基因總覽
C11orf21 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 chromosome 11 open reading frame 21。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11p15.5。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000381153 ★ | 2,295,628–2,301,918 | 4 |
| ENST00000456145 | 2,295,628–2,302,082 | 5 |
| ENST00000856028 | 2,295,628–2,303,180 | 5 |
| ENST00000856029 | 2,295,628–2,302,082 | 4 |
| ENST00000856030 | 2,295,628–2,303,180 | 5 |
| ENST00000856031 | 2,295,628–2,303,180 | 5 |
| ENST00000856032 | 2,295,628–2,302,082 | 5 |
| ENST00000961288 | 2,295,628–2,303,180 | 5 |
| ENST00001138805 | 2,295,628–2,302,082 | 4 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>C11orf21 ENST00000381153 GRCh38 chr11:2301818-2302918 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CGCTCGGCGGATGACAGCAAAGTGGGCCCCGAAGTAGGTAAGAGTCACCATGGTGGCCACAGAGAGGCCC AGCAGCTGTGGATAGGGCAGACTCAGAGTGTGGGGCATGGGACTGCTGCAGGAGCAGGGAGCTCGGCCCC AGCGGGCAGGGTTGGGGCTCTCTCCAGCTTCCCGGTCCCGTGAGAGACAGGCTCAGCTGCAGGGATTCCC GGTGTTTCCGTGGAGTGGTCTCAGGAGGCCTTCACTGCAGACGCCCCAGCACACTCACAGGCACCCCCAC ATGGTAGACGCATACACGCACAGCCCAGCTTCCCCAGACACCCAGGACCTCTGATCATTGTGTCTACGGA GTGGGAGTGAGCCCCACCCCTGTGCCAGCACCCTCCGGGGCAGGAAGGGGAGAAGATCCCTGGAGCCCGG CAGCCAGTGCCCCTCCACCCCAGCTCGCCCCAGGCCTCAGCCCCACTCAGGCCTCCTCCAGGCTCTGTGC TGCCCCTCAGGAGGAGAGACGGGGTTGCTCATGGTGGTCCCTGCCTGCCTGCGGCTGTCTGCAAGGGCAG GACACATGTCTGCAAGGGCAGGACAGGGACAGTAGGGCTGGTGTGTGTGTCAGGGGAGGGATAATCCCTG TGCTGAGGCCCTGCCACCCCTCACCCCTGCTCACCCCCACCCACCACCCACTCCTGCCCGACCTGCCTGT TACCAAGATAAAGAAGCAGGTGACCAGCATCTGGCATTTGGCAACCCTGACTCGACTCCAAGGCCCCATG ACGGTTCCTCTCCTCTCCTCTCCTCCCCTCCCTTCCCCTCCCTGTGGTTTCCAGCTGGGCAGGGGCCTCA GACCGCAGCTCACTGCCCAGGAGGTAGGCTGCATCCGCCCCTCTGTCTGTCTGTCAACATCGCCCTAGGA CCGAGCTGCTGGGTGCCCCGGAAGAAGGGCAGGCAGGAAGGGGAGGGGCAGTGAGGTTGGCTCCCCCCAC CACCTCACCCTGGTGCCCCCAGCCCAGCCCAAGACACCAGGGCATTTGCTGACATCTGAGGCCCTTCCCA GGAAGACATGGCCTCGTTCTTGGTGTGGCCACTGAGGACGGCGCTGAGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C11orf21_1 ↗ | 11:2,301,918 | 負股 | 2,301,908–2,301,967 |
| C11orf21_2 ↗ | 11:2,302,079 | 負股 | 2,302,069–2,302,128 |
| C11orf21_3 ↗ | 11:2,303,140 | 負股 | 2,303,130–2,303,189 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_5JL76 · CTCF_binding_site · 2298914–2298935 · regulatory
ENSR11_5JL9P · CTCF_binding_site · 2299468–2299489 · regulatory
ENSR11_5JLM2 · CTCF_binding_site · 2301477–2301498 · regulatory
ENSR11_9WN4 · promoter · 2301903–2302160 · regulatory
ENSR11_9WN8 · promoter · 2302233–2302733 · regulatory
ENSR11_5JMBN · CTCF_binding_site · 2305502–2305523 · regulatory
· motif · 2298916–2298932 · motif
· motif · 2299470–2299486 · motif
· motif · 2300401–2300414 · motif
· motif · 2301479–2301495 · motif
· motif · 2305440–2305455 · motif
· motif · 2305504–2305520 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：132 aa
Uncharacterized protein C11orf21 長 132 個胺基酸；第 17 至 75 位胺基酸區段註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
C11orf21 的定位註記為細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | C11orf21 的細胞內定位註記為細胞質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGCCCAGCCCAAGACACCAGGGCATTTGCTGACATCTGAG40GCCCTTCCCAGGAAGACATGGCCTCGTTCTTGGTGTGGCC80ACTGAGGACGGCGCTGAGAGGGGGAAAGTCATGGGCAGGA120CCTGGTGTGGGATGTGGAGGAGACGGCGCCCGGGGAGGAG160GAGCGCTGTGCCCAGGTGGCCTCACTTGTCATCTCAAAGT200GGCGTCGAACCCCCTGACAGGTGGACGGGAACCCCCGGCT240GGCCCTCCAGAGACCAGGAGGCCCCTGGCTCAATGATGCC280ACCTGCAGCTGCCCAACCCTCCGCCCATGGTGCCCTTGTT320CCACCTGCCACCGCTCATGAACCTGTGGATCACCCAGCTC360TGCACTGGCTTGCCTGCTGCTGCTGTCTCAGTTTACCTGG400GCAGTTGCCCCTGGCTATCCGGCTGGGATGGGACTTGGAC440TTAGAAGCAGGCCCCTCCTCTGGAAAGCTGTGTCCTCGGG480CCAGGAGGTGGCAGCCTCTACCTTCCTGAGACAGGGACCC520TTTTCTGTCCATCAGAGGACAGCTGTATGAAGACACAGAG560AGAAGGCAGCCATCTGTAAGCCAGGAAGAGAGCCCTCACC600AAGACTGGAATCAGCAGCACCTTGATATTGGACTTCCAGC640CTCCAGAACTGCAAGAAATAAGCACCTGCTGTTTACATGC680CCAGCCTGCAGTGCTTCCTTATGGCAGATTGGAGCTAACT720GAGACAGCTCCCAGCACTCATTCATTCATTCATTCATTCA760CTCACCTCATGTCTACTAAACAGCTCTGGGCTGGCTCTGG800GAAGCAGTGAGTCACACACACTGCCCCCAGCAACGTGTGA840AATATGTTTAGAGACAGTGGGCTACAGCGGAAAGGGTAGA880TGCCCTGAGAACCCCAGCGGTGCTGGTCAGAAGCACAGGC920CTTGTTGGGCTGAGGCTGGCATGGGGTGAACCTGGGGAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。