演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C6

complement C6

C6 編碼 complement C6,是補體膜攻擊複合體(MAC)的組成蛋白,參與複合體在目標細胞膜上形成孔洞的過程。

Homo sapiens5p13.1UniProt P13671
OFFICIAL SYMBOL
C6
CHROMOSOME
5
UNIPROT
P13671
PDB / ALPHAFOLD
8B0F
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C6 是一種蛋白質編碼基因,其產物 complement C6 屬於 complement C6/C7/C8/C9 蛋白質家族。這種蛋白質長 934 個胺基酸,具有多種結構域與功能區域,包括 MACPF、TSP type-1、Sushi、Kazal-like、LDL-receptor class A 及 EGF-like 結構域,並含有 C5b-binding domain。這些結構特徵構成其蛋白質架構;其在補體膜攻擊複合體中的角色見下文說明。

Official symbol
C6
Gene name
complement C6
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1339
UniProt
P13671
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55p13.1
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegC6pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:41,140,236–41,261,561
Gene span
121,326 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000337836 ★41,142,116–41,213,53218
ENST0000026341341,140,236–41,261,56118
ENST0000090524941,140,236–41,213,60818
ENST0000090525041,140,236–41,213,60819
ENST0000090525141,140,236–41,213,60815
ENST0000090525241,140,236–41,213,60819
ENST0000090525341,140,236–41,213,60815
ENST0000090525441,140,236–41,213,60819
ENST0000090525541,140,236–41,213,60817
ENST0000090525641,140,236–41,213,60819
ENST0000090525741,140,236–41,213,60819
ENST0000090525841,140,236–41,213,60818

顯示 12/53 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

complement C6 是膜攻擊複合體(MAC)的組成成分。MAC 是由補體級聯反應啟動的多蛋白複合體,形成後可插入目標細胞膜並在膜上造成孔洞,進而導致細胞膜破裂與細胞裂解。C6 因此參與補體反應對目標細胞膜造成破壞的過程。

MAC 的形成始於補體 C5 被蛋白水解切割,產生 complement C5b。此切割可由典型、替代、凝集素及 GZMK 補體途徑引發。這些途徑由一連串蛋白質反應構成,與吞噬及病原體分解相關,也會傳遞能強化適應性免疫系統的訊號。

在複合體組裝過程中,complement C5b 與 C6 一同與目標細胞膜外側脂質層結合。兩者的膜關聯作用可降低膜彎曲所需的能量,支持後續 MAC 組裝。C6 的功能重點在於參與這項組裝過程,而後續形成的 MAC 才在目標膜上建立孔洞並造成細胞裂解。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 41213532 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C6 ENST00000337836 GRCh38 chr5:41213432-41214532 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAAATCTCAATGTAGTATAAGAGAGAGAAAAAAGACTGGAAATCAGATCATCTGTATTCCAGTTCTGAC
TTACTCTGGCCTTGGGAAAGTTACTACCATGTATATTAAACTATGTGACCTTTGAGTGGTGGGTTCCCAG
CTGTGTTTCAAGTAATCTTTAGACTTGCTGAGATCATCATTTCCCACCATGTGATAAAAATCTAAGCTGT
CTAAGGAATATTTGTTTTAGTTGTTTTCTACTGCTTTGAAAAAAGTTTGAAAAACACTTGTTTTACAAAT
GAGGGACCAGTGTTCCAATGAGGTATAGTGATTTATTGAAGCTCACATAGCTGGTAGCTGCTTAGTGCAG
AAACAAGACTAGAATATGTATCCACATTCTCAGTCCCTATAGTTTTTTTTCTTTTCTATTGCACTATTTT
GTTCTGCTTCACCTTAGGATGAAATCCATTTTACTTCAATCTAAAGTTAAATTGCAACCATTTCAGAGAA
GCGTAATCATCATTACATATAAAGAGCCCATTTGATCATTGCTATTTTAATTCTTTCCAAATTAAATTTT
CTGTTTGGTTTTGCTGGCATATAGAAACACTTTTTACTATAATAAACTTGTGTTGATAAATCATACTAAA
TTCATTTATTAATTCTAATGTTTGTAGATTCTTTTGAATTTTCTACATACACAATCACATTGTCTCCAAA
AACATTTCTTAAATAGTTACCAATAACTATTCTATAATCAAAAACTAAGAATCTATACATTCCTAAGGGG
GGCAGCAATTTTAAGCAATTAATCTAAAGGATTCTTTAAAATGGAAAGAGAGATTTCTATGCAGTAGCAA
TAGCTACTACAATAGCCCTTGAATTGAAAACTCACTGAAAATTCAGGACTCTGTGTAACATCCAACACCC
AGAGTTTCAGGGTTACTACTGATTGGTGTAATCATTTGCAAAGTTCAAGTTCCAGAGAACATTTATTTTG
ACAACCCTCTAGGTGTTGCTAGGCTTCTGGGATATGACAGCATTGCCTTGTGTTAGCTAGCAATAAGAAA
AGAAGCTTTGTTTGGATTAACATATATACCCTCTTCATTCTGCATACCTAT
C6 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C6_1 ↗5:41,213,491負股41,213,481–41,213,540
C6_2 ↗5:41,232,564負股41,232,554–41,232,613

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 41211644–41211657 · motif

· motif · 41213567–41213582 · motif

· motif · 41213575–41213589 · motif

· motif · 41214361–41214372 · motif

· motif · 41214367–41214381 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:934 aa

1 aa934 aa結構域功能區域訊號胜肽跨膜區
依 P13671 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

complement C6 長 934 個胺基酸,具有 N 端訊號序列(第 1–21 位)。其結構包含 MACPF、三個 TSP type-1、兩個 Sushi、兩個 Kazal-like,以及 LDL-receptor class A 和 EGF-like 結構域;另有 C5b-binding domain。第 278–290 位與第 402–415 位各註記一段 β 股跨膜區。

訊號胜肽1–21 aa
跨膜區Beta stranded278–290 aa
跨膜區Beta stranded402–415 aa
結構域TSP type-1 122–79 aa
結構域TSP type-1 281–134 aa
結構域LDL-receptor class A138–175 aa
結構域MACPF176–522 aa
結構域EGF-like523–553 aa
結構域TSP type-1 3565–612 aa
結構域Sushi 1642–701 aa
結構域Sushi 2702–763 aa
結構域Kazal-like 1780–839 aa
結構域Kazal-like 2876–934 aa
功能區域CCP 1611–688 aa
功能區域C5b-binding domain642–934 aa
功能區域CCP 2689–765 aa
功能區域Factor I module (FIM) 1766–840 aa
功能區域Factor I module (FIM) 2858–934 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8B0F…

PDB · 8B0F

EM · 3.00 A · B=1-934

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Target cell membrane

complement C6 以可溶性蛋白質形式分泌;參與 MAC 作用時則可插入目標細胞膜。 資料亦將其描述為目標細胞膜上的多次跨膜蛋白質,並指出其由分泌狀態轉至目標膜的插入情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C6C6NCK1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

complement C6 是 MAC 的組成亞基。該複合體包含 complement C5b、C6、C7、C8A、C8B、C8G,以及多個具成孔作用的 C9。此資料支持 C6 與這些蛋白共同構成複合體,但未逐一說明各亞基間的直接結合關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

complement component 6 deficiency(C6D)是罕見的補體典型途徑缺陷,與嚴重、反覆感染的易感性相關,感染主要由 Neisseria gonorrhoeae 或 Neisseria meningitidis 引起。疾病易感性與此基因的變異相關;資料未將這項關聯描述為直接因果。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能complement C6 是補體膜攻擊複合體(MAC)的組成成分。MAC 由補體級聯反應啟動,插入目標細胞膜並形成孔洞,造成膜破裂與細胞裂解。MAC 形成始於 C5 被蛋白水解切割為 complement C5b;典型、替代、凝集素及 GZMK 補體途徑均可引發此過程。補體級聯也與吞噬、病原體分解及強化適應性免疫系統的訊號有關。C5b 與 C6 結合目標膜外側脂質層,可降低膜彎曲所需能量。含實驗來源
證據與來源

Component of the membrane attack complex (MAC), a multiprotein complex activated by the complement cascade, which inserts into a target cell membrane and forms a pore, leading to target cell membrane rupture and cell lysis. The MAC is initiated by proteolytic cleavage of C5 into complement C5b in response to the classical, alternative, lectin and GZMK complement pathways. The complement pathways consist in a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. Together with component C5b, involved in MAC complex assembly: complement C5b and C6 associate with the outer leaflet of target cell membrane, reducing the energy for membrane bending

