演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C1QTNF2CTRP2

C1q and TNF related 2

C1QTNF2 是蛋白質編碼基因,產物為 Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2;資料指出其參與脂肪組織與肝臟的脂質代謝調節。

Homo sapiens5q33.3UniProt Q9BXJ5
OFFICIAL SYMBOL
C1QTNF2
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q9BXJ5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C1QTNF2 的正式名稱為 C1q and TNF related 2,屬於蛋白質編碼基因,其產物名稱為 Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2。現有資料將其歸入與 C1q 相關的蛋白質,並記載蛋白質具有 collagen-like 區域及 C1q 結構域。來源未提供更完整的家族特性或結構功能說明;其脂質代謝相關角色見功能說明。

Official symbol
C1QTNF2
Gene name
C1q and TNF related 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14325
UniProt
Q9BXJ5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CTRP2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q33.3
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegC1QTNF2pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr5:160,347,363–160,370,666
Gene span
23,304 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000652664 ★160,347,754–160,370,6263
ENST00000393975160,347,363–160,370,6663
ENST00000891629160,347,363–160,370,6454
ENST00000950991160,347,363–160,355,3442
ENST00001133210160,347,363–160,370,6263
ENST00001092367160,348,992–160,370,6583

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

C1QTNF2 的產物被記載與脂質代謝調節有關,涉及脂肪組織及肝臟。現有資料只指出其參與這些組織中的脂質代謝調節,未說明調節的方向、作用方式或涉及的具體代謝步驟,因此不能據此判定它會促進或抑制脂質代謝,也無法進一步描述其分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 160370626 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C1QTNF2 ENST00000652664 GRCh38 chr5:160370526-160371626 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACACCATCTGTGAGATTATCTGACTTGATTAAGGTGGTGGATACAACATTAGAATTCAAATGCATATCTG
TATTAAAATTCTGACTGTAAATTTTGTGTCACTTACCAGCTGTTAACCAGATGCTCTGGCTGTGCAGAGT
GAAATATGGGTAGCTAGTGGAAGAGAGCAGTGGAAGGAACAGGGAGAAGCAAAAGCCAGGCCTTGGAGGA
TTTCCTTTCCTCCAGTGCCTGCTTGATTCCCAAATAGGATTGCTTTGCCTATCCTGGGAGCTGAGACCCT
CCATAAGTCTCTCAATGACTTGAGGCTGGGCCAGAGTGAGTGAGACCAGTGAATCCTCACCTTCTGGGGA
GAAGAGAAATGAGAGCTGGTACACAGGGGAACTCACCCACACTAGTGTGTATGTGCACACTCACATCCGG
ACAAAATCCACACCAAGGCATGCATAGAAATCAACACATAGAATGAGCCACTGCACAGTCATACACACAT
TTAAACATACACCCCACATACAGATGTCAAACCAACACACAGAATGAGCCCCTGCACAGTCACACACACA
TTTAAACATGCACCCCACATACAGATGTCTAGCCACTATCGTGTACATCCAACCACTGATGTGCCCTCCA
GTTTTACACCAAGCTGCCATCTTGGACATGTGCATGCATGTGTACATACACCGAACAGCCCTGATGAAAA
TTTGGATAAACGCACGTACGCACACACACAACTAAACACATCCCTATGATTTATCATCACACTCAAGTAC
ATGCACACCTTTGCAAACGCGTGGGAAACAATCACTCTGATCACTCTGGCGCACAAAACCTCCAAATACG
CTAACAAGCTCTACAAACGCAGAGATGCATCGACACACCCGAGTTGTCATCAGCACTGCAAGTTTTTTCC
AAACAGCTGCTAAAAAGAGAATGCTGCGCTGCGGGCCAGCCCACGTGACCGGGAGGAAGGCTCTCCCGCC
CATGACGGGATGGGAAAACTATGCCTGGGGCCGACGCTCTGCCCGGCTGCTGCCGCTGAGGAAAGCCGGG
ACGCGGAGCCCCGCCGAGAGCTTCTTTGCTCCGGACGCCCCTGGACGTGGC
C1QTNF2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C1QTNF2_1 ↗5:160,370,626負股160,370,616–160,370,675

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_B36SBR · promoter · 160370616–160371131 · regulatory

· motif · 160370139–160370152 · motif

· motif · 160370668–160370677 · motif

· motif · 160370668–160370677 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:285 aa

1 aa285 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 Q9BXJ5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2 長 285 個胺基酸。其 N 端第 1–15 位為訊號肽;第 40–141 位為 collagen-like 區域,第 145–281 位為 C1q 結構域。第 33–144 位另標註為無序區域。

訊號胜肽1–15 aa
結構域Collagen-like40–141 aa
結構域C1q145–281 aa
功能區域Disordered33–144 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9BXJ5…

AlphaFold · Q9BXJ5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

資料將 C1QTNF2 的產物標示為分泌型;未提供其他定位條件、細胞內定位或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 24 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CTRP2C1QTNF2AIRIMANKRD11BANPCHIC2GPANK1HPCAHPCAL1KCNIP3KLHL12LCKLGALS14MTX2NCALDNCS1NOL4P4HA3PHOSPHO2TCEANCTIMM8ATRIM54UBQLN1UBQLN2USP20VSNL1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 24 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C1QTNF2 可能與 ERFE 互作。資料以可能性描述此關係,未進一步界定互作是否為直接結合,亦未提供複合體或功能關係的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能C1QTNF2 參與脂肪組織與肝臟中的脂質代謝調節;資料未說明調節方向、具體作用方式或所涉代謝步驟。推論支持
證據與來源

Involved in the regulation of lipid metabolism in adipose tissue and liver

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用C1QTNF2 可能與 ERFE 互作。此描述保留可能性,資料未進一步說明互作是否為直接結合,或是否涉及複合體及特定功能關係。推論支持
證據與來源

May interact with ERFE

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000652664 · 2,396 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATGCCTGGGGCCGACGCTCTGCCCGGCTGCTGCCGCTGAG40
41GAAAGCCGGGACGCGGAGCCCCGCCGAGAGCTTCTTTGCT80
81CCGGACGCCCCTGGACGTGGCGGGCAGCCGCGAGGGTAAC120
121CACCATGATCCCCTGGGTGCTCCTGGCCTGTGCCCTCCCC160
161TGTGCTGCTGACCCACTGCTTGGCGCCTTTGCTCGCAGGG200
201ACTTCCGGAAAGGCTCCCCTCAACTGGTCTGCAGCCTGCC240
241TGGCCCCCAGGGCCCACCCGGCCCCCCAGGAGCCCCAGGG280
281CCCTCAGGAATGATGGGACGAATGGGCTTTCCTGGCAAAG320
321ACGGCCAAGATGGACACGACGGCGACCGGGGGGACAGCGG360
361AGAGGAAGGTCCACCTGGCCGGACAGGTAACCGGGGAAAG400
401CCAGGACCAAAGGGCAAAGCCGGGGCCATTGGGCGGGCTG440
441GCCCCCGTGGCCCCAAGGGGGTCAACGGTACCCCCGGGAA480
481GCATGGCACACCAGGCAAGAAGGGGCCCAAGGGCAAGAAG520
521GGGGAGCCAGGCCTCCCAGGCCCCTGCAGCTGTGGCAGTG560
561GCCATACCAAGTCAGCTTTCTCGGTGGCAGTGACCAAGAG600
601CTACCCACGGGAGCGGCTGCCCATCAAGTTTGACAAGATT640
641CTGATGAACGAGGGTGGCCACTACAATGCTTCCAGCGGCA680
681AGTTCGTCTGCGGCGTGCCTGGGATCTACTACTTCACCTA720
721CGACATCACGCTGGCCAACAAGCACCTGGCCATCGGCCTG760
761GTGCACAACGGCCAGTACCGCATCCGGACCTTTGATGCCA800
801ACACCGGCAACCACGATGTGGCCTCAGGCTCCACCATCCT840
841GGCTCTCAAGCAGGGTGACGAAGTTTGGCTGCAGATCTTC880
881TACTCAGAGCAGAACGGGCTCTTCTATGACCCTTACTGGA920
921CAGACAGCCTCTTTACGGGCTTCCTAATCTATGCCGACCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。