基因總覽
C5AR1 是蛋白質編碼基因,其產物 complement C5a receptor 1 為多次穿膜受體,歸屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。受體具有胞外區、七段穿膜螺旋與細胞質區,胞外 N 端及穿膜區均包含與配體辨識相關的區域。這種膜蛋白架構使其能在細胞外接收訊號,並透過細胞內側的分子傳遞訊息。其主要角色是作為 C5a 的受體,參與對趨化與發炎訊號的回應。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000355085 ★ | 47,309,861–47,322,066 | 2 |
| ENST00000594787 | 47,297,075–47,320,186 | 4 |
| ENST00001041457 | 47,309,850–47,322,075 | 3 |
| ENST00001125754 | 47,309,850–47,322,061 | 3 |
| ENST00001136063 | 47,309,850–47,322,075 | 2 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
C5AR1 的產物是趨化與發炎胜肽 anaphylatoxin C5a 的受體。C5a 與受體結合後,可促進細胞趨化、顆粒酵素釋放、細胞內鈣離子釋放及超氧陰離子生成,將胞外配體訊號轉化為多種細胞反應。
配體結合會引起受體構形改變,進而啟動 G protein 訊號並調節下游效應分子,例如 adenylate cyclase。C5AR1 與 G(i)/G(o) 類 Gα 蛋白(GNAI1 或 GNAO1)偶聯,並介導 adenylate cyclase 活性受到抑制。這說明受體活化不只辨識 C5a,也會透過 G 蛋白調整細胞內訊號傳遞。
C5a 與受體至少透過兩個位置互動:胞外 N 端提供高親和力結合位點,另一處位於穿膜區,並與下游訊號活化相關。兩處的作用共同連結配體辨識與訊號傳遞,使 C5AR1 能引發多種細胞反應;來源所述的效應包括趨化、顆粒酵素釋放、鈣離子動態及超氧陰離子生成。
Promoter 與基因調控
>C5AR1 ENST00000355085 GRCh38 chr19:47308861-47309961 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCTCCCAGGTTTAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCTTCCCAAGTAGCTGGGATTACAGGCACCTGCCACCA CACCTGGGTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGACTCGTCTTGAACTC CTGACCTCAAGTGATTCATTTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTATAGGTGTGAGCCATTGCACCT GGCCCTAGAAGGAAGATTTAACAGTAAAATATACTTAAATGCTGGGCTACCTCCGCAGACTAGCTCAGCC TCTTTGGGTCTCAAATCAGCCTGGCCGGGAGGCTGAGTGGAGGTTACAGTCTCTGCTTTCTTGAATCCCA AGGGAGGGGTTTAAGCCAACTGCATTCCTGAGCTTTTGCCCAGAAGGCTGGCGTCTTAGGAGGAAAGAGA TAGATGGCTCCAGGCCGGGCGCAGTGGCTCACACTTGTAATTCTAGCACTTTGGGAGGTTGAGGTGGGTG ATTGCCTGAGCTCAGGAGTTTGAGTCCAGCCTGGCCAACATGGCGAAACCCCGTCTTTACTAAAAATACA AAAAATTAGCCGGGGGTGGTGACACACACGTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAAGTG CTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTACAGAGAGCCGAGATTGCACCACTCCACTGCAGCCTGGGCGACACAG CAAGACTCTATCAAAAAAAAAAAAAAAAAAATGAGAGAGAAGAGATGGCCCCAAATAGGGAAACCAAGGC CAGGAGAGGGGCCGAGCCTGCACAGGAGCTTCCTCGGTTTTCCGAGCGCCGGCCCCCCTTCTCTGCCTGG GAGGAGGTGGTTAGAGTCCCCTGGGTGTGTGCCCCGCAGAGGGAGCTCTGGCCTCAGTGCCCAGTGTGCA GACCAATGAGAGCCCCAGAGAGAAAGACGGTCATTTCCTCCCTGCATCTTCCCTTGGGGCTTTAAAAACC ACAGCCCTTGGGCAGGAGGGACCTTCGATCCTCGGGGAGCCCAGGAGACCAGAACATGGTGAGTCTCGAA GGGGAATGGGAGCAGGAAACTTTGTCCTGGGTCCCTCCCATCTTTGCTCCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C5AR1_1 ↗ | 19:47,309,861 | 正股 | 47,309,812–47,309,871 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR19_9NQXX · enhancer · 47305305–47305800 · regulatory
ENSR19_5F5FCP · CTCF_binding_site · 47305443–47305464 · regulatory
ENSR19_83DK22 · enhancer · 47309136–47309304 · regulatory
ENSR19_83DK2C · promoter · 47309662–47309871 · regulatory
ENSR19_9NR2J · enhancer · 47310828–47311193 · regulatory
ENSR19_9NR37 · enhancer · 47313193–47313500 · regulatory
· motif · 47305445–47305461 · motif
· motif · 47305456–47305463 · motif
· motif · 47305677–47305692 · motif
· motif · 47305709–47305720 · motif
· motif · 47305709–47305720 · motif
· motif · 47308993–47309008 · motif
· motif · 47308998–47309010 · motif
· motif · 47309001–47309008 · motif
· motif · 47309409–47309420 · motif
· motif · 47309715–47309728 · motif
· motif · 47309715–47309728 · motif
· motif · 47309818–47309831 · motif
· motif · 47309818–47309831 · motif
· motif · 47309973–47309984 · motif
· motif · 47310164–47310177 · motif
· motif · 47310164–47310177 · motif
· motif · 47310165–47310178 · motif
· motif · 47310165–47310178 · motif
· motif · 47311784–47311799 · motif
· motif · 47311789–47311801 · motif
· motif · 47311792–47311799 · motif
· motif · 47311860–47311875 · motif
· motif · 47312304–47312319 · motif
· motif · 47313196–47313211 · motif
· motif · 47313201–47313213 · motif
· motif · 47313204–47313211 · motif
· motif · 47313204–47313219 · motif
· motif · 47313523–47313538 · motif
· motif · 47313529–47313541 · motif
· motif · 47313531–47313538 · motif
· motif · 47313531–47313546 · motif
· motif · 47314617–47314628 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:350 aa
complement C5a receptor 1 長 350 個胺基酸,具有胞外 N 端、七段螺旋穿膜區及細胞質區。第 10–18 位胺基酸區域為 CHIPS 結合所需,第 21–30 位參與 C5a 結合;第 336–339 位含有 P-X-P-P motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C5AR1 位於細胞膜,屬多次穿膜蛋白。 磷酸化的 C5aR 會與 ARRB1、ARRB2 在細胞質囊泡中共定位;此描述涉及磷酸化狀態,並非將 ARRB1 或 ARRB2 的定位視為未修飾受體的定位。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
C5AR1 可形成同源二聚體,也可能形成更高階寡聚體。受體磷酸化時會與 ARRB1、ARRB2 互作,此互作與受體內化及對配體的短期去敏化相關。微生物感染時,Staphylococcus aureus 的 chemotaxis inhibitory protein(CHIPS)可經由 C5AR1 的 N 端與其互作,阻斷受體,因而可能抑制免疫反應。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | C5AR1 是趨化與發炎胜肽 anaphylatoxin C5a 的受體,可促進細胞趨化、顆粒酵素釋放、細胞內鈣離子釋放及超氧陰離子生成。配體結合引發受體構形改變,啟動 G 蛋白訊號並調節 adenylate cyclase 等下游效應;受體與 G(i)/G(o) 類 Gα 蛋白 GNAI1 或 GNAO1 偶聯,抑制 adenylate cyclase。C5a 至少接觸兩處:胞外 N 端的高親和力位點,以及參與下游訊號活化的穿膜區位點。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for the chemotactic and inflammatory peptide anaphylatoxin C5a, stimulating chemotaxis, granule enzyme release, intracellular calcium release and superoxide anion production. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors, such as adenylate cyclase. C5AR1 is coupled to G(i)/G(o) (GNAI1 or GNAO1) G alpha proteins and mediates inhibition of adenylate cyclase. The ligand interacts with at least two sites on the receptor: a high-affinity site on the extracellular N-terminus, and a second site in the transmembrane region which activates downstream signaling events PMID 10636859 ↗ · PMID 15153520 ↗ · PMID 1847994 ↗ · PMID 29300009 ↗ · PMID 36806352 ↗ · PMID 37852260 ↗ · PMID 7622471 ↗ · PMID 8182049 ↗ · PMID 9553099 ↗ |
| 交互作用 | C5AR1 可形成同源二聚體,也可能組成更高階寡聚體。受體磷酸化時會與 ARRB1、ARRB2 互作;此互作與受體內化及對配體的短期去敏化相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. May also form higher-order oligomers. Interacts (when phosphorylated) with ARRB1 and ARRB2; the interaction is associated with internalization of the receptor and short-term desensitization to the ligand PMID 12464600 ↗ · PMID 12835319 ↗ · PMID 29300009 ↗ · PMID 37209686 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下,Staphylococcus aureus 的 chemotaxis inhibitory protein(CHIPS)會經由自身與 C5AR1 的 N 端互作。這種互作可阻斷受體,因此可能抑制免疫反應。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via N-terminal domain) with S.aureus chemotaxis inhibitory protein (CHIPS); the interaction blocks the receptor and may thus inhibit the immune response PMID 15153520 ↗ · PMID 15542591 ↗ · PMID 21706042 ↗ |
| 細胞定位 | C5AR1 是多次穿膜蛋白,位於細胞膜;另有細胞質囊泡中的定位描述。磷酸化的 C5aR 會與 ARRB1 和 ARRB2 在細胞質囊泡中共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Cytoplasmic vesicle; Phosphorylated C5aR colocalizes with ARRB1 and ARRB2 in cytoplasmic vesicles PMID 12464600 ↗ · PMID 29300009 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACCTTCGATCCTCGGGGAGCCCAGGAGACCAGAACATGGA40CTCCTTCAATTATACCACCCCTGATTATGGGCACTATGAT80GACAAGGATACCCTGGACCTCAACACCCCTGTGGATAAAA120CTTCTAACACGCTGCGTGTTCCAGACATCCTGGCCTTGGT160CATCTTTGCAGTCGTCTTCCTGGTGGGAGTGCTGGGCAAT200GCCCTGGTGGTCTGGGTGACGGCATTCGAGGCCAAGCGGA240CCATCAATGCCATCTGGTTCCTCAACTTGGCGGTAGCCGA280CTTCCTCTCCTGCCTGGCGCTGCCCATCTTGTTCACGTCC320ATTGTACAGCATCACCACTGGCCCTTTGGCGGGGCCGCCT360GCAGCATCCTGCCCTCCCTCATCCTGCTCAACATGTACGC400CAGCATCCTGCTCCTGGCCACCATCAGCGCCGACCGCTTT440CTGCTGGTGTTTAAACCCATCTGGTGCCAGAACTTCCGAG480GGGCTGGCTTGGCCTGGATCGCCTGTGCCGTGGCTTGGGG520TTTAGCCCTGCTGCTGACCATACCCTCCTTCCTGTACCGG560GTGGTCCGGGAGGAGTACTTTCCACCAAAGGTGTTGTGTG600GCGTGGACTACAGCCACGACAAACGGCGGGAGCGAGCCGT640GGCCATCGTCCGGCTGGTCCTGGGCTTCCTGTGGCCTCTA680CTCACGCTCACGATTTGTTACACTTTCATCCTGCTCCGGA720CGTGGAGCCGCAGGGCCACGCGGTCCACCAAGACACTCAA760GGTGGTGGTGGCAGTGGTGGCCAGTTTCTTTATCTTCTGG800TTGCCCTACCAGGTGACGGGGATAATGATGTCCTTCCTGG840AGCCATCGTCACCCACCTTCCTGCTGCTGAAGAAGCTGGA880CTCCCTGTGTGTCTCCTTTGCCTACATCAACTGCTGCATC920AACCCCATCATCTACGTGGTGGCCGGCCAGGGCTTCCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。