基因總覽
BTF3P13(basic transcription factor 3 pseudogene 13)在人類基因組中被分類為假基因。資料將此位點描述為可能屬於 BTF3 轉錄因子家族,但這是推定的家族歸屬;現有資訊未提供其 RNA 或蛋白質產物、序列結構或其他分子特徵,因此不宜將其描述為已確認具有轉錄因子功能的基因。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000513224 ★ | 98,740,742–98,741,231 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
已知功能與來源註解
目前資料僅指出,BTF3P13 位點可能是 BTF3 轉錄因子家族的成員,並被認為代表一個假基因。這些描述反映的是推定的家族關係與假基因判定,未提供可說明其分子作用方式或生物學功能的資料。
現有資訊也未敘述此位點是否產生 RNA 或蛋白質、是否具有轉錄調控活性,或是否參與特定生物學過程。因此,不能據此將 BTF3P13 說成具有已確認的轉錄因子作用;其功能仍無法由這筆摘要確定。
Promoter 與基因調控
>BTF3P13 ENST00000513224 GRCh38 chr4:98739742-98740842 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCTTTTTTTTCTTTTGAGAAGTGAGTCTTGAATTGCAGCGTGCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTATTTTAGCTTAGGTTTGGGGGCACATGTGCAGGCTTGTTATATAGGTAAACTCGTGTGATGGGAG TTTGTTGTACAGATTATTTCATCATCCAGTTACCAAGCCTAGTATCCAATAGTCATTTTTTCTGCTCCTC TCCCTCCTCCCACCCTCCACCCTTAAGTAGGCCCCAGCGTCTGTTGTTTCCGTTTTTGTGTTTATGAGTT CTCATCATTTAGCTCCTACTTAGAAAGGAGAACACGCTGCATTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGC TAAGGCTAATGGCCTCCAGCTCAATCCATGTTCCCACAAAGAACGTGATCTCATTCAAAAAAGCAAACTT ATAAAACAGAGAGTAGAACAATAGTTTCCAAGGGCTGGAGGTCAGGTAGAAGAGTGAGAAGGATGTTGGC CAAAGGGTACATAGTTTTGGTTAGATAGGATGAAAAGTTTTGGAGATCTATTGTATAGCATGATGATGAC AATAATAATGTATTACACACTTGAAATTGCTGAGAGTAGATCTTAAATGTTCTCACCACAAAAAAAGGTA TAAGAGGTGATTGATATGTTAATTAGCTTGACTTAATCATTTCACAATGTATACATATACCAAAATGTCA CATCATATACAATTTGTATTTGTCAATTATACCTTTGTAAAGGAACAAATTTTTATAAATAGTGAGGCTG AATATTTTTTCATATTTTTATTCATCCTTTGACATTCTTTTTCTGAGAACTGTCCATTTATGCCTTTTGT CCGTTCTCTGATCGGTAAGTTCCTTCTTTTAAGTTTGAAAGATCCTCCCTCTAGCTGCCATCTTGCATCC CCGAATGTGTGTGCCTAATCTTAGCTGGTCCACCCGAGATACCCTGAGCACCAACCCTAGTCCCCCTAGC AGCCCCTTATCTGCTCCAACAAGATGAAAGAAATGATCATGAACCAGGAAAACTCGCCAAACTGCAGGCA CAAGTGCGCATTGGTGGGAAAGGAACTGCTCACAGAAAGAAGAAGGTCTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
基因座與轉錄註解
BTF3P13 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000513224 ★ | processed_pseudogene | 490 nt | 1 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTF3P13 位點被推定為 BTF3 轉錄因子家族的可能成員,並被認為代表一個假基因;此描述出自 2008 年 7 月提供的 RefSeq 摘要。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This locus defines a putative member of the BTF3 family of transcription factors and is thought to represent a pseudogene. |
DNA 與 RNA 序列
AAGATGAAAGAAATGATCATGAACCAGGAAAACTCGCCAA40ACTGCAGGCACAAGTGCGCATTGGTGGGAAAGGAACTGCT80CACAGAAAGAAGAAGGTCTTCCATAGAACAGCCACAGCCG120ATGATAAAAAGCTTCAATTCTCCTTAAAGAAGTTACAGGT160AAACAATATCTCTGGTATTGAAAAGGTGAATATGTTTACA200AACCAAGGAACAGTGATCCACTTTAACAACCCTAAATTTC240AGGCATCGCTGGCAGTGAACACTTTCACCATAACAGGTCA280TGCTGAGGCAAAGCAGGTGACAGAAATGCTACCCAGTGTC320TTAAGCCAGCTTGGTGCAGACAGTCTGACTAGTTTAAGGA360GACTGGCTGAAGTTCTGCCCAAACAACCTGTGGATGGAAA400AGCACCACTTGCTACTGGAGGGGATGATGATGATGGAGTT440CCAGAATTGTGGAGAATTTTGATGAGGCTTCCAGGAATGA480GGCAAGCTGA490cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。