演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C1QCC1QG

complement C1q C chain

C1QC 是編碼 complement C1q C chain 的蛋白質編碼基因,其產物是補體 C1 複合體中 C1Q 次複合體的核心組成之一,參與經典補體途徑的啟動。

Homo sapiens1p36.12UniProt P02747
OFFICIAL SYMBOL
C1QC
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P02747
PDB / ALPHAFOLD
2JG8
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C1QC 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 complement C1q C chain。其產物屬於 C1Q 次複合體,與 C1QA、C1QB 共同構成補體 C1 複合體中的辨識部分。C1QC 蛋白質具有膠原樣區域與 C1q 結構域;在 C1Q 次複合體內,三種鏈形成多條膠原樣三股螺旋,並連接球狀的配體辨識模組。這種多鏈組成使 C1Q 次複合體能作為 C1 複合體辨識目標的部分,並與其餘組成共同參與補體系統的運作。

Official symbol
C1QC
Gene name
complement C1q C chain
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1245
UniProt
P02747
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C1QG

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.12
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegC1QCpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:22,642,558–22,648,122
Gene span
5,565 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000374640 ★22,643,633–22,648,1083
ENST0000069575222,642,558–22,648,1102
ENST0000086766422,642,558–22,648,1222
ENST0000086766522,642,971–22,648,1224
ENST0000069574922,643,014–22,648,1223
ENST0000069575022,643,626–22,648,1103
ENST0000069575122,643,626–22,648,1223
ENST0000037463922,643,626–22,648,1223
ENST0000114580322,643,626–22,648,1223
ENST0000037463722,643,627–22,648,1223
ENST0000069575322,643,632–22,648,1222
ENST0000096884822,643,634–22,648,1223

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

C1QC 蛋白質是 C1Q 次複合體的組成鏈之一,該次複合體負責啟動補體 C1 複合體所屬的經典補體途徑。此途徑是一連串補體蛋白質參與的反應,可促進吞噬作用與病原體分解,並傳遞能強化適應性免疫系統的訊號。

啟動過程中,C1Q 次複合體辨識與抗原結合的 IgG 或 IgM,並藉由其 C1q 結構域辨識免疫球蛋白的 Fc 區域。這類抗原—抗體複合物可形成於病原體表面。當 C1Q 次複合體與免疫球蛋白結合後,會活化酵素原 C1R;C1R 接著切割 C1S,從而引發補體系統的蛋白水解級聯反應。

不同免疫球蛋白複合物的組成與活化方式有所差異:與抗原結合的 IgG 六聚體可活化 C1Q 次複合體,而五聚體形式的 IgM 也能促成活化。這些結果描述的是 C1Q 次複合體對免疫複合物的辨識,並非單獨由 C1QC 完成全部反應。

此外,C1Q 次複合體也能辨識並結合程式性細胞死亡中細胞表面暴露的 phosphatidylserine;這種結合可能促進補體系統活化,但其作用仍以可能性表述。由此可見,C1QC 所在的次複合體除了辨識抗原—抗體複合物,也可能感知凋亡細胞表面的訊號,並將辨識結果連結至補體級聯反應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22643633 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C1QC ENST00000374640 GRCh38 chr1:22642633-22643733 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACTGCCTGACAGCCCCTTCATCCCTAGAATCTCATGTGAGGAGAAGAGGGAGAGGGGAGAAGGCCTCTCA
GCTCTGCCAGCCTGGTCCTGATGGGGAGCCCCTCACCAGCCATGGTGGGCTCCAAGCCCAGAGGCAGGGC
ACCCCCAGGATGCAGGCAAGGAGGGTGGTGTTGGCAGGGAAGATGGAACCGTCAGGGAAGACCAGGTGCC
CCAACGAAGGAAGAGGCACCAATACTGAAAGCCAAGGCCACCCCAGTAGACAGAAGGGAGGCCAGAGGGA
CCAGTGATTTGCTGAAGGCATCTGGTCCATGCAGTGACAGGGCTGGAAGGAGAAGCCAGGGCCCTGGCTC
TGTAGCCAGGGCAGCCCGTGCACCACAACAGCTGCCTGCCGCCAAAGCGGGTCCATCCTGGGGGTCCACC
TCCAAGTGTGGCCACTGGGATGGGGCACATGGAAGTTTCTAGAACAAGGCTTGCAACTTGACAAGTGCAT
GTGAGGCTTGTTTCTGGGGGCAGCTGAGCAGAGGGGTCAGAGCAAGGCTTTGGGCCCCAAGAGACCACTC
AGTGTGTGACTTTGGGCAACGGTGTACATCCTCCTGAGCCTGTTTCCTTATCTGTAAAGGGGGATAATAA
CTTCCTCCTAGGGATTCTGGGAAAACTGAGTCTCAGGCAAAGCAAATGCTAACATTGGTCATTAGATGGG
ATGAACCTGACTCTGGGGGACGTCTGTGCCCTGGGGGCTTGTGTTTATACACACACACACACACACACAC
ACACACACACCCTCAGCCAGATGCTGGGGCAGGGGACAGTTCCTCATTTCGGACACTGACTGCCGGTGGG
GGGATGTGGATGGGGTATTGCTGTGGTCAGTCTGGCTCAGCACCCAAAAGAAAGTGTCAAGTCAGGGAAA
ATTCTGGGAAAGGGGATGTGGGATTGGGGGAGGGCACGAGAAGGGGAGGGGGCCCAGCCCTGCTTTGGGC
AATCCTTGCTCTGACCACTCAGACACCGTGTCCTCTTGCCTGGGAGAGGGGAAGCAGATCTGAGGACATC
TCTGTGCCAGGCCAGAAACCGCCCACCTGCAGGTGAGGCCCGGACCCCTGC
C1QC 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C1QC_1 ↗1:22,643,633正股22,643,584–22,643,643

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B6HBQ · enhancer · 22641715–22642632 · regulatory

ENSR1_57BRF2 · CTCF_binding_site · 22642197–22642218 · regulatory

· motif · 22642184–22642197 · motif

· motif · 22642199–22642215 · motif

· motif · 22643439–22643452 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:245 aa

1 aa245 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 P02747 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

C1QC 蛋白質長 245 個胺基酸,具有位於第 1–28 位的訊號胜肽。其膠原樣區域位於第 31–112 位,C1q 結構域位於第 115–245 位;第 45–113 位另註記為無序區域。

訊號胜肽1–28 aa
結構域Collagen-like31–112 aa
結構域C1q115–245 aa
功能區域Disordered45–113 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2JG8…

PDB · 2JG8

X-ray · 2.05 A · C/F=115-245

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Cell surface

C1QC 蛋白質被註記為分泌型,亦見於細胞表面。 其與抗原結合的 IgG 或 IgM 結合時,可形成位於病原體表面的抗原—抗體複合物;此處所述的病原體表面是複合物所在位置,不應視為 C1QC 單獨定位的證據。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

未繪示構造:Cell surface。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C1QGC1QCC1QBPUBQLN2ZNF534
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C1QC 與 C1QA、C1QB 一同組成 C1Q 次複合體;三種鏈各有三條,形成 18 個次單元的結構,其中包含六條膠原樣三股螺旋及六個球狀配體辨識模組。C1Q 次複合體再與兩個 C1R 分子及兩個 C1S 分子組成具鈣依賴性的 C1 複合體。來源描述的是複合體組成,並未指出 C1QC 與 C1R 或 C1S 之間的獨立直接結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

C1QC 相關的 C1q deficiency 3(C1QD3)為自體隱性疾病,與經典補體途徑活化受損有關。疾病通常表現為嚴重免疫複合體疾病,可有反覆皮膚病灶、慢性感染,並伴隨全身性紅斑狼瘡風險增加及腎小球腎炎。來源指出,影響此條目所代表基因的變異可導致此病;這是特定疾病與基因變異的關聯,不宜推論為所有 C1QC 變異皆造成相同結果。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能C1Q 次複合體是補體 C1 複合體的核心部分,負責啟動經典補體途徑;此途徑可促進吞噬、病原體分解,並傳遞強化適應性免疫的訊號。C1QA、C1QB 與 C1QC 透過 C1q 結構域辨識 IgG 或 IgM 的 Fc 區域,結合抗原—抗體複合物後活化 C1R,使其切割 C1S。抗原結合的 IgG 六聚體或 IgM 五聚體可活化 C1Q 次複合體;它也能結合凋亡細胞表面暴露的 phosphatidylserine,並可能促進補體活化。含實驗來源
證據與來源

Core component of the complement C1 complex, a multiprotein complex that initiates the classical pathway of the complement system, a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. The classical complement pathway is initiated by the C1Q subcomplex of the C1 complex, which specifically binds IgG or IgM immunoglobulins complexed with antigens, forming antigen-antibody complexes on the surface of pathogens: C1QA, together with C1QB and C1QC, specifically recognizes and binds the Fc regions of IgG or IgM via its C1q domain. Immunoglobulin-binding activates the proenzyme C1R, which cleaves C1S, initiating the proteolytic cascade of the complement system. The C1Q subcomplex is activated by a hexamer of IgG complexed with antigens, while it is activated by a pentameric IgM. The C1Q subcomplex also recognizes and binds phosphatidylserine exposed on the surface of cells undergoing programmed cell death, possibly promoting activation of the complement system

