基因總覽
BTF3（basic transcription factor 3）是蛋白質編碼基因，產物屬於 NAC-beta 家族。其蛋白質具有 NAC-A/B 結構域，並在序列兩端帶有無序區域。BTF3 的特性涵蓋轉錄相關角色，以及與新生多肽處理相關的功能；它也可與 NACA 組成複合體。這些性質使 BTF3 同時涉及基因轉錄與新生蛋白質的處理。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380591 ★ | 73,498,442–73,505,667 | 6 |
| ENST00000335895 | 73,498,408–73,507,479 | 6 |
| ENST00000678135 | 73,498,436–73,507,479 | 5 |
| ENST00001079155 | 73,498,441–73,507,479 | 6 |
| ENST00001079160 | 73,498,441–73,507,479 | 5 |
| ENST00001135975 | 73,498,441–73,507,479 | 6 |
| ENST00000677654 | 73,498,466–73,505,011 | 5 |
| ENST00000507081 | 73,498,510–73,504,403 | 4 |
| ENST00000509708 | 73,502,591–73,505,493 | 3 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
BTF3 具有轉錄相關功能，可作為一般轉錄因子，並能與 RNA polymerase II 形成穩定複合體。來源指出，BTF3 是轉錄起始所必需的因子，顯示它參與 RNA polymerase II 相關的轉錄起始過程；但現有資料未進一步說明其作用於何種特定基因或轉錄調控步驟。
BTF3 也參與新生多肽離開核糖體時的處理。它可在多肽鏈自核糖體生成並伸出時與之結合；當 BTF3 與 NACA 結合時，能阻止非分泌性多肽不適當地被導向內質網。其作用方式是阻斷新生多肽與 signal recognition particle（SRP）的交互作用。SRP 通常會將新生分泌性多肽導向內質網，因此這項阻斷有助於避免非分泌性多肽遭到錯誤導向。來源未提供此作用的其他條件或不同蛋白質類別間的差異。
Promoter 與基因調控
>BTF3 ENST00000380591 GRCh38 chr5:73497442-73498542 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TGGAGAGGGGTCTGCACTTGAACAAGTTTTCTTGCTACACACATTGCATTCTAAGATTTCGGACTCACTT TTGAATATGCAAAGACATTTCATGGTTAAGACCACAAAAAGGCTGATCAGAGAACATTTTTATTTAAATT GCCATTTTAAATATCAGTCGTTTTATCTTAAAGCTTGTCCTGGGTTTAACAAAGTTTAACTCACATCCAC GCGTTGTCTCTCCAAACACAGCAGGCAGAAATTCTCCTTTGATTGGATTAAGATAGATAAAGTCTGCTTA ACCGTGAATCGCTAATTGTCAAATCCATGCCAATTCGGTACCTAGGAGTCAATTTTTTTGCCTGATAAAC AAGATAATTGTGTGGACCGTTTTAAGGTGGTTAGTCATCTGCTAAATTGGCTGAAATGCGGATTACCCAG TTCCTTCGTCGTACAGAGTTGCATTCTGAGGAGTGGGGCTCGGGGATACAGCCCCCAGAAATTCTGAACC TCGGTCCCGCAATCTACCACACCACCTAACCTTGGAAGGCCAAACTAACTTCACTATTTTTGACAAAATG CTTTGGTAATGGCTCATTCGGGCCGAGAGGGAAATTCTGCAATTCTCCAACCCACACCTCCAGCAAGGGG AGAGCTGCTTGAGTGGTGAGCACAAGCTGGGCACCTCCGGCGTCTCCAGGAAACGTGAATAGGCCCTTTC TTCGGAGGGCACAGAACTTCAGGATCAGGGCCCAATGGAGACTGAGCGGACTTAACCCTAACTGTGCACA GGACCGCGCTCTCCGACCCCTTTGTGGCCTCTCCCAGAGGTACGGGCTGCGCCCCAAGCCAGCAGTCTCT CGTAGGGCCTACAGCCGGCAGCCGCTGGAGCAGGAGGAGGAGAATAGGGACTCGCTGGACCATCACAAAC GCTGTCGCGCGTGCGCAGGGAGGAACCGAGTTCGCGGCGAAGTCAGTTTCCTGACTCTTGAAGGAAGTGG CCTTGTGTCACTTCCGGCCTCCCTTTAGCTGCCATCTTGCGTCCCCGCGTGTGTGCGCCTAATCTCAGGT GGTCCACCCGAGACCCCTTGAGCACCAACCCTAGTCCCCCGCGCGGCCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BTF3_1 ↗ | 5:73,498,443 | 正股 | 73,498,394–73,498,453 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_846C9H · enhancer · 73496083–73496261 · regulatory
ENSR5_C99WN · enhancer · 73496966–73498319 · regulatory
ENSR5_5M9QDK · CTCF_binding_site · 73497137–73497158 · regulatory
ENSR5_846CBR · promoter · 73498320–73498476 · regulatory
ENSR5_5M9QLM · CTCF_binding_site · 73498447–73498468 · regulatory
ENSR5_5M9QN4 · CTCF_binding_site · 73498758–73498779 · regulatory
ENSR5_9346N4 · promoter · 73498864–73499181 · regulatory
ENSR5_9346N7 · enhancer · 73499258–73499605 · regulatory
· motif · 73495179–73495193 · motif
· motif · 73497054–73497063 · motif
· motif · 73497054–73497063 · motif
· motif · 73497139–73497155 · motif
· motif · 73498103–73498112 · motif
· motif · 73498357–73498368 · motif
· motif · 73498357–73498368 · motif
· motif · 73498430–73498439 · motif
· motif · 73498430–73498441 · motif
· motif · 73498430–73498441 · motif
· motif · 73498449–73498465 · motif
· motif · 73498459–73498472 · motif
· motif · 73498598–73498611 · motif
· motif · 73498760–73498776 · motif
· motif · 73499191–73499202 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：206 aa
BTF3 蛋白質長 206 個胺基酸，屬於 NAC-beta 家族。第 82 至 147 位胺基酸為 NAC-A/B 結構域；第 1 至 42 位及第 170 至 206 位則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
與 NACA 形成的異二聚體則定位於細胞質；此資料描述的是複合體定位，不能直接視為單獨 BTF3 在細胞內的分布。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- IFTAPQ86VG3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TXLNAP40222 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TXLNBQ8N3L3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ESR1P03372 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- NAA40Q86UY6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NMT2O60551 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NOTOA8MTQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMYD2Q9NRG4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
BTF3 與 NACA 透過 NAC-A/B 結構域組成新生多肽相關複合體（NAC）異二聚體。NAC 經由 BTF3/NACB 次單元與核糖體相連；BTF3 與 NACA 兩個次單元都能接觸新生多肽鏈。此處描述的是複合體組成及其與核糖體、新生多肽的關聯。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | BTF3 與 NACA 結合時，可避免非分泌性多肽被不適當地導向內質網。BTF3 在新生多肽鏈自核糖體伸出時與其結合，並阻斷其與通常會將新生分泌性多肽導向內質網的 signal recognition particle（SRP）互動。此外，BTF3 是一般轉錄因子，可與 RNA polymerase II 形成穩定複合體，且為轉錄起始所必需。 | 含實驗來源 | 證據與來源When associated with NACA, prevents inappropriate targeting of non-secretory polypeptides to the endoplasmic reticulum (ER). Binds to nascent polypeptide chains as they emerge from the ribosome and blocks their interaction with the signal recognition particle (SRP), which normally targets nascent secretory peptides to the ER. BTF3 is also a general transcription factor that can form a stable complex with RNA polymerase II. Required for the initiation of transcription PMID 10982809 ↗ |
| 交互作用 | BTF3 是新生多肽相關複合體（NAC）的一部分；NAC 由 NACA 與 BTF3 透過 NAC-A/B 結構域形成異二聚體。NAC 經由 BTF3/NACB 次單元與核糖體相連，而兩個次單元都能接觸新生多肽鏈。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the nascent polypeptide-associated complex (NAC), which is a heterodimer of NACA and BTF3 (via NAC-A/B domains). NAC associates with ribosomes through the BTF3/NACB subunit. Both subunits can contact nascent polypeptide chains PMID 21203952 ↗ |
| 細胞定位 | BTF3 位於細胞質與細胞核；BTF3 與 NACA 形成的異二聚體則位於細胞質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCTTTAGCTGCCATCTTGCGTCCCCGCGTGTGTGCGCCT40AATCTCAGGTGGTCCACCCGAGACCCCTTGAGCACCAACC80CTAGTCCCCCGCGCGGCCCCTTATTCGCTCCGACAAGGTA120CAAAAAGGCTCTGGACGGCGGCGTGGTAGGAGGACGGGAG160CGGGGGCGGGAAGTTCCCTGAAGGAGCGAGACAGGGAGGG200ACAGGGCAGAGGAGGAGAGGAAGGCGATGCGACGGACAGG240CGCACCCGCTCAGGCTGACTCTCGGGGGCGAGGTCGAGCC280AGGGGCGGCTGCCCTGGGGGCGAGGCGACGCTGTCTCAAC320CTCCACCTCGCGGCGGAACCCGAGGACAGGAGCCTCAGAT360GAAAGAAACAATCATGAACCAGGAAAAACTCGCCAAACTG400CAGGCACAAGTGCGCATTGGTGGGAAAGGAACTGCTCGCA440GAAAGAAGAAGGTGGTTCATAGAACAGCCACAGCAGATGA480CAAAAAACTTCAGTTCTCCTTAAAGAAGTTAGGGGTAAAC520AATATCTCTGGTATTGAAGAGGTGAATATGTTTACAAACC560AAGGAACAGTGATCCACTTTAACAACCCTAAAGTTCAGGC600ATCTCTGGCAGCGAACACTTTCACCATTACAGGCCATGCT640GAGACAAAGCAGCTGACAGAAATGCTACCCAGCATCTTAA680ACCAGCTTGGTGCGGATAGTCTGACTAGTTTAAGGAGACT720GGCCGAAGCTCTGCCCAAACAATCTGTGGATGGAAAAGCA760CCACTTGCTACTGGAGAGGATGATGATGATGAAGTTCCAG800ATCTTGTGGAGAATTTTGATGAGGCTTCCAAGAATGAGGC840AAACTGAATTGAGTCAACTTCTGAAGATAAAACCTGAAGA880AGTTACTGGGAGCTGCTATTTTATATTATGACTGCTTTTT920AAGAAATTTTTGTTTATGGATCTGATAAAATCTAGATCTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。