基因總覽
C1QTNF4（C1q and TNF related 4）是蛋白質編碼基因，其產物為 Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 4。此蛋白長 329 個胺基酸，具有兩個 C1q 結構域，並包含一段被註解為無序的區域。蛋白質可形成同源多聚體，包括三聚體、六聚體及高分子量寡聚體；這項多聚化特性目前標註為相似性推論。來源另指出此蛋白為分泌型。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302514 ★ | 47,589,667–47,594,411 | 2 |
| ENST00000862513 | 47,589,666–47,595,642 | 3 |
| ENST00000954826 | 47,589,666–47,594,159 | 2 |
| ENST00001143199 | 47,589,666–47,595,493 | 2 |
| ENST00000530097 | 47,589,822–47,590,810 | 2 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
C1QTNF4 可能參與發炎網絡的調節，但現有描述並未將其作用固定為促發炎或抗發炎。其對發炎的方向似乎會隨情境而變，因此不宜將它概括為單一方向的發炎調節因子。
此外，C1QTNF4 在腦內給予時，似乎也參與食物攝取與能量平衡的調節。此效應可持續兩天；給予後 3 小時，下視丘中促食慾神經肽的表現量伴隨下降。這些關於腦內給予後效應的敘述屬於相似性推論，來源未進一步說明適用物種或具體分子機制。
Promoter 與基因調控
>C1QTNF4 ENST00000302514 GRCh38 chr11:47594311-47595411 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAGCAGAGGCAGAATTAGAGCCCATGGCTCTGGAGTCAACCAGGGCCAGGCAGAGGGCACCAGCTCTTG GCTGCTGAAAGTAGAGCTCTTCAAAAGTCATCCACTCAGTCAGCATCTACTGAGTGCCAGGCAGTGTCGT CACCTCTACAGCCGTCAGGGGAGAGAACAGCAGCCTAGAGAAAGGGAGTCTGAGCCCCCATCCCACGGGC TCGAAGCCCAGAGTAGAGGCCAGCACTAGTGCCTCTGGTGAGTATTACCATGGGAAGACCGCTGTTCCCA GCCCGGGTGCCCTGCTGGACTCTTGCTAGCCTGGCCCCAGCGAGGCAGGGCATCAGTTTCCCTCTCCAGA GGCCTTTCTTCCCCACCTATTGCCCTCTCAATCCTGTCCCTTCTTGCAGGAGCAACCTTCCCAGCAGAAA ATTCCATTCTGCCCCAAGGACTCTCCTCCTTACTGCCCCTCACCCCGGGGAACGCAGGCTGCCCCTCTGA TGCCTGCAGACTCCCTTCTCCCTCTTTCCTAACCGACCGTGGGCATTTTCCAATTTGGAGGTGAGGAGGA AAAACTAGGTTATTTTCAGCTCTTCCTTTACTGGCAACATTGACCCATTTATCCTTCTCTTCCTTCAGAC CTCTCCCCCAAGGCCACTTAGCTTGGACATCTGTCCCAGCCAAAATCTCACCTTCCACTGTCCTTGCAGC CCAAAGGCTAGTCCAGCCTCTGAGTCCAGCTCTAGCCCTCTCTCCCCACACTAGGAAGGAAGCTGGACTG TAGAGCGCTCTGGGCCACCCCGCGTTAGCTGCTGCCTCTGGCCTCAGTTTCCCCAACTGCTCAGATTAAT GATGCCTGCTCTCTAGACCCAGAGGACGAAGCTCTAAGGAGGTCACAGATGAGGAAGGGTCCAGTGCTCG GCGCAGACTCCGTGCGGAGCCCCTAGGCCCCGCAGCTCGCCCCTCCCTCTCCCCTACTCCCCTCCTCTCC CCCTCCCGTCTCTCCCCCGCCTCTTCGCTCTCGCTCGGCTCCCTCTCTAGCTGACCTTCCCTTTCCCTCA CGCCTCCCCACGCCCGGCCCCTGGCCCCAGCACCCTGTCCGCTGCCGCCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C1QTNF4_1 ↗ | 11:47,594,411 | 負股 | 47,594,401–47,594,460 |
| C1QTNF4_2 ↗ | 11:47,594,664 | 負股 | 47,594,654–47,594,713 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BCG2F · enhancer · 47591731–47592371 · regulatory
ENSR11_9NW3G · enhancer · 47593998–47594400 · regulatory
ENSR11_9NW3L · promoter · 47594401–47594895 · regulatory
ENSR11_9NW3Q · enhancer · 47595058–47595389 · regulatory
· motif · 47589429–47589442 · motif
· motif · 47589568–47589581 · motif
· motif · 47591608–47591623 · motif
· motif · 47591613–47591625 · motif
· motif · 47591616–47591631 · motif
· motif · 47591988–47592000 · motif
· motif · 47591991–47591998 · motif
· motif · 47592406–47592418 · motif
C1QTNF4 的表現會受到 IL6 上調。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：329 aa
C1QTNF4 蛋白長 329 個胺基酸，N 端第 1–16 位為訊號肽。蛋白含有 C1q 1（第 25–162 位）與 C1q 2（第 172–317 位）兩個結構域；第 164–195 位另註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C1QTNF4 為分泌型蛋白。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- L3MBTL3Q96JM7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEPSINQ96N21 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
C1QTNF4 可形成同源多聚體，包括三聚體、六聚體及高分子量寡聚體。此多聚化資訊標註為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | C1QTNF4 可能參與發炎網絡調節，但其促發炎或抗發炎作用似乎依情境而異。腦內給予時，它似乎也參與食物攝取與能量平衡調節；效應可持續兩天，且給予後 3 小時下視丘促食慾神經肽表現下降，此腦內作用屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源May be involved in the regulation of the inflammatory network. Its role as pro- or anti-inflammatory seems to be context dependent. Seems to have some role in regulating food intake and energy balance when administered in the brain. This effect is sustained over a two-day period, and it is accompanied by decreased expression of orexigenic neuropeptides in the hypothalamus 3 hours post-injection (By similarity) PMID 21658842 ↗ · PMID 27086950 ↗ |
| 交互作用 | C1QTNF4 可形成同源多聚體，包括三聚體、六聚體及高分子量寡聚體；此多聚化描述依相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Homomultimer. Forms trimers, hexamers and high molecular weight oligomers (By similarity) |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | C1QTNF4 會受到 IL6 上調。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCTTCGCTCTCGCTCGGCTCCCTCTCTAGCTGACCTTCC40CTTTCCCTCACGCCTCCCCACGCCCGGCCCCTGGCCCCAG80CACCCTGTCCGCTGCCGCCTCAGAGCCGGGAAAAGCAGCC120GGAGCCCCCGCCGCCCCTGCCGCAGCGCGGGCGGTCAGCG160CGCAGCCCGGCACCCGCAGCCTGCAGCCTGCAGCCCGCAG200CCCGCAGCCCGGAGCCAGATCGCGGGCTCAGACCGAACCC240GACTCGACCGCCGCCCCCAGCCAGGCGCCATGCTGCCGCT280TCTGCTGGGCCTGCTGGGCCCAGCGGCCTGCTGGGCCCTG320GGCCCGACCCCCGGCCCGGGATCCTCTGAGCTGCGCTCGG360CCTTCTCGGCGGCACGCACCACCCCCCTGGAGGGCACGTC400GGAGATGGCGGTGACCTTCGACAAGGTGTACGTGAACATC440GGGGGCGACTTCGATGTGGCCACCGGCCAGTTTCGCTGCC480GCGTGCCCGGCGCCTACTTCTTCTCCTTCACGGCTGGCAA520GGCCCCGCACAAGAGCCTGTCGGTGATGCTGGTGCGAAAC560CGCGACGAGGTGCAGGCGCTGGCCTTCGACGAGCAGCGGC600GGCCAGGCGCGCGGCGCGCAGCCAGCCAGAGCGCCATGCT640GCAGCTCGACTACGGCGACACAGTGTGGCTGCGGCTGCAT680GGCGCCCCGCAGTACGCGCTAGGCGCGCCCGGCGCCACCT720TCAGCGGCTACCTAGTCTACGCCGACGCCGACGCTGACGC760GCCTGCGCGCGGGCCGCCCGCGCCCCCCGAGCCGCGCTCG800GCCTTCTCGGCGGCGCGCACGCGCAGCTTGGTGGGCTCGG840ACGCTGGCCCCGGGCCGCGGCACCAACCACTCGCCTTCGA880CACCGAGTTCGTCAACATTGGCGGCGACTTCGACGCGGCG920GCCGGCGTGTTCCGCTGCCGTCTGCCCGGCGCCTACTTCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。