演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C1QTNF7CTRP7

C1q and TNF related 7

C1QTNF7 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens4p15.32UniProt Q9BXJ2
OFFICIAL SYMBOL
C1QTNF7
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q9BXJ2
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C1QTNF7 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 C1q and TNF related 7。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 4p15.32。

Official symbol
C1QTNF7
Gene name
C1q and TNF related 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14342
UniProt
Q9BXJ2
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CTRP7

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44p15.32
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25C1QTNF7pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr4:15,339,818–15,446,167
Gene span
106,350 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000444304 ★15,428,033–15,446,1673
ENST0000039770015,339,818–15,442,3624
ENST0000029529715,339,936–15,446,1673
ENST0000038238315,374,549–15,442,2663
ENST0000042969015,374,551–15,446,1673
ENST0000111659615,427,995–15,446,1673
ENST0000088153215,428,004–15,446,1674

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 15428033 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C1QTNF7 ENST00000444304 GRCh38 chr4:15427033-15428133 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGCATTAAGATTTTGGAAAGCCAACAAATTCAAAGGACCATTTCCTCCAGTGTGGAGAGTGGATCCCAA
AGGCAAAATTAAGCTGGTCAGAACGGGGAGCCCAGCAATCTCGTTGGTCAAGTGTGTGGTCAACATCCAC
TTCACTAACTCTGGAAACATTCCTTTCAATTAGAGTTCTCATTGCTTGAGAAGAATGAGAGGAAAAGAAA
GATAAAAACAAGATTTTTTTCAGTCGTCTAATTTCCATAAATGACATCATAAATTATATATTGCTGTTGC
CAAGGAAATATAAGAAATACATAGCAGAAGGAAACAAAGAAATTGATTGCACCATAGACGACTAGTCATA
TGCTTTGGAGAATCATTCTGCCTTTTGAGATGTTATGATCAGTTCTTTACAGGCACAAAGACATATTAGT
TTTCTAAAAATACCCAATCATTTATCCATTCAGCAAAGAACAAAGAAAACAAAATCAGTGCAATTCTCAT
AACCCTCTTTCTTTGCACAGCACATAGAATGAGGGGCTATTTTCCTGCCATATTTACCAAGAATAGGGAC
AGTGTTCATTATTCCACAAGACACCATCCTAGGTCCAGAATCTAAAGGCTCTACCTCCAAAACTCTCAAA
TATAAAATGGCTTTTTTCTCTAAGTTAACAACTAATTTCCAGTCAGTGAGTAATTTTTTTCCTGAAACAT
TCACTCAGTGGAAAACAAATGAAGAGGGAAAAAATTAAGTAAACAAATCTGAAAAAGAGGCCACAACACA
CAGAGATGGAGAAGCTCTAAACTTACCACTGAAGGAAAGCAGGCACTTAAAGTTTATCCCAAACAAAACT
GTAATTTTAACTGGTCCCCGAGTTGAGCCTCACTCGATGAATGACTTCCAGGGCCTTTGGCTCTTTGGGA
CTAAACGAGAAAATTATTTTTAGCACAACTATTTGGAAATCTTTGAGAATTTGGATCTGTTATTCTGTCT
GGTACCAAAGCAAGTTTTTCACTGAGCTCTCATGAAAGATCCTCAGTCTCTTGTGGATTTAGAATCCTGC
AGCAGCCCACCATCTAAGAGCAAGGTATGGTGTTTACTCTTTTTTTTAGAA
C1QTNF7 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_8G8MT · enhancer · 15427232–15427472 · regulatory

ENSR4_8G8N7 · promoter · 15427874–15428043 · regulatory

ENSR4_8G8NB · enhancer · 15428044–15428207 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:289 aa

1 aa289 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 Q9BXJ2 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 7 長 289 個胺基酸。其 N 端第 1–16 位為訊號序列;第 38–139 位標註為 Collagen-like 區域,第 143–279 位為 C1q 結構域。第 36–134 位另有無序區域註解,該註解來自序列預測資料。

訊號胜肽1–16 aa
結構域Collagen-like38–139 aa
結構域C1q143–279 aa
功能區域Disordered36–134 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BXJ2…

AlphaFold · Q9BXJ2

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

C1QTNF7 的定位註記為分泌至細胞外。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000444304 · 4,320 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ACTGAGCTCTCATGAAAGATCCTCAGTCTCTTGTGGATTT40
41AGAATCCTGCAGCAGCCCACCATCTAAGAGCAAGAGCCAA80
81AGATGTTTGTCTTGCTCTATGTTACAAGTTTTGCCATTTG120
121TGCCAGTGGACAACCCCGGGGTAATCAGTTGAAAGGAGAG160
161AACTACTCCCCCAGGTATATCTGCAGCATTCCTGGCTTGC200
201CTGGACCTCCAGGGCCCCCTGGAGCAAATGGTTCCCCTGG240
241GCCCCATGGTCGCATCGGCCTTCCAGGAAGAGATGGTAGA280
281GACGGCAGGAAAGGAGAGAAAGGTGAAAAGGGAACTGCAG320
321GTTTGAGAGGTAAGACTGGACCGCTAGGTCTTGCCGGTGA360
361GAAAGGGGACCAAGGAGAGACTGGGAAGAAAGGACCCATA400
401GGACCAGAGGGAGAGAAAGGAGAAGTAGGTCCAATTGGTC440
441CTCCTGGACCAAAGGGAGACAGAGGAGAACAAGGGGACCC480
481GGGGCTGCCTGGAGTTTGCAGATGTGGAAGCATCGTGCTC520
521AAATCCGCCTTTTCTGTTGGCATCACAACCAGCTACCCAG560
561AAGAAAGACTACCTATTATATTTAACAAGGTCCTCTTCAA600
601CGAGGGAGAGCACTACAACCCTGCCACAGGGAAGTTCATC640
641TGTGCTTTCCCAGGGATCTATTACTTTTCTTATGATATCA680
681CATTGGCTAATAAGCATCTGGCAATCGGACTGGTACACAA720
721TGGGCAATACCGGATAAAGACCTTCGACGCCAACACAGGA760
761AACCATGATGTGGCTTCGGGGTCCACAGTCATCTATCTGC800
801AGCCAGAAGATGAAGTCTGGCTGGAGATTTTCTTCACAGA840
841CCAGAATGGCCTCTTCTCAGACCCAGGTTGGGCAGACAGC880
881TTATTCTCCGGGTTTCTCTTATACGTTGACACAGATTACC920
921TAGATTCCATATCAGAAGATGATGAATTGTGATCAGGACC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。