基因總覽
C1QTNF6 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 C1q and TNF related 6。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 22q12.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000337843 ★ | 37,180,166–37,188,247 | 3 |
| ENST00001133593 | 37,180,166–37,188,995 | 3 |
| ENST00000397110 | 37,180,167–37,188,995 | 4 |
| ENST00000880425 | 37,180,167–37,188,995 | 3 |
| ENST00000434784 | 37,182,174–37,188,995 | 4 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>C1QTNF6 ENST00000337843 GRCh38 chr22:37188147-37189247 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACATCTGGTCATCCTTATTGCTCATTGTATGTTAATTAAAATGTGTTAGCTTGCTAAAACACACTTCTAC CAGCACCAAGACAGCCTACAAATACCATGGCAATGTCCGGAAATTACCCTATATTGTCTAAAAGGGGGAG GAAGCCTCAGTTTCAGGAAATTCCCACCCCTTTCCTGGAAAACTCATGAATAATCCACCCCTGTTTAGCA TAGGATCAAGAAATAACTATAAAAATAGCCAACTAGCAGTGCTTGGGGGTGCTCTGCCTATGGAGTAGCC ATTCTTTTGTTTCTTTGCTTCTCTAATAAACTTGCTTTCACTTTGCTCTGTGGACTTACCCCAAATTCTT TCTGGTGCAAGATCCAAGAATTCTCTCTTGGGGTCTGATCAGTACCCCTCTCTGGTAACACTTGCATGAT ACCTGAGGAGGTCAGCCTGGTCATTCACCCAACAAACATGGGTTAAGCCCTCCCATGTGCCTGGCACAAA GGGGGCTGAGGACTGCAGTTCTGGAACACCTAGGCTCTGAGAGGCGACGCGACTGTGGTAGCAGGGCCAG GATTCTAGCCTGTGCCTGGAGGGCCAACACCTGCACCTTCTCTGCTACCCACCCTGCCTCTGTGACTCAG AGCAGTTAAGCACTTTAGCTCAGGGTGGACTCAGGGCTGCCTCCCCCTTCCTGAGCAACCTAGGGGCTCC TGTGCCCCATGCCTGTGTCCATTTCCCAATCATCAGGGGGCCTCAGACTCCTGCCTGCTCTGACTTTCTA GGCCTTTGAATCAAGCAAGACCCCACTGGATCACCAAAGAGTTAAGCAAAGGAAATCCCTGCCTCCCTTT ATCTCCGCAGAACCCAGAGGCTGAAAGGGAGGGAGCAGGGAGGAGGGGAAGTGGGAAGCGGCTCTGCCCT CTCCCTCCGCCCTCCCTCCGCCCTCTCTCCCTCCATCCCCTCCTCTCTCCCTCCTCTGCTGGGCCTGGGG GTCTGGGCCAGCAACAAGTTAGTATTGCAGACATGGGCCAAGGAGCCAGAGGCCATGCAGTGGCTCAGGG TCCGTGAGTCGCCTGGGGAGGCCACAGGACACAGGGTGAGTGACCAGAGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C1QTNF6_1 ↗ | 22:37,188,247 | 負股 | 37,188,237–37,188,296 |
| C1QTNF6_2 ↗ | 22:37,199,391 | 負股 | 37,199,381–37,199,440 |
| C1QTNF6_3 ↗ | 22:37,199,984 | 負股 | 37,199,974–37,200,033 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_834HZC · enhancer · 37183638–37183829 · regulatory
ENSR22_D3SS2 · enhancer · 37185911–37188225 · regulatory
ENSR22_B9D99 · promoter · 37188226–37188776 · regulatory
ENSR22_9JQJZ · enhancer · 37189777–37190099 · regulatory
ENSR22_9JQK5 · enhancer · 37190391–37190660 · regulatory
· motif · 37186027–37186042 · motif
· motif · 37187369–37187382 · motif
· motif · 37187369–37187382 · motif
· motif · 37188125–37188135 · motif
· motif · 37193103–37193115 · motif
· motif · 37193241–37193256 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：278 aa
Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6 長 278 個胺基酸。其序列包含第 1–46 位的訊號區、第 97–138 位的 collagen-like 區域，以及第 139–259 位的 C1q 結構域；第 99–135 位另註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C1QTNF6 被註記為分泌型蛋白質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- C1QTNF1Q9BXJ1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- repP0DTD1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- COLEC11Q9BWP8-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ALBP02769 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTATTGCAGACATGGGCCAAGGAGCCAGAGGCCATGCAG40TGGCTCAGGGTCCGTGAGTCGCCTGGGGAGGCCACAGGAC80ACAGGGTCACCATGGGGACAGCCGCCCTGGGTCCCGTCTG120GGCAGCGCTCCTGCTCTTTCTCCTGATGTGTGAGATCCCT160ATGGTGGAGCTCACCTTTGACAGAGCTGTGGCCAGCGGCT200GCCAACGGTGCTGTGACTCTGAGGACCCCCTGGATCCTGC240CCATGTATCCTCAGCCTCTTCCTCCGGCCGCCCCCACGCC280CTGCCTGAGATCAGACCCTACATTAATATCACCATCCTGA320AGGGTGACAAAGGGGACCCAGGCCCAATGGGCCTGCCAGG360GTACATGGGCAGGGAGGGTCCCCAAGGGGAGCCTGGCCCT400CAGGGCAGCAAGGGTGACAAGGGGGAGATGGGCAGCCCCG440GCGCCCCGTGCCAGAAGCGCTTCTTCGCCTTCTCAGTGGG480CCGCAAGACGGCCCTGCACAGCGGCGAGGACTTCCAGACG520CTGCTCTTCGAAAGGGTCTTTGTGAACCTTGATGGGTGCT560TTGACATGGCGACCGGCCAGTTTGCTGCTCCCCTGCGTGG600CATCTACTTCTTCAGCCTCAATGTGCACAGCTGGAATTAC640AAGGAGACGTACGTGCACATTATGCATAACCAGAAAGAGG680CTGTCATCCTGTACGCGCAGCCCAGCGAGCGCAGCATCAT720GCAGAGCCAGAGTGTGATGCTGGACCTGGCCTACGGGGAC760CGCGTCTGGGTGCGGCTCTTCAAGCGCCAGCGCGAGAACG800CCATCTACAGCAACGACTTCGACACCTACATCACCTTCAG840CGGCCACCTCATCAAGGCCGAGGACGACTGAGGGCCTCTG880GGCCACCCTCCCGGCTGGAGAGCTCAGGTGCTGGTCCCGT920CCCCTGCAGGGCTCAGTTTGCACTGCTGTGAAGCAGGAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。