基因總覽
BTG3 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 BTG anti-proliferation factor 3。現有資料未提供足以描述其蛋白質家族、整體結構或其他基本性質的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000348354 ★ | 17,593,653–17,612,901 | 5 |
| ENST00000339775 | 17,593,650–17,613,014 | 6 |
| ENST00000880537 | 17,593,650–17,613,014 | 8 |
| ENST00000880538 | 17,593,650–17,613,014 | 6 |
| ENST00000880539 | 17,593,650–17,613,014 | 6 |
| ENST00000880540 | 17,593,650–17,613,014 | 5 |
| ENST00000880541 | 17,593,650–17,613,014 | 7 |
| ENST00000880542 | 17,593,650–17,613,014 | 6 |
| ENST00000880543 | 17,593,650–17,613,014 | 4 |
| ENST00000880544 | 17,593,650–17,613,014 | 6 |
| ENST00000880545 | 17,593,650–17,613,014 | 7 |
| ENST00000880546 | 17,593,650–17,613,014 | 8 |
顯示 12/29 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
在血清誘導的細胞週期進程中,BTG3 過度表現會妨礙細胞由 G0/G1 期進入 S 期。這項觀察指出,BTG3 表現量增加與該細胞週期轉換受阻相關。
現有資料未說明此效應涉及的分子作用方式、實驗系統或其他條件,也未提供更多生物學過程或功能結果。因此,對 BTG3 的功能解讀應限於上述過度表現與血清誘導之 G0/G1 至 S 期進程受損的關聯。
Promoter 與基因調控
>BTG3 ENST00000348354 GRCh38 chr21:17612801-17613901 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTCTTAAGTAGTTTACAACATGGTTTAGCCCTCTTTTAATAATAATAATAAAAAGGTAGGAATATCTTGT ATTCCTCCCGCTAGTTGGATGTATTAAAGTGCTTTCACAAAACTAAGACCATGGTGTTAACTCAATATAA AAGGTTGAAAAGATGTTCCTTCTTTTCTTCAGAAAGTTAATGTTCCCTCTCCATATTTGTATTTGCTCAA AGATGAAGCTTTGCATCTGGGAAGTCCTTGAGTAGAGTGTCTCAGAAATAGAAAGCCTGGACTCTCAAGG CTTCATTCCTTTGGCCAACATCTTTGGAGCCTCTCCTTTATGCAAAACACAGTGGCCGGTGCCAGGGCAG CACACAAGCGTCCACAGGAGGCAGGCCCTGCTGTGAGGGGCCAGGGAAGGGCCCAACTAGGAGTGCCAAC AACCGCCTAAAATACAGCAGGGCGGCTGCACGGTTAACGTGCGTGTAATTGACTACAGCAAGAAGGATGA GGATCTGTCCATAAATGCCAAGTTCCCCTTCCCGTCGAGTCCGTGTCCCCCATGAAGCCCCGGGTCTAGA GAGCTGGGTCTAGAACTCGCCATTCCGCCCTGAGGGTGTCAAGTGCAGCGTGGAGAGACCTGAGGGGGAA ACAAAAAGGCCGAGACAGCCGAAAGGACCAAGCCCGCGCGACCCCCGAAGGCGCTGACGCACGTAGGGCG GCCGGGCGGGGGTCCCACAGGCCTTCAGCGCCGCTTTTTGCCGGGGAGGGAAGCCCGCGGTTCTGCGGAC CGCGCCGTCGCGGTCGAGGGTCTGCGCCAGGCTCAGGGTAGGGCGAGGGTGTGTCGCCTCCCGTGCGGCT AGGCCCGGGGCTCGGGGGTGGCCTCGCGGCGAAGCCCCGCCCCCGGCACCGCCCCTCAGGCGCGCGAGCC GATCCCGCGCGCGCCAACCCTTTCCCGGGTCATCGCCCCTCCCCTCTTCCGGGCCGCGAGCCCCCTGCGC GCCGCTTTGGGGCTGCGCTCACTCGTGTGCGCGCTCGTCCGCCCGCCAGTCCTCTCAACGCGCGCTTGGC CGCCCGACGACGCGGGAGCCGCACGCGCCGGACGAGGCTCGCTGCGCTCCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTG3_1 ↗ | 21:17,612,901 | 負股 | 17,612,891–17,612,950 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_8HZDP · enhancer · 17607786–17607921 · regulatory
ENSR21_B5HCX · promoter · 17611201–17611756 · regulatory
ENSR21_C3Q73 · enhancer · 17611757–17612833 · regulatory
ENSR21_565SX5 · CTCF_binding_site · 17612225–17612246 · regulatory
ENSR21_B5HD7 · promoter · 17612834–17613391 · regulatory
· motif · 17611648–17611661 · motif
· motif · 17611692–17611705 · motif
· motif · 17611692–17611705 · motif
· motif · 17612175–17612188 · motif
· motif · 17612227–17612243 · motif
· motif · 17612420–17612437 · motif
· motif · 17612660–17612670 · motif
· motif · 17612695–17612712 · motif
· motif · 17612825–17612841 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:252 aa
BTG3 蛋白長 252 個胺基酸,屬於 BTG family。序列第 138 至 162 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- E2F1Q01094 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTG3 過度表現會妨礙血清誘導的細胞週期進程,使細胞由 G0/G1 期進入 S 期的過程受阻。資料未提供更具體的實驗系統或分子機制。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACTCGTGTGCGCGCTCGTCCGCCCGCCAGTCCTCTCAACG40CGCGCTTGGCCGCCCGACGACGCGGGAGCCGCACGCGCCG80GACGAGGCTCGCTGCGCTCCCTGTTGCCCAGCGCGGGCCC120GTTGAGGCGGAGCCCTCAGTTCCCGGCCAGGACACGGTCT160GGGCCGCCGAATCTCCGGCCGAAGAGCGGCGGCGGCAGCG200GCGGGAAAAAAATGAAGAATGAAATTGCTGCCGTTGTCTT240CTTTTTCACAAGGCTAGTTCGAAAACATGATAAGTTGAAA280AAAGAGGCAGTTGAGAGGTTTGCTGAGAAATTGACCCTAA320TACTTCAAGAAAAATATAAAAATCACTGGTATCCAGAAAA360ACCATCGAAAGGACAGGCCTACAGATGTATTCGTGTCAAT400AAATTTCAGAGAGTTGATCCTGATGTCCTGAAAGCCTGTG440AAAACAGCTGCATCTTGTATAGTGACCTGGGCTTGCCAAA480GGAGCTCACTCTCTGGGTGGACCCATGTGAGGTGTGCTGT520CGGTATGGAGAGAAAAACAATGCATTCATTGTTGCCAGCT560TTGAAAATAAAGATGAGAACAAGGATGAGATCTCCAGGAA600AGTTACCAGGGCCCTTGATAAGGTTACCTCTGATTATCAT640TCAGGATCCTCTTCTTCAGATGAAGAAACAAGTAAGGAAA680TGGAAGTGAAACCCAGTTCGGTGACTGCAGCCGCAAGTCC720TGTGTACCAGATTTCAGAACTTATATTTCCACCTCTTCCA760ATGTGGCACCCTTTGCCCAGAAAAAAGCCAGGAATGTATC800GAGGGAATGGCCATCAGAATCACTATCCTCCTCCTGTTCC840ATTTGGTTATCCAAATCAGGGAAGAAAAAATAAACCATAT880CGCCCAATTCCAGTGACATGGGTACCTCCTCCTGGAATGC920ATTGTGACCGGAATCACTGGATTAATCCTCACATGTTAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。