基因總覽
C4A 的正式名稱為 complement C4A (Chido/Rodgers blood group)，屬蛋白質編碼基因。其產物是補體級聯反應中非酵素性成分的前體，涉及 classical、lectin 與 GZMK 補體途徑。這些途徑由一連串蛋白質反應構成，與病原體的吞噬及分解，以及增強適應性免疫系統的訊號傳遞相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000428956 ★ | 31,982,057–32,002,681 | 41 |
| ENST00000498271 | 31,981,991–32,005,247 | 40 |
| ENST00000883667 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000883668 | 31,981,991–32,005,247 | 40 |
| ENST00000883670 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000883671 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000883672 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000883673 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000883674 | 31,981,991–32,005,247 | 40 |
| ENST00000883675 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000883676 | 31,981,991–32,005,247 | 41 |
| ENST00000967848 | 31,981,991–32,005,247 | 40 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
C4A 產物是 classical、lectin 與 GZMK 補體途徑中非酵素性成分的前體。補體途徑由蛋白質級聯反應構成，可促進病原體被吞噬與分解，並傳遞增強適應性免疫系統的訊號。
依補體途徑而異，C1S、MASP2 或 GZMK 可裂解此蛋白，生成的 C4b 共價附著於病原體表面，作為調理素標記抗原表面，促進其移除。C4b 接著招募絲胺酸蛋白酶 complement C2b，形成 C3 轉化酶與 C5 轉化酶；兩者分別裂解並活化 C3、C5，使補體級聯得以往下進行。
不同 C4b 同種型形成鍵結的方式有所差異：complement C4b-A 能有效與免疫聚集物或蛋白質抗原形成醯胺鍵；complement C4b-B 則催化硫酯羰基的轉醯基反應，與醣類抗原形成酯鍵。這些差異描述了 C4b 與不同靶標表面連結的方式。
裂解後釋出的 C4a 被提出可能是體液性介質，且與過敏毒素相似，但其作用仍不明。曾有報告指出它可能介導局部發炎；然而，相關生物測定中的效果可能來自 C3a 或 C5a 過敏毒素污染，因此尚不能確定該發炎作用是由 C4a 本身造成。
Promoter 與基因調控
>C4A ENST00000428956 GRCh38 chr6:31981057-31982157 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTCATCATTGCTCAGCTCCTCAGAGTGGGCCGGGAGGGGACTAGAAGAGCTGCATGATGGTGGCTGAGA CAGGGTCACCTTGGGAAGGCTTGGGAGCCAGGATGAGTGTCGGGCTCTCGTGTGTGCAAAAGGTCAGATG TGACTGCTGCTGTTTGCCTGGTTTCTGACCCAGTGGTGGGGTTTGAGCAATGCTTCTCTGCCCTTCCATG GAAAGTGGAACCAGAAATGGTGCCAAGGCTGTGGCTGTTCCCTTTCGTGTAAAATGGTGCTGTTATTACT CTGTCTTGAAATAGGAAGGTGGGATTTCTGGGGAGGCTGGTGAAGGAGGGCAGGGTTCTTTTCTCTACGT GTCATGTTAAAATTGCCAAATAAAGTACCTCTGCCTGTGATATTTTCTGGATGTCCTTTATTTACTGTGA CGTGTGTTTGGGTGCCTTGTTTAGGGGTAGAGGTGAAGTCTGAGCTTTGCCTCATTCAGAGAGGAAAGGG GTCAGGGGTTCACTCTGACGTTCAGGCCATTCTCCCTGTGGAGTGGTGAGGGTGTACCTAATCTCCTAAA CCACGGAATTTCTGTTAGGGCCTAAAAAAGCAAAAGCCTAGTATAGTTCAATTTGTGTTGGAATGAAAGT AAGAGACAAGTGTCTTAGAAGCCTGTCATTGTTTTGTGAGGGCCTTTAAATATCCTGTACTCGTGGGCCA TGTTGGGCCCTTGTACGCCCAGGTATACATGAGCTTGTGTGCACCTATACCCTGATACAGATATACCTGG TAGGGGGAGGTGCTCAGGCACTGGAATGAGAGGAGTTAACGGGGAAGGACAGGGTTATTTCTGGGCCAAG ATTCAGAGTTTCCCATGGACACCCAGGTGTCCGGGGTGCCCCCACAACTCTGGGCCTGAGGCCAGTTGCA CTTCTTGGCTGTCACGTGGTTTCCCAGCTTAGCTGGGCTGGGGGAGGAGCAAGGTCCAGAGTCAACTCTG CCCCGAGGCCTAGCTTGGCCAGAAGGTAGCAGACAGACAGACGGATCTAACCTCTCTTGGATCCTCCAGC CATGAGGCTGCTCTGGGGGCTGATCTGGGCATCCAGCTTCTTCACCTTATC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C4A_1 ↗ | 6:31,980,699 | 正股 | 31,980,650–31,980,709 |
| C4A_2 ↗ | 6:31,982,057 | 正股 | 31,982,008–31,982,067 |
| C4B_1 ↗ | 6:32,014,795 | 正股 | 32,014,746–32,014,805 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9GNQ2 · promoter · 31981818–31982078 · regulatory
· motif · 31981186–31981199 · motif
· motif · 31981499–31981512 · motif
· motif · 31981544–31981557 · motif
· motif · 31981829–31981839 · motif
· motif · 31982006–31982016 · motif
· motif · 31982011–31982026 · motif
· motif · 31982018–31982033 · motif
· motif · 31982028–31982041 · motif
· motif · 31982452–31982467 · motif
· motif · 31982452–31982467 · motif
· motif · 31982942–31982955 · motif
· motif · 31983209–31983222 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1744 aa
此蛋白質長 1,744 個胺基酸，具有位於第 1–19 位的訊號序列。序列註解標示一段 Anaphylatoxin-like 結構域（第 702–736 位）及一段 NTR 結構域（第 1,595–1,742 位）。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C4A 產物可分泌；裂解產物 C4a 亦有分泌註記。 Complement C4b-A 可位於細胞表面，並共價附著於病原體表面；其內部硫酯鍵可與靶標表面的醣類抗原反應，形成醯胺鍵或酯鍵。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Synapse；Cell projection, axon；Cell projection, dendrite；Cell surface。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- TMEM89A2RUT3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
補體在血液中以由 alpha、beta 與 gamma 鏈透過雙硫鍵連結的三聚體形式循環。Complement C4b 則由 complement C4b-A、complement C4 beta 與 complement C4 gamma 鏈組成，鏈間以雙硫鍵相連。功能複合體方面，C4b 與絲胺酸蛋白酶 complement C2b 組成 C3 轉化酶 C4bC2b；加入 C3b 後形成 C5 轉化酶 C4bC2bC3b。
疾病與遺傳關聯
Complement component 4A deficiency 是一種罕見的 classical 補體途徑缺陷，與自體免疫疾病的發生相關，主要包括系統性紅斑狼瘡，可伴有或不伴有腎小球腎炎；此缺陷被描述為由影響 C4A 的變異所致。另有資料指出，影響此基因的變異與系統性紅斑狼瘡易感性相關。C4 拷貝數變異及相關多型性與易感性差異有關：總 C4 僅有兩個拷貝者風險顯著增加，而較高拷貝數是保護因子。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 10 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | C4A 產物是 classical、lectin 與 GZMK 補體途徑中非酵素性成分的前體。這些途徑由蛋白質級聯反應構成，可導致病原體被吞噬與分解，並傳遞能增強適應性免疫系統的訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Precursor of non-enzymatic components of the classical, lectin and GZMK complement pathways, which consist in a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system PMID 12878586 ↗ · PMID 18204047 ↗ · PMID 22691502 ↗ · PMID 22949645 ↗ · PMID 2395880 ↗ · PMID 32769120 ↗ · PMID 35428691 ↗ · PMID 39814882 ↗ · PMID 39914456 ↗ · PMID 8538770 ↗ |
| 功能 | C4A 裂解後形成非酵素性 C4b；依補體途徑不同，裂解酶可為 C1S、MASP2 或 GZMK。C4b 共價附著於病原體表面並作為調理素，標記抗原以利移除；它也招募 complement C2b，組成能分別裂解、活化 C3 與 C5 的轉化酶。C4b-A 偏於和免疫聚集物或蛋白質抗原形成醯胺鍵；C4b-B 則催化硫酯羰基轉醯基，形成與醣類抗原的酯鍵。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-enzymatic component of C3 and C5 convertases. Generated following cleavage by complement proteases (C1S, MASP2 or GZMK, depending on the complement pathway), it covalently attaches to the surface of pathogens, where it acts as an opsonin that marks the surface of antigens for removal. It then recruits the serine protease complement C2b to form the C3 and C5 convertases, which cleave and activate C3 and C5, respectively, the next components of the complement pathways. Complement C4b-A isotype is responsible for effective binding to form amide bonds with immune aggregates or protein antigens, while complement C4b-B isotype catalyzes the transacylation of the thioester carbonyl group to form ester bonds with carbohydrate antigens PMID 12878586 ↗ · PMID 18204047 ↗ · PMID 2387864 ↗ · PMID 27738201 ↗ · PMID 6906228 ↗ · PMID 8538770 ↗ |
| 功能 | C1S、MASP2 或 GZMK 依補體途徑裂解後會釋出 C4a；它被提出可能是體液性介質，且與過敏毒素高度相似，但作用尚不清楚。雖曾有報告將其視為局部發炎介質，相關生物測定效果可能是 C3a 或 C5a 過敏毒素污染所致，因此該作用仍有不確定性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Putative humoral mediator released following cleavage by complement proteases (C1S, MASP2 or GZMK, depending on the complement pathway). While it is strongly similar to anaphylatoxins, its role is unclear. Was reported to act as a mediator of local inflammatory process; however these effects were probably due to contamination with C3a and/C5a anaphylatoxins in biological assays PMID 6167582 ↗ · PMID 25659340 ↗ |
| 交互作用 | 補體在血液中以三聚體形式循環，三個組成鏈分別為 alpha、beta 與 gamma 鏈，彼此由雙硫鍵連結。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement circulates in blood as a disulfide-linked trimer of an alpha, beta and gamma chain PMID 4424566 ↗ |
| 交互作用 | Complement C4b 由 complement C4b-A、complement C4 beta 與 complement C4 gamma 鏈構成，鏈間以雙硫鍵相連。C4b 與絲胺酸蛋白酶 complement C2b 組成 C3 轉化酶 C4bC2b；再與 C3b 組成 C5 轉化酶 C4bC2bC3b。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement C4b is composed of complement C4b-A, complement C4 beta and complement C4 gamma chains that are associated via disulfide bonds. Non-enzymatic component of the C3 convertase, also named C4bC2b, composed of the serine protease complement C2b (C2), as well as complement C4b. Non-enzymatic component of the C5 convertase, also named C4bC2bC3b, composed of the serine protease complement C2b (C2), complement C3b, as well as complement C4b PMID 12878586 ↗ · PMID 1740458 ↗ · PMID 18204047 ↗ · PMID 22949645 ↗ · PMID 2387864 ↗ · PMID 27252379 ↗ · PMID 27599733 ↗ · PMID 3874204 ↗ · PMID 6906228 ↗ |
| 細胞定位 | C4A 產物有分泌定位記錄，亦記錄於突觸、軸突細胞突起及樹突細胞突起。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Synapse; Cell projection, axon; Cell projection, dendrite PMID 6167582 ↗ · PMID 8538770 ↗ · PMID 26814963 ↗ |
| 細胞定位 | C4a 過敏毒素有分泌定位記錄。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Complement C4b-A 有分泌及細胞表面定位記錄，並可共價附著於病原體表面。其內部硫酯鍵會與靶標表面的醣類抗原反應，形成醯胺鍵或酯鍵。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement C4b-A; Secreted; Cell surface; Covalently associated with the surface of pathogens: the internal thioester bond reacts with carbohydrate antigens on the target surface to form amide or ester bonds PMID 8538770 ↗ |
| 疾病關聯 | Complement component 4A deficiency 是罕見的 classical 補體途徑缺陷，與自體免疫疾病發生相關，主要為系統性紅斑狼瘡，可伴隨或不伴隨腎小球腎炎。此疾病被描述為由影響該基因的變異造成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Complement component 4A deficiency C4AD A rare defect of the complement classical pathway associated with the development of autoimmune disorders, mainly systemic lupus with or without associated glomerulonephritis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614380 PMID 8473511 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 C4A 的變異與系統性紅斑狼瘡易感性相關。個體間 complement C4 拷貝數變異及相關多型性造成易感性差異；總 C4 僅有兩個拷貝者，狼瘡易感風險顯著增加，而較高拷貝數具有保護作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Systemic lupus erythematosus SLE A chronic, relapsing, inflammatory, and often febrile multisystemic disorder of connective tissue, characterized principally by involvement of the skin, joints, kidneys and serosal membranes. It is of unknown etiology, but is thought to represent a failure of the regulatory mechanisms of the autoimmune system. The disease is marked by a wide range of system dysfunctions, an elevated erythrocyte sedimentation rate, and the formation of LE cells in the blood or bone marrow. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry. Interindividual copy-number variation (CNV) of complement component C4 and associated polymorphisms result in different susceptibilities to SLE. The risk of SLE susceptibility has been shown to be significantly increased among subjects with only two copies of total C4. A high copy number is a protective factor against SLE MIM: 152700 PMID 10092831 ↗ · PMID 17503323 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAAGGTAGCAGACAGACAGACGGATCTAACCTCTCTTGG40ATCCTCCAGCCATGAGGCTGCTCTGGGGGCTGATCTGGGC80ATCCAGCTTCTTCACCTTATCTCTGCAGAAGCCCAGGTTG120CTCTTGTTCTCTCCTTCTGTGGTTCATCTGGGGGTCCCCC160TATCGGTGGGGGTGCAGCTCCAGGATGTGCCCCGAGGACA200GGTAGTGAAAGGATCAGTGTTCCTGAGAAACCCATCTCGT240AATAATGTCCCCTGCTCCCCAAAGGTGGACTTCACCCTTA280GCTCAGAAAGAGACTTCGCACTCCTCAGTCTCCAGGTGCC320CTTGAAAGATGCGAAGAGCTGTGGCCTCCATCAACTCCTC360AGAGGCCCTGAGGTCCAGCTGGTGGCCCATTCGCCATGGC400TAAAGGACTCTCTGTCCAGAACGACAAACATCCAGGGTAT440CAACCTGCTCTTCTCCTCTCGCCGGGGGCACCTCTTTTTG480CAGACGGACCAGCCCATTTACAACCCTGGCCAGCGGGTTC520GGTACCGGGTCTTTGCTCTGGATCAGAAGATGCGCCCGAG560CACTGACACCATCACAGTCATGGTGGAGAACTCTCACGGC600CTCCGCGTGCGGAAGAAGGAGGTGTACATGCCCTCGTCCA640TCTTCCAGGATGACTTTGTGATCCCAGACATCTCAGAGCC680AGGGACCTGGAAGATCTCAGCCCGATTCTCAGATGGCCTG720GAATCCAACAGCAGCACCCAGTTTGAGGTGAAGAAATATG760TCCTTCCCAACTTTGAGGTGAAGATCACCCCTGGAAAGCC800CTACATCCTGACGGTGCCAGGCCATCTTGATGAAATGCAG840TTAGACATCCAGGCCAGGTACATCTATGGGAAGCCAGTGC880AGGGGGTGGCATATGTGCGCTTTGGGCTCCTAGATGAGGA920TGGTAAGAAGACTTTCTTTCGGGGGCTGGAGAGTCAGACC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。