演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

C11orf24DM4E3

chromosome 11 open reading frame 24

C11orf24 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens11q13.2UniProt Q96F05
OFFICIAL SYMBOL
C11orf24
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q96F05
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

C11orf24 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 chromosome 11 open reading frame 24。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11q13.2。

Official symbol
C11orf24
Gene name
chromosome 11 open reading frame 24
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1174
UniProt
Q96F05
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
DM4E3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q13.2
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegC11orf24pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:68,261,335–68,272,001
Gene span
10,667 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000304271 ★68,261,338–68,271,9734
ENST0000085301468,261,335–68,272,0014
ENST0000085301568,261,335–68,271,9845
ENST0000085301668,261,335–68,271,9845
ENST0000085301768,261,335–68,271,9844
ENST0000085301968,261,335–68,268,3943
ENST0000085302168,261,335–68,264,1892
ENST0000091903268,261,335–68,272,0014
ENST0000094596568,261,335–68,271,9845
ENST0000113585468,261,335–68,271,9844
ENST0000053331068,261,609–68,272,0015
ENST0000052728068,263,692–68,271,9893

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 68271973 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>C11orf24 ENST00000304271 GRCh38 chr11:68271873-68272973 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TATTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC
ACGATCTCTGCTCACTTCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG
CTGGGACTACAGGCGCACGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCA
TGTTGCCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGAGCTCAGATAATCCGCCCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGG
ATTACAGGCAAGAGCCACCGCGCCTGGCCTGCAAAGCCTATTTCTAACCAAAGTCAAGTCCCACACACTT
GCCTCTAAATTGCGTTTTGCTCCTTTGTTATCCCAGGTTTTACAATTACAGAGCACTTGATGAGCCTGTT
TCCACGTCTGTAAAATGAGGCGAAGTTCTTCACTGTGCTATTGCAGAATTAAGCCACTGGCTCTATAGGC
AAAGTGCTTAGCACGGGCGTGGCACGCTGCGGGTGCACAGAAACGCTCGCTGCCACCCCACCCTTAACTA
CCGGGCACCCCAGCGCCCCGCCAGGGGCTGAAGAAACGTGGGAGGAAGCGGAGGAACGCGAAGGGCGTGT
GCCCGCGAAAGGTCTCACGAGGCGTTTCGAGGTCGCCTCTTCAGGCTCGGCTGCCGACAAGGTGCCTCTG
AGCTCACCCAGCCCAACCCGCGCACCCCGGGACCCCAAGACGGCAGCGGGCACAGCTGGGCAGCAGAGAC
CCGGGAACACCCACTTCCGCCACAGACCTGCTCAAAATAGCTCCTTCTGGCAGCGCGCAAGAAGTGGCCC
GAGCCGGCCCCGGGGAGGCGGGGCCTGAGAGCAGACAACCCCCCCACTTCCGGCTCGCCTCCGTTCGCCA
CAGGCCCCGCCGCAGCCGCTCTTCGCCCCGGCCAGCAGGCCCGCCCCGCCCTCCGTGACGTCATTTCCGG
CGTTTGGGCGGGGCCCGGGCAGGGCGCGCTGCCCGGAGCTGCCTGGGTTGCGCTGCCGGCCACGTCCCCG
CGCCGGGCCTCAGGCTCCTTCCTACTGTCCGAGGGCCACCAGGCCGCCGGG
C11orf24 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
C11orf24_1 ↗11:68,271,973負股68,271,963–68,272,022

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:449 aa

1 aa449 aa功能區域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q96F05 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Uncharacterized protein C11orf24 長 449 個胺基酸,具有第 1–20 位的訊號序列。其第 21–400 位為胞外區,第 401–421 位為螺旋型跨膜區,第 422–449 位為細胞質區。序列註解另標示第 72–101、154–187 與 215–381 位為無序區。

訊號胜肽1–20 aa
拓樸區域Extracellular21–400 aa
跨膜區Helical401–421 aa
拓樸區域Cytoplasmic422–449 aa
功能區域Disordered72–101 aa
功能區域Disordered154–187 aa
功能區域Disordered215–381 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96F05…

AlphaFold · Q96F05

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane

C11orf24 是單次穿膜的 I 型膜蛋白,位於細胞膜及 Golgi apparatus 的 trans-Golgi network 膜。 它會以 pH 敏感的方式經由胞內體循環至細胞膜,並與 Rab6 陽性囊泡相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
DM4E3C11orf24CREB3L1FAM209AFFAR2MGST3SLC10A6SSMEM1TMEM80
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位C11orf24 是單次穿膜的 I 型膜蛋白,定位於細胞膜與 Golgi apparatus 的 trans-Golgi network 膜。它能以對 pH 敏感的方式經由胞內體循環至細胞膜,並與 Rab6 陽性囊泡相關。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane / Single-pass type I membrane protein; Cycles to the plasma membrane via endosomes in a pH sensitive manner. Associated with Rab6-positive vesicles

PMID 24312644 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000304271 · 2,071 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGGCGCGCTGCCCGGAGCTGCCTGGGTTGCGCTGCCGGC40
41CACGTCCCCGCGCCGGGCCTCAGGCTCCTTCCTACTGTCC80
81GAGGGCCACCAGGCCGCCGGGGGCCTGCTGCGCCCGGATG120
121CGTCTGTTACTAGAGTGGAGAGTCTACCTTCGTCTCACAT160
161GTGCCACAAAGGATGGCATGGCCCGGGAGTGCCCCACCAC200
201GTGGCTTTCACCCCCTGCAAAGCCAGACTTCGCCCAGCGA240
241CACAGTGTCAAGCCCACAGCTCTCCAAGGAGGAAGATGGT280
281CCAGGCTGGGAGCATCCCCTTAGCAGCAGCCTCTGATCCC320
321TTGGCCAAGCAGGAGGGAACCATTAGCAGCCTGAGGAGCT360
361GGCTGGCTGGGAGCCTCGGGGACCGCCCAGCCTTGCTCCC400
401AGCTCACCCACAAGATGTGGACAGCTCTTGTGCTCATTTG440
441GATTTTCTCCTTGTCCTTATCTGAAAGCCATGCGGCATCC480
481AACGATCCACGCAACTTTGTCCCTAACAAAATGTGGAAGG520
521GATTAGTCAAGAGGAATGCATCTGTGGAAACAGTTGATAA560
561TAAAACGTCTGAGGATGTAACCATGGCAGCAGCTTCTCCT600
601GTCACATTGACCAAAGGGACTTCGGCAGCCCACCTCAACT640
641CTATGGAAGTCACAACAGAGGACACAAGCAGGACAGATGT680
681GAGTGAACCAGCAACTTCAGGAGGTGCAGCTGATGGTGTG720
721ACCTCCATTGCTCCCACGGCTGTGGCCTCCAGTACGACTG760
761CGGCCTCCATTACGACTGCGGCCTCCAGTATGACTGTGGC800
801CTCCAGTGCTCCCACGACTGCAGCCTCCAGTACAACTGTG840
841GCCTCCATTGCTCCCACGACTGCAGCCTCCAGTATGACTG880
881CGGCCTCCAGCACTCCCATGACACTTGCACTCCCCGCGCC920
921CACGTCCACTTCCACAGGGCGGACCCCGTCCACTACCGCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。