基因總覽
C21orf58 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 chromosome 21 open reading frame 58。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 21q22.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000291691 ★ | 46,301,130–46,323,870 | 8 |
| ENST00000397683 | 46,300,430–46,320,825 | 9 |
| ENST00000956568 | 46,300,432–46,324,460 | 9 |
| ENST00000417060 | 46,300,511–46,318,206 | 8 |
| ENST00000851029 | 46,301,130–46,320,825 | 9 |
| ENST00000397682 | 46,301,130–46,323,875 | 9 |
| ENST00000397679 | 46,301,130–46,319,137 | 7 |
| ENST00000397680 | 46,301,130–46,323,857 | 8 |
| ENST00000894108 | 46,301,130–46,324,460 | 8 |
| ENST00001131414 | 46,301,130–46,324,460 | 8 |
| ENST00000445935 | 46,314,871–46,323,869 | 6 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>C21orf58 ENST00000291691 GRCh38 chr21:46323770-46324870 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAAGCATCTCCGACGGACGAGGCGAAGGCGCACCCTGGGGAGGCGCTGCAGGCCACCCGCGCCACGCCC CCGGCCCCGGCCGCGCAGGAAACTGGCCCTAGACCAAGCAGCCACCCGAATACCGGCCGCCCGCCCCAGG CCACCCGGTCCCGGAGGACGCGGGAGCCACTGGAAGATCCAGCCTGGGGTCCAGCGCCTGCCGCGCCCCA CCCCCTCCGTGCAGCCACGCCACGCCCCTGTAGCCCCGCCCTGCAGCCACACCCCGCCCCGGCGTGCACC GCGCCCAGCCCGCGCCCCACCCCCCCCGACGCAGGCGCAGCCCCGCCCCGGCCCGCCCGAGAGGCGCCGC GCGTCCCGGCCGCTGATTGGCTGTGGCCGCGGCGGGGGCGGGACCTGGCGGAGAGCGGCGGATTCAAGAT GGCGGCGGCCAGGAGGCGGCTTCCAGCGGAGCCGGCGGGAAAAAGCGAGACCTCCGCGGCGGCTTCCGCC GGACCGCGTCCTCTCCTGGCAGGGGGCGGTGGCGGGCACCGGAGCCGCCCTTAGGACTTCACGCCAGAGC AGCTAGAGAAGAAGCCCCTAATGTTTACCTTCGTCCTCCCGGCCTCCACCTTTCTGCGCCGCTGCTCTTG CTCAACTTCCATCTCCCTCAGACTCCGCGCGGGCCGCCCGGCGGTGACGGGGCTGACACAGAGCAGCCTT CGCTCTATTTACACTCCCTCCCCCGCGCTTGGGCTCGCCCTCCCCCCGCGACAACTGTCACGCAGCCGCG GCCCCGCCCCCGACACGCGCCGCCAATCAGGGGGCTGCGTTTCCGGTCTCGCGCACGCGCGCTCTGGGCG GTGCAGCCTGGGCGGAGCCCCGCCCTTTACGCTCGCCGGCCACAGATTGGTGCGCTCACGTACCCGCCTC CTACGGCAGGACCAGTAAGCGGAAAGCGGAGGCCTGGCGCCCGCTGTGATTGGCCGATTTTAAAATCCCC TGCCAGGCTGGCCGAGCGGCAAAAAGTTCGCGCTGCTGGTCCCGCGCGGGCGGCCCCTGGGCTTTGTGTC CACCAGGACAGCGGGCCGGGCTCCCTGCAGGCGCGGGCGGCGCCGAACGGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C21orf58_2 ↗ | 21:46,318,153 | 負股 | 46,318,143–46,318,202 |
| C21orf58_1 ↗ | 21:46,323,843 | 負股 | 46,323,833–46,323,892 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_9NDDX · enhancer · 46320388–46320814 · regulatory
ENSR21_83CQS3 · promoter · 46320815–46320976 · regulatory
ENSR21_C6L4W · enhancer · 46322337–46323846 · regulatory
ENSR21_9NDFX · promoter · 46323847–46324166 · regulatory
ENSR21_5DW75N · CTCF_binding_site · 46324358–46324379 · regulatory
ENSR21_9NDG5 · promoter · 46324398–46324898 · regulatory
