基因總覽
BUB1B 是蛋白質編碼基因，其產物為 Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta，屬於蛋白激酶超家族中的 Ser/Thr protein kinase family，並歸於 BUB1 subfamily。此蛋白具有激酶性質，並含有 BUB1 N-terminal 結構域與 Protein kinase 結構域；其 N 端另有核定位訊號，序列中也註記了與特定蛋白交互作用相關的區域。作為細胞有絲分裂檢查複合體的成員，BUB1B 參與細胞分裂期間的檢查工作。其結構同時包含未規則區域，顯示蛋白質序列具有不同性質的區段。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000287598 ★ | 40,161,069–40,221,123 | 23 |
| ENST00000412359 | 40,161,023–40,221,136 | 23 |
| ENST00000897791 | 40,161,023–40,221,136 | 23 |
| ENST00000897792 | 40,161,023–40,221,136 | 23 |
| ENST00000918305 | 40,161,023–40,221,136 | 22 |
| ENST00000918306 | 40,161,023–40,221,136 | 24 |
| ENST00000918307 | 40,161,023–40,221,136 | 19 |
| ENST00000918308 | 40,161,023–40,221,136 | 20 |
| ENST00000918309 | 40,161,023–40,221,136 | 23 |
| ENST00000918310 | 40,161,023–40,221,136 | 20 |
| ENST00001130833 | 40,161,023–40,170,766 | 4 |
| ENST00001134363 | 40,161,023–40,221,136 | 23 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BUB1B 是有絲分裂檢查點複合體（MCC）的組成成員。MCC 由 CDC20、MAD2L1/MAD2、BUB1B/BUBR1 與 BUB3 組成，是紡錘體組裝檢查點的重要部分。當染色體尚未正確連接至有絲分裂紡錘體時，MCC 可抑制 APC/C，使染色體分離延後，並延緩細胞由中期進入後期。這項檢查有助於在進入染色體分離階段前，等待染色體與紡錘體的連接狀態符合條件。
MCC 與 APC/C 結合時，APC/C 維持不活化狀態；當紡錘體組裝檢查點解除，MCC-APC/C 複合體會招募 E2 酵素 UBCH10，促使 MCC 中的 CDC20 自我泛素化，進而使 APC/C 重新活化，讓細胞得以進入後期。BUB1B 因而參與檢查點對細胞週期轉換的調節，但相關資料描述的是複合體整體的作用，並非只由 BUB1B 單獨完成。
MCC 也監測依賴動粒馬達 CENPE 的動粒活動；BUB1B 是 CENPE 定位至動粒所必需的因子。此外，BUB1B 在間期細胞中負向調節 PLK1 活性，並抑制中心體擴增。來源另指出 BUB1B 可能參與腫瘤抑制，但此項功能標示為相似性推論，不能視為已確立的直接作用。
Promoter 與基因調控
>BUB1B ENST00000287598 GRCh38 chr15:40160069-40161169 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAGTGCCACCTCTCTGACCATCCCCACAGTCATAAAGGAGAACTCCCCTGTACCTGGGCTTTCTTAAAT GACCCTGTTCCTTCCTCAAGGTGGCTAATGCCTGTAATCGCAGCTACTGCGGAGGCTGAGGTGGGAGGAT CACTTGACCCCGGGAGTTGGAGGCTGGAATGCAGTAGCCCCATGATGGGGCTACTGCACTCCAGCCTGGG CAACAGAGCAAGAAGAAGACCCTGTCTCTAAAACAAAACCAACCAACCAAACAAACAAAAAGACTCTACT CCCCTGGTCACATCTGAGCTATCACAATTTCTTCCTCAGAAAATTGAAATTGCAACAAACAGTTTAATGT CAGTCAAGGCTAGTCCCCTGAAGGGGAAAAGAGGTAACACCTTGGGAACCATAGCATGGCTGTGTTTACT GCTTGTGGACTGAGCAGAAGAGAAAGCAAGACAGTATCATCACTTTATAGATGAGGAAAACTGATGGTCA GAAAGATTATGTAGCTTGCCTAAGGTTGCACATTTGGTATGATTTTACAGAACTAGAATCCAGCTTTTTG AATTCAAGGGTGGGGCAGGAAACAGCTAGGTCAGTGGCCTAAGAACTCCGGACGGGTGAGATTTGGGGCA GACAGCAGGGGTAGTCACCCTACAAGAGTCACGCCAAGTGCAAGCACTCAGAGACATCTCCCAACACTCA AAACAGCAAAGAAGTTCTGGTGCTTTAAGTGTTCCTCGCTCGGCTCAGAGACTCGGCTTCGAGCCGCGAC TCAAGACAGCACCTGGGGGTATTTGTTTTGCCTAAGCCTGCTGCACTTCCACGGCCATTGAATCCCAAAA ACTACAATTCCCATTATGCACCGCGAGTTCGCGGACTAAACAGGCATAAACTACAAGCCCCAGAATGCCT TGGGCGAGACGCGAGAGCACGGAGGAGCGGAGGGGCGTGGCCACGTCGACCGCGCGGGACCGTTAAATTT GAAACTTGGCGGCTAGGGGTGTGGGCTTGAGGTGGCCGGTTTGTTAGGGAGTCGTGTACGTGCCTTGGTC GCTTCTGTAGCTCCGAGGGCAGGTTGCGGAAGAAAGCCCAGGCGGTCTGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BUB1B_1 ↗ | 15:40,161,069 | 正股 | 40,161,020–40,161,079 |
| BUB1B_2 ↗ | 15:40,220,742 | 正股 | 40,220,693–40,220,752 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_9KXDL · promoter · 40160577–40161079 · regulatory
ENSR15_C5ZL7 · enhancer · 40161080–40162462 · regulatory
· motif · 40160956–40160971 · motif
· motif · 40161016–40161033 · motif
· motif · 40161141–40161152 · motif
· motif · 40161158–40161173 · motif
· motif · 40161587–40161598 · motif
· motif · 40161619–40161630 · motif
· motif · 40162699–40162712 · motif
· motif · 40164285–40164297 · motif
· motif · 40164607–40164619 · motif
BUB1B 在有絲分裂期間受到誘導。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1050 aa
BUB1B 蛋白長 1,050 個胺基酸，屬於 BUB1 subfamily 的 Ser/Thr protein kinase。其 N 端含 BUB1 N-terminal 結構域，C 端區域包含 Protein kinase 結構域；另有核定位訊號及 D-box。第 152–185 位胺基酸區段是與 KNL1 交互作用所需的區域。序列中另註記兩段未規則區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BUB1B 在間期位於細胞質；進入早期前期後，會與動粒結合。 其動粒定位需要 BUB1、PLK1 與 KNL1。 來源也將其定位記錄於細胞核、著絲點／動粒及中心體等位置。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Chromosome, centromere, kinetochore。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- BUB1O43683 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- BUB3O43684 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- CDC20Q12834 · UniProt INTERACTION · 39 experiments
- CENPEQ02224 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KAT2BQ92831 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- KNL1Q8NG31-2 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- MAD2L1Q13257 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- SIRT2Q8IXJ6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBCP0CG48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAEP62258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CrebbpP45481 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BUB1B 是 MCC 的組成成員，並在複合體中與 CDC20 及閉合構形的 MAD2L1/MAD2 交互作用。MCC 與 CDC20-APC/C 結合形成 CDC20-APC/C-MCC 複合體；其中 BUB1B/BUBR1 分別與 MCC 內及 CDC20-APC/C 內的 CDC20 交互作用，穩定兩個複合體間的結合。另有資料記載 BUB1B 與 CENPE、PLK1、KNL1、KAT2B 及 RIPK3 交互作用。
疾病與遺傳關聯
BUB1B 缺陷與腫瘤形成有關，但資料未指出此關聯可直接解讀為單一因果機制。BUB1B 變異也與早熟染色單體分離特徵（PCS）相關；該特徵呈常染色體顯性遺傳，若出現在至少 5% 的細胞中稱為異型合子 PCS，通常沒有明顯表型影響，但曾有生育力降低的報告。雙等位基因 BUB1B 突變則會造成鑲嵌型多倍體症候群 1（MVA1），此嚴重發育疾病可伴隨多種染色體的鑲嵌性非整倍體、子宮內生長遲滯與小頭症，且惡性腫瘤風險高。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 9 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BUB1B 是 MCC 的激酶成員；MCC 抑制 APC/C，直到染色體正確連接紡錘體後才解除檢查點並促進進入後期。MCC 也監測依賴 CENPE 的動粒活動，BUB1B 對 CENPE 的動粒定位不可或缺；在間期，BUB1B 負向調節 PLK1 並抑制中心體擴增。其腫瘤抑制作用僅為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Kinase which is a component of the mitotic checkpoint complex (MCC), which inhibits APC/C and delays chromosome segregation until all chromosomes are properly attached to the mitotic spindle. The MCC, which consists of CDC20, MAD2L1/MAD2, BUB1B/BUBR1 and BUB3, is a key player of the spindle assembly checkpoint. The MCC-bound APC/C complex is inactive and this delays the metaphase/anaphase transition. When the spindle assembly checkpoint is silenced, the MCC-APC/C complex recruits the E2 enzyme UBCH10 and triggers the auto-ubiquitination of CDC20 in the MCC, thereby reactivating APC/C for transition into anaphase. MCC also monitors kinetochore activities that depend on the kinetochore motor CENPE. Required for kinetochore localization of CENPE. Negatively regulates PLK1 activity in interphase cells and suppresses centrosome amplification. May play a role for tumor suppression (By similarity) PMID 10477750 ↗ · PMID 11702782 ↗ · PMID 14706340 ↗ · PMID 15020684 ↗ · PMID 19411850 ↗ · PMID 19503101 ↗ · PMID 27509861 ↗ · PMID 31201382 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) PMID 10477750 ↗ · PMID 31201382 ↗ |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | BUB1B 與 CDC20、MAD2L1/MAD2、BUB3 組成 MCC，並與其中的 CDC20 及閉合構形 MAD2L1/MAD2 交互作用。MCC 可與 CDC20-APC/C 組成複合體，BUB1B 與兩處 CDC20 的交互作用有助穩定複合體結合；此外也記載其與 CENPE、PLK1、KNL1、KAT2B、RIPK3 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitotic checkpoint complex (MCC), composed of CDC20, MAD2L1/MAD2, BUB1B/BUBR1 and BUB3; within the complex interacts with CDC20 and MAD2L1/MAD2 in its closed conformation. The MCC associates with CDC20-APC/C to form the CDC20-APC/C-MCC complex; within the complex BUB1B/BUBR1 interacts with both the CDC20 in MCC and the CDC20 in CDC20-APC/C, stabilizing the interaction between the two complexes. Interacts with CENPE. Interacts with PLK1. Interacts with KNL1. Interacts with KAT2B. Interacts with RIPK3 PMID 10477750 ↗ · PMID 11702782 ↗ · PMID 12925705 ↗ · PMID 16760428 ↗ · PMID 17376779 ↗ · PMID 17785528 ↗ · PMID 17981135 ↗ · PMID 19407811 ↗ · PMID 19503101 ↗ · PMID 19625775 ↗ · PMID 27509861 ↗ · PMID 29162720 ↗ · PMID 29883609 ↗ · PMID 33094908 ↗ |
| 細胞定位 | BUB1B 記錄於細胞質、細胞核、著絲點／動粒及中心體等位置；間期時位於細胞質，早期前期則與動粒結合。其動粒定位需要 BUB1、PLK1 與 KNL1。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Chromosome, centromere, kinetochore; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasmic in interphase cells. Associates with the kinetochores in early prophase. Kinetochore localization requires BUB1, PLK1 and KNL1 PMID 14706340 ↗ · PMID 9763420 ↗ · PMID 10477750 ↗ · PMID 16760428 ↗ · PMID 17376779 ↗ · PMID 17785528 ↗ |
| 調控 | BUB1B 在有絲分裂期間受到誘導。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | BUB1B 缺陷與腫瘤形成相關；此項資料指出的是關聯，未提供足以將其表述為直接因果的細節。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 早熟染色單體分離特徵（PCS）涉及中期染色體的染色單體分開並呈散開狀態。當至少 5% 細胞具有 PCS 時稱為異型合子 PCS，呈常染色體顯性遺傳，通常沒有明顯表型影響，但曾有生育力降低的報告；此疾病與影響 BUB1B 的變異有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Premature chromatid separation trait PCS Consists of separate and splayed chromatids with discernible centromeres and involves all or most chromosomes of a metaphase. It is found in up to 2% of metaphases in cultured lymphocytes from approximately 40% of normal individuals. When PCS is present in 5% or more of cells, it is known as the heterozygous PCS trait and has no obvious phenotypic effect, although some have reported decreased fertility. Inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 176430 PMID 16411201 ↗ |
| 疾病關聯 | 雙等位基因 BUB1B 突變會造成鑲嵌型多倍體症候群 1（MVA1），這是一種嚴重發育疾病，以多種染色體及組織的鑲嵌性非整倍體為特徵，常見子宮內生長遲滯與小頭症，亦可能有眼部異常、發育遲緩及其他先天異常；惡性腫瘤風險偏高。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mosaic variegated aneuploidy syndrome 1 MVA1 A severe developmental disorder characterized by mosaic aneuploidies, predominantly trisomies and monosomies, involving multiple different chromosomes and tissues. Affected individuals typically present with severe intrauterine growth retardation and microcephaly. Eye anomalies, mild dysmorphism, variable developmental delay, and a broad spectrum of additional congenital abnormalities and medical conditions may also occur. The risk of malignancy is high, with rhabdomyosarcoma, Wilms tumor and leukemia reported in several cases. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry. MVA1 is caused by biallelic mutations in the BUB1B gene MIM: 257300 PMID 15475955 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTGGGCTTGAGGTGGCCGGTTTGTTAGGGAGTCGTGTACG40TGCCTTGGTCGCTTCTGTAGCTCCGAGGGCAGGTTGCGGA80AGAAAGCCCAGGCGGTCTGTGGCCCAGAGGAAAGGCCTGC120AGCAGGACGAGGACCTGAGCCAGGAATGCAGGATGGCGGC160GGTGAAGAAGGAAGGGGGTGCTCTGAGTGAAGCCATGTCC200CTGGAGGGAGATGAATGGGAACTGAGTAAAGAAAATGTAC240AACCTTTAAGGCAAGGGCGGATCATGTCCACGCTTCAGGG280AGCACTGGCACAAGAATCTGCCTGTAACAATACTCTTCAG320CAGCAGAAACGGGCATTTGAATATGAAATTCGATTTTACA360CTGGAAATGACCCTCTGGATGTTTGGGATAGGTATATCAG400CTGGACAGAGCAGAACTATCCTCAAGGTGGGAAGGAGAGT440AATATGTCAACGTTATTAGAAAGAGCTGTAGAAGCACTAC480AAGGAGAAAAACGATATTATAGTGATCCTCGATTTCTCAA520TCTCTGGCTTAAATTAGGGCGTTTATGCAATGAGCCTTTG560GATATGTACAGTTACTTGCACAACCAAGGGATTGGTGTTT600CACTTGCTCAGTTCTATATCTCATGGGCAGAAGAATATGA640AGCTAGAGAAAACTTTAGGAAAGCAGATGCGATATTTCAG680GAAGGGATTCAACAGAAGGCTGAACCACTAGAAAGACTAC720AGTCCCAGCACCGACAATTCCAAGCTCGAGTGTCTCGGCA760AACTCTGTTGGCACTTGAGAAAGAAGAAGAGGAGGAAGTT800TTTGAGTCTTCTGTACCACAACGAAGCACACTAGCTGAAC840TAAAGAGCAAAGGGAAAAAGACAGCAAGAGCTCCAATCAT880CCGTGTAGGAGGTGCTCTCAAGGCTCCAAGCCAGAACAGA920GGACTCCAAAATCCATTTCCTCAACAGATGCAAAATAATA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。