PMID 12847249 ↗ · PMID 18250442 ↗ · PMID 19006321 ↗ · PMID 19706439 ↗ · PMID 24626930 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 3258649 ↗ · PMID 34155115 ↗ · PMID 6249812 ↗ · PMID 6776418 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用補體 C1 複合體是鈣依賴性複合體,由一個 C1Q 次複合體、兩個 C1R 分子及兩個 C1S 分子組成。C1Q 次複合體含 18 個次單元:C1QA、C1QB 與 C1QC 各三條鏈形成六條膠原樣三股螺旋,並連接六個球狀配體辨識模組。含實驗來源
證據與來源

Core component of the complement C1 complex, a calcium-dependent complex composed of 1 molecule of the C1Q subcomplex, 2 molecules of C1R and 2 molecules of C1S. The C1Q subcomplex is composed 18 subunits: 3 chains of C1QA, C1QB, and C1QC trimerize to form 6 collagen-like triple helices connected to six globular ligand-recognition modules (C1q domain)

PMID 12960167 ↗ · PMID 18250442 ↗ · PMID 20548024 ↗ · PMID 23650384 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 2988513 ↗ · PMID 34155115 ↗ · PMID 6249812 ↗ · PMID 6952210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位C1QC 被註記為分泌型及位於細胞表面;它可特異結合與抗原形成複合物的 IgG 或 IgM,形成位於病原體表面的抗原—抗體複合物。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Cell surface; Specifically binds IgG or IgM immunoglobulins complexed with antigens, forming antigen-antibody complexes on the surface of pathogens

PMID 18250442 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 486087 ↗ · PMID 34155115 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯C1q deficiency 3(C1QD3)是自體隱性疾病,與經典補體途徑活化受損有關,通常導致嚴重免疫複合體疾病。其特徵包括反覆皮膚病灶、慢性感染、全身性紅斑狼瘡風險增加及腎小球腎炎;來源指出,影響此條目所代表基因的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

C1q deficiency 3 C1QD3 An autosomal recessive disorder caused by impaired activation of the complement classical pathway. It generally leads to severe immune complex disease characterized by recurrent skin lesions, chronic infections, an increased risk of systemic lupus erythematosus, and glomerulonephritis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620322

PMID 8630118 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000374640 · 1,158 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACACCGTGTCCTCTTGCCTGGGAGAGGGGAAGCAGATC40
41TGAGGACATCTCTGTGCCAGGCCAGAAACCGCCCACCTGC80
81AGTTCCTTCTCCGGGATGGACGTGGGGCCCAGCTCCCTGC120
121CCCACCTTGGGCTGAAGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCT160
161GCCCCTCAGGGGCCAAGCCAACACAGGCTGCTACGGGATC200
201CCAGGGATGCCCGGCCTGCCCGGGGCACCAGGGAAGGATG240
241GGTACGACGGACTGCCGGGGCCCAAGGGGGAGCCAGGAAT280
281CCCAGCCATTCCCGGGATCCGAGGACCCAAAGGGCAGAAG320
321GGAGAACCCGGCTTACCCGGCCATCCTGGGAAAAATGGCC360
361CCATGGGACCCCCTGGGATGCCAGGGGTGCCCGGCCCCAT400
401GGGCATCCCTGGAGAGCCAGGTGAGGAGGGCAGATACAAG440
441CAGAAATTCCAGTCAGTGTTCACGGTCACTCGGCAGACCC480
481ACCAGCCCCCTGCACCCAACAGCCTGATCAGATTCAACGC520
521GGTCCTCACCAACCCGCAGGGAGATTATGACACGAGCACT560
561GGCAAGTTCACCTGCAAAGTCCCCGGCCTCTACTACTTTG600
601TCTACCACGCGTCGCATACAGCCAACCTGTGCGTGCTGCT640
641GTACCGCAGCGGCGTCAAAGTGGTCACCTTCTGTGGCCAC680
681ACGTCCAAAACCAATCAGGTCAACTCGGGCGGTGTGCTGC720
721TGAGGTTGCAGGTGGGCGAGGAGGTGTGGCTGGCTGTCAA760
761TGACTACTACGACATGGTGGGCATCCAGGGCTCTGACAGC800
801GTCTTCTCCGGCTTCCTGCTCTTCCCCGACTAGGGCGGGC840
841AGATGCGCTCGAGCCCCACGGGCCTTCCACCTCCCTCAGC880
881TTCCTGCATGGACCCACCTTACTGGCCAGTCTGCATCCTT920
921GCCTAGACCATTCTCCCCACCAGATGGACTTCTCCTCCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。