基因總覽
C1QTNF1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 C1q and TNF related 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q25.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000579760 ★ | 79,024,169–79,049,788 | 4 |
| ENST00000354124 | 79,022,729–79,049,788 | 4 |
| ENST00000580454 | 79,022,729–79,049,788 | 5 |
| ENST00000885300 | 79,022,729–79,049,788 | 5 |
| ENST00000885301 | 79,022,729–79,049,788 | 6 |
| ENST00000951174 | 79,022,729–79,049,788 | 6 |
| ENST00000951175 | 79,022,729–79,049,788 | 7 |
| ENST00000951177 | 79,022,729–79,049,788 | 6 |
| ENST00001126550 | 79,022,729–79,049,788 | 4 |
| ENST00000578229 | 79,022,814–79,049,788 | 4 |
| ENST00000951176 | 79,022,893–79,049,788 | 4 |
| ENST00000951178 | 79,023,413–79,049,788 | 4 |
顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>C1QTNF1 ENST00000579760 GRCh38 chr17:79023169-79024269 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCACAGGAGGGATAACAAAACAAAAAAATCCAGCTGCAACATCGAGGTGAGGGGCAGCTCGGAGAGAACA GGGCAGAGGGGGGAAAAAAGAAGCAAAAAAAGGGGGAATGCTGTTATCATCAGAGCTGGCTTCTGCTTCT CTGGCCAAATCCTTCCCCTGCTAGTGATATGGTAAGTTTCCAGAGCAAGCTGGGCTGACGCAGAGTCTAG GGATGGAGACTGGGTCCCAACCAGGGCCGGCTCTGGAGCAGCCTGGATCAGGGATCAGGATGGGAGGGCA GCCTACGGGCCTTGTTCAGAAAAAATATTTGTGTATGACTGAGAAAATGTCAGGTTTTCATATCAAGGAA TGAGAGGCCTGATAGAGACTGAGGAGTGCTTCCAGCCATCCTGGGCTCACCACTGTACTCGTGCTGTTCT CTAGAAAATGGAAATCTTCCCGGCAGGGGCTCCTTCCTAACCTTTAGATCACAGAGCTCTCAAGACTCTG AACAAAACAGTGGACCATCACCTTCCAAAGGTGATGCGCGCGCGCGCACACACACACACACACACACACA CACACACACAGTTTGGCATTTTGTTATAGGGGGTTCACAGATTCCCCCAAACCTGTCTGAGTCCCCGATA ATGCACAGGGCGTCTCAGGTCTGCCACTGTTTGGAGACCTGACCCCTCAGGGTTGGCCACAGCGGATCCC GGAGGCCTTGGGGCTCATCCCTCTGCTACCAAGTGACTAGGAGCGCTCAGCCTTGCTGGGCACCCCCATC CTGCGGGGGGCATTCTCGTCCGGGGCTCGCAGCCCCTCCGCCTCTGGACGGACCTCCAGACTCACGGAAT CTGCCCCACCCCCACTCTCAGCCTGGCGGGCTCCCCAGGGGGCCGGGAGGAGGCGGCCGCTGGATTTCCC TGAGGCGCGGCGCGGGGCACACACGGTTAATCCTCCGCGGCTGCTGTTTGGACGAAAAGCGCTGGGGGTG TTGGAGGCTCCTCGCTGCTCACATCTGGCTGGGCTTCGCTCCTTGCGCGTCTGTCCCACTTTCTCCCTCT CTTCCTTTACTTTCGAGAAACCGCGCTTCCGCTTCTGGTCGCAGAGACCTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C1QTNF1_1 ↗ | 17:79,024,169 | 正股 | 79,024,120–79,024,179 |
| C1QTNF1_3 ↗ | 17:79,034,262 | 正股 | 79,034,213–79,034,272 |
| C1QTNF1_2 ↗ | 17:79,034,438 | 正股 | 79,034,389–79,034,448 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_BKNFB · enhancer · 79019564–79020561 · regulatory
ENSR17_936CST · enhancer · 79020743–79021193 · regulatory
ENSR17_84BPPQ · promoter · 79022696–79022824 · regulatory
ENSR17_BKNFT · promoter · 79023679–79024271 · regulatory
ENSR17_5NKT45 · CTCF_binding_site · 79024047–79024068 · regulatory
ENSR17_936CW6 · promoter · 79025173–79025673 · regulatory
ENSR17_84BPRH · enhancer · 79025674–79025847 · regulatory
ENSR17_C9SPM · enhancer · 79026383–79027609 · regulatory
ENSR17_BKNGF · promoter · 79027610–79028163 · regulatory
ENSR17_5NKTTN · CTCF_binding_site · 79028708–79028729 · regulatory
· motif · 79023837–79023844 · motif
· motif · 79024049–79024065 · motif
· motif · 79025549–79025562 · motif
· motif · 79025549–79025562 · motif
· motif · 79028710–79028726 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：281 aa
C1QTNF1 的蛋白質長 281 個胺基酸，含有位於第 1–25 位的訊號胜肽、位於第 99–140 位的 collagen-like 區域，以及第 141–281 位的 C1q 結構域。第 34–68 位與第 100–138 位另被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C1QTNF1 定位於細胞外，來源註記其為分泌蛋白。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- PRPF31Q8WWY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- C14orf119Q9NWQ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1QTNF6Q9BXI9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TGM1P22735 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- UBL5Q9BZL1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACATCTGGCTGGGCTTCGCTCCTTGCGCGTCTGTCCCACT40TTCTCCCTCTCTTCCTTTACTTTCGAGAAACCGCGCTTCC80GCTTCTGGTCGCAGAGACCTCGGAGACCGCGCCGGGGAGA120CGGAGGTGCTGTGGGTGGGGGGGACCTGTGGCTGCTCGTA160CCGCCCCCCACCCTCCTCTTCTGCACTGCCGTCCTCCGGA200AGACCTTTTCCCCTGCTCTGTTTCCTTCACCGAGTCTGTG240CATCGCCCCGGACCTGGCCGGGAGGAGGCTTGGCCGGCGG280GAGATGCTCTAGGGGCGGCGCGGGAGGAGCGGCCGGCGGG320ACGGAGGGCCCGGCAGGAAGATGGGCTCCCGTGGACAGGG360ACTCTTGCTGGCGTACTGCCTGCTCCTTGCCTTTGCCTCT400GGCCTGGTCCTGAGTCGTGTGCCCCATGTCCAGGGGGAAC440AGCAGGAGTGGGAGGGGACTGAGGAGCTGCCGTCGCCTCC480GGACCATGCCGAGAGGGCTGAAGAACAACATGAAAAATAC520AGGCCCAGTCAGGACCAGGGGCTCCCTGCTTCCCGGTGCT560TGCGCTGCTGTGACCCCGGTACCTCCATGTACCCGGCGAC600CGCCGTGCCCCAGATCAACATCACTATCTTGAAAGGGGAG640AAGGGTGACCGCGGAGATCGAGGCCTCCAAGGGAAATATG680GCAAAACAGGCTCAGCAGGGGCCAGGGGCCACACTGGACC720CAAAGGGCAGAAGGGCTCCATGGGGGCCCCTGGGGAGCGG760TGCAAGAGCCACTACGCCGCCTTTTCGGTGGGCCGGAAGA800AGCCCATGCACAGCAACCACTACTACCAGACGGTGATCTT840CGACACGGAGTTCGTGAACCTCTACGACCACTTCAACATG880TTCACCGGCAAGTTCTACTGCTACGTGCCCGGCCTCTACT920TCTTCAGCCTCAACGTGCACACCTGGAACCAGAAGGAGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。