基因總覽
BTG1 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 BTG anti-proliferation factor 1。其產物屬於 BTG family,來源將其概括為具有抗增殖作用的蛋白質。現有資料未提供蛋白質長度、結構域或其他序列特徵,因此不進一步描述其分子結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000256015 ★ | 92,140,278–92,145,846 | 2 |
| ENST00001099348 | 92,143,931–92,145,854 | 2 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTG1 的功能資料將其描述為抗增殖蛋白,指出其作用與抑制細胞增殖有關。現有來源未進一步說明其作用機制、受影響的分子過程、細胞或組織條件,也未提供可據以延伸的功能細節,因此此處僅保留抗增殖這項概括性描述。
Promoter 與基因調控
>BTG1 ENST00000256015 GRCh38 chr12:92145746-92146846 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACTAGGTAAAAAAGAAAATCTTCAGTTTTGTGCACACAAGTTTTAAAATACATTGTACAGATTTTTTTT TTTTGGATACACACCACTCTTTACAGGATCCGCGTTATATCTGCTTTCAGTAACTGGCTCTCCTGTCCGC ATCCAGTAAGGTTTCCACTCTTCTCTCCGTTGACTGCTGAAGTTACTGAAACAGCAACCACAAATGGCCT TACTAACCTACTTATTTTGCAATTAAACTTTTAAAAGATATCCCCCTACTCCTCCCCTAGGGTGGAACAG AAATGGCTCCGCGGCGTTGGCAGCTCGTCTGCGAGGGGACCCTGGCTCCCCGAGGCTGCAGTCCTTTTTC TTGGACAGAACGCCCCGCAGGACCGTTCCCTCCACTTTCCCCCGCACTAAGGCAGCGCACCGCCAGCACA CACAGCGCTGGCGCCCGCATCGCGCCGCACCACACGCGTCTCCGGCTTGAGGAGCCAGTCACCGAGACCC GGAGCGGGAACGAGATGTAAACACGGAGTGGGGACATGCAGCCCGATCTGAGAAGGCGGCGTGAAGAGTA GACACAGCCTGCGCCAGGCGGTTCTTATTTACCCAGCACTTACACTCCAGGGCAAGCGGGCCCAGGCAGC GCACTCTTGGAGAAGGATGCACTGGCGCAGAGCCTGGACCTGCTGAAGCGGGAAGGAGGAGCTAGGGCTG GGGGCGGAGCTTTCACACGCGCACCCTCTGTTCCCTCCCTCCCTCCCTCGACACAAGCAACTGGGTCTCC AGCCGCCACTCCGGGTTTATTTGTTTACAAGCGGATTACGTCAGCTCCTCCCTCTCTTCCCTATCTCTGG ACCCGCCTCCTGAACTCTTTTCCCGCCCCTTTCGGCTCCGAACCGGCTTGCGTCACAATGGTGCGATATT CGGATTGGCTGGAGTCGGCCATCACGCTCCAGCTACGCCACTTCCTTTTCGTGGCACTATAAAGGGTGCT GCACGGCGCTTGCATCTCTTCGCCTCTCGGAGCTGGAAATGCAGCTATTGAGATCTTCGAATGCTGCGGA GCTGGAGGCGGAGGCAGCTGGGGAGGTCCGAGCGATGTGACCAGGCCGCCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTG1_1 ↗ | 12:92,145,846 | 負股 | 92,145,836–92,145,895 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_D6KFM · enhancer · 92139505–92141702 · regulatory
ENSR12_93CKGG · promoter · 92141703–92142203 · regulatory
ENSR12_93CKGP · promoter · 92142658–92143161 · regulatory
ENSR12_BN9Q7 · promoter · 92144883–92145583 · regulatory
ENSR12_84P623 · enhancer · 92145584–92145835 · regulatory
ENSR12_93CKHL · promoter · 92145836–92146215 · regulatory
ENSR12_CC5TQ · enhancer · 92146216–92148255 · regulatory
ENSR12_93CKJG · enhancer · 92148699–92149139 · regulatory
· motif · 92143268–92143276 · motif
· motif · 92143968–92143981 · motif
· motif · 92143968–92143981 · motif
· motif · 92144258–92144280 · motif
· motif · 92144258–92144280 · motif
· motif · 92144518–92144540 · motif
· motif · 92144518–92144540 · motif
· motif · 92145105–92145122 · motif
· motif · 92145229–92145244 · motif
· motif · 92145330–92145343 · motif
· motif · 92145544–92145557 · motif
· motif · 92145743–92145753 · motif
· motif · 92145901–92145917 · motif
· motif · 92146031–92146044 · motif
· motif · 92146031–92146044 · motif
· motif · 92146162–92146178 · motif
· motif · 92146450–92146461 · motif
· motif · 92146644–92146652 · motif
· motif · 92147548–92147559 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:171 aa
BTG1 產物屬於 BTG family。現有資料未提供其胺基酸長度、結構域、功能區域或序列註解,故無法據此補充更細節的蛋白質結構描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CNOT7Q9UIV1 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CNOT8Q9UFF9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- FADDQ13158 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMAD4Q13485 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- Cnot7Q60809 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
BTG1 與 CNOT7 及 CNOT8 有交互作用的記載。來源未說明這些關係是否代表直接實體結合、共同組成特定複合體,或僅涉及功能上的關聯,因此不進一步界定交互作用性質。
疾病與遺傳關聯
涉及 BTG1 的染色體異常可能是某種 B 細胞慢性淋巴性白血病的成因之一;資料特別列出與 MYC 有關的 t(8;12)(q24;q22) 易位。此記載呈現的是可能的疾病關聯,不能據此視為已確立的因果關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTG1 的產物被描述為具有抗增殖作用的蛋白質;此項資料僅提供概括性的功能說明,未進一步指出作用機制、細胞背景或具體生物學過程。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | BTG1 與 CNOT7 及 CNOT8 有交互作用的記載;資料未說明交互作用的性質,也未指出是否涉及直接結合、特定複合體或功能上的關聯。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 涉及 BTG1 的染色體異常可能是某種 B 細胞慢性淋巴性白血病的成因之一;資料列出的異常為與 MYC 有關的 t(8;12)(q24;q22) 易位,關聯仍以可能性表述。 | 含實驗來源 | 證據與來源A chromosomal aberration involving BTG1 may be a cause of a form of B-cell chronic lymphocytic leukemia. Translocation t(8;12)(q24;q22) with MYC PMID 2069907 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CGCCTCTCGGAGCTGGAAATGCAGCTATTGAGATCTTCGA40ATGCTGCGGAGCTGGAGGCGGAGGCAGCTGGGGAGGTCCG80AGCGATGTGACCAGGCCGCCATCGCTCGTCTCTTCCTCTC120TCCTGCCGCCTCCTGTCTCGAAAATAACTTTTTTAGTCTA160AAGAAAGAAAGACAAAAGTAGTCGTCCGCCCCTCACGCCC200TCTCTTCCTCTCAGCCTTCCGCCCGGTGAGGAAGCCCGGG240GTGGCTGCTCCGCCGTCGGGGCCGCGCCGCCGAGCCCCAG280CCGCCCCGGGCCGCCCCCGCACGCCGCCCCCATGCATCCC320TTCTACACCCGGGCCGCCACCATGATAGGCGAGATCGCCG360CCGCCGTGTCCTTCATCTCCAAGTTTCTCCGCACCAAGGG400GCTCACGAGCGAGCGACAGCTGCAGACCTTCAGCCAGAGC440CTGCAGGAGCTGCTGGCAGAACATTATAAACATCACTGGT480TCCCAGAAAAGCCATGCAAGGGATCGGGTTACCGTTGTAT520TCGCATCAACCATAAAATGGATCCTCTGATTGGACAGGCA560GCACAGCGGATTGGACTGAGCAGTCAGGAGCTGTTCAGGC600TTCTCCCAAGTGAACTCACACTCTGGGTTGACCCCTATGA640AGTGTCCTACAGAATTGGAGAGGATGGCTCCATCTGTGTG680CTGTATGAAGCCTCACCAGCAGGAGGTAGCACTCAAAACA720GCACCAACGTGCAAATGGTAGACAGCCGAATCAGCTGTAA760GGAGGAACTTCTCTTGGGCAGAACGAGCCCTTCCAAAAAC800TACAATATGATGACTGTATCAGGTTAAGATATAGTCTGTG840GATGGATCATCTGATGATGATGGATAAATTTGATTTTTGC880TTTGGGTGGGCTCCTCTTGGGGATGGATTATGGAATTTAA920ACCATGTCACAGCTGTGAAGATCTGGCACAAGATAGAATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。