ENSR21_BC786 · enhancer · 46324899–46325886 · regulatory
ENSR21_83CQX6 · promoter · 46326155–46326298 · regulatory
· motif · 46323069–46323081 · motif
· motif · 46323178–46323190 · motif
· motif · 46323331–46323344 · motif
· motif · 46323331–46323344 · motif
· motif · 46323493–46323508 · motif
· motif · 46323590–46323610 · motif
· motif · 46323837–46323853 · motif
· motif · 46323960–46323970 · motif
· motif · 46324004–46324014 · motif
· motif · 46324040–46324051 · motif
· motif · 46324040–46324051 · motif
· motif · 46324054–46324063 · motif
· motif · 46324085–46324098 · motif
· motif · 46324090–46324100 · motif
· motif · 46324110–46324123 · motif
· motif · 46324110–46324123 · motif
· motif · 46324125–46324135 · motif
· motif · 46324142–46324155 · motif
· motif · 46324147–46324157 · motif
· motif · 46324349–46324359 · motif
· motif · 46324360–46324376 · motif
· motif · 46324444–46324454 · motif
· motif · 46324477–46324487 · motif
· motif · 46324479–46324492 · motif
· motif · 46324541–46324551 · motif
· motif · 46324565–46324575 · motif
· motif · 46324567–46324577 · motif
· motif · 46324600–46324610 · motif
· motif · 46324605–46324615 · motif
· motif · 46324632–46324642 · motif
· motif · 46324654–46324664 · motif
· motif · 46324656–46324666 · motif
· motif · 46325432–46325447 · motif
· motif · 46325985–46325996 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：322 aa
Uncharacterized protein C21orf58 長 322 個胺基酸。序列註解指出，第 1–51 位及第 107–130 位各有一段無序區域；來源未提供其他結構域或功能區域資訊。
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
AAAAAGTTCGCGCTGCTGGTCCCGCGCGGGCGGCCCCTGG40GCTTTGTGTCCACCAGGACAGCGGGCCGGGCTCCCTGCAG80GCGCGGGCGGCGCCGAACGGTGCTCAGCAACCACCCGGAC120AGGGCCAGGCCGTTTTCTCCCGCTCAGGCATTAGTCGTTG160GCTGTGGGCCGCCGCGGGAAGTTGAGGCCTACCACGGAGG200AGGCTGCTGAGGTGGATCTCAGGGGATCCGCAAGGGCTCC240CTCACCCTTGCCGGGACCCTGGGAACCCGAAACAAAATCC280TACGCCACCAGCCCGCCGAATGCGCCCCCTCGGCCGGGGG320TCCTGGGTCTTCAGAGAAGAACTCGGCCGAATGCGGTCAG360AAAGCCCGCGAACCGCCTGGACCTGCAGGCCCCGCCGCTT400GGAGCTCCCGCCTTTCCCGACCGAGCCCGTGTCTGCTCGT440GTGTCTCACTGATGTCTTAGGTCTCAAAAAAAAAAGAAAA480GAAAAGGTTTTTAGTAGACAGAAGAGAAATGGGGCCGTGG520GTTCGTGGTCCCAGGGGGAAACTGACGTCGCATGAGGTCG560TCGTCCCTCAGCTTGAGCTCAGCGGAACATAAGCTTGCAG600AGGTGGAAACCACGGAAGGTTTGGGTGTCTTGGAGCTCTC640TGGACACCGAAGCCCGGACACAGTCCCGGGGTCCGCACCG680CCTGTGACCTGTGGCGGGACCGCCGGGGTGGGCGTTTTCT720CAGCTGGCGCGCGCGTAGGTGGAACTTGGGAAACTAACTG760GAGCGAAGTGGCAAAAAACCAAGACAGGGCCGGTGACCTC800GCGCAGGCCGTCCTTAACTGTGGAGTATTCCTTCAGCTAA840CCCCTTTATTTCATGTGTCCAAGTCTGGTTTCTGGGTTTC880TTTGTAGTCCTCCGGGCCTGTTCGTGCGCCTTCACTTGCA920AAAGGTTCGTCGTGGAGGGCCGTGTGCTTGTTTGCAGCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。