演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C4BPAC4BP

complement component 4 binding protein alpha

C4BPA 編碼 complement component 4 binding protein alpha,是參與補體經典途徑調控的蛋白質。

Homo sapiens1q32.2UniProt P04003
OFFICIAL SYMBOL
C4BPA
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P04003
PDB / ALPHAFOLD
2A55
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C4BPA 是蛋白質編碼基因,其產物為 complement component 4 binding protein alpha。這條 alpha chain 是補體調控蛋白的一部分,來源資料指出它可參與控制補體經典途徑的活化;其蛋白質組成與結構形式另見交互作用說明。

Official symbol
C4BPA
Gene name
complement component 4 binding protein alpha
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1325
UniProt
P04003
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C4BP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q32.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegC4BPApq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:207,102,319–207,145,047
Gene span
42,729 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000367070 ★207,104,233–207,144,97212
ENST00000902659207,102,319–207,145,04712
ENST00000902660207,102,319–207,145,04712
ENST00000902661207,102,319–207,145,04712
ENST00000902662207,102,851–207,145,04712
ENST00000902663207,102,851–207,145,04712
ENST00000902664207,102,899–207,145,04712
ENST00000902665207,102,899–207,145,04712
ENST00000902666207,104,163–207,145,04711
ENST00000902667207,104,163–207,145,04711
ENST00000902668207,104,163–207,145,04712
ENST00000902669207,104,163–207,145,04713

顯示 12/58 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

C4BPA 的 alpha chain 參與控制補體經典途徑的活化。它結合補體片段 C4b,並作為 C3b/C4b inactivator(C3bINA)的輔因子;C3bINA 隨後可水解 C4b,因而參與調控補體片段的活性。

此外,C4BPA 可促進 C4bC2a 複合體(C3 convertase)的降解,方式是使其中的補體片段 C2a 解離。這項作用與對 C4b 的調控共同構成來源所述的經典途徑控制方式。

來源也記載 C4BPA 與抗凝血蛋白 protein S 及 serum amyloid P component 互相作用;資料未進一步說明這些互作的功能效果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 207104233 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C4BPA ENST00000367070 GRCh38 chr1:207103233-207104333 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACATTGGAAAACGGTACTTTAAAGAAATAGCAGCTTTAAAGGTGATATTTCTTCCAATTTAGTCTCAAGA
CTGTGCAATCTGGAATCCTCCTCTATCTTCATTCTGGTCAAATCAGTGTCTCACCTTGGTGACCTAGCGC
ATGGTTTCTTTACATCTAATATCCTTACCACTTTTATCTAATAATTTCTACCTTTTATCCAAATCTCACA
TCTTCTGTAGAAACTTCCTTGATTAACTCAACCTGTTGTAGTTTAGTTCCTTTTCTGAAACTCTTCTGGG
ACTTTCAGTATTTATTACAGAAAAAGTGAAGTTCTCAGAAAGAATTGCCTTTTAATAGCAATCTTCTGAG
CACACAAATCTTAACCTTGAGGATTAGTAGCTTAATTGGACTATGTAAGTGCTTGTGGTCTTTTTAGATC
TATGCGAGAGGAAACATGGCCGGTCCTTCATTGCGTTCTTCTGAGCGCACTGGATAGATCAATTTTTGGA
GGCCCTCTGGTGCCTGACATGTAGTAGCAGTTAACATTTGCTGAACTCCAAATACGTTCTAGATAACTCA
GCACATAGTGGAAACCCAATGCATGTTTGATAAATTCCCCACCTTTTGTAATTCCTTGGGGTGGGATAGA
GACGAGCTCTGGGCAAGAATATCAGTTTTCAAACTCCAGGAAAGCATACTGGACCTAGTGTCATGGAAAG
TGGATCATTTTTGCGGAGGCTCTCTGAACCTCGCAGTATCCAAGGTTTCCAGGCTAGCTGGACTGTGTCT
TGCCATAACCCTTATGTGTTTATGAAAAGAAAAAAGAATTCTGGCTTCAAATTCAAATTACCTTTCCACT
TAGGGGAAATGGTTGGCAGAGGAGAAAATAAACGATTGCGACATGTTACGAAGAATGAGGACTAGCAAAG
AGGAAGGAGCTTAGGTAAACAGTGCTGCTTTATTTCTGCTGTTAATCATTCATTGGGCCCGTCAAAAGTT
TCTGCCCATCTATTTCCATCAACCGTCCTTGACCAGCCAACCACATGGCTGAAATTCAGGGACTCTTTGG
TGGAGCAATTACCAGTCAACTTCAGGGTATTATGATAAACTCTGATCTGGG
C4BPA 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C4BPA_1 ↗1:207,104,233正股207,104,184–207,104,243

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 207102307–207102320 · motif

· motif · 207103617–207103632 · motif

· motif · 207104318–207104331 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:597 aa

1 aa597 aa結構域訊號胜肽
依 P04003 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

complement component 4 binding protein alpha 長 597 個胺基酸。序列註解列出位於第 1–48 個胺基酸的訊號區,以及八個連續的 Sushi 結構域:Sushi 1 至 Sushi 8,分別位於第 49–540 個胺基酸的不同區段。

訊號胜肽1–48 aa
結構域Sushi 149–110 aa
結構域Sushi 2111–172 aa
結構域Sushi 3173–236 aa
結構域Sushi 4237–296 aa
結構域Sushi 5297–362 aa
結構域Sushi 6363–424 aa
結構域Sushi 7425–482 aa
結構域Sushi 8483–540 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2A55…

PDB · 2A55

NMR · - · A=49-172

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

C4BPA 的蛋白質產物被標註為分泌型;來源未提供其在細胞內的具體定位或定位改變條件。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C4BPC4BPACRParp4
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C4BPA 可形成由 alpha chain 與 beta chain 以雙硫鍵連結的複合體,記載有三種組成:七條 alpha chain 加一條 beta chain、七條 alpha chain 組成的同源七聚體,或六條 alpha chain 加一條 beta chain。alpha chain 同源聚合體的中央部分支撐觸手狀結構,其末端各有 C4b 結合位點。感染情境下,C4BPA 也會與 Staphylococcus aureus 蛋白質 SdrE 互作;此互作會抑制補體介導的細菌調理作用。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能C4BPA 控制補體經典途徑的活化;其 alpha chain 結合 C4b,並作為 C3b/C4b inactivator(C3bINA)的輔因子,使後者水解 C4b。它也藉由促使 C2a 解離,加速 C4bC2a(C3 convertase)降解,並與 protein S 及 serum amyloid P component 互作。資料庫紀錄
證據與來源

Controls the classical pathway of complement activation. It binds as a cofactor to C3b/C4b inactivator (C3bINA), which then hydrolyzes the complement fragment C4b. It also accelerates the degradation of the C4bC2a complex (C3 convertase) by dissociating the complement fragment C2a. Alpha chain binds C4b. It also interacts with anticoagulant protein S and with serum amyloid P component

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用C4BPA 可形成三種雙硫鍵連結複合體:七條 alpha chain 與一條 beta chain 組成的 570 kDa 複合體、530 kDa 的 alpha chain 同源七聚體,或六條 alpha chain 與一條 beta chain 組成的 500 kDa 複合體。alpha chain 同源聚合體中央支撐觸手狀結構,每條觸手末端都有 C4b 結合位點。含實驗來源
證據與來源

Disulfide-linked complex of alpha and beta chains of 3 possible sorts: a 570 kDa complex of 7 alpha chains and 1 beta chain, a 530 kDa homoheptamer of alpha chains or a 500 kDa complex of 6 alpha chains and 1 beta chain. The central body of the alpha chain homomer supports tentacles, each with the binding site for C4b at the end

PMID 16330538 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,C4BPA 與 Staphylococcus aureus 蛋白質 SdrE 互作;此互作會抑制補體介導的細菌調理作用。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Staphylococcus aureus protein SdrE; this interaction inhibits complement-mediated bacterial opsonization

PMID 24600566 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000367070 · 2,272 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACCGTCCTTGACCAGCCAACCACATGGCTGAAATTCAGG40
41GACTCTTTGGTGGAGCAATTACCAGTCAACTTCAGGGTAT80
81TATGATAAACTCTGATCTGGGGAGGAACCAGGACTACATA120
121GATCAAGGCAGTTTTCTTCTTTGAGAAACTATCCCAGATA160
161TCATCATAGAGTCTTCTGCTCTTCCTCAACTACCAAAGAA200
201AAACATCAGCGAAGCAGCAGGCCATGCACCCCCCAAAAAC240
241TCCATCTGGGGCTCTTCATAGAAAAAGGAAAATGGCAGCC280
281TGGCCCTTCTCCAGGCTGTGGAAAGTCTCTGATCCAATTC320
321TCTTCCAAATGACCTTGATCGCTGCTCTGTTGCCTGCTGT360
361TCTTGGCAATTGTGGTCCTCCACCCACTTTATCATTTGCT400
401GCCCCGATGGATATTACGTTGACTGAGACACGCTTCAAAA440
441CTGGAACTACTCTGAAATACACCTGCCTCCCTGGCTACGT480
481CAGATCCCATTCAACTCAGACGCTTACCTGTAATTCTGAT520
521GGCGAATGGGTGTATAACACCTTCTGTATCTACAAACGAT560
561GCAGACACCCAGGAGAGTTACGTAATGGGCAAGTAGAGAT600
601TAAGACAGATTTATCTTTTGGATCACAAATAGAATTCAGC640
641TGTTCAGAAGGATTTTTCTTAATTGGCTCAACCACTAGTC680
681GTTGTGAAGTCCAAGATAGAGGAGTTGGCTGGAGTCATCC720
721TCTCCCACAATGTGAAATTGTCAAGTGTAAGCCTCCTCCA760
761GACATCAGGAATGGAAGGCACAGCGGTGAAGAAAATTTCT800
801ACGCATACGGCTTTTCTGTCACCTACAGCTGTGACCCCCG840
841CTTCTCACTCTTGGGCCATGCCTCCATTTCTTGCACTGTG880
881GAGAATGAAACAATAGGTGTTTGGAGACCAAGCCCTCCTA920
921CCTGTGAAAAAATCACCTGTCGCAAGCCAGATGTTTCACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。