PMID 22267737 ↗ · PMID 22832194 ↗ · PMID 26841837 ↗ · PMID 27052168 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 32569291 ↗ · PMID 39814882 ↗ · PMID 39914456 ↗

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交互作用complement C6 是膜攻擊複合體(MAC)的組成成分。MAC 包含 complement C5b、C6、C7、C8A、C8B、C8G,以及多個具成孔作用的 C9。含實驗來源
證據與來源

Component of the membrane attack complex (MAC), composed of complement C5b, C6, C7, C8A, C8B, C8G and multiple copies of the pore-forming subunit C9

PMID 22267737 ↗ · PMID 22500023 ↗ · PMID 22832194 ↗ · PMID 26841837 ↗ · PMID 27052168 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 31061395 ↗ · PMID 32569291 ↗

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細胞定位complement C6 以可溶性蛋白質形式分泌,也可插入目標細胞膜;資料將其描述為目標膜上的多次跨膜蛋白質。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Target cell membrane / Multi-pass membrane protein; Secreted as soluble protein. Inserts into the cell membrane of target cells

PMID 2808363 ↗ · PMID 30552328 ↗ · PMID 31061395 ↗ · PMID 32569291 ↗

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疾病關聯complement component 6 deficiency(C6D)是罕見的補體典型途徑缺陷,與嚴重且反覆感染的易感性相關,感染主要由 Neisseria gonorrhoeae 或 Neisseria meningitidis 引起。疾病易感性與此基因的變異相關。含實驗來源
證據與來源

Complement component 6 deficiency C6D A rare defect of the complement classical pathway associated with susceptibility to severe recurrent infections, predominantly by Neisseria gonorrhoeae or Neisseria meningitidis. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612446

PMID 15565285 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000337836 · 3,691 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGCTTCTGGGATATGACAGCATTGCCTTGTGTTAGCTAG40
41CAATAAGAAAAGAAGCTTTGTTTGGATTAACATATATACC80
81CTCTTCATTCTGCATACCTATTTTTTCCCCAATAATTTGC120
121AGCTTAGGTCCGAGGACACCACAAACTCTGCTTAAAGGGC160
161CTGGAGGCTCTCAAGGCATGGCCAGACGCTCTGTCTTGTA200
201CTTCATCCTGCTGAATGCTCTGATCAACAAGGGCCAAGCC240
241TGCTTCTGTGATCACTATGCATGGACTCAGTGGACCAGCT280
281GCTCAAAAACTTGCAATTCTGGAACCCAGAGCAGACACAG320
321ACAAATAGTAGTAGATAAGTACTACCAGGAAAACTTTTGT360
361GAACAGATTTGCAGCAAGCAGGAGACTAGAGAATGTAACT400
401GGCAAAGATGCCCCATCAACTGCCTCCTGGGAGATTTTGG440
441ACCATGGTCAGACTGTGACCCTTGTATTGAAAAACAGTCT480
481AAAGTTAGATCTGTCTTGCGTCCCAGTCAGTTTGGGGGAC520
521AGCCATGCACTGCGCCTCTGGTAGCCTTTCAACCATGCAT560
561TCCATCTAAGCTCTGCAAAATTGAAGAGGCTGACTGCAAG600
601AATAAATTTCGCTGTGACAGTGGCCGCTGCATTGCCAGAA640
641AGTTAGAATGCAATGGAGAAAATGACTGTGGAGACAATTC680
681AGATGAAAGGGACTGTGGGAGGACAAAGGCAGTATGCACA720
721CGGAAGTATAATCCCATCCCTAGTGTACAGTTGATGGGCA760
761ATGGGTTTCATTTTCTGGCAGGAGAGCCCAGAGGAGAAGT800
801CCTTGATAACTCTTTCACTGGAGGAATATGTAAAACTGTC840
841AAAAGCAGTAGGACAAGTAATCCATACCGTGTTCCGGCCA880
881ATCTGGAAAATGTCGGCTTTGAGGTACAAACTGCAGAAGA920
921TGACTTGAAAACAGATTTCTACAAGGATTTAACTTCTCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。