基因總覽
BTN3A3 的正式名稱為 butyrophilin subfamily 3 member A3,屬於蛋白質編碼基因。其產物參與適應性免疫反應中的 T 細胞反應;目前提供的資料未進一步說明其在此反應中的具體作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000244519 ★ | 26,440,504–26,453,415 | 11 |
| ENST00000878507 | 26,440,452–26,453,415 | 8 |
| ENST00000878508 | 26,440,452–26,453,415 | 11 |
| ENST00000878509 | 26,440,452–26,453,415 | 10 |
| ENST00000878510 | 26,440,452–26,453,409 | 11 |
| ENST00000878511 | 26,440,452–26,453,422 | 11 |
| ENST00000878512 | 26,440,452–26,453,413 | 9 |
| ENST00000878513 | 26,440,452–26,453,410 | 9 |
| ENST00000878514 | 26,440,452–26,453,412 | 10 |
| ENST00000878515 | 26,440,452–26,453,411 | 10 |
| ENST00000878516 | 26,440,452–26,453,413 | 10 |
| ENST00000949569 | 26,440,452–26,453,406 | 11 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTN3A3 參與適應性免疫反應中的 T 細胞反應。現有資料指出這項功能關聯,但未提供更詳細的分子機制、作用條件或對 T 細胞反應的具體影響,因此不能據此進一步描述其調控方式或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>BTN3A3 ENST00000244519 GRCh38 chr6:26439504-26440604 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AAACTATTGATTCCAACTTAGTCCCTTGTTCTCTGGTATCTATGAGATAGCAGAGCCTATTGAAGTACCC AAGAAAATTAGGCTTTATCACCAAGAAGAAAGGGGGACTGCATGATGCAGAAGGGACCAGCCATCTCAAC CAGATACTGCACAGCCTAAATTCAAACTGTTACAATATAATCAAATTTCATCAACCCCAGTCACATCTTA ATCTTAGGAGTTTTGATCACTGACTTGCAAATCCAAAAAGTGTGTTTTGAGGTCCTAGGCCACAGGAAGA ACCAGTTTGTCTCACAGACCTCTTACAGAGATGGCATTTGTAGTCTATCTAGATTCCAGCTTCAGATAAT ATGTACTCCACTGGCAGCACGAGAAATAAATACACAGGAAAATACAATATAGCACAAACCAGGAGCTGAG GGCGAATGAAGATGCTCAGAAACACCTGCACTAAAAGTTTCCTGAAAAAGGTAAAAAATGTCAATCAGCA CTGCCTCTGGAAACCAGAAACATTATATTATTTGATAACAGATCCTAAGTCTGGATGCTGGAGGTGCTTA AAAATGTGCATTGCGTCTGGCTTTCTTTCCATGTATACATTTATTTGACGCTGTAGTAAAATCTCCTCCT TCAGGTACCCATATTCATGCAAGCAAATGTTAGCAAACTGCCACAGTAGCATTTTAATTAGTGCACAACT TTCTCTCTTCACCACATTATAATCTTTTCTCATTTTGTTCTGCTGCTATTTCTATTATGATAAAAGACTT AAGTAAATATGTAGAAATACTTATATACATGGACACGCAATAATGATTCAAATAGATAAACACAGAAACA CAAACACTAAGGGAGGTACGGCTGGAATTTTTCTGCAACGTGTACAATTCAATGTACTTTCACTTTTCAT TTCAACCCTCCTCAGTGGTTTCCTCCCAGCAACTGATGAGAAACATCACCTCTGAGCCAATCAAAAAACT AATTCTTCCAAAAAGAGATTGTTATTATTCCTCACAATAACCAGATAGCCTCTGCTTTCTTTTTCCTTTC TTCGGAATGAGAGACTCAACCATAATAGAAAGAATGGAGAACTATTAACCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTN3A3_1 ↗ | 6:26,440,504 | 正股 | 26,440,455–26,440,514 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B78N9 · promoter · 26439998–26440514 · regulatory
ENSR6_B78NC · enhancer · 26440515–26441255 · regulatory
· motif · 26437255–26437264 · motif
· motif · 26437255–26437264 · motif
· motif · 26438917–26438927 · motif
· motif · 26440906–26440917 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:584 aa
BTN3A3 蛋白質長 584 個胺基酸,屬於免疫球蛋白超家族的 BTN/MOG family。其胞外區包含兩個免疫球蛋白樣 V 型結構域(Ig-like V-type 1、Ig-like V-type 2),並以單次跨膜螺旋連接胞內區;胞內區含有 B30.2/SPRY 結構域,末端另有註記為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTN3A3 位於細胞膜,是單次跨膜的 I 型膜蛋白。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- BTN3A1O00481 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BTN3A3 可形成同源二聚體。現有資料未提供其他結合夥伴或其複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTN3A3 參與適應性免疫反應中的 T 細胞反應;來源未進一步說明此作用的分子機制、發生條件或對 T 細胞反應的具體影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | BTN3A3 位於細胞膜,並屬於單次跨膜的 I 型膜蛋白;來源未提供定位變化或異構型差異的資訊。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTTATTATTCCTCACAATAACCAGATAGCCTCTGCTTTCT40TTTTCCTTTCTTCGGAATGAGAGACTCAACCATAATAGAA80AGAATGGAGAACTATTAACCACCATTCTTCAGTGGGCTGT120GATTTTCAGAGGGGAATACTAAGAAATGGTTTTCCATACT160GGAACCCAAAGGTAAAGACACTCAAGGACAGACATTTTTG200GCAGAGCATAGATGAAAATGGCAAGTTCCCTGGCTTTCCT240TCTGCTCAACTTTCATGTCTCCCTCTTCTTGGTCCAGCTG280CTCACTCCTTGCTCAGCTCAGTTTTCTGTGCTTGGACCCT320CTGGGCCCATCCTGGCCATGGTGGGTGAAGACGCTGATCT360GCCCTGTCACCTGTTCCCGACCATGAGTGCAGAGACCATG400GAGCTGAGGTGGGTGAGTTCCAGCCTAAGGCAGGTGGTGA440ACGTGTATGCAGATGGAAAGGAAGTGGAAGACAGGCAGAG480TGCACCGTATCGAGGGAGAACTTCGATTCTGCGGGATGGC520ATCACTGCAGGGAAGGCTGCTCTCCGAATACACAACGTCA560CAGCCTCTGACAGTGGAAAGTACTTGTGTTATTTCCAAGA600TGGTGACTTCTACGAAAAAGCCCTGGTGGAGCTGAAGGTT640GCAGCATTGGGTTCTGATCTTCACATTGAAGTGAAGGGTT680ATGAGGATGGAGGGATCCATCTGGAGTGCAGGTCCACTGG720CTGGTACCCCCAACCCCAAATAAAGTGGAGCGACACCAAG760GGAGAGAACATCCCGGCTGTGGAAGCACCTGTGGTTGCAG800ATGGAGTGGGCCTGTATGCAGTAGCAGCATCTGTGATCAT840GAGAGGCAGCTCTGGTGGGGGTGTATCCTGCATCATCAGA880AATTCCCTCCTCGGCCTGGAAAAGACAGCCAGCATATCCA920TCGCAGACCCCTTCTTCAGGAGCGCCCAGCCCTGGATCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。