演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C1QB

complement C1q B chain

C1QB 是編碼 complement C1q B chain 的蛋白質編碼基因,其產物為補體 C1 複合體的核心組成部分,參與經典補體途徑的啟動。

Homo sapiens1p36.12UniProt P02746
OFFICIAL SYMBOL
C1QB
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P02746
PDB / ALPHAFOLD
5HKJ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C1QB 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 complement C1q B chain。其產物是 C1Q 次複合體的三種鏈之一,與 C1QA、C1QC 共同組成補體 C1 複合體中的辨識部分。C1q B chain 含有膠原樣區域與 C1q domain,呈現由膠原樣結構連接球狀辨識模組的組織方式。這些特徵使其成為多蛋白質補體系統中的結構性組成,而非單獨運作的完整複合體。

Official symbol
C1QB
Gene name
complement C1q B chain
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1242
UniProt
P02746
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.12
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegC1QBpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:22,652,713–22,661,637
Gene span
8,925 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000509305 ★22,653,236–22,661,6373
ENST0000095220122,652,713–22,661,6373
ENST0000051026022,652,762–22,661,0903
ENST0000069575822,653,090–22,661,6373
ENST0000069575922,653,090–22,661,5353
ENST0000069576022,653,090–22,661,5353
ENST0000069576122,653,090–22,661,5353
ENST0000069576222,653,090–22,661,5353
ENST0000089731022,653,090–22,661,6373
ENST0000089731122,653,090–22,661,6373
ENST0000089731322,653,090–22,661,6374
ENST0000095220222,653,090–22,661,6374

顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

C1QB 的產物是 C1Q 次複合體的一部分,該次複合體負責啟動補體 C1 複合體所參與的經典補體途徑。此途徑由一連串蛋白質反應構成,可促進吞噬作用與病原體分解,並透過訊號增強適應性免疫。C1QB 與 C1QA、C1QC 協同辨識抗原結合的 IgG 或 IgM,並透過 C1q domain 結合免疫球蛋白的 Fc 區域。

當抗體已與抗原形成複合物時,C1Q 次複合體可辨識這些免疫複合物,促使補體反應開始。其活化條件與抗體聚集形式有關:抗原結合的 IgG 六聚體可活化 C1Q 次複合體;五聚體形式的 IgM 也可產生此作用。免疫球蛋白結合後,C1R 前酶會被活化,接著切割 C1S,從而啟動補體系統的蛋白水解級聯反應。

除了辨識抗體,C1Q 次複合體也能辨識並結合程序性細胞死亡細胞表面暴露的 phosphatidylserine。這種結合可能促進補體系統活化,但來源所述為可能作用,並非確定的因果結論。整體而言,C1QB 透過參與 C1Q 的辨識功能,連結抗原-抗體複合物或特定死亡細胞表面訊號與後續補體級聯反應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22653236 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C1QB ENST00000509305 GRCh38 chr1:22652236-22653336 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCCCGTAGAAGGGAGGCCCCATGGGGGCAGGGACCATGGCTGATTTGCTAAGAGCTCTCTCTTCAGTGCA
CATGGAAGCAAACACTAAATATTTGTTAAATGGTGGGTCTCCCCTCTGGGCCTCAGTTTCCTCGTATATA
AAATGAGGAGGATGGGCCGAGTAACCTCAGCCCCTCTCCGGCCCTAACTTGGCGTGATTCCAGGATCGAG
AAGAAGCAACAGGCCCCTGCCTGGGCCTATTATTGTCATCAGCGTCCAGCCCTGCTGGAAGCAGAGGGAG
GGGTATCAATAAATAATGAACACATTTAAAATTCATTATGAGATTATTTTCTGAGAACAGGGAAAGAGCA
GGGGCACAGAATGGGAAGGAAGCAGAAGAGATGAGCCCAGAAAGGGGAAGCCTGGGACATGAAGTGATAT
TAACAATGAACACGTGCACAGCCCTTTACAGTTTACCCCCAGACACTTCCTCCCCCATCATTTCCTCCAT
TATCCTCCCAGTGGCCTGTGAGATCTGTATCTGTAGAGCAGGTACAATTATGGTCCCATCCTATAGCAGA
GAAAATTGGGGCTCCCTTGACTGACAACACATCAACTGGCAAGTGGCAGAGGCGGGATTGGAATCAAAGG
CTCTGACTGTAAGCCAGCACTCAGGCAGCGGGCCCGCCACATGATGCTCACTGAGGAACACCCCTGCCCA
GTGTAGAAGAAGATCACGAGGTCAGAGAGCCTGGGAGGGTGAGCTGTGGATGTTCCCCCAGGACAGCGTG
TTCTCCCCACAGCTGCTGAGTTGGCAGAACCAAACTTGCCACCCACCCGTCTCATTTACAGTAAATCCAG
TGGGTTGCAGAAATAGGACCTGAAACTGCCTGAGGGCAGCAGGGTGGGGGGACAGTGAGGGGACGGGAAA
GGGGCCAGCCTGCTGGTCCATGGGAGGGGACCGTCAGGGGAAAGCCCTTCCCGCCTCTGGGGAAGGGAAC
TTCCGCTTCGGACCGAGGGCAGTAGGCTCTCGGCTCCTGGTCCCACTGCTGCTCAGCCCAGTGGCCTCAC
AGGACACCAGCTTCCCAGGTGAGGACGGGGCTTGGCGCCTGGGGGAGGCTG
C1QB 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C1QB_1 ↗1:22,653,236正股22,653,187–22,653,246

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_8MZKD · enhancer · 22654674–22654861 · regulatory

· motif · 22653018–22653032 · motif

· motif · 22653018–22653032 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:253 aa

1 aa253 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 P02746 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

complement C1q B chain 長 253 個胺基酸,N 端第 1–27 位為訊號序列。序列含有兩段膠原樣區域,分別標註於第 37–86 位與第 60–114 位;第 38–115 位另註為無序區。C 端第 117–253 位為 C1q domain。

訊號胜肽1–27 aa
結構域Collagen-like 137–86 aa
結構域Collagen-like 260–114 aa
結構域C1q117–253 aa
功能區域Disordered38–115 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5HKJ…

PDB · 5HKJ

X-ray · 1.35 A · A=117-253

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Cell surface

complement C1q B chain 被標註為分泌型,並與細胞表面相關。 其所在的 C1Q 次複合體可結合抗原複合物中的 IgG 或 IgM,形成位於病原體表面的抗原-抗體複合物;此處描述的是複合體結合後的表面關聯。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

未繪示構造:Cell surface。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C1QBC1QBC1QAC1QBPUBQLN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C1QB 是 C1Q 次複合體的組成鏈;該次複合體由 C1QA、C1QB、C1QC 各三條鏈組成,形成六條膠原樣三股螺旋,並連接六個球狀 C1q domain 配體辨識模組。C1Q 次複合體與兩個 C1R 分子及兩個 C1S 分子構成具鈣依賴性的 C1 複合體。這些資料描述其複合體組成,未另外指出 C1QB 單獨與各成員的直接結合關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

C1QB 相關資料列出 C1q deficiency 2(C1QD2),屬常染色體隱性疾病,與補體經典途徑活化受損有關。疾病通常伴隨嚴重免疫複合物疾病,可見反覆皮膚病灶、慢性感染,以及全身性紅斑狼瘡與腎小球腎炎風險增加。來源指出,影響此基因的變異會造成該疾病。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能C1QB 是補體 C1 複合體的核心組成部分,參與啟動經典補體途徑;此級聯反應可促進吞噬與病原體分解,並提供增強適應性免疫的訊號。C1QB 與 C1QA、C1QC 共同辨識抗原結合的 IgG 或 IgM Fc 區域。免疫球蛋白結合會活化 C1R,使其切割 C1S;抗原結合的 IgG 六聚體或五聚體 IgM 可活化 C1Q 次複合體。此外,該次複合體可結合程序性細胞死亡細胞表面的 phosphatidylserine,並可能促進補體活化。含實驗來源
證據與來源

Core component of the complement C1 complex, a multiprotein complex that initiates the classical pathway of the complement system, a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. The classical complement pathway is initiated by the C1Q subcomplex of the C1 complex, which specifically binds IgG or IgM immunoglobulins complexed with antigens, forming antigen-antibody complexes on the surface of pathogens: C1QA, together with C1QB and C1QC, specifically recognizes and binds the Fc regions of IgG or IgM via its C1q domain. Immunoglobulin-binding activates the proenzyme C1R, which cleaves C1S, initiating the proteolytic cascade of the complement system. The C1Q subcomplex is activated by a hexamer of IgG complexed with antigens, while it is activated by a pentameric IgM. The C1Q subcomplex also recognizes and binds phosphatidylserine exposed on the surface of cells undergoing programmed cell death, possibly promoting activation of the complement system

PMID 12847249 ↗ · PMID 18250442 ↗ · PMID 19006321 ↗ · PMID 19706439 ↗ · PMID 24626930 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 3258649 ↗ · PMID 34155115 ↗ · PMID 6249812 ↗ · PMID 6776418 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用C1 複合體是具鈣依賴性的組合,由一個 C1Q 次複合體、兩個 C1R 分子及兩個 C1S 分子構成。C1Q 次複合體含 18 個亞基:C1QA、C1QB、C1QC 各三條鏈形成六條膠原樣三股螺旋,並連接六個球狀配體辨識模組,即 C1q domain。含實驗來源
證據與來源

Core component of the complement C1 complex, a calcium-dependent complex composed of 1 molecule of the C1Q subcomplex, 2 molecules of C1R and 2 molecules of C1S. The C1Q subcomplex is composed 18 subunits: 3 chains of C1QA, C1QB, and C1QC trimerize to form 6 collagen-like triple helices connected to six globular ligand-recognition modules (C1q domain)

PMID 12960167 ↗ · PMID 18250442 ↗ · PMID 20548024 ↗ · PMID 23650384 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 2988513 ↗ · PMID 34155115 ↗ · PMID 6249812 ↗ · PMID 6952210 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位complement C1q B chain 被標註為分泌型及細胞表面相關;其結合抗原複合物中的 IgG 或 IgM,可形成位於病原體表面的抗原-抗體複合物。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Cell surface; Specifically binds IgG or IgM immunoglobulins complexed with antigens, forming antigen-antibody complexes on the surface of pathogens

PMID 18250442 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 708376 ↗ · PMID 34155115 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯C1q deficiency 2(C1QD2)是常染色體隱性疾病,與補體經典途徑活化受損相關,通常造成嚴重免疫複合物疾病,表現包括反覆皮膚病灶、慢性感染,以及全身性紅斑狼瘡和腎小球腎炎風險升高。來源指出,影響此基因的變異會造成該疾病。含實驗來源
證據與來源

C1q deficiency 2 C1QD2 An autosomal recessive disorder caused by impaired activation of the complement classical pathway. It generally leads to severe immune complex disease characterized by recurrent skin lesions, chronic infections, an increased risk of systemic lupus erythematosus, and glomerulonephritis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620321

PMID 9476130 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000509305 · 1,098 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTAGGCTCTCGGCTCCTGGTCCCACTGCTGCTCAGCCCA40
41GTGGCCTCACAGGACACCAGCTTCCCAGGAGGCGTCTGAC80
81ACAGTATGATGATGAAGATCCCATGGGGCAGCATCCCAGT120
121ACTGATGTTGCTCCTGCTCCTGGGCCTAATCGATATCTCC160
161CAGGCCCAGCTCAGCTGCACCGGGCCCCCAGCCATCCCTG200
201GCATCCCGGGTATCCCTGGGACACCTGGCCCCGATGGCCA240
241ACCTGGGACCCCAGGGATAAAAGGAGAGAAAGGGCTTCCA280
281GGGCTGGCTGGAGACCATGGTGAGTTCGGAGAGAAGGGAG320
321ACCCAGGGATTCCTGGGAATCCAGGAAAAGTCGGCCCCAA360
361GGGCCCCATGGGCCCTAAAGGTGGCCCAGGGGCCCCTGGA400
401GCCCCAGGCCCCAAAGGTGAATCGGGAGACTACAAGGCCA440
441CCCAGAAAATCGCCTTCTCTGCCACAAGAACCATCAACGT480
481CCCCCTGCGCCGGGACCAGACCATCCGCTTCGACCACGTG520
521ATCACCAACATGAACAACAATTATGAGCCCCGCAGTGGCA560
561AGTTCACCTGCAAGGTGCCCGGTCTCTACTACTTCACCTA600
601CCACGCCAGCTCTCGAGGGAACCTGTGCGTGAACCTCATG640
641CGTGGCCGGGAGCGTGCACAGAAGGTGGTCACCTTCTGTG680
681ACTATGCCTACAACACCTTCCAGGTCACCACCGGTGGCAT720
721GGTCCTCAAGCTGGAGCAGGGGGAGAACGTCTTCCTGCAG760
761GCCACCGACAAGAACTCACTACTGGGCATGGAGGGTGCCA800
801ACAGCATCTTTTCCGGGTTCCTGCTCTTTCCAGATATGGA840
841GGCCTGACCTGTGGGCTGCTTCACATCCACCCCGGCTCCC880
881CCTGCCAGCAACGCTCACTCTACCCCCAACACCACCCCTT920
921GCCCAACCAATGCACACAGTAGGGCTTGGTGAATGCTGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。