演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

BRWD1FLJ11315

bromodomain and WD repeat domain containing 1

BRWD1(bromodomain and WD repeat domain containing 1)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控與染色質重塑,並與細胞形態及細胞骨架組織的調節有關。

Homo sapiens21q22.2UniProt Q9NSI6
OFFICIAL SYMBOL
BRWD1
CHROMOSOME
21
UNIPROT
Q9NSI6
PDB / ALPHAFOLD
3Q2E
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

BRWD1 是蛋白質編碼基因,產物為 Bromodomain and WD repeat-containing protein 1。其蛋白質具有 WD 重複序列與 bromodomain,屬於同時含有這兩類結構特徵的蛋白質。來源資料指出,BRWD1 可能具有轉錄活化作用,並與細胞形態及細胞骨架組織的調節有關;染色質重塑則是依相似性推定的可能功能。

Official symbol
BRWD1
Gene name
bromodomain and WD repeat domain containing 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12760
UniProt
Q9NSI6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
FLJ11315N143DCAF19C21orf107WDR9

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.2
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegBRWD1pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:39,184,176–39,321,559
Gene span
137,384 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000342449 ★39,185,482–39,313,63241
ENST0000033322939,184,176–39,313,81942
ENST0000113188839,185,482–39,313,81941
ENST0000038080039,193,817–39,313,81942
ENST0000093870439,195,573–39,313,81938
ENST0000093870339,195,580–39,313,81939
ENST0000042444139,202,366–39,229,39212
ENST0000111134539,231,286–39,313,81925
ENST0000111134839,236,624–39,313,81923
ENST0000111134739,236,630–39,313,81922
ENST0000045586739,236,719–39,280,21314
ENST0000111644139,254,545–39,313,81919

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

BRWD1 可能具有轉錄活化作用,但來源未進一步說明其調控的特定基因或轉錄步驟,因此此功能仍應視為可能角色,而非已界定的完整機制。資料也指出,BRWD1 可能參與染色質重塑;這項說法標示為依相似性推定,反映其證據屬推論性質,不能據此視為已直接證實的作用。

另有研究指出,BRWD1 是調節細胞形態與細胞骨架組織所必需的因子。這表示 BRWD1 與細胞形態維持及細胞骨架安排相關的生物學過程有關;然而,現有資料沒有提供具體的分子步驟、作用對象或調控方向,也未說明該作用如何連結至其可能的轉錄活化或染色質重塑功能。因此,這些功能主張應分別理解,不宜把尚未說明的機制串接成確定的因果路徑。

整體而言,來源支持 BRWD1 可能涉及轉錄調控與染色質重塑,並在細胞形態及細胞骨架組織調節中具有必要性;前兩項帶有可能性或相似性推定的限制,後一項則有研究證據支持。現有資訊不足以進一步界定各作用之間的關係或其細胞情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 39313632 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>BRWD1 ENST00000342449 GRCh38 chr21:39313532-39314632 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGGCTGGATGCGCGGAGGAAACTCATAGTTAGGTCAGAAGCCTGGCAAGACAAGGGAATTTTCTGGTCG
TCGTCCACCTCTCCAACCTCACATCCTACTAGTCTTCCAAGAGGATTCTAACTGCACATGACTCCCTAGT
TTCCGGCTTCTCTTCCTAAGGAGGGTCTGCGGCCCGTCTGCACCACCCTCTCCCCACAGTCCCGTTTTCC
TGTCCATGCTTGGATGGATCCAGCCGAGCCGTCAGCCGCAGCTGCGCGCTGCTCCCCCGACTCGCACCCC
CTCGGCGAAGCGCTGCATTTTATGTAATTTTCTGCCGGGCTGCTGGCTTGTGGGGGATGTGGCTGGGTCT
CGGCAGCCTTCAGCGCCGCAGACGCTCCGGCAACGCCAGCATACGAGGCCCCCGCCCCAGGAGCGCGGGT
CCGGGCGGCGTTCCCCTCTGCGGGAGGCGCGGCGAGCCAATCCTCACTTTAAAAGCTTTCCTGTCCTCGA
AGCGAGGGGTCTTCCGTGCGGGGCAAGACGCACTGGCCCCAGACGACCGGTCCGTGAAATGACCCTTCCG
AGCGACCCGGAGCGGGCGACCTTGCCCAACCCGCGACTCGGGGCCCCTGCGGTCCCGCGTAGAGGACCCA
GGTCCCACGGGGGGCGGCGGTGAATCGCCCCCTCTTGTGGCCGCGCTTCCGCCCCCGGCACCCGCCCGCT
GCTGGGCCACCCGGCGTCGCGCTGCCGCCTCACAAAGCCCGGGCAGCCGCCTCATTGCGCGCAGGGATTC
GGACCACGCGCCCTCCCCTCCCCCