基因總覽
BTNL3 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 butyrophilin like 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5q35.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000342868 ★ | 180,988,846–181,006,727 | 8 |
| ENST00000899564 | 180,988,846–181,006,727 | 8 |
| ENST00000946317 | 180,988,846–181,006,727 | 7 |
| ENST00001004600 | 180,988,846–181,006,727 | 8 |
| ENST00001116534 | 180,988,846–180,995,504 | 2 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>BTNL3 ENST00000342868 GRCh38 chr5:180987846-180988946 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACAATTTCTAAGTTCATGGGGTTTCCTCTTTTTAAATTGCTCTTTACCTTCGTTGTCCTTCGTGGTGCTC TCCGTGGAAACCTGCTTTCTGATCTAGTAAGTGCTTATTCTTTGTGCATGTCCCTAGACTTGAAATCACT GCATAATCCCTAACTGTGTGTGTCCTGGCTTAGTGCATCTAATGAATGACTGAATGAATGCATCTTTGCC TTTGCCTTACCCCCGGGCCTGAAACATCGTCTTGGTCCCCTTCTCAATACCTTGGATCCTTGGAGATCAA GGTCCTGGTTGTTCTGGCAAGTTCAACACAATCTGGCCTCATGATCAGAGTCCTGTCCCTGAACTCAAGA CAAGGGAGGGATGGGCAGAATTACCTCATGCTGTGCCAGGAAATATGAGTCTCATGGGGCATGGCCTGTG TGCCTGGGCAAATTCACTGCCTCACTACCCTGTGCTGAGATGATCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTCTGAGATAGAGCCTCACTCTGTCACCAGACTGGAGTGTAGTAGTGCAATCTGGGCTCACTGCAACC TCCCTCTTCCCGGTTCAAGCAATTCTCCTGCCTCAGCCGCCCAAGTAGGTGGGACTACAGGTGCGCACCA CCATGCCTGGCTGATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGATGATCTCGAT CTCTTGACCTCGTGATTCACCTGCCTTGGCTTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCC CGTCCAATCTCTCTTTCAGGGACAGATGTTCACTCTCTCTTGCAGCTCTGCCTGCCAGACTAAGCCTGAA AATATCTCTGCATCTGGCATTCCTTTACCACCTATGTGGGGCACAACCCAGAACAAAGTCCCTCCAAGTG TACCCTACTCTCTTTCCATTATCATTTCTCTGGTCTGAGATAGATGTTTATGACCTGCCAATAAATGCAG TGACTCAAACTCCAGTGCCCATACTCCTCATTCATACAGCCATGTTTAGGGAGGCTCTAGGGAGAAATGC ACAGTTTGACATCGTTCATGAAGAGCCTCTCCACGGCTCCTGCGCCTGAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTNL3_1 ↗ | 5:180,988,846 | 正股 | 180,988,797–180,988,856 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 180989737–180989752 · motif
· motif · 180990319–180990330 · motif
· motif · 180991521–180991533 · motif
· motif · 180992541–180992554 · motif
· motif · 180992541–180992554 · motif
· motif · 180992604–180992626 · motif
· motif · 180992604–180992626 · motif
· motif · 180992606–180992628 · motif
· motif · 180992606–180992628 · motif
· motif · 180992658–180992680 · motif
· motif · 180992658–180992680 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:466 aa
Butyrophilin-like protein 3 長 466 個胺基酸,屬於免疫球蛋白超家族中的 BTN/MOG family。其序列含有 Ig-like V-type 結構域(胺基酸 138–218)及 B30.2/SPRY 結構域(270–463);另有 1–17 的訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTNL3 是單次穿膜的 I 型膜蛋白;其胞外區位於胺基酸 18–237,跨膜螺旋位於 238–258,胞質區則為 259–466。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- BTNL8Q6UX41 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | BTNL3 被註記為膜蛋白,具有單次穿膜的 I 型膜蛋白拓樸。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ATACTCCTCATTCATACAGCCATGTTTAGGGAGGCTCTAG40GGAGAAATGCACAGTTTGACATCGTTCATGAAGAGCCTCT80CCACGGCTCCTGCGCCTGAGACAGCTGGCCTGACCTCCAA120ATCATCCATCCACCCCTGCTGTCATCTGTTTTCATAGTGT160GAGATCAACCCACAGGAATATCCATGGCTTTTGTGCTCAT200TTTGGTTCTCAGTTTCTACGAGCTGGTGTCAGGACAGTGG240CAAGTCACTGGACCGGGCAAGTTTGTCCAGGCCTTGGTGG280GGGAGGACGCCGTGTTCTCCTGCTCCCTCTTTCCTGAGAC320CAGTGCAGAGGCTATGGAAGTGCGGTTCTTCAGGAATCAG360TTCCATGCTGTGGTCCACCTCTACAGAGATGGGGAAGACT400GGGAATCTAAGCAGATGCCACAGTATCGAGGGAGAACTGA440GTTTGTGAAGGACTCCATTGCAGGGGGGCGTGTCTCTCTA480AGGCTAAAAAACATCACTCCCTCGGACATCGGCCTGTATG520GGTGCTGGTTCAGTTCCCAGATTTACGATGAGGAGGCCAC560CTGGGAGCTGCGGGTGGCAGCACTGGGCTCACTTCCTCTC600ATTTCCATCGTGGGATATGTTGACGGAGGTATCCAGTTAC640TCTGCCTGTCCTCAGGCTGGTTCCCCCAGCCCACAGCCAA680GTGGAAAGGTCCACAAGGACAGGATTTGTCTTCAGACTCC720AGAGCAAATGCAGATGGGTACAGCCTGTATGATGTGGAGA760TCTCCATTATAGTCCAGGAAAATGCTGGGAGCATATTGTG800TTCCATCCACCTTGCTGAGCAGAGTCATGAGGTGGAATCC840AAGGTATTGATAGGAGAGACGTTTTTCCAGCCCTCACCTT880GGCGCCTGGCTTCTATTTTACTCGGGTTACTCTGTGGTGC920CCTGTGTGGTGTTGTCATGGGGATGATAATTGTTTTCTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。