演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BTG2PC3

BTG anti-proliferation factor 2

BTG2 是一種 BTG family 蛋白,具有抑制細胞增殖的作用,並參與細胞週期調節。

Homo sapiens1q32.1UniProt P78543
OFFICIAL SYMBOL
BTG2
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P78543
PDB / ALPHAFOLD
3DJU
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BTG2(正式名稱為 BTG anti-proliferation factor 2)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 BTG family。來源將此蛋白描述為具有抗增殖作用,並指出它與細胞週期調節相關。現有資料未提供其蛋白質長度、結構域或其他具體結構特色,因此不對這些性質作進一步描述。

Official symbol
BTG2
Gene name
BTG anti-proliferation factor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1131
UniProt
P78543
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PC3TIS21MGC126063MGC126064APRO1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q32.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegBTG2pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:203,305,491–203,311,424
Gene span
5,934 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000290551 ★203,305,519–203,309,6022
ENST00001119532203,305,519–203,309,6022
ENST00001119534203,305,519–203,309,5983
ENST00001145648203,305,519–203,311,4242

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BTG2 具有抑制細胞增殖的作用,其功能與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶亞基相關。它可依賴 CNOT6 與 CNOT7 活化 mRNA 去腺苷酸化;另一方面,在體外,BTG2 也能抑制 CNOT7 和 CNOT8 的去腺苷酸酶活性。這些作用的方向與條件不同,現有資料並未進一步說明其差異如何受到調控。

BTG2 也參與細胞週期調節。來源指出,它可能參與神經前驅細胞的生長停滯與分化,但這項敘述標示為依相似性推論,應保留其可能性,而非視為已確立的功能。此外,BTG2 可調節由 ESR1 介導的轉錄調控;資料未提供更具體的轉錄標的或調控方式。

在其他細胞相關過程中,BTG2 與粒線體去極化及神經突生長有關。來源提及這些功能,但未在此處詳述其作用機制或適用條件。整體而言,現有資料支持 BTG2 與細胞增殖、細胞週期、特定轉錄調控,以及粒線體與神經突相關過程相連;其中神經前驅細胞的生長停滯與分化則屬於依相似性提出的可能作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 203305519 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BTG2 ENST00000290551 GRCh38 chr1:203304519-203305619 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTTACAAACACGGCATCTGTATGCCAGACCCTGGGCCAGGCTTCACGGTGTTGGGTAGAAGTTATCCTC
ATTCAGCAGACATCTACCGAGTGCCTGTGATGGTGGCGGTCCCTGAGTGTGGAAGAGGGAGACTGAGGCC
AGATTCTTTCTCGAGAAGGTCCAAACCACAATGAGGAAGGAAGACGGCTGGGGGAAGGAGGGAGTGGACG
GAAAAATACGTACAGTTGAGAGCAGACCACTAATTCAAAAAAATTAGCACTTAAGGAAAGTGAGAACTAG
AAAAATAAGTTGAGAAGACAAAAGTCTTGCAACACACCCCCTACCCCTACCCACCAGAAAACTTAGACTT
GAATGGTTCTCAGCAAGAGAAAAGACATTGCTGTAGAATGGAACTTGTTGTGGGAGGTGGGATTACCACG
GAAATAAATAGAAGACAGCCTCCCTTTCCAAAGAGCCAAAAGGAACCCATTTCGTCTAGTTAAGAGACGA
GGCAAAGCGGTAAAATGGTGACAACACGTCCTGGTGAGTGGTTCTGACCGTGAATGGTTGGAAAATGCTG
TGGGAATCAGAAAGGGGAACCGTCTGGGAGAGGTGGTGTCACCGAAGGCTTCTCGGAGGAGGTGGCCTCT
AACTCGAGCCTTAAAAATGGGCGAAGAGGCGAGGCCGGGGCCTGCCCCGCGCGGAGTACTCGGGAGCCGC
CTCCCTCCTTTCAGAGCTCTCAGTCCCGTCCCCGGGCCTCGCTTTCTCCTCTCGCCTCGCTCAGCTCAGC
CGGGCGCAGGTTCCTAGCACTGACGACAGCGAGCGATGACCTCAGCGCCGCCAAGGCTGCGAGGGCGGGG
GCTGGGGTGGCGGGGGCGGGGAAAAGCGCCGGAGCGGGGCCGAGCGGAGCGGCTCCGGGCCCCGCCCCCA
TCCTCTGGCCGCGACCAATGAGCGCCGCCGCCGGCTGCCCCCCTACCTCCCTGGACCTCCTGAAAAACGC
TGCCCGGGGAAAGTCCGGGCAGAGCCCGAGCAGCGGCCAGGGTAACGCTGTCTTGTGGACCCGCACTTCC
CACCCGAGACCTCTCACTGAGCCCGAGCCGCGCGCGACATGAGCCACGGGA
BTG2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BTG2_1 ↗1:203,305,519正股203,305,470–203,305,529

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_CQ6NC · enhancer · 203300024–203301430 · regulatory

ENSR1_DD4CB · enhancer · 203302934–203305290 · regulatory

ENSR1_87ZDJL · promoter · 203305291–203305529 · regulatory

ENSR1_53QS5DG · CTCF_binding_site · 203305771–203305792 · regulatory

ENSR1_53QS5GW · CTCF_binding_site · 203306296–203306317 · regulatory

ENSR1_53QS5R4 · CTCF_binding_site · 203308063–203308084 · regulatory

ENSR1_94ZNS3 · enhancer · 203309659–203309920 · regulatory

ENSR1_B3HCF5 · enhancer · 203310071–203310810 · regulatory

· motif · 203300814–203300829 · motif

· motif · 203300878–203300895 · motif

· motif · 203303609–203303615 · motif

· motif · 203304681–203304689 · motif

· motif · 203305321–203305333 · motif

· motif · 203305324–203305331 · motif

· motif · 203305344–203305357 · motif

· motif · 203305350–203305363 · motif

· motif · 203305365–203305378 · motif

· motif · 203305689–203305702 · motif

· motif · 203305773–203305789 · motif

· motif · 203306298–203306314 · motif

· motif · 203306377–203306383 · motif

· motif · 203307171–203307179 · motif

· motif · 203307271–203307293 · motif

· motif · 203307271–203307293 · motif

· motif · 203307444–203307457 · motif

· motif · 203307493–203307508 · motif

· motif · 203307537–203307548 · motif

· motif · 203307756–203307778 · motif

· motif · 203307756–203307778 · motif

· motif · 203308065–203308081 · motif

· motif · 203308279–203308290 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:158 aa

BTG2 蛋白屬於 BTG family。現有來源未列出其結構域、功能區域、序列特徵或其他蛋白質結構註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3DJU…

PDB · 3DJU

X-ray · 2.26 A · B=7-128

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PC3BTG2ARCNOT7CNOT8Cnot7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BTG2 與 CNOT7、CNOT8 有互作,這些互作可作為其與 CCR4-NOT complex 相關的線索。它也與 PIN1 互作,並伴隨粒線體去極化。另有資料指出 BTG2 與 PRKCABP 互作,但此項關係標示為依相似性推論。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BTG2 具有抑制細胞增殖的作用,其功能與 CCR4-NOT complex 的去腺苷酸酶亞基相關;它依賴 CNOT6、CNOT7 活化 mRNA 去腺苷酸化,但在體外可抑制 CNOT7、CNOT8 的去腺苷酸酶活性。另參與細胞週期調節,可能影響神經前驅細胞生長停滯與分化,並調節 ESR1 介導的轉錄調控;也與粒線體去極化及神經突生長有關。含實驗來源
證據與來源

Anti-proliferative protein; the function is mediated by association with deadenylase subunits of the CCR4-NOT complex. Activates mRNA deadenylation in a CNOT6 and CNOT7-dependent manner. In vitro can inhibit deadenylase activity of CNOT7 and CNOT8. Involved in cell cycle regulation. Could be involved in the growth arrest and differentiation of the neuronal precursors (By similarity). Modulates transcription regulation mediated by ESR1. Involved in mitochondrial depolarization and neurite outgrowth

PMID 12771185 ↗ · PMID 15788397 ↗ · PMID 18337750 ↗ · PMID 18773938 ↗ · PMID 23236473 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BTG2 與 CNOT7、CNOT8 互作,這項關係提示其與 CCR4-NOT complex 相關;它也與 PIN1 互作,並伴隨粒線體去極化。BTG2 與 PRKCABP 的互作則是依相似性提出,保留此項推論性質。含實驗來源
證據與來源

Interacts with PRKCABP (By similarity). Interacts with CNOT7 and CNOT8; indicative for an association with the CCR4-NOT complex. Interacts with PIN1, inducing mitochondrial depolarization

PMID 11136725 ↗ · PMID 12771185 ↗ · PMID 15788397 ↗ · PMID 18974182 ↗ · PMID 23236473 ↗ · PMID 9712883 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000290551 · 2,729 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCCCGAGCAGCGGCCAGGGTAACGCTGTCTTGTGGAC40
41CCGCACTTCCCACCCGAGACCTCTCACTGAGCCCGAGCCG80
81CGCGCGACATGAGCCACGGGAAGGGAACCGACATGCTCCC120
121GGAGATCGCCGCCGCCGTGGGCTTCCTCTCCAGCCTCCTG160
161AGGACCCGGGGCTGCGTGAGCGAGCAGAGGCTTAAGGTCT200
201TCAGCGGGGCGCTCCAGGAGGCACTCACAGAGCACTACAA240
241ACACCACTGGTTTCCCGAAAAGCCGTCCAAGGGCTCCGGC280
281TACCGCTGCATTCGCATCAACCACAAGATGGACCCCATCA320
321TCAGCAGGGTGGCCAGCCAGATCGGACTCAGCCAGCCCCA360
361GCTGCACCAGCTGCTGCCCAGCGAGCTGACCCTGTGGGTG400
401GACCCCTATGAGGTGTCCTACCGCATTGGGGAGGACGGCT440
441CCATCTGCGTCTTGTACGAGGAGGCCCCACTGGCCGCCTC480
481CTGTGGGCTCCTCACCTGCAAGAACCAAGTGCTGCTGGGC520
521CGGAGCAGCCCCTCCAAGAACTACGTGATGGCAGTCTCCA560
561GCTAGGCCCTTCCGCCCCCGCCCTGGGCGCCGCCGTGCTC600
601ATGCTGCCGTGACAACAGGCCACCACATACCTCAACCTGG640
641GGAACTGTATTTTTAAATGAAGAGCTATTTATATATATTA680
681TTTTTTTTTAAGAAAGGAGGAAAAGAAACCAAAAGTTTTT720
721TTTAAGAAAAAAAATCCTTCAAGGGAGCTGCTTGGAAGTG760
761GCCTCCCCAGGTGCCTTTGGAGAGAACTGTTGCGTGCTTG800
801AGTCTGTGAGCCAGTGTCTGCCTATAGGAGGGGGAGCTGT840
841TAGGGGGTAGACCTAGCCAAGGAGAAGTGGGAGACGTTTG880
881GCTAGCACCCCAGGAAGATGTGAGAGGGAGCAAGCAAGGT920
921TAGCAACTGTGAACAGAGAGGTCGGGATTTGCCCTGGGGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。