基因總覽
butyrophilin subfamily 3 member A1(BTN3A1)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,屬於免疫球蛋白超家族中的 BTN/MOG family。其序列長 513 個胺基酸,具有細胞外區、單次跨膜區及細胞質區;細胞外部分包含兩個 Ig-like V-type 結構域,細胞質部分則含有 B30.2/SPRY 結構域。BTN3A1 位於細胞膜,與 T 細胞活化及適應性免疫反應相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000289361 ★ | 26,402,275–26,415,208 | 10 |
| ENST00000476549 | 26,402,237–26,413,246 | 10 |
| ENST00000425234 | 26,402,237–26,412,920 | 10 |
| ENST00000850859 | 26,402,237–26,415,216 | 10 |
| ENST00000414912 | 26,402,237–26,414,073 | 10 |
| ENST00000865808 | 26,402,237–26,415,216 | 9 |
| ENST00000865809 | 26,402,237–26,415,204 | 10 |
| ENST00000865810 | 26,402,237–26,415,204 | 6 |
| ENST00000865811 | 26,402,237–26,415,216 | 9 |
| ENST00000865812 | 26,402,237–26,415,203 | 10 |
| ENST00001000089 | 26,402,237–26,415,206 | 10 |
| ENST00001000090 | 26,402,237–26,415,213 | 10 |
顯示 12/21 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTN3A1 參與 T 細胞活化及適應性免疫反應,並調節已活化 T 細胞的增殖。這些作用使其與 T 細胞的免疫反應調控相關;現有資料未進一步說明其調節增殖的分子機制。
BTN3A1 也調節已活化 T 細胞釋放細胞激素及 IFNG。此處的來源描述的是對釋放的調節,未指出調節方向或具體作用途徑,因此不宜據此推定其會促進或抑制特定細胞激素的產生。
此外,BTN3A1 介導 T 細胞對受感染或轉化細胞的反應;這些目標細胞的特徵是具有較高水平的磷酸化代謝物,例如 isopentenyl pyrophosphate。來源指出這類代謝物水平與所述反應相關,但未提供更細的辨識或訊號傳遞機制。整體而言,BTN3A1 涉及 T 細胞活化、增殖、細胞激素釋放,以及對特定受感染或轉化細胞的反應。
Promoter 與基因調控
>BTN3A1 ENST00000289361 GRCh38 chr6:26401275-26402375 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTTTTATAGACATCTTACAGAGACAGCATTCACAGTTTATCTAGAGTCTGGCCTCAGAGAATATGTACTC CACTGGCAGCAGGAGAAACAAATACACAGGAAAATACAGTGTAGCACAGAACAGGAGCTGAGGGTGAATG GAGATGCTCAGAAACACCTGCACTAAAAATTTGCTGAAAAAGGTAAAACGTGTCAAGCAGCACTGCCTCT GGAAGCCAGAAAAATTACATTTTTTGATAACAGATCCTAAGCCTGGATGCTGGAGGTGCTTAAAAATGTG CATTGTGGGCCGGGTGCAGTGGCTTAAGCCTGTAATCCTAGCACTTTGGGATCTGAGGAGGGAGGATCAC TTGAGCTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGCAAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAG TAGCCGGGCATGGGGCGAGCACCTGTAATCCCAGTTATTCAGGAGCTGAGGCAGGAAAATCACTTGAACC TGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCCTGCAACTGCACTCCAACCTGGGTGACAGAGTGAAACTC CGTTTCAAAAAAAAAGTGCATTGTGTCTGGTTTTCTTTCCATTCATACGTTTATTTGACTCTGTAGTAAA ATCTCCTCCTCCTCCATGTACCCATATTCATGCAAGCAAATGTTAGCAAACTGCCACAGTAGCATTTTAA TTAGTGCTCATCTTTCTCTCTTCACCACATTAAAATCTTTTCCCATTGTGTTCTGCTGATATTTCTATTA TGATAAAAGACTTAAGACAAGTGACTATATAGAAATACGTATATACACACAAGAATGAAAGAGATAAACA GTAAGGGAGGTAGGGCAGGAATTTTTCTTCAACGTGTACAATTCAATGTACTTTCAGTTTTCATTTCAGC CTTCCTCAGTGGTTTCTGCCCAGCAACTGATGAGAAACATCACCTCTGAGCCAATCAAAAAACTTATTCT TCCAAAGAGAGATTGTTATTATTCCTCACGATGACCCGACAGTCTCTGCTTTCTTTTTCCTTTCTTCCAG AAGGAGATTTAACCATAGTAGAAAGAATGGAGAACTATTAACTGCCTTTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTN3A1_1 ↗ | 6:26,402,275 | 正股 | 26,402,226–26,402,285 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_9DGX6 · enhancer · 26400753–26401068 · regulatory
ENSR6_8QXTL · enhancer · 26401338–26401501 · regulatory
ENSR6_B78GP · promoter · 26401747–26402305 · regulatory
ENSR6_B78GS · enhancer · 26402306–26402890 · regulatory
· motif · 26398234–26398245 · motif
· motif · 26398756–26398765 · motif
· motif · 26398756–26398765 · motif
· motif · 26400736–26400758 · motif
· motif · 26400736–26400758 · motif
· motif · 26400887–26400898 · motif
· motif · 26400887–26400898 · motif
· motif · 26400904–26400919 · motif
· motif · 26400904–26400919 · motif
· motif · 26400969–26400982 · motif
· motif · 26401737–26401751 · motif
· motif · 26402163–26402183 · motif
· motif · 26402169–26402189 · motif
· motif · 26402301–26402321 · motif
· motif · 26402540–26402555 · motif
· motif · 26402542–26402553 · motif
· motif · 26402542–26402553 · motif
· motif · 26403003–26403014 · motif
· motif · 26403004–26403015 · motif
· motif · 26403345–26403360 · motif
· motif · 26404737–26404748 · motif
· motif · 26404737–26404748 · motif
· motif · 26404777–26404789 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:513 aa
BTN3A1 長 513 個胺基酸,N 端含有訊號序列;其細胞外區域包含兩個 Ig-like V-type 結構域,接著是單次穿膜的螺旋區。細胞質區域帶有 B30.2/SPRY 結構域。這些結構註解描述蛋白質的區域組成,來源未進一步指明各結構域的具體作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTN3A1 是單次穿膜的 I 型膜蛋白,定位於細胞膜。 來源未描述定位會隨條件或異構型而改變,也未提供其他細胞內位置。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- BTN3A2P78410 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- BTN3A3O00478 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DMWDG5E9A7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPLO60437 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- TFF1P04155 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BTN3A1 可形成同源二聚體。來源未指出其他結合夥伴或更大型複合體,也未提供其二聚化與功能之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTN3A1 參與 T 細胞活化及適應性免疫反應,並調節已活化 T 細胞的增殖,以及細胞激素和 IFNG 的釋放。此外,它介導 T 細胞對受感染或轉化細胞的反應;這些細胞具有較高水平的磷酸化代謝物,例如 isopentenyl pyrophosphate。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in T-cell activation and in the adaptive immune response. Regulates the proliferation of activated T-cells. Regulates the release of cytokines and IFNG by activated T-cells. Mediates the response of T-cells toward infected and transformed cells that are characterized by high levels of phosphorylated metabolites, such as isopentenyl pyrophosphate PMID 21113407 ↗ · PMID 21918970 ↗ · PMID 22767497 ↗ · PMID 22846996 ↗ |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | BTN3A1 定位於細胞膜,屬於單次穿膜的 I 型膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein PMID 21113407 ↗ · PMID 21918970 ↗ · PMID 22767497 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATTCCTCACGATGACCCGACAGTCTCTGCTTTCTTTTTCC40TTTCTTCCAGAAGGAGATTTAACCATAGTAGAAAGAATGG80AGAACTATTAACTGCCTTTCTTCTGTGGGCTGTGATTTTC120AGAGGGGAATGCTAAGAGGTGATTTTCAATGTTGGGACTC160AAAGGTGAAGACACTGAAGGACAGAATTTTTGGCAGAGGA200AAGATCTTCTTCGGTCACCATACTTGAGTTAGCTCTAGGG240AAGTGGAGGTTTCCATTTGGAATTCTATAGCTTCTTCCAG280GTCATAGTGTCTGCCCCCCACCTTCCAGTATCTCCTGATA320TGCAGCATGAATGAAAATGGCAAGTTTCCTGGCCTTCCTT360CTGCTCAACTTTCGTGTCTGCCTCCTTTTGCTTCAGCTGC400TCATGCCTCACTCAGCTCAGTTTTCTGTGCTTGGACCCTC440TGGGCCCATCCTGGCCATGGTGGGTGAAGACGCTGATCTG480CCCTGTCACCTGTTCCCGACCATGAGTGCAGAGACCATGG520AGCTGAAGTGGGTGAGTTCCAGCCTAAGGCAGGTGGTGAA560CGTGTATGCAGATGGAAAGGAAGTGGAAGACAGGCAGAGT600GCACCGTATCGAGGGAGAACTTCGATTCTGCGGGATGGCA640TCACTGCAGGGAAGGCTGCTCTCCGAATACACAACGTCAC680AGCCTCTGACAGTGGAAAGTACTTGTGTTATTTCCAAGAT720GGTGACTTCTATGAAAAAGCCCTGGTGGAGCTGAAGGTTG760CAGCACTGGGTTCTGATCTTCACGTTGATGTGAAGGGTTA800CAAGGATGGAGGGATCCATCTGGAGTGCAGGTCCACTGGC840TGGTACCCCCAACCCCAAATACAGTGGAGCAACAACAAGG880GAGAGAACATCCCGACTGTGGAAGCACCTGTGGTTGCAGA920CGGAGTGGGCCTGTATGCAGTAGCAGCATCTGTGATCATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。