演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BTNL3BTNLR

butyrophilin like 3

BTNL3 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens5q35.3UniProt Q6UXE8
OFFICIAL SYMBOL
BTNL3
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q6UXE8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BTNL3 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 butyrophilin like 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5q35.3。

Official symbol
BTNL3
Gene name
butyrophilin like 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1143
UniProt
Q6UXE8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
BTNLRBTN9.1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q35.3
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegBTNL3pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:180,988,846–181,006,727
Gene span
17,882 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000342868 ★180,988,846–181,006,7278
ENST00000899564180,988,846–181,006,7278
ENST00000946317180,988,846–181,006,7277
ENST00001004600180,988,846–181,006,7278
ENST00001116534180,988,846–180,995,5042

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 180988846 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BTNL3 ENST00000342868 GRCh38 chr5:180987846-180988946 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ACAATTTCTAAGTTCATGGGGTTTCCTCTTTTTAAATTGCTCTTTACCTTCGTTGTCCTTCGTGGTGCTC
TCCGTGGAAACCTGCTTTCTGATCTAGTAAGTGCTTATTCTTTGTGCATGTCCCTAGACTTGAAATCACT
GCATAATCCCTAACTGTGTGTGTCCTGGCTTAGTGCATCTAATGAATGACTGAATGAATGCATCTTTGCC
TTTGCCTTACCCCCGGGCCTGAAACATCGTCTTGGTCCCCTTCTCAATACCTTGGATCCTTGGAGATCAA
GGTCCTGGTTGTTCTGGCAAGTTCAACACAATCTGGCCTCATGATCAGAGTCCTGTCCCTGAACTCAAGA
CAAGGGAGGGATGGGCAGAATTACCTCATGCTGTGCCAGGAAATATGAGTCTCATGGGGCATGGCCTGTG
TGCCTGGGCAAATTCACTGCCTCACTACCCTGTGCTGAGATGATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
TTTTCTGAGATAGAGCCTCACTCTGTCACCAGACTGGAGTGTAGTAGTGCAATCTGGGCTCACTGCAACC
TCCCTCTTCCCGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCGCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGTGCGCACCA
CCATGCCTGGCTGATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGATGATCTCGAT
CTCTTGACCTCGTGATTCACCTGCCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCC
CGTCCAATCTCTCTTTCAGGGACAGATGTTCACTCTCTCTTGCAGCTCTGCCTGCCAGACTAAGCCTGAA
AATATCTCTGCATCTGGCATTCCTTTACCACCTATGTGGGGCACAACCCAGAACAAAGTCCCTCCAAGTG
TACCCTACTCTCTTTCCATTATCATTTCTCTGGTCTGAGATAGATGTTTATGACCTGCCAATAAATGCAG
TGACTCAAACTCCAGTGCCCATACTCCTCATTCATACAGCCATGTTTAGGGAGGCTCTAGGGAGAAATGC
ACAGTTTGACATCGTTCATGAAGAGCCTCTCCACGGCTCCTGCGCCTGAGA
BTNL3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BTNL3_1 ↗5:180,988,846正股180,988,797–180,988,856

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 180989737–180989752 · motif

· motif · 180990319–180990330 · motif

· motif · 180991521–180991533 · motif

· motif · 180992541–180992554 · motif

· motif · 180992541–180992554 · motif

· motif · 180992604–180992626 · motif

· motif · 180992604–180992626 · motif

· motif · 180992606–180992628 · motif

· motif · 180992606–180992628 · motif

· motif · 180992658–180992680 · motif

· motif · 180992658–180992680 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:466 aa

1 aa466 aa結構域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q6UXE8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Butyrophilin-like protein 3 長 466 個胺基酸,屬於免疫球蛋白超家族中的 BTN/MOG family。其序列含有 Ig-like V-type 結構域(胺基酸 138–218)及 B30.2/SPRY 結構域(270–463);另有 1–17 的訊號序列。

訊號胜肽1–17 aa
拓樸區域Extracellular18–237 aa
跨膜區Helical238–258 aa
拓樸區域Cytoplasmic259–466 aa
結構域Ig-like V-type138–218 aa
結構域B30.2/SPRY270–463 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q6UXE8…

AlphaFold · Q6UXE8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Membrane

BTNL3 是單次穿膜的 I 型膜蛋白;其胞外區位於胺基酸 18–237,跨膜螺旋位於 238–258,胞質區則為 259–466。

未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BTNLRBTNL3BTNL8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
細胞定位BTNL3 被註記為膜蛋白,具有單次穿膜的 I 型膜蛋白拓樸。推論支持
證據與來源

Membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000342868 · 2,439 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATACTCCTCATTCATACAGCCATGTTTAGGGAGGCTCTAG40
41GGAGAAATGCACAGTTTGACATCGTTCATGAAGAGCCTCT80
81CCACGGCTCCTGCGCCTGAGACAGCTGGCCTGACCTCCAA120
121ATCATCCATCCACCCCTGCTGTCATCTGTTTTCATAGTGT160
161GAGATCAACCCACAGGAATATCCATGGCTTTTGTGCTCAT200
201TTTGGTTCTCAGTTTCTACGAGCTGGTGTCAGGACAGTGG240
241CAAGTCACTGGACCGGGCAAGTTTGTCCAGGCCTTGGTGG280
281GGGAGGACGCCGTGTTCTCCTGCTCCCTCTTTCCTGAGAC320
321CAGTGCAGAGGCTATGGAAGTGCGGTTCTTCAGGAATCAG360
361TTCCATGCTGTGGTCCACCTCTACAGAGATGGGGAAGACT400
401GGGAATCTAAGCAGATGCCACAGTATCGAGGGAGAACTGA440
441GTTTGTGAAGGACTCCATTGCAGGGGGGCGTGTCTCTCTA480
481AGGCTAAAAAACATCACTCCCTCGGACATCGGCCTGTATG520
521GGTGCTGGTTCAGTTCCCAGATTTACGATGAGGAGGCCAC560
561CTGGGAGCTGCGGGTGGCAGCACTGGGCTCACTTCCTCTC600
601ATTTCCATCGTGGGATATGTTGACGGAGGTATCCAGTTAC640
641TCTGCCTGTCCTCAGGCTGGTTCCCCCAGCCCACAGCCAA680
681GTGGAAAGGTCCACAAGGACAGGATTTGTCTTCAGACTCC720
721AGAGCAAATGCAGATGGGTACAGCCTGTATGATGTGGAGA760
761TCTCCATTATAGTCCAGGAAAATGCTGGGAGCATATTGTG800
801TTCCATCCACCTTGCTGAGCAGAGTCATGAGGTGGAATCC840
841AAGGTATTGATAGGAGAGACGTTTTTCCAGCCCTCACCTT880
881GGCGCCTGGCTTCTATTTTACTCGGGTTACTCTGTGGTGC920
921CCTGTGTGGTGTTGTCATGGGGATGATAATTGTTTTCTTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。