基因總覽
BTN2A2(butyrophilin subfamily 2 member A2)是蛋白質編碼基因。其產物與 T 細胞反應相關;來源指出,該蛋白可抑制經 anti-CD3 抗體活化的 CD4 與 CD8 T 細胞增殖,也會抑制 T 細胞代謝及 IL2、IFNG 分泌。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000356709 ★ | 26,383,108–26,394,874 | 8 |
| ENST00000469230 | 26,383,091–26,394,875 | 8 |
| ENST00000352867 | 26,383,091–26,394,874 | 7 |
| ENST00000482536 | 26,383,091–26,393,007 | 6 |
| ENST00000432533 | 26,383,091–26,393,008 | 7 |
| ENST00000923334 | 26,383,091–26,393,992 | 7 |
| ENST00000923335 | 26,383,091–26,393,980 | 8 |
| ENST00000960895 | 26,383,091–26,394,880 | 8 |
| ENST00000960896 | 26,383,091–26,394,879 | 7 |
| ENST00000960897 | 26,383,091–26,394,874 | 8 |
| ENST00000960898 | 26,383,091–26,394,768 | 7 |
| ENST00000960899 | 26,383,091–26,394,866 | 7 |
顯示 12/37 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTN2A2 的功能涉及對活化 T 細胞反應的抑制。當 CD4 或 CD8 T 細胞由 anti-CD3 抗體活化時,BTN2A2 可抑制這些細胞的增殖,顯示其作用與 T 細胞活化後的增殖反應相關。
除了影響細胞增殖,BTN2A2 也會抑制 T 細胞代謝,並降低 IL2 與 IFNG 的分泌。這些作用分別涉及細胞代謝狀態與細胞激素分泌;來源未進一步說明分子作用方式、各作用之間的因果關係,或其發生所需的其他條件。
Promoter 與基因調控
>BTN2A2 ENST00000356709 GRCh38 chr6:26382108-26383208 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAGGAGGTTATGTGTGCTGGTGTGTGTGTGTGGTCCTTGGACTTAACCCCACCACCTACTGGCAGAAGGT CAAGGTCAACTGAAAGTCTTTGCTCACTTCCATCTTCTGCCTCCACCAGAATACCACCTCCCCGTGGGAA AGGGTTTTTAATCCTCACTCAGTATTCTCAGCACGTCTTATCCAATAGCTTTGGAGTGAACAACAAGACC TTCATAACAGCCACTGCAACTGCTGTCACCTTTCCTTTGCTACCCCTCCCACTCCAGCCATGCCTGCTTC CCCCAAGGCCTCCCGCGCACCAGGCCCAACCTTCAAAGCCAGCAACATGAACAAGAGTCCTCTGGCTTTG GAAAGACGGCGGCTTATGTTTTCCTCCTCATGTTTCCTCCCCAGCAAAATCACTCTACATAGAGAGCCCT CTCCTCGTCTACACCAGCAAAGCCACTGACACCTTGGGGATCTCAAGGCTTTGTAAAAGAACGGAAGGAA AGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAG AAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAGAAGAGAAGGAAGAGAAAGAGAGAAAGGAA GAGAGAGGAAGGAAGGAAGGAAGAAAAAAGAAAGAAAGCGAGAAAGAAAGAAAGAATAAAGTGAGAGAGA GACATATGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAAAGAGAATGAGAAAGGAAAGAAGGAAGCAAGGAAGGAAGGAAG AAAGGAAGGAAGAAAGGAAAATAAAGGAAAAAAGTCTTGCTTCCAAAGACAGAAAAAGGAAATAGAAATA CCTAATAATCCCAAAAGGTTATTTGCTGCTTGAGATTTTTGGGGGGTTTTTGTGTGTGTATTCTACCTAG TAACAGCTGAGAAATAAGGCTCGAGACACCATTGGTTGGTTCAGCCTCACTCGGCCAATCCTGGGCTCTA AACTGCTCAGTGGAAATCTTGGGACTTTTTGGACACCCAGAGAACAGGTCCCAGATACCGAGTCCGCAAC TCCAAACATCGCGATTAATAGGAGGTGAACACAGCTTTTCTCTTCTCTTTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTN2A2_1 ↗ | 6:26,383,126 | 正股 | 26,383,077–26,383,136 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_8QXGH · enhancer · 26382095–26382330 · regulatory
ENSR6_587JNM · CTCF_binding_site · 26382153–26382174 · regulatory
ENSR6_9DGPZ · promoter · 26382869–26383218 · regulatory
ENSR6_C4LNJ · enhancer · 26383219–26384359 · regulatory
ENSR6_8QXJD · enhancer · 26385414–26385564 · regulatory
· motif · 26378302–26378313 · motif
· motif · 26378306–26378320 · motif
· motif · 26378306–26378320 · motif
· motif · 26378342–26378356 · motif
· motif · 26378342–26378356 · motif
· motif · 26382155–26382171 · motif
· motif · 26383513–26383525 · motif
· motif · 26385058–26385073 · motif
· motif · 26385406–26385417 · motif
· motif · 26385547–26385560 · motif
· motif · 26385798–26385820 · motif
· motif · 26385798–26385820 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:523 aa
BTN2A2 蛋白長 523 個胺基酸,屬於免疫球蛋白超家族的 BTN/MOG 家族。其胞外區域含 Ig-like V-type 與 Ig-like C2-type 結構域;其後為單次穿膜螺旋,接續胞質區域。胞質區域包含 B30.2/SPRY 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTN2A2 是單次穿膜的 I 型膜蛋白。 來源將其描述為膜蛋白,並將蛋白質拓撲區分為胞外區、穿膜區與胞質區;未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 38 個夥伴
- AQP6Q13520 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BIKQ13323 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- PEX12O00623 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PSMA3P25788 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SEC11CQ9BY50 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTN2A2 可抑制經 anti-CD3 抗體活化的 CD4 與 CD8 T 細胞增殖,也抑制 T 細胞代謝,以及 IL2 和 IFNG 的分泌。 | 推論支持 | 證據與來源Inhibits the proliferation of CD4 and CD8 T-cells activated by anti-CD3 antibodies, T-cell metabolism and IL2 and IFNG secretion |
| 細胞定位 | BTN2A2 被描述為膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白;此項定位資訊未提供其他條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGGACTTTTTGGACACCCAGAGAACAGGTCCCAGATACCG40AGTCCGCAACTCCAAACATCGCGATTAATAGGAGGCCTCT80GGTCTCTGCCTGCCCTGGGTGCTCATGGAACCAGCTGCTG120CTCTGCACTTCTCCCTGCCAGCCTCCCTCCTCCTCCTCCT160GCTCCTCCTCCTTCTCAGCCTGTGTGCACTGGTCTCAGCC200CAGTTTACTGTCGTGGGGCCAGCTAATCCCATCCTGGCCA240TGGTGGGAGAAAACACTACATTACGCTGCCATCTGTCACC280CGAGAAAAATGCTGAGGACATGGAGGTGCGGTGGTTCCGG320TCTCAGTTCTCCCCCGCAGTGTTTGTGTATAAGGGTGGGA360GAGAGAGAACAGAGGAGCAGATGGAGGAGTACCGGGGAAG400AATCACCTTTGTGAGCAAAGACATCAACAGGGGCAGCGTG440GCCCTGGTCATACATAACGTCACAGCCCAGGAGAATGGGA480TCTACCGCTGTTACTTCCAAGAAGGCAGGTCCTACGATGA520GGCCATCCTACGCCTCGTGGTGGCAGGCCTTGGGTCTAAG560CCCCTCATTGAAATCAAGGCCCAAGAGGATGGGAGCATCT600GGCTGGAGTGCATATCTGGAGGGTGGTACCCAGAGCCCCT640CACAGTGTGGAGGGACCCCTACGGTGAGGTTGTGCCCGCC680CTGAAGGAGGTTTCCATCGCTGATGCTGACGGCCTCTTCA720TGGTCACCACAGCTGTGATCATCAGAGACAAGTATGTGAG760GAATGTGTCCTGCTCTGTCAACAACACCCTGCTCGGCCAG800GAGAAGGAAACTGTCATTTTTATTCCAGAATCCTTTATGC840CCAGCGCATCTCCCTGGATGGTGGCCCTAGCTGTCATCCT880GACCGCATCTCCCTGGATGGTGTCCATGACTGTCATCCTG920GCTGTTTTCATCATCTTCATGGCTGTCAGCATCTGTTGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。