCTTGGAACATCCCAGCTGGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。