演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C1QA

complement C1q A chain

C1QA 編碼 complement C1q A chain,是補體 C1 複合體的核心組成之一,與 C1QB、C1QC 共同構成可辨識免疫複合體的 C1Q 次複合體。

Homo sapiens1p36.12UniProt P02745
OFFICIAL SYMBOL
C1QA
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P02745
PDB / ALPHAFOLD
5HKJ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C1QA 是蛋白質編碼基因,其產物 complement C1q A chain 為補體 C1q 的 A 鏈,屬於 C1Q 次複合體的組成部分。C1Q 次複合體由 C1QA、C1QB 與 C1QC 的鏈共同組成,並以膠原樣三股螺旋連接球狀的 C1q domain,形成具有配體辨識能力的結構。這項結構特色使 C1QA 成為補體 C1 複合體中參與辨識的核心成員。

Official symbol
C1QA
Gene name
complement C1q A chain
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1241
UniProt
P02745
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.12
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegC1QApq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:22,635,057–22,640,201
Gene span
5,145 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000374642 ★22,636,628–22,639,6783
ENST0000088202022,635,057–22,640,2013
ENST0000069573822,635,077–22,640,2012
ENST0000069573922,636,450–22,639,6783
ENST0000069574022,636,450–22,640,2013
ENST0000096538122,636,450–22,640,2013
ENST0000069574122,636,456–22,639,6063
ENST0000069574222,636,456–22,639,6063
ENST0000069574322,636,456–22,639,6063
ENST0000069574422,636,456–22,640,2013
ENST0000040232222,636,456–22,640,2013
ENST0000088202222,636,456–22,640,2013

顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

complement C1q A chain 是補體 C1 複合體的核心組成,參與啟動補體系統的 classical pathway。這條途徑可引發一連串蛋白質反應,促進病原體的吞噬與分解,並透過訊號作用增強適應性免疫。C1QA 與 C1QB、C1QC 一同構成 C1Q 次複合體,負責辨識帶有抗原的 IgG 或 IgM 免疫球蛋白。

C1QA 透過其 C1q domain 辨識並結合 IgG 或 IgM 的 Fc 區域。這類抗體已與抗原結合,並形成位於病原體表面的抗原—抗體複合體;C1Q 次複合體對這些複合體的辨識,是 classical pathway 的起始步驟之一。啟動條件與抗體組成有關:與抗原結合的六聚體 IgG 可活化 C1Q 次複合體,五聚體 IgM 也能使其活化。

免疫球蛋白結合後,會活化酵素原 C1R;C1R 接著切割 C1S,從而啟動補體系統的蛋白水解級聯反應。這使 C1QA 所參與的辨識事件連接至後續補體反應,支持病原體清除及免疫訊號傳遞。

此外,C1Q 次複合體也能辨識並結合細胞程序性死亡期間暴露於細胞表面的 phosphatidylserine。這種結合可能促進補體系統活化,但其作用在來源中以可能性描述,並非確定的結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 22636628 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C1QA ENST00000374642 GRCh38 chr1:22635628-22636728 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGCTCCCACTGGCTACATGGAGCATGCAGCCCTGGCCGTGCCTCCCTGCTGCAGCCAGTGTGATGACAGC
AGCCATTCCAGACGGCCCGCCATTGCCATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGGGTCTTGTTCT
GTCTCCCAGGCAGGAGTGCAGTGGTAAGATCAAAGCTCACTGCAGCCTCAACCTCCTGGGCTCTAGCAAT
CCTCCCAGCTCAGCCTCCCAAATAGCTGGGACTACACAGGTGCATGCTACCACACCTGGCTATTTTTTAA
ATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCG
CCTGCCTTGACCTCCCAAAATGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAAAGCACCTAGACTTGCTGTTTTTTTA
AATGTTGGCAAAAGCTAGTGACTAAGTGTTCACCATGTGCCAAGTGTTTTGTATGTGCAAGTCATTAAAA
TGTTATAATAATCAGATGATATAGGACCCCGTTCCCAGTGTACAGATAAAACTGAGGGCTCAGGAGGTCA
AGTAATTTCCCAAAGACATGCAACTAGGAAGCAGCAAGTCTAGAAACAGATTGCTGTGCTTCCTTCTCAC
CAATGCACTGTTCTTTCTTCTTTGTATTTTCCAAGCTTTTGGCAATGAATTGCATGTCACTTTCATAATC
ATGAAAAGTCCTACAAGGGACAGATTTTTTTAAAGATTCCTTCCGCTCTGGTGTTCTGTGCTTCGCTGGT
TCTCAGAACCTCACCCTGCACGGCCTCCACCCCACATCCTCACAGGCACTGGCCTCACTGCCCCCACTCC
CACACCAGCTGTTGCTGGGGCAGGACGCCCAATGTCCCAGTCTTGCTGAAGTCTGCTTGAAATGTCCCTG
GTGAGCTTCTGGCCACTGGGGAAGTTCAGGGGGCAGGTCTGAAGAAGGGGAAGTAGGAAGGGATGTGAAA
CTTGGCCACAGCCTGGAGCCACTCCTGCTGGGCAGCCCACAGGGTCCCTGGGCGGAGGGCAGGAGCATCC
AGTTGGAGTTGACAACAGGAGGCAGGTGAGGCCAGAGTCCCAGAGGGAGGG
C1QA 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C1QA_1 ↗1:22,636,628正股22,636,579–22,636,638

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_9BZKW · promoter · 22636336–22636698 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:245 aa

1 aa245 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 P02745 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

complement C1q A chain 長 245 個胺基酸。其 N 端 1–22 位為訊號序列;31–109 位標註為 Collagen-like domain,110–245 位為 C1q domain。27–114 位另標註為無序區域,與 Collagen-like domain 的範圍部分重疊。

訊號胜肽1–22 aa
結構域Collagen-like31–109 aa
結構域C1q110–245 aa
功能區域Disordered27–114 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5HKJ…

PDB · 5HKJ

X-ray · 1.35 A · A=110-245

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Cell surface

complement C1q A chain 為分泌型蛋白,並可位於細胞表面。 當 C1Q 次複合體結合已與抗原形成複合體的 IgG 或 IgM 時,這些複合體可位於病原體表面;此處描述的是結合目標所在位置,不應視為 C1QA 本身定位於病原體內部。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

未繪示構造:Cell surface。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C1QAC1QAC1QBC1QBPSGTBUBQLN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

C1QA 是補體 C1 複合體及 C1Q 次複合體的組成鏈;後者由 C1QA、C1QB、C1QC 各三條鏈組成,形成六條膠原樣三股螺旋及六個球狀辨識模組。C1 複合體另含兩個 C1R 與兩個 C1S,並以鈣離子依賴方式組成。C1QA 與 CR1 有交互作用,涉及 CR1 的 Sushi 24 與 Sushi 25 domains;其 C 端也與 CD33 交互作用,並活化 CD33 的抑制性基序。微生物感染時,Staphylococcus aureus 的 Cna protein 可與 C1QA 交互作用,並抑制 classical complement pathway。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

C1QA 相關的 C1q deficiency 1(C1QD1)為自體隱性疾病,與補體 classical pathway 活化受損有關。此病通常造成嚴重的免疫複合體疾病,可見反覆皮膚病灶、慢性感染,並伴隨 systemic lupus erythematosus 風險增加及腎小球腎炎。來源指出,造成此病的變異影響本條目所代表的基因。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能C1QA 是補體 C1 複合體的核心組成,參與啟動 classical pathway;該途徑可促進病原體吞噬與分解,並增強適應性免疫訊號。C1QA 與 C1QB、C1QC 構成的 C1Q 次複合體,透過 C1q domain 辨識已與抗原結合之 IgG 或 IgM 的 Fc 區域。抗體結合可活化 C1R,繼而切割 C1S;六聚體 IgG 或五聚體 IgM 可活化 C1Q 次複合體。此外,它也能結合程序性死亡細胞表面暴露的 phosphatidylserine,並可能促進補體活化。含實驗來源
證據與來源

Core component of the complement C1 complex, a multiprotein complex that initiates the classical pathway of the complement system, a cascade of proteins that leads to phagocytosis and breakdown of pathogens and signaling that strengthens the adaptive immune system. The classical complement pathway is initiated by the C1Q subcomplex of the C1 complex, which specifically binds IgG or IgM immunoglobulins complexed with antigens, forming antigen-antibody complexes on the surface of pathogens: C1QA, together with C1QB and C1QC, specifically recognizes and binds the Fc regions of IgG or IgM via its C1q domain. Immunoglobulin-binding activates the proenzyme C1R, which cleaves C1S, initiating the proteolytic cascade of the complement system. The C1Q subcomplex is activated by a hexamer of IgG complexed with antigens, while it is activated by a pentameric IgM. The C1Q subcomplex also recognizes and binds phosphatidylserine exposed on the surface of cells undergoing programmed cell death, possibly promoting activation of the complement system

PMID 12847249 ↗ · PMID 18250442 ↗ · PMID 19006321 ↗ · PMID 19706439 ↗ · PMID 24626930 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 3258649 ↗ · PMID 34155115 ↗ · PMID 6249812 ↗ · PMID 6776418 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用C1QA 是鈣離子依賴性補體 C1 複合體的組成部分;該複合體含一個 C1Q 次複合體、兩個 C1R 與兩個 C1S。C1Q 次複合體包含 C1QA、C1QB、C1QC 各三條鏈,形成六條膠原樣三股螺旋,並連接六個球狀配體辨識模組。C1QA 與 CR1 交互作用涉及 Sushi 24、Sushi 25 domains;其 C 端亦與 CD33 交互作用,並活化 CD33 的抑制性基序。含實驗來源
證據與來源

Core component of the complement C1 complex, a calcium-dependent complex composed of 1 molecule of the C1Q subcomplex, 2 molecules of C1R and 2 molecules of C1S. The C1Q subcomplex is composed 18 subunits: 3 chains of C1QA, C1QB, and C1QC trimerize to form 6 collagen-like triple helices connected to six globular ligand-recognition modules (C1q domain). Interacts with CR1 (via Sushi 24 and Sushi 25 domains). Interacts (via C-terminus) with CD33; this interaction activates CD33 inhibitory motifs

PMID 12960167 ↗ · PMID 18250442 ↗ · PMID 20548024 ↗ · PMID 23650384 ↗ · PMID 28325905 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 29563915 ↗ · PMID 2988513 ↗ · PMID 34155115 ↗ · PMID 6249812 ↗ · PMID 6952210 ↗ · PMID 9324355 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境下,C1QA 與 Staphylococcus aureus 的 Cna protein 交互作用;此交互作用會抑制 classical complement pathway。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Interacts with Staphylococcus aureus protein Cna; this interaction results in the inhibition of the classical complement pathway

PMID 23720782 ↗

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細胞定位C1QA 為分泌型蛋白,並可位於細胞表面。它可特異性結合已與抗原形成複合體的 IgG 或 IgM;這些抗原—抗體複合體形成於病原體表面。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Cell surface; Specifically binds IgG or IgM immunoglobulins complexed with antigens, forming antigen-antibody complexes on the surface of pathogens

PMID 18250442 ↗ · PMID 29449492 ↗ · PMID 34155115 ↗

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疾病關聯C1q deficiency 1(C1QD1)是自體隱性疾病,與補體 classical pathway 活化受損有關,通常造成嚴重免疫複合體疾病。其特徵包括反覆皮膚病灶、慢性感染、systemic lupus erythematosus 風險增加及腎小球腎炎。疾病由影響本條目所代表基因的變異造成。含實驗來源
證據與來源

C1q deficiency 1 C1QD1 An autosomal recessive disorder caused by impaired activation of the complement classical pathway. It generally leads to severe immune complex disease characterized by recurrent skin lesions, chronic infections, an increased risk of systemic lupus erythematosus, and glomerulonephritis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613652

PMID 9777412 ↗

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情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000374642 · 1,091 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCCTGCTGGGCAGCCCACAGGGTCCCTGGGCGGAGGGC40
41AGGAGCATCCAGTTGGAGTTGACAACAGGAGGCAGAGGCA80
81TCATGGAGGGTCCCCGGGGATGGCTGGTGCTCTGTGTGCT120
121GGCCATATCGCTGGCCTCTATGGTGACCGAGGACTTGTGC160
161CGAGCACCAGACGGGAAGAAAGGGGAGGCAGGAAGACCTG200
201GCAGACGGGGGCGGCCAGGCCTCAAGGGGGAGCAAGGGGA240
241GCCGGGGGCCCCTGGCATCCGGACAGGCATCCAAGGCCTT280
281AAAGGAGACCAGGGGGAACCTGGGCCCTCTGGAAACCCCG320
321GCAAGGTGGGCTACCCAGGGCCCAGCGGCCCCCTCGGAGC360
361CCGTGGCATCCCGGGAATTAAAGGCACCAAGGGCAGCCCA400
401GGAAACATCAAGGACCAGCCGAGGCCAGCCTTCTCCGCCA440
441TTCGGCGGAACCCCCCAATGGGGGGCAACGTGGTCATCTT480
481CGACACGGTCATCACCAACCAGGAAGAACCGTACCAGAAC520
521CACTCCGGCCGATTCGTCTGCACTGTACCCGGCTACTACT560
561ACTTCACCTTCCAGGTGCTGTCCCAGTGGGAAATCTGCCT600
601GTCCATCGTCTCCTCCTCAAGGGGCCAGGTCCGACGCTCC640
641CTGGGCTTCTGTGACACCACCAACAAGGGGCTCTTCCAGG680
681TGGTGTCAGGGGGCATGGTGCTTCAGCTGCAGCAGGGTGA720
721CCAGGTCTGGGTTGAAAAAGACCCCAAAAAGGGTCACATT760
761TACCAGGGCTCTGAGGCCGACAGCGTCTTCAGCGGCTTCC800
801TCATCTTCCCATCTGCCTGAGCCAGGGAAGGACCCCCTCC840
841CCCACCCACCTCTCTGGCTTCCATGCTCCGCCTGTAAAAT880
881GGGGGCGCTATTGCTTCAGCTGCTGAAGGGAGGGGGCTGG920
921CTCTGAGAGCCCCAGGACTGGCTGCCCCGTGACACATGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。