基因總覽
BTRC 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 beta-transducin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase。其產物是 E3 泛素蛋白連接酶複合體中的底物辨識組成部分，主要以 SCF(BTRC) 複合體形式參與蛋白質泛素化。蛋白質具有 F-box 與 WD 重複序列等結構特徵，這些特徵與其複合體組成及底物辨識角色相符。其辨識對象包含多種磷酸化蛋白，因此 BTRC 可將特定蛋白質的辨識連結至後續泛素化及蛋白酶體降解。BTRC 的作用涉及多種細胞訊息與調控過程；其具體底物及生物學結果，則依各底物與相關訊息情境而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370187 ★ | 101,354,165–101,557,313 | 15 |
| ENST00000408038 | 101,354,030–101,557,321 | 14 |
| ENST00000393441 | 101,354,030–101,557,319 | 14 |
| ENST00000861879 | 101,354,030–101,557,284 | 15 |
| ENST00000861880 | 101,354,030–101,557,301 | 16 |
| ENST00000861881 | 101,354,030–101,557,313 | 15 |
| ENST00000861882 | 101,354,030–101,554,224 | 13 |
| ENST00000861883 | 101,354,030–101,553,709 | 14 |
| ENST00000924128 | 101,354,030–101,553,484 | 14 |
| ENST00000953682 | 101,354,030–101,554,216 | 16 |
| ENST00001117156 | 101,354,030–101,437,281 | 3 |
| ENST00001121945 | 101,354,030–101,557,324 | 14 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTRC 是 SCF（SKP1-CUL1-F-box protein）E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分。它可辨識並結合磷酸化的目標蛋白，促進其泛素化；許多受此調控的蛋白質接著會被蛋白酶體降解。這使 BTRC 能依底物的磷酸化狀態，參與調整不同蛋白質的穩定性與訊息作用。來源亦指出，BTRC 可能透過 DBB1-CUL4 E3 泛素蛋白連接酶複合體參與泛素化及後續降解。
在訊息傳遞方面，SCF(BTRC) 會泛素化 CTNNB1，參與 Wnt 訊息傳遞。它也作用於 NF-κB 調控相關蛋白：NFKBIA、NFKBIB 與 NFKBIE 經泛素化及降解後，原先與其相關的 NFKB1 得以移入細胞核並活化轉錄；NFKBIA 的泛素化位點包括 Lys-21 與 Lys-22。另有報告指出，SCF(BTRC) 可泛素化磷酸化的 NFKB1、ATF4、CDC25A、DLG1、FBXO5、SMAD3、SMAD4、SNAI1，以及可能的 NFKB2。SCF(FBXW11) 則可泛素化 NFKB1 的 p105 形式並促使其降解。
BTRC 也參與細胞週期與生理節律調控。它介導 CEP68 的泛素化，而此作用是有絲分裂期間中心粒分離所必需；透過降解磷酸化的 PER1 與 PER2，則在依時鐘調控的轉錄控制中具有重要角色。於平滑化蛋白訊息傳遞中，當 smoothened 不存在時，SCF(BTRC) 促進 GLI2 與 GLI3 的泛素化及加工，使其轉為轉錄抑制因子。
其他已描述的底物與結果包括：NFE2L1 的核內形式經泛素化後降解；REST 經泛素化後被蛋白酶體降解；KLF4 的泛素化與降解則負向調節細胞多能性維持及胚胎發生。SCF(BTRC) 亦可泛素化磷酸化的 DEPTOR、TFE3 與 MITF，並促使其降解，參與 mTORC1 訊息傳遞調節。在 T 細胞受體訊息傳遞中，SCF(BTRC) 對 UBR2 進行 Lys-48 連結型泛素化。來源並指出，BTRC 是 IL1B、MAP3K14、MAP3K1、IKBKB 與 TNF 活化 NFKB 介導轉錄所需的因子。
Promoter 與基因調控
>BTRC ENST00000370187 GRCh38 chr10:101353165-101354265 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGTATAACCAATTATCACAAACATAGCAGCTTAAAACAACCTAAATCACTTTTAACCAAACCCTAGAGT TTTCTCCTCCTAAGGTAGACCCAATTTCCAAAATAAACCCATATTGTACCTTTTCAGGCCAAAGAAAATA TTTATATGCTTTATTTGCTGGAGGCCATTATATTCCACCGTTGAAGGACTTTTGTTAAGTACCTGTTTGA CCCTTAGTGCAGGGCTTACATCCCACAGTTAGCAATAGCAAGTTATGTGCTTTTTGAGCTCTAAACACTG AGAATTTCTTGAACCGAGTTCTATTCGGCCCTGACTTGCTGTGGGGGAGAAAAGATTCCTCGGGAGAAGT GTGGGTGGCGATGGCTTAGGAGGACCTTGAAATTCCGCATTTGTCTGTGAGCTGCTGCCAGGTGCCCATT GGCCCAGCTACTCTGGGTCGCAAACCTGCAGATGCCAGATACATGAAATTTGGGGACGTTCAGCTTCCTA AAACCACAGTTAGGCAGGTCCTAGGACCCGTGATTCTTGCCACAGTTTTTCTTAGTATTTGGGCTACAAG TGAGGCATTGGCCGCCATCTTGATATCAAATGCCAGGCAAGCCGCTACTGGCGTCGCTCGGTAACCACGG AGACACCCGTGCCCCTCCCGTTTCTCATCCTTAGAGGCTGTAAACTACAATTCCCATCAGCCGATTTCCT CTGCGTAATGGCAACTTATCTAAATCTGGCTTGTGGGCAACCGCAACGCTGCCGCAGTGAACTGTGGGAG TTGCGGTTCACGGCGTAGCCTCAGTTTTTTTCCTGGGGGAAGTTCCAGAACTACAAATCCCGTGAGCCAG TGGGCTTTCGCCTGCGCACGGAGAAGCCGATTCTCCTTGGCCCCTCAGCCTGCGCCTGAGAGGTAAGAGA GGGCGGGGGGAAGGAAGAGGAGGCGGGATCCGGGCGCTGCGTTGGCTGCGGCCTGGCACCAAAGGGGCGG CCCCGGCGGAGAGCGGACCCAGTGGCCTCGGCGATTATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTGCAAGAGAAGG CACTCAAGTTTATGGTGAGGAGACGGTGGAGGCCGGGGAACGGTGGAGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTRC_1 ↗ | 10:101,354,165 | 正股 | 101,354,116–101,354,175 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_BQ54G · promoter · 101353543–101354175 · regulatory
ENSR10_BQ54K · enhancer · 101354176–101355164 · regulatory
ENSR10_5TSN2H · CTCF_binding_site · 101354426–101354447 · regulatory
ENSR10_5TSN2Q · CTCF_binding_site · 101354480–101354501 · regulatory
ENSR10_93H88F · enhancer · 101358918–101359231 · regulatory
· motif · 101353655–101353663 · motif
· motif · 101353734–101353744 · motif
· motif · 101353879–101353885 · motif
· motif · 101353902–101353910 · motif
· motif · 101353926–101353943 · motif
· motif · 101353928–101353938 · motif
· motif · 101353935–101353943 · motif
· motif · 101353935–101353950 · motif
· motif · 101354011–101354022 · motif
· motif · 101354073–101354083 · motif
· motif · 101354111–101354128 · motif
· motif · 101354410–101354420 · motif
· motif · 101354427–101354437 · motif
· motif · 101354428–101354444 · motif
· motif · 101354482–101354498 · motif
· motif · 101354516–101354526 · motif
· motif · 101359147–101359158 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：605 aa
BTRC 蛋白質長 605 個胺基酸。其 F-box 位於第 190–228 個胺基酸；第 301–338、341–378、381–418、424–461、464–503、505–541 及 553–590 個胺基酸區段各有一個 WD 重複序列。第 128–177 個胺基酸區段註記為同源二聚化區域；F-box 所在區段亦註記為 SNAI1 下調所需區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTRC 的細胞內定位記錄為細胞質與細胞核；來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的說明。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 38 個夥伴
- AMER1Q5JTC6 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ATF4P18848 · UniProt INTERACTION · 21 experiments · 2 筆來源紀錄
- AXIN2Q9Y2T1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP68Q76N32 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- COPS6Q7L5N1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CTNNB1P35222 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CUL1Q13616 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GLI2P10070 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL10RAQ13651 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- INAVAQ3KP66 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAP2K1Q02750 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDM2Q00987 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- NDUFV1P49821 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NEDD8Q15843 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NFE2Q16621 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NFE2L2Q16236 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NHSL2Q5HYW2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLK4O00444 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- PTPN18Q99952 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
- RASSF5Q8WWW0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- RESTQ13127 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- SKP1P63208 · UniProt INTERACTION · 25 experiments
BTRC 可形成同源二聚體，並與 CUL1、SKP1、RBX1 組成 SCF(BTRC) 複合體；它透過 F-box 與 SKP1 直接作用。BTRC 也與多種磷酸化底物及其他蛋白質互作，包括 CTNNB1、PER1、PER2、CEP68、REST、KLF4 與 UBR2；部分底物互作依賴特定磷酸化。另有感染情境下的互作記錄：vaccinia virus A49 與 BTRC 互作並抑制 NF-κB 活化；BTRC 也與 HIV-1 Vpu 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTRC 是 SCF 型 E3 泛素蛋白連接酶複合體的底物辨識組成部分，可辨識並結合磷酸化目標蛋白，促進其泛素化及後續蛋白酶體降解。其底物涉及 Wnt、NF-κB、細胞週期、晝夜節律、平滑化蛋白與 mTORC1 等調控，並包括 CTNNB1、NFKBIA、PER1、GLI2、REST、KLF4 等蛋白；部分底物或作用方式帶有來源所述的可能性或相似性限制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Substrate recognition component of a SCF (SKP1-CUL1-F-box protein) E3 ubiquitin-protein ligase complex which mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of target proteins. Recognizes and binds to phosphorylated target proteins. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination of CTNNB1 and participates in Wnt signaling. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination of phosphorylated NFKB1, ATF4, CDC25A, DLG1, FBXO5, PER1, SMAD3, SMAD4, SNAI1 and probably NFKB2. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination of NFKBIA, NFKBIB and NFKBIE; the degradation frees the associated NFKB1 to translocate into the nucleus and to activate transcription. Ubiquitination of NFKBIA occurs at 'Lys-21' and 'Lys-22'. The SCF(FBXW11) complex also regulates NF-kappa-B by mediating ubiquitination of phosphorylated NFKB1: specifically ubiquitinates the p105 form of NFKB1, leading to its degradation. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination of CEP68; this is required for centriole separation during mitosis. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination and subsequent degradation of nuclear NFE2L1 (By similarity). Has an essential role in the control of the clock-dependent transcription via degradation of phosphorylated PER1 and PER2. May be involved in ubiquitination and subsequent proteasomal degradation through a DBB1-CUL4 E3 ubiquitin-protein ligase. Required for activation of NFKB-mediated transcription by IL1B, MAP3K14, MAP3K1, IKBKB and TNF. SCF(BTRC) acts as a negative regulator of smoothened signaling by mediating ubiquitination of GLI2 and GLI3 in absence of smoothened, promoting their processing into transcription repressors. Mediates ubiquitination of REST, thereby leading to its proteasomal degradation. SCF(BTRC) mediates the ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of KLF4; thereby negatively regulating cell pluripotency maintenance and embryogenesis (By similarity). SCF(BTRC) acts as a regulator of mTORC1 signaling pathway by catalyzing ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of phosphorylated DEPTOR, TFE3 and MITF. SCF(BTRC) directs 'Lys-48'-linked ubiquitination of UBR2 in the T-cell receptor signaling pathway PMID 10066435 ↗ · PMID 10497169 ↗ · PMID 10644755 ↗ · PMID 10835356 ↗ · PMID 11158290 ↗ · PMID 11238952 ↗ · PMID 11359933 ↗ · PMID 11994270 ↗ · PMID 12077367 ↗ · PMID 12791267 ↗ · PMID 12820959 ↗ · PMID 12902344 ↗ · PMID 14603323 ↗ · PMID 14673179 ↗ · PMID 14681206 ↗ · PMID 14988407 ↗ · PMID 15448698 ↗ · PMID 15917222 ↗ · PMID 16371461 ↗ · PMID 16705181 ↗ · PMID 18354482 ↗ · PMID 21258371 ↗ · PMID 22017875 ↗ · PMID 22017876 ↗ · PMID 22017877 ↗ · PMID 22087322 ↗ · PMID 25503564 ↗ · PMID 25704143 ↗ · PMID 33110214 ↗ |
| 分子活性 | BTRC 相關活性包括蛋白質修飾，具體涉及蛋白質泛素化；此條目未提供更進一步的反應條件、底物或實驗情境。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | BTRC 可自我結合形成同源二聚體，並與 CUL1、SKP1、RBX1 組成 SCF(BTRC) 複合體；其 F-box 直接與 SKP1 作用。它與多種磷酸化底物互作，部分底物辨識要求底物破壞基序中的兩個絲胺酸殘基磷酸化。來源另記載其與多種調控蛋白、泛素相關蛋白及其他複合體成分互作；部分互作具有特定磷酸化或細胞週期條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Self-associates. Component of the SCF(BTRC) complex formed of CUL1, SKP1, RBX1 and a BTRC dimer. Direct interaction with SKP1 occurs via the F-box domain. Interacts with phosphorylated ubiquitination substrates SMAD3 and SMAD4. Interacts with phosphorylated ubiquitination substrates CTNNB1, NFKBIA, NFKBIB, NFKBIE, NFKB1/nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, ATF4, CDC25A, DLG1, FBXO5 and SNAI1; the interaction requires the phosphorylation of the 2 serine residues in the substrate destruction motif D-S-G-X(2,3,4)-S. Binds UBQLN1. Interacts with CDC34 and UBE2R2. Interacts with FBXW11. Interacts with CUL4A and DDB1. Part of a SCF(BTRC)-like complex lacking CUL1, which is associated with phosphorylated NKBIA and RELA; RELA interacts directly with NFKBIA. Interacts with CLU. Interacts with PER1 (phosphorylated), PER2 (phosphorylated) and PER3. Interacts with phosphorylated ubiquitination substrate CEP68. Interacts with ZC3H12A; this interaction occurs when ZC3H12A is phosphorylated in a IKBKB/IKKB-dependent manner (By similarity). Interacts with HSF1; this interaction occurs during mitosis and induces HSF1 ubiquitin-dependent degradation, a process inhibited by CDC20. Interacts with NFE2L1 (By similarity). Interacts with INAVA. Interacts with IL10RA; this interaction leads to IL10RA ubiquitination and subsequent degradation. Interacts with REST. Interacts with KLF4; this interaction leads to KLF4 ubiquitination and subsequent degradation (By similarity). Interacts with UBR2, as part of a SCF(BTRC) complex; the interaction mediates 'Lys-48'-linked ubiquitination of UBR2 and is regulated by DUSP22 in the T-cell receptor signaling pathway PMID 10066435 ↗ · PMID 10497169 ↗ · PMID 10644755 ↗ · PMID 10835356 ↗ · PMID 10983987 ↗ · PMID 11238952 ↗ · PMID 11359933 ↗ · PMID 12037680 ↗ · PMID 12077367 ↗ · PMID 12791267 ↗ · PMID 12820959 ↗ · PMID 12902344 ↗ · PMID 14603323 ↗ · PMID 14681206 ↗ · PMID 14988407 ↗ · PMID 15448698 ↗ · PMID 15647282 ↗ · PMID 15917222 ↗ · PMID 17079684 ↗ · PMID 17574027 ↗ · PMID 18354482 ↗ · PMID 18794143 ↗ · PMID 20068069 ↗ · PMID 22017875 ↗ · PMID 22017876 ↗ · PMID 22017877 ↗ · PMID 22087322 ↗ · PMID 25503564 ↗ · PMID 25704143 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，BTRC 與 vaccinia virus A49 互作；此互作會抑制 NF-κB 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with vaccinia virus A49; this interaction inhibits NF-kappa-B activation PMID 23468625 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染相關記錄中，BTRC 與 HIV-1 Vpu 互作；此條目未進一步說明互作的功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | BTRC 的細胞內定位記錄包括細胞質與細胞核；此條目未提供定位改變的條件或其他動態資訊。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTGGCCTCGGCGATTATGGACCCGGCCGAGGCGGTGCTG40CAAGAGAAGGCACTCAAGTTTATGTGCTCTATGCCCAGGT80CTCTGTGGCTGGGCTGCTCCAGCCTGGCGGACAGCATGCC120TTCGCTGCGATGCCTGTATAACCCAGGGACTGGCGCACTC160ACAGCTTTCCAGAATTCCTCAGAGAGAGAAGACTGTAATA200ATGGCGAACCCCCTAGGAAGATAATACCAGAGAAGAATTC240ACTTAGACAGACATACAACAGCTGTGCCAGACTCTGCTTA280AACCAAGAAACAGTATGTTTAGCAAGCACTGCTATGAAGA320CTGAGAATTGTGTGGCCAAAACAAAACTTGCCAATGGCAC360TTCCAGTATGATTGTGCCCAAGCAACGGAAACTCTCAGCA400AGCTATGAAAAGGAAAAGGAACTGTGTGTCAAATACTTTG440AGCAGTGGTCAGAGTCAGATCAAGTGGAATTTGTGGAACA480TCTTATATCCCAAATGTGTCATTACCAACATGGGCACATA520AACTCGTATCTTAAACCTATGTTGCAGAGAGATTTCATAA560CTGCTCTGCCAGCTCGGGGATTGGATCATATTGCTGAGAA600CATTCTGTCATACCTGGATGCCAAATCACTATGTGCTGCT640GAACTTGTGTGCAAGGAATGGTACCGAGTGACCTCTGATG680GCATGCTGTGGAAGAAGCTTATCGAGAGAATGGTCAGGAC720AGATTCTCTGTGGAGAGGCCTGGCAGAACGAAGAGGATGG760GGACAGTATTTATTCAAAAACAAACCTCCTGACGGGAATG800CTCCTCCCAACTCTTTTTATAGAGCACTTTATCCTAAAAT840TATACAAGACATTGAGACAATAGAATCTAATTGGAGATGT880GGAAGACATAGTTTACAGAGAATTCACTGCCGAAGTGAAA920CAAGCAAAGGAGTTTACTGTTTACAGTATGATGATCAGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。