基因總覽
BTG2(正式名稱為 BTG anti-proliferation factor 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 BTG family。來源將此蛋白描述為具有抗增殖作用,並指出它與細胞週期調節相關。現有資料未提供其蛋白質長度、結構域或其他具體結構特色,因此不對這些性質作進一步描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000290551 ★ | 203,305,519–203,309,602 | 2 |
| ENST00001119532 | 203,305,519–203,309,602 | 2 |
| ENST00001119534 | 203,305,519–203,309,598 | 3 |
| ENST00001145648 | 203,305,519–203,311,424 | 2 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTG2 具有抑制細胞增殖的作用,其功能與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶亞基相關。它可依賴 CNOT6 與 CNOT7 活化 mRNA 去腺苷酸化;另一方面,在體外,BTG2 也能抑制 CNOT7 和 CNOT8 的去腺苷酸酶活性。這些作用的方向與條件不同,現有資料並未進一步說明其差異如何受到調控。
BTG2 也參與細胞週期調節。來源指出,它可能參與神經前驅細胞的生長停滯與分化,但這項敘述標示為依相似性推論,應保留其可能性,而非視為已確立的功能。此外,BTG2 可調節由 ESR1 介導的轉錄調控;資料未提供更具體的轉錄標的或調控方式。
在其他細胞相關過程中,BTG2 與粒線體去極化及神經突生長有關。來源提及這些功能,但未在此處詳述其作用機制或適用條件。整體而言,現有資料支持 BTG2 與細胞增殖、細胞週期、特定轉錄調控,以及粒線體與神經突相關過程相連;其中神經前驅細胞的生長停滯與分化則屬於依相似性提出的可能作用。
Promoter 與基因調控
>BTG2 ENST00000290551 GRCh38 chr1:203304519-203305619 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTTACAAACACGGCATCTGTATGCCAGACCCTGGGCCAGGCTTCACGGTGTTGGGTAGAAGTTATCCTC ATTCAGCAGACATCTACCGAGTGCCTGTGATGGTGGCGGTCCCTGAGTGTGGAAGAGGGAGACTGAGGCC AGATTCTTTCTCGAGAAGGTCCAAACCACAATGAGGAAGGAAGACGGCTGGGGGAAGGAGGGAGTGGACG GAAAAATACGTACAGTTGAGAGCAGACCACTAATTCAAAAAAATTAGCACTTAAGGAAAGTGAGAACTAG AAAAATAAGTTGAGAAGACAAAAGTCTTGCAACACACCCCCTACCCCTACCCACCAGAAAACTTAGACTT GAATGGTTCTCAGCAAGAGAAAAGACATTGCTGTAGAATGGAACTTGTTGTGGGAGGTGGGATTACCACG GAAATAAATAGAAGACAGCCTCCCTTTCCAAAGAGCCAAAAGGAACCCATTTCGTCTAGTTAAGAGACGA GGCAAAGCGGTAAAATGGTGACAACACGTCCTGGTGAGTGGTTCTGACCGTGAATGGTTGGAAAATGCTG TGGGAATCAGAAAGGGGAACCGTCTGGGAGAGGTGGTGTCACCGAAGGCTTCTCGGAGGAGGTGGCCTCT AACTCGAGCCTTAAAAATGGGCGAAGAGGCGAGGCCGGGGCCTGCCCCGCGCGGAGTACTCGGGAGCCGC CTCCCTCCTTTCAGAGCTCTCAGTCCCGTCCCCGGGCCTCGCTTTCTCCTCTCGCCTCGCTCAGCTCAGC CGGGCGCAGGTTCCTAGCACTGACGACAGCGAGCGATGACCTCAGCGCCGCCAAGGCTGCGAGGGCGGGG GCTGGGGTGGCGGGGGCGGGGAAAAGCGCCGGAGCGGGGCCGAGCGGAGCGGCTCCGGGCCCCGCCCCCA TCCTCTGGCCGCGACCAATGAGCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTACCTCCCTGGACCTCCTGAAAAACGC TGCCCGGGGAAAGTCCGGGCAGAGCCCGAGCAGCGGCCAGGGTAACGCTGTCTTGTGGACCCGCACTTCC CACCCGAGACCTCTCACTGAGCCCGAGCCGCGCGCGACATGAGCCACGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTG2_1 ↗ | 1:203,305,519 | 正股 | 203,305,470–203,305,529 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_CQ6NC · enhancer · 203300024–203301430 · regulatory
ENSR1_DD4CB · enhancer · 203302934–203305290 · regulatory
ENSR1_87ZDJL · promoter · 203305291–203305529 · regulatory
ENSR1_53QS5DG · CTCF_binding_site · 203305771–203305792 · regulatory
ENSR1_53QS5GW · CTCF_binding_site · 203306296–203306317 · regulatory
ENSR1_53QS5R4 · CTCF_binding_site · 203308063–203308084 · regulatory
ENSR1_94ZNS3 · enhancer · 203309659–203309920 · regulatory
ENSR1_B3HCF5 · enhancer · 203310071–203310810 · regulatory
· motif · 203300814–203300829 · motif
· motif · 203300878–203300895 · motif
· motif · 203303609–203303615 · motif
· motif · 203304681–203304689 · motif
· motif · 203305321–203305333 · motif
· motif · 203305324–203305331 · motif
· motif · 203305344–203305357 · motif
· motif · 203305350–203305363 · motif
· motif · 203305365–203305378 · motif
· motif · 203305689–203305702 · motif
· motif · 203305773–203305789 · motif
· motif · 203306298–203306314 · motif
· motif · 203306377–203306383 · motif
· motif · 203307171–203307179 · motif
· motif · 203307271–203307293 · motif
· motif · 203307271–203307293 · motif
· motif · 203307444–203307457 · motif
· motif · 203307493–203307508 · motif
· motif · 203307537–203307548 · motif
· motif · 203307756–203307778 · motif
· motif · 203307756–203307778 · motif
· motif · 203308065–203308081 · motif
· motif · 203308279–203308290 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- ARP10275 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CNOT7Q9UIV1 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CNOT8Q9UFF9 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- Cnot7Q60809 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
BTG2 與 CNOT7、CNOT8 有互作,這些互作可作為其與 CCR4-NOT complex 相關的線索。它也與 PIN1 互作,並伴隨粒線體去極化。另有資料指出 BTG2 與 PRKCABP 互作,但此項關係標示為依相似性推論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTG2 具有抑制細胞增殖的作用,其功能與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶亞基相關;它依賴 CNOT6、CNOT7 活化 mRNA 去腺苷酸化,但在體外可抑制 CNOT7、CNOT8 的去腺苷酸酶活性。另參與細胞週期調節,可能影響神經前驅細胞生長停滯與分化,並調節 ESR1 介導的轉錄調控;也與粒線體去極化及神經突生長有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Anti-proliferative protein; the function is mediated by association with deadenylase subunits of the CCR4-NOT complex. Activates mRNA deadenylation in a CNOT6 and CNOT7-dependent manner. In vitro can inhibit deadenylase activity of CNOT7 and CNOT8. Involved in cell cycle regulation. Could be involved in the growth arrest and differentiation of the neuronal precursors (By similarity). Modulates transcription regulation mediated by ESR1. Involved in mitochondrial depolarization and neurite outgrowth PMID 12771185 ↗ · PMID 15788397 ↗ · PMID 18337750 ↗ · PMID 18773938 ↗ · PMID 23236473 ↗ |
| 交互作用 | BTG2 與 CNOT7、CNOT8 互作,這項關係提示其與 CCR4-NOT complex 相關;它也與 PIN1 互作,並伴隨粒線體去極化。BTG2 與 PRKCABP 的互作則是依相似性提出,保留此項推論性質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PRKCABP (By similarity). Interacts with CNOT7 and CNOT8; indicative for an association with the CCR4-NOT complex. Interacts with PIN1, inducing mitochondrial depolarization PMID 11136725 ↗ · PMID 12771185 ↗ · PMID 15788397 ↗ · PMID 18974182 ↗ · PMID 23236473 ↗ · PMID 9712883 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAGCCCGAGCAGCGGCCAGGGTAACGCTGTCTTGTGGAC40CCGCACTTCCCACCCGAGACCTCTCACTGAGCCCGAGCCG80CGCGCGACATGAGCCACGGGAAGGGAACCGACATGCTCCC120GGAGATCGCCGCCGCCGTGGGCTTCCTCTCCAGCCTCCTG160AGGACCCGGGGCTGCGTGAGCGAGCAGAGGCTTAAGGTCT200TCAGCGGGGCGCTCCAGGAGGCACTCACAGAGCACTACAA240ACACCACTGGTTTCCCGAAAAGCCGTCCAAGGGCTCCGGC280TACCGCTGCATTCGCATCAACCACAAGATGGACCCCATCA320TCAGCAGGGTGGCCAGCCAGATCGGACTCAGCCAGCCCCA360GCTGCACCAGCTGCTGCCCAGCGAGCTGACCCTGTGGGTG400GACCCCTATGAGGTGTCCTACCGCATTGGGGAGGACGGCT440CCATCTGCGTCTTGTACGAGGAGGCCCCACTGGCCGCCTC480CTGTGGGCTCCTCACCTGCAAGAACCAAGTGCTGCTGGGC520CGGAGCAGCCCCTCCAAGAACTACGTGATGGCAGTCTCCA560GCTAGGCCCTTCCGCCCCCGCCCTGGGCGCCGCCGTGCTC600ATGCTGCCGTGACAACAGGCCACCACATACCTCAACCTGG640GGAACTGTATTTTTAAATGAAGAGCTATTTATATATATTA680TTTTTTTTTAAGAAAGGAGGAAAAGAAACCAAAAGTTTTT720TTTAAGAAAAAAAATCCTTCAAGGGAGCTGCTTGGAAGTG760GCCTCCCCAGGTGCCTTTGGAGAGAACTGTTGCGTGCTTG800AGTCTGTGAGCCAGTGTCTGCCTATAGGAGGGGGAGCTGT840TAGGGGGTAGACCTAGCCAAGGAGAAGTGGGAGACGTTTG880GCTAGCACCCCAGGAAGATGTGAGAGGGAGCAAGCAAGGT920TAGCAACTGTGAACAGAGAGGTCGGGATTTGCCCTGGGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。