基因總覽
BTN3A2(butyrophilin subfamily 3 member A2)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於免疫球蛋白超家族中的 BTN/MOG family。其結構包含細胞外區域、跨膜區域與細胞質區域,並具有 Ig-like V-type domain。這種單次穿膜架構將細胞外部分與細胞內部分分置於細胞膜兩側。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377708 ★ | 26,365,198–26,378,312 | 11 |
| ENST00000532865 | 26,365,159–26,370,603 | 4 |
| ENST00000396934 | 26,365,159–26,378,320 | 9 |
| ENST00000508906 | 26,365,159–26,378,320 | 10 |
| ENST00000872162 | 26,365,160–26,378,320 | 11 |
| ENST00000872163 | 26,365,167–26,378,320 | 11 |
| ENST00000872164 | 26,365,167–26,378,318 | 10 |
| ENST00000530653 | 26,365,170–26,370,360 | 4 |
| ENST00000527417 | 26,365,170–26,372,942 | 5 |
| ENST00000872165 | 26,365,170–26,378,318 | 11 |
| ENST00000872166 | 26,365,170–26,378,320 | 10 |
| ENST00000872177 | 26,365,170–26,378,320 | 10 |
顯示 12/77 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTN3A2 參與適應性免疫反應中的 T 細胞反應。其來源所述的具體作用之一,是抑制已活化 T 細胞釋放 IFNG,顯示 BTN3A2 與活化後 T 細胞的細胞因子釋放調節有關。
此作用的描述限定於活化 T 細胞及 IFNG 的釋放;來源未進一步說明抑制作用如何發生,也未指出 BTN3A2 透過何種分子機制影響 T 細胞。因此,現有資訊支持將其定位為 T 細胞反應的參與者及 IFNG 釋放的抑制因子,但不足以推定其他免疫細胞、細胞因子或調節途徑亦受其影響。
在生物學層面,抑制活化 T 細胞釋放 IFNG,構成其參與適應性免疫反應的一項具體功能描述。來源並未提供該作用發生的條件、效應大小或其對整體免疫反應的後續影響,故不宜延伸為更廣泛的免疫調節結論。
Promoter 與基因調控
>BTN3A2 ENST00000377708 GRCh38 chr6:26364198-26365298 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTAGTCCCTTGGCCTGCCCTATCTTCAAGGGGGAAGAGCAGGATGCAGTACCCCAGAAAATTAGGCCTTG TCACTAAGAAGAAGGGGGCATGCACGCTGCAGAAGCAACCAGCCATCTCAAGCAGATACCACACAGCCTA AATTCAAACTGTTGCAATATAATCAAATCCCATCAGCTCCAGTCACATATTAGCTCTAGGAGATTTCTGG CTTGCAGCCCAAAAAAGTGTGTTTTGAGGTCGTAAGCCACAGGGAGAACAAGATTGTCCCATAAACTCCT TACAGAGATGGTGTACAGGAAACGAGCCTTACAGAGACCACAGCCTATGGAGTGTCTAGCTTCAGAGAAT ATGTACTCCACTGGCAGCGTGAGAAACAAATACCCAAGAAAATACAATATAGCACAAACCAGGAGCTGAG GGTGAATGAAGATGCTCAGAAAGATCTGCAGTAAGAATTTCCTGGGAAAGGTAAAACAATGTCAAGCAGC ACTGCCTCTGGAAATCAGAAAAATTATATTATTTGATACCATATCCTAAGCCTAAATGCCAGAAGTTCTT AAAGAGGTGCAGTTTGTCTCATTTTCTTTCCATTCATACCTTTATTAGGCTCTGTAAAAAAGATCCTCCT CTTCTACGTACCTATCTACATGCAAGCAAACTGCCACAGAAGCATCTTAATTAGTGCACATCTTCCTCTC TTTGCACATTAAATTTTTTTACTTTCCTACTCCATTCTGCTAATATTTCTATTACCATGTAAAAGACACG AGACAGGTGAATATAAAGAAATACTTATATACATCCACGCACAAGAATGATTCAAATAGATAAACACAGA AACACAAACACTAAGGGAGGTAGGGCTGGAGTTTTTCCTCAACGTGTACAATTCAATGTACTTTCAGTTT TCATTTCAACGTTCCTCAGTGGTTTCTGCCCAGCAACTGATGAGAAACATCACCTCTGAGCCAATCAAAA AACTAATTCTTCCAAAGAGCGACTCTTACTGTTTCTCATGGTGAGAAGACAATATTTGCTTTCTCTTTTT CCTTTCTTCCGGATGAGAGGCTAAGCCATAATAGAAAGAATGGAGAATTAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTN3A2_1 ↗ | 6:26,365,198 | 正股 | 26,365,149–26,365,208 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B788R · enhancer · 26360541–26361310 · regulatory
ENSR6_B789D · promoter · 26364669–26365276 · regulatory
ENSR6_B789G · enhancer · 26365277–26365857 · regulatory
ENSR6_8QX5J · enhancer · 26366607–26366853 · regulatory
· motif · 26360438–26360453 · motif
· motif · 26360443–26360455 · motif
· motif · 26360446–26360461 · motif
· motif · 26360616–26360624 · motif
· motif · 26360616–26360633 · motif
· motif · 26360623–26360632 · motif
· motif · 26360692–26360701 · motif
· motif · 26360698–26360710 · motif
· motif · 26360701–26360708 · motif
· motif · 26360741–26360753 · motif
· motif · 26360744–26360751 · motif
· motif · 26360764–26360776 · motif
· motif · 26360839–26360848 · motif
· motif · 26361034–26361043 · motif
· motif · 26363013–26363022 · motif
· motif · 26364953–26364969 · motif
· motif · 26364953–26364969 · motif
· motif · 26365251–26365262 · motif
· motif · 26365251–26365262 · motif
· motif · 26365517–26365526 · motif
· motif · 26365676–26365684 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:334 aa
BTN3A2 蛋白質長 334 個胺基酸。其 N 端具有訊號肽,細胞外區域位於第 30–248 位胺基酸,並包含第 30–139 位的 Ig-like V-type domain;第 249–269 位為螺旋狀跨膜區,第 270–334 位為細胞質區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTN3A2 是細胞膜上的單次穿膜第一型膜蛋白。 來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- BTN3A1O00481 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CLDN2P57739 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- OPTNQ96CV9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BTN3A2 被註記為形成同源二聚體。來源未提供其他實體結合夥伴、複合體組成或僅屬功能關聯的互作資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTN3A2 參與適應性免疫反應中的 T 細胞反應,並抑制活化 T 細胞釋放 IFNG。來源未進一步說明此抑制作用的分子機制或其他影響範圍。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in T-cell responses in the adaptive immune response. Inhibits the release of IFNG from activated T-cells PMID 21918970 ↗ · PMID 22767497 ↗ |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | BTN3A2 位於細胞膜,屬於單次穿膜第一型膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GACTCTTACTGTTTCTCATGGTGAGAAGACAATATTTGCT40TTCTCTTTTTCCTTTCTTCCGGATGAGAGGCTAAGCCATA80ATAGAAAGAATGGAGAATTATTGATTGACCGTCTTTATTC120TGTGGGCTCTGATTCTCCAATGGGAATACCAAGGGATGGT160TTTCCATACTGGAACCCAAAGGTAAAGACACTCAAGGACA200GACATTTTTGGCAGAGCATAGATGAAAATGGCAAGTTCCC240TGGCTTTCCTTCTGCTCAACTTTCATGTCTCCCTCCTCTT280GGTCCAGCTGCTCACTCCTTGCTCAGCTCAGTTTTCTGTG320CTTGGACCCTCTGGGCCCATCCTGGCCATGGTGGGTGAAG360ACGCTGATCTGCCCTGTCACCTGTTCCCGACCATGAGTGC400AGAGACCATGGAGCTGAAGTGGGTAAGTTCCAGCCTAAGG440CAGGTGGTGAACGTGTATGCAGATGGAAAGGAAGTGGAAG480ACAGGCAGAGTGCACCGTATCGAGGGAGAACTTCGATTCT520GCGGGATGGCATCACTGCAGGGAAGGCTGCTCTCCGAATA560CACAACGTCACAGCCTCTGACAGTGGAAAGTACTTGTGTT600ATTTCCAAGATGGTGACTTCTATGAAAAAGCCCTGGTGGA640GCTGAAGGTTGCAGCACTGGGTTCTAATCTTCACGTCGAA680GTGAAGGGTTATGAGGATGGAGGGATCCATCTGGAGTGCA720GGTCCACCGGCTGGTACCCCCAACCCCAAATACAGTGGAG760CAACGCCAAGGGAGAGAACATCCCAGCTGTGGAAGCACCT800GTGGTTGCAGATGGAGTGGGCCTATATGAAGTAGCAGCAT840CTGTGATCATGAGAGGCGGCTCCGGGGAGGGTGTATCCTG880CATCATCAGAAATTCCCTCCTCGGCCTGGAAAAGACAGCC920AGCATTTCCATCGCAGACCCCTTCTTCAGGAGCGCCCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。