演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BTC

betacellulin

BTC 編碼 betacellulin,是可與 EGFR、ERBB4 等 EGF receptor family 成員結合的生長因子,並能促進特定細胞增殖。

Homo sapiens4q13.3UniProt P35070
OFFICIAL SYMBOL
BTC
CHROMOSOME
4
UNIPROT
P35070
PDB / ALPHAFOLD
1IOX
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BTC 是蛋白質編碼基因,產物 betacellulin 屬於生長因子,可與 EGFR、ERBB4 及其他 EGF receptor family 成員結合。其前驅形式 Probetacellulin 含有訊號序列、細胞外區段、跨膜區段及細胞質區段;細胞外區段中具有 EGF-like domain。這些特徵描述了它由膜相關前驅形式至分泌型 betacellulin 的基本性質。來源指出,成熟 betacellulin 位於細胞外空間,而 Probetacellulin 可見於細胞膜。

Official symbol
BTC
Gene name
betacellulin
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1121
UniProt
P35070
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q13.3
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25BTCpq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:74,744,759–74,794,717
Gene span
49,959 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000395743 ★74,744,759–74,794,5236
ENST0000090912174,744,759–74,794,7176
ENST0000090912274,744,759–74,794,7175
ENST0000095196674,744,759–74,794,7174
ENST0000114060974,744,759–74,794,7176
ENST0000095196574,744,762–74,794,7176
ENST0000051274374,746,379–74,770,1564

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

betacellulin 是生長因子,可結合 EGFR、ERBB4 與其他 EGF receptor family 成員。這項結合特性是來源所列的主要分子作用;目前資料未進一步說明受體活化的步驟、下游訊號路徑,或 betacellulin 對不同受體的作用差異,因此不宜延伸推定其具體訊號機制。

在細胞層次,betacellulin 對視網膜色素上皮細胞與血管平滑肌細胞具有強效促有絲分裂作用。也就是說,在來源所述的這兩類細胞中,它能促進與細胞分裂相關的增殖反應;資料並未提供其他細胞類型、作用條件或反應程度的比較。

結合受體與促進特定細胞增殖,是來源支持的兩項功能描述。現有資訊未交代這些受體結合是否直接造成上述細胞的增殖,也未說明兩者之間的因果關係或生理情境。因此,betacellulin 的功能可概括為具受體結合能力、並能促進視網膜色素上皮細胞及血管平滑肌細胞增殖的生長因子。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 74794523 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BTC ENST00000395743 GRCh38 chr4:74794423-74795523 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGGAGGCAATATATAACCACATAAGGTAAAATTGGATGCTGCTTGCTTTCTCTAAAAGCTGTGAGGATGT
CTTTCTGTTCCAGAAATTGCTTAATGCAAGTAAATGAAAATATACTGAATACATGAGTAAATTCATAAAC
AGAAATACAAATGAAATTTCTAAAGTAGGTCCTGGTGAGCCCCAATTTTATGAATTATTAGAAGACAATG
CACCCAGAAACTAAGACACTAGCTTGAAGACTTTTTTCATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG
TTGCTGATGTTGTTGTTGTTGTTGTCGTTGTTTTGAAACAGTGTCTCACTCTTGCGCCTTGGCTGGAGTG
AAGTGGCTCGATCTAGGCTCATTGAAGGCTCCATCTCCCAAGCTTAAGCGATCCTCCCCACCTCAGCCTC
AGGGAATGGATGGGACTGCAGGTGCACACCACCATACCCGGCTATTAATTTACTTTTGTATTTTTTGTAG
AGACGAGGTTTCGCTATGGCTTCAAGACTTTAAAAGGCAACAATGACTCTTTTGAAATTGCCTGCATTAT
CAAATGCCTGAAGTCAACCACAATGAATGGTGAGTCTGGTTTCTCCATGACACTAGCAATCCTCTGAAAT
AAAGGAAGTTAGAATTCCAGAACACGTTTGGGTCTCTGACTCTTCCTCGGTGGCTTCCAGGAGTTTAGGT
CAGCCTGCAGGCCCGACCGGAACCCCCGACACCCCTCCACGCGGATTCTTTACATCTCCCTCCCTACCTT
GTTTACGCCCTAGGGGGTAGGGAAATGAACAGTCAGTCAGGTGAGACCCAGCAGGGGGAGTGGTGAGCTG
GTCCGAGGGCAGCCCGAATATGTCCCTGGGTGTGGGTATGGGTGTGGGGCAATTTGGGTGGGAGCAGCGT
GGAGGCTCCCAGGACCAAGTCCTGCGCCTCTTTGGCGGGGTGTGTGCAGGAGGAGGGGGGATAAATAGGA
GGCTCCCTCCTCCCGGCGACATTCACGGAGCCGGCCGGCCTCCCGCCCTGGGTGTTTCCCTGCCTTGTAG
CCAGGGTGCCAGCCTGGGAAGTAGTTTCGTTTCCTTCTGCCTCCGGGATTA
BTC 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_BJSQW · enhancer · 74793556–74794512 · regulatory

ENSR4_934NK2 · promoter · 74794513–74795013 · regulatory

· motif · 74792384–74792397 · motif

· motif · 74793840–74793849 · motif

· motif · 74793840–74793849 · motif

· motif · 74794184–74794197 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:178 aa

1 aa178 aa結構域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 P35070 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

betacellulin 長 178 個胺基酸。其 N 端第 1–31 位為訊號序列,第 32–118 位為細胞外區段;其中第 65–105 位標註為 EGF-like domain。第 119–139 位為螺旋型跨膜區段,第 140–178 位位於細胞質側。

訊號胜肽1–31 aa
拓樸區域Extracellular32–118 aa
跨膜區Helical119–139 aa
拓樸區域Cytoplasmic140–178 aa
結構域EGF-like65–105 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1IOX…

PDB · 1IOX

NMR · - · A=62-111

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space;Cell membrane

betacellulin 的分泌型形式位於細胞外空間;Probetacellulin 則標註為細胞膜上的單次跨膜第一型膜蛋白。 資料呈現兩種形式的定位差異,但未提供定位轉換的條件或動態細節。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 7 個夥伴 · 最多顯示 50 個
BTCBTCGMPPAKPRPKRT31KRTAP1-3S100A4SGTASGTB
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

betacellulin 以單體形式存在,並與 EGFR 及 ERBB4 交互作用。這裡記載的是與兩種受體的交互作用,未指出 betacellulin 與它們組成何種複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能betacellulin 是可與 EGFR、ERBB4 及其他 EGF receptor family 成員結合的生長因子;它對視網膜色素上皮細胞與血管平滑肌細胞具有強效促有絲分裂作用。含實驗來源
證據與來源

Growth factor that binds to EGFR, ERBB4 and other EGF receptor family members. Potent mitogen for retinal pigment epithelial cells and vascular smooth muscle cells

PMID 8570211 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用betacellulin 以單體形式存在,並與 EGFR 和 ERBB4 交互作用。含實驗來源
證據與來源

Monomer. Interacts with EGFR and ERBB4

PMID 10867024 ↗ · PMID 8570211 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位betacellulin 的定位為分泌至細胞外空間。資料庫紀錄
證據與來源

Betacellulin; Secreted, extracellular space

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Probetacellulin 位於細胞膜,為單次跨膜第一型膜蛋白。資料庫紀錄
證據與來源

Probetacellulin; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000395743 · 2,653 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTCACGGAGCCGGCCGGCCTCCCGCCCTGGGTGTTTCCC40
41TGCCTTGTAGCCAGGGTGCCAGCCTGGGAAGTAGTTTCGT80
81TTCCTTCTGCCTCCGGGATTAGTTTCCAGGCACCCTCTCA120
121GGCGCCCGAGGCCCGGGAAGGGGGCGAAGAAGGAGGGAGA160
161CTTGTCTAGGGGCTGCCCGGCCCGGCAGAGCGGGGTTGAT200
201GGACCGGGCCGCCCGGTGCAGCGGCGCCAGCTCCCTGCCA240
241CTGCTCCTGGCCCTTGCCCTGGGTCTAGTGATCCTTCACT280
281GTGTGGTGGCAGATGGGAATTCCACCAGAAGTCCTGAAAC320
321TAATGGCCTCCTCTGTGGAGACCCTGAGGAAAACTGTGCA360
361GCTACCACCACACAATCAAAGCGGAAAGGCCACTTCTCTA400
401GGTGCCCCAAGCAATACAAGCATTACTGCATCAAAGGGAG440
441ATGCCGCTTCGTGGTGGCCGAGCAGACGCCCTCCTGTGTC480
481TGTGATGAAGGCTACATTGGAGCAAGGTGTGAGAGAGTTG520
521ACTTGTTTTACCTAAGAGGAGACAGAGGACAGATTCTGGT560
561GATTTGTTTGATAGCAGTTATGGTAGTTTTTATTATTTTG600
601GTCATCGGTGTCTGCACATGCTGTCACCCTCTTCGGAAAC640
641GTCGTAAAAGAAAGAAGAAAGAAGAAGAAATGGAAACTCT680
681GGGTAAAGATATAACTCCTATCAATGAAGATATTGAAGAG720
721ACAAATATTGCTTAAAAGGCTATGAAGTTACCTCCAGGTT760
761GGTGGCAAGCTGCAAAGTGCCTTGCTCATTTGAAAATGGA800
801CAGAATGTGTCTCAGGAAAACAGCTAGTAGACATGAATTT840
841TAAATAATGTATTTACTTTTTATTTGCAACTTTAGTTTGT880
881GTTATTATTTTTTAATAAGAACATTAATTATATGTATATT920
921GTCTAGTAATTGGGAAAAAAGCAACTGGTTAGGTAGCAAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。