基因總覽
C3AR1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 complement C3a receptor 1。其產物屬於 G protein-coupled receptor 1 家族,是位於細胞膜上的多次穿膜受體。蛋白質全長 482 個胺基酸,具有七段穿膜螺旋,並由細胞外區段與細胞質區段交錯構成。這種膜蛋白架構使受體能接收細胞外訊號,並將訊號傳向細胞內。C3AR1 的主要角色是辨識補體胜肽 C3a;其受體活性與趨化及發炎反應相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000307637 ★ | 8,056,844–8,066,359 | 2 |
| ENST00000904895 | 8,056,844–8,066,337 | 2 |
| ENST00000962850 | 8,056,844–8,066,440 | 3 |
| ENST00001136117 | 8,056,844–8,066,440 | 2 |
| ENST00000904894 | 8,056,871–8,066,440 | 2 |
| ENST00000546241 | 8,059,746–8,066,337 | 2 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
C3AR1 是趨化性及發炎性胜肽 anaphylatoxin C3a 的受體。C3a 與受體結合後,會引發趨化、顆粒酵素釋放及超氧陰離子生成等反應,將細胞外的配體訊號連結至多種細胞反應。
配體結合會使受體構形改變,進而啟動由 G 蛋白介導的訊號傳遞,並調節下游效應分子的活性。C3AR1 與 G(i)/G(o) 類 Gα 蛋白耦聯,其中包括 GNAI1 或 GNAO1;這條訊號關係可抑制 adenylate cyclase。來源亦指出受體訊號會調節 adenylate cyclase 等下游效應分子。
因此,C3AR1 將 C3a 的辨識轉換為細胞內訊號,並與趨化及發炎相關反應相連。上述功能描述涵蓋配體引發的細胞反應及 G 蛋白耦聯所造成的效應;來源未提供更廣泛的生理情境或其他機制細節。
Promoter 與基因調控
>C3AR1 ENST00000307637 GRCh38 chr12:8066259-8067359 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACAAGTTGATTAATATAGACTGAAGCCTATATCACAGACAACAGTGTTCAAATACATTTGACCCAAATA AACTTTATTTTATATGCATATATCTAAAAGAGTATATGCATATATCTAAAAGAATAATATAAGAATTATT TACAGCATAGTATTCATTAAGCAGGAATTACCTTCAGTCTTCTGTACTCCTTCCTGATGAAACAGCACCT AGACTCCAGCCTGTTCTCCAGTGACCACTAAGCTCTCCCACCTACCTCCCCACCTACCTGCCCTCTACCA CCTACCTGCCTTTGACTAGGCTCCACTTATAGCCTAAGCAGCTTTTCACCTTTTTCTGTCTCTAGAATTC CTACAGGTACTTAATTAAGTACTTGCCCACATCTTATTTCTATCTTAAGACTCTCCTAGATTGCCCTGGG TTATATATACCCCTGGCTAGAGTGTTCTATTATTTTACTTCTATTGTTACTTCTATTATTATAGCCTAGT TTGTATTACAGCTTTGTGTGTATATGTATGGGTACATATTCCCACTCGATTGTGAATCTCTGGAGATTAG AATATAGCTTAATTCATCCTGATTTTGACATGGCACCGTTTTTCACATATATCAAGCATTTCAGATATGT TATTTGAGATTAATTAAATGAGTTTATTCAGGTCATTCCTCCCCAACCACTCCCCACTCCAACCCTCACA TCTCATAGAGTCTTTTTTTTTTCATTTCTAAACAAAACCTATAAAGTTGAACCCTATGTACAGAGGTACC CTCTCTCTAACCATTCTCTGTGTGCTGCAGAAAATGTCTCAGGATTATAAACTCCTACTTCTGTTTTCCT GCTTTGCCTTTCTAAGCCATTTAGAAATGACTCACTTTGAAACTCTTCCTGTGAGGTCAGATAGTGGTCT AGAGCATAAGACTTAACTTATTGCCGGAAACAGAGAGAGAACAGAAGAAGAGAAAGCTCAGCAAATTTTC TTGCCATACTTCATGACTTCACTGTGGCTAAGTGTGGGGACCAGACAGGACTCGTGGAGACATCCAGGTG CTGAAGCCTTCAGCTACTGTCTCAGTTTTTTGGTAAGAAAACCTAGACCTA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C3AR1_1 ↗ | 12:8,066,359 | 負股 | 8,066,349–8,066,408 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_88DTX · enhancer · 8066110–8066348 · regulatory
ENSR12_957G3 · promoter · 8066349–8066687 · regulatory
· motif · 8064316–8064327 · motif
· motif · 8064320–8064334 · motif
· motif · 8064320–8064334 · motif
· motif · 8066382–8066393 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:482 aa
C3AR1 蛋白質長 482 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。其序列包含七段穿膜螺旋,並有位於細胞外與細胞質的拓樸區段;較長的細胞外區段位於第 161 至 332 個胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C3AR1 定位於細胞膜,是多次穿膜蛋白。 來源未提供其定位隨條件變化或不同異構型之間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
C3AR1 與 VGF 衍生胜肽 TLQP-21 的互作屬於相似性推論。另有資料指出,受體磷酸化時會與 ARRB1 互作;此互作與受體內化及對配體的短期去敏感化相關。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | C3AR1 是趨化性及發炎性胜肽 anaphylatoxin C3a 的受體,可促進趨化、顆粒酵素釋放與超氧陰離子生成。配體結合造成受體構形改變,啟動 G 蛋白訊號並調節下游效應分子;受體與 G(i)/G(o) 類 Gα 蛋白耦聯,並抑制 adenylate cyclase。 | 含實驗來源 | 證據與來源Receptor for the chemotactic and inflammatory peptide anaphylatoxin C3a, stimulating chemotaxis, granule enzyme release and superoxide anion production. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors, such as adenylate cyclase. C3AR1 is coupled to G(i)/G(o) (GNAI1 or GNAO1) G alpha proteins and mediates inhibition of adenylate cyclase PMID 12871936 ↗ · PMID 37852260 ↗ · PMID 8702752 ↗ |
| 交互作用 | C3AR1 與 VGF 衍生胜肽 TLQP-21 的互作是依相似性推定。受體磷酸化時會與 ARRB1 互作;這項互作與受體內化,以及受體對配體的短期去敏感化相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with VGF-derived peptide TLQP-21 (By similarity). Interacts (when phosphorylated) with ARRB1; the interaction is associated with internalization of the receptor and short-term desensitization to the ligand PMID 38175886 ↗ |
| 細胞定位 | C3AR1 是定位於細胞膜的多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTGTGGCTAAGTGTGGGGACCAGACAGGACTCGTGGAGA40CATCCAGGTGCTGAAGCCTTCAGCTACTGTCTCAGTTTTT80TGAAGTTTAGCAATGGCGTCTTTCTCTGCTGAGACCAATT120CAACTGACCTACTCTCACAGCCATGGAATGAGCCCCCAGT160AATTCTCTCCATGGTCATTCTCAGCCTTACTTTTTTACTG200GGATTGCCAGGCAATGGGCTGGTGCTGTGGGTGGCTGGCC240TGAAGATGCAGCGGACAGTGAACACAATTTGGTTCCTCCA280CCTCACCTTGGCGGACCTCCTCTGCTGCCTCTCCTTGCCC320TTCTCGCTGGCTCACTTGGCTCTCCAGGGACAGTGGCCCT360ACGGCAGGTTCCTATGCAAGCTCATCCCCTCCATCATTGT400CCTCAACATGTTTGCCAGTGTCTTCCTGCTTACTGCCATT440AGCCTGGATCGCTGTCTTGTGGTATTCAAGCCAATCTGGT480GTCAGAATCATCGCAATGTAGGGATGGCCTGCTCTATCTG520TGGATGTATCTGGGTGGTGGCTTTTGTGATGTGCATTCCT560GTGTTCGTGTACCGGGAAATCTTCACTACAGACAACCATA600ATAGATGTGGCTACAAATTTGGTCTCTCCAGCTCATTAGA640TTATCCAGACTTTTATGGAGATCCACTAGAAAACAGGTCT680CTTGAAAACATTGTTCAGCCGCCTGGAGAAATGAATGATA720GGTTAGATCCTTCCTCTTTCCAAACAAATGATCATCCTTG760GACAGTCCCCACTGTCTTCCAACCTCAAACATTTCAAAGA800CCTTCTGCAGATTCACTCCCTAGGGGTTCTGCTAGGTTAA840CAAGTCAAAATCTGTATTCTAATGTATTTAAACCTGCTGA880TGTGGTCTCACCTAAAATCCCCAGTGGGTTTCCTATTGAA920GATCACGAAACCAGCCCACTGGATAACTCTGATGCTTTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。