基因總覽
BTN2A1 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 butyrophilin subfamily 2 member A1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p22.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000312541 ★ | 26,457,955–26,469,637 | 8 |
| ENST00000541522 | 26,457,904–26,469,653 | 7 |
| ENST00000429381 | 26,457,904–26,469,637 | 8 |
| ENST00000469185 | 26,457,904–26,476,621 | 8 |
| ENST00000897005 | 26,457,904–26,471,643 | 7 |
| ENST00000897006 | 26,457,904–26,469,648 | 8 |
| ENST00000897007 | 26,457,904–26,469,642 | 8 |
| ENST00000897008 | 26,457,904–26,469,637 | 7 |
| ENST00000897009 | 26,457,904–26,469,629 | 8 |
| ENST00000897010 | 26,457,904–26,469,636 | 8 |
| ENST00000957668 | 26,457,904–26,469,645 | 7 |
| ENST00000957669 | 26,457,904–26,469,635 | 8 |
顯示 12/22 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>BTN2A1 ENST00000312541 GRCh38 chr6:26456955-26458055 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCATGGGAAAAGGAGCACTGGCCACAGGGAGTGCAACGTTGTGATGCAAGGCCACTGTGGAGCCATTGC TAGCGTATTAACTGCAAAGTTTTGAATTGAATCAGAAGGGAATTGGAGGCCTCCAGACTAAGCATTTAGA CACTTGAGGGGAATATTGACAACTGGGCCTCGGGAAGATTATTCTGGAAGATATCTTTACAATTACAAGA TTGGAGCCTTTGGGAGAGGGATGATGTTTACGGGAGGATGGTATGTGTGCTAGTGTGTGTGTCTGTGTGT GGCTCTTGGACCCAACCTGACCACCTACTATCTAGAAGGTGAAGGACAACTAGAAAGTTTTGCTCAATTC CATCTTCTGCCACCACCAGAATGCCACCTCCCTGAGGGAAAAGGTTTTTGATCCTCAGTCAGGATTCTCA GCACCTCTTATCCGATAGCTTTGGAATGAATGGCAAGGCCTTCATAACAGCCACTGCAACTGCTGTCTCC TTTCCTTTGCTACCCCTCCCGCTCCAGCCATGCCAGCTTCCCCCAAGCCCTCCTGCGCTCCAGGCCCAAC CTCCAAAGCCAGCAACTTGAACAGGAGTCCTCTGGCTTTGGAAAGGGGGCGGCTTACGTTTTCCTGCTCA TGTTTCCTCCCCAGCAAAATTGCCCTCTACATAGAGAGGCCTCTCCTTGTGGACACCAGCAAAGCCACCG ACCTCAGTGACAAACCCCAGGGAATCTCCCCAAGGAATCTCAAAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGTCTTGAG AGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGTCTTGCTTTCGAACAAAGAAAAAGGAAATAAAAAGACCCGATAATCTC AAAAGGTTATTTGCTGCTTGAAATTTGTGATTCGGTGTATTCTACCCAGCAACTGCTGAGAAATAAGGTT CGACACCATTGGCTGGTTCACTCACACCCGGCCAATCCTGGGCTCTAAAATACTTAGGGAACTCTTGGGA CTGTGGAAGCCCAGGAGACCAGATTTCGTTTCCTGCATCTCCAAACATGGCGACCTAGGAGAAGGGGAAG AACAATTTTTTCTCCTCTTTTGGGAAGGTTTGTGTCTAGTAGTGCCTGTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTN2A1_1 ↗ | 6:26,457,955 | 正股 | 26,457,906–26,457,965 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_5882KM · CTCF_binding_site · 26457322–26457343 · regulatory
ENSR6_B78QR · promoter · 26457414–26457978 · regulatory
ENSR6_B78QW · enhancer · 26457979–26458878 · regulatory
· motif · 26453059–26453070 · motif
· motif · 26456467–26456478 · motif
· motif · 26457324–26457340 · motif
· motif · 26457666–26457679 · motif
· motif · 26457666–26457679 · motif
· motif · 26457679–26457692 · motif
· motif · 26457679–26457692 · motif
· motif · 26457923–26457936 · motif
· motif · 26457979–26457989 · motif
· motif · 26458309–26458320 · motif
· motif · 26458309–26458320 · motif
· motif · 26458994–26459005 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:527 aa
BTN2A1 蛋白質長 527 個胺基酸,具有 N 端訊號序列(第 1–28 位)及細胞外區域(第 29–248 位)。第 29–141 位含 Ig-like V-type 結構域;第 249–269 位為螺旋型跨膜區,第 270–527 位位於細胞質側,並含第 310–506 位的 B30.2/SPRY 結構域。此蛋白屬於免疫球蛋白超家族的 BTN/MOG 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
BTN2A1 被註解為膜蛋白,具有單次跨膜的 I 型膜蛋白拓撲;來源未提供其定位改變條件或異構型差異。
未繪示構造:Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- CLDN19Q8N6F1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTXN3Q4LDR2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MALP21145 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NSG1P42857 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PLPP6Q8IY26 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- STRIT1P0DN84 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | BTN2A1 被註解為膜蛋白,屬於單次跨膜的 I 型膜蛋白;此描述提供其膜拓撲分類,但未說明更具體的膜區室、定位變化條件或其他定位特徵。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGATTTCGTTTCCTGCATCTCCAAACATGGCGACCTAGGA40GAAGGGGAAGAACAATTTTTTCTCCTCTTTTGGGAAGGTT80TGTGTCTAGTAGTGCCTGTGCCCCTGGGCAGATTGGAGAG120AAGAGGGACGACTGGAGAATCGTCGAGAACCAGCGGAGAA160AAGAAAAAGCAACGTTTAATTCTAGAAGGCCTCCTGTCCC200TGCCTGCTCTGGGTGCTCATGGAATCAGCTGCTGCCCTGC240ACTTCTCCCGGCCAGCCTCCCTCCTCCTCCTCCTCCTCAG280CCTGTGTGCACTGGTCTCAGCCCAGTTTATTGTCGTGGGG320CCCACTGATCCCATCTTGGCCACGGTTGGAGAAAACACTA360CGTTACGCTGCCATCTGTCACCCGAGAAAAATGCTGAGGA400CATGGAGGTGCGGTGGTTCCGGTCTCAGTTCTCCCCCGCA440GTGTTTGTGTATAAAGGTGGCAGAGAGAGAACAGAGGAGC480AGATGGAGGAGTACCGAGGAAGAACCACCTTTGTGAGCAA520AGACATCAGCAGGGGCAGCGTGGCCCTGGTCATACACAAC560ATCACAGCCCAGGAAAACGGCACCTACCGCTGTTACTTCC600AAGAAGGCAGGTCCTACGATGAGGCCATCCTGCACCTCGT640AGTGGCAGGACTAGGCTCTAAGCCCCTCATTTCAATGAGG680GGCCATGAAGACGGGGGCATCCGGCTGGAGTGCATATCTA720GAGGGTGGTACCCAAAGCCCCTCACAGTGTGGAGGGACCC760CTACGGTGGGGTTGCGCCTGCCCTGAAAGAGGTCTCCATG800CCTGATGCAGACGGCCTCTTCATGGTCACCACGGCTGTGA840TCATCAGAGACAAGTCTGTGAGGAACATGTCCTGCTCTAT880CAACAACACCCTGCTCGGCCAGAAGAAAGAAAGTGTCATT920TTTATTCCAGAATCCTTTATGCCCAGTGTGTCTCCCTGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。