演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN GENE LOCUS

BTF3P12HUMBTFC

basic transcription factor 3 pseudogene 12

BTF3P12 是被認為屬於 BTF3 轉錄因子家族的假基因位點,目前尚無轉錄紀錄。

Homo sapiens8q13.3
OFFICIAL SYMBOL
BTF3P12
CHROMOSOME
8
LOCUS TYPE
processed_pseudogene
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BTF3P12 的正式名稱為 basic transcription factor 3 pseudogene 12,基因類型為假基因。NCBI 將此位點描述為可能屬於 BTF3 轉錄因子家族;但目前尚無此位點發生轉錄的紀錄,因此資料來源認為它可能是該家族的假基因位點。現有資訊未提供其 RNA 產物、蛋白質產物或結構特徵,故不能據此推定它會產生功能性轉錄因子。

Official symbol
BTF3P12
Gene name
basic transcription factor 3 pseudogene 12
Organism
Homo sapiens
Gene type
pseudogene
HGNC ID
HGNC:1127
Locus type
pseudogene
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HUMBTFCBTF3L2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q13.3
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegBTF3P12pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:70,273,369–70,273,837
Gene span
469 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000519620 ★70,273,369–70,273,8371

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

已知功能與來源註解

目前沒有資料記錄 BTF3P12 位點發生轉錄。由於缺乏轉錄紀錄,資料來源認為此位點可能是 BTF3 轉錄因子家族的假基因,而不是已確認會產生轉錄因子的功能性基因。此描述屬於對位點性質的推測,並未提供其產物或生物學作用的證據;因此,現有資訊不足以說明 BTF3P12 具體參與哪些分子機制或生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 70273369 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BTF3P12 ENST00000519620 GRCh38 chr8:70272369-70273469 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAAAACCTTCTCAGCAGTAACTATCTAACTTATCTACGTGTCTCCTCTACTCTTCCCTTAATTCTTCTGT
GTCATGTTTCTGGTTATACTATCATGTGCTTCCAACTTTTTTTCCTTTGATAAGAGTAATTTTAAGAGGC
TAATTTTTTTTTCTTACCCCACAGCAGTCTCTTAACTGATTGGTCTGAAATTCCTTTGCTCCACCTCCTA
ACATCTGTCACAAAAGTCAGATTATAAGTCAACCCAAAGGGGAGCAAGGGGTGTGCACGTAAGAGGGAAC
ACCAGAAAAATGAAACACTAGTGGTTAGGGCATCACTAGAAACCATAATATAGTTTCTATTCTTTATTTG
ATACAATTGTACAAAAGGACACCATGTTAGATATAACATTAGGCTGAATGTTAATTTCCTAAATAAAAAT
TCTCTTTAAAGATGTAAAATAATAATCCCTTTATTATTCAATATGTAGAGATTTATTAAACACTTATAAA
GTAATAATTTAATATTTACAGTGAAGAAAACTAACTTTCATCTTCATTTTTAAAGTAATCTCTAATACTA
TCAGAAATATTAACAGTGAAATACATTAATTACAAGCCAAATTATACATTGTATGTAGCTACTTAGGTAT
TTTACTAAGAAAATAACTTTATCTTTGATATTTCCTATTTTAAAAACTTATCTGTGAATTGATTTAATGA
TTGTGTATATAAATCTGCCAAAATTATTTCAATGGATGAAACAATGAATCAGTACCTATTTATATGCTGC
CAAGGCACACCTATAATTTTTTAAATGATGATAAGAGTAGCCTAAAGCAGTGAGCAGACATCTCAGAAAT
TTCAGTGTAAGTGGTTTTAACTTGCAACATGATGCCAAAAAACTTAGAACAGGGAGCTGCCATCTTGCAT
CCCCGTGTGTGTGCACCTAATCTCAGCTGGTTCCCCCGAGACCCCCTGAGCACCAACCCTAGTCCCCCGC
GCAGCCCCTTATCCGCTGCGACAAGATGAAAGAAACAATCATGAACCAGGAAAAACTCGCCAAACTGCAG
GCAAAAGTGCCCATTGGTGGAACTGCTCACAGAAAGAAGGTGGTTCACAGA
BTF3P12 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_932W48 · enhancer · 70271519–70271926 · regulatory

ENSR8_932W4S · enhancer · 70273457–70273946 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / GENE ANATOMY

基因座與轉錄註解

pseudogene

BTF3P12 依 HGNC/Ensembl 分類為 pseudogene。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000519620 ★processed_pseudogene469 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與基因產物定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BTF3P12 位點被認為可能是 BTF3 轉錄因子家族的一員;目前尚無轉錄紀錄,因此資料來源推測它可能是該家族的假基因。資料庫紀錄
證據與來源

This locus represents a putative member of the BTF3 family of transcription factors. With no transcription yet documented, it is thought that this locus represents a pseudogene.

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000519620 · 469 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAAGATGAAAGAAACAATCATGAACCAGGAAAAACTCGC40
41CAAACTGCAGGCAAAAGTGCCCATTGGTGGAACTGCTCAC80
81AGAAAGAAGGTGGTTCACAGAACAGCCACAGCAAATGATA120
121AAAAACGTCAGTTCTCCTTAAAGAAGTTAGAAATCTCTGG160
161CATTGAAGAGGTGAATATGTTTACAAACCAAGCAACAGTG200
201ATCCACTTTAACAACCCTAAAGCCCAGACATCTCTGGCAG240
241TGAACACTTTCACCATTACAGGCTATACTGAGACAAAGCA280
281GCTGACAGAAATGCTACCCAGAATCTTAAACCAGCTTGGT320
321GCAGGCAGTCTGACTAGTTTAAGGACTGGCTGAAGCACTG360
361TCCAAACAATCTGTGGGTGGAAAAGCACCACTTACTACTG400
401GAGAGAATGATGATGATGAAGTTCCAGATCTTGTGGAGAA440
441TTTGGATGAGGCTTCCAAGAATGAGGCAA469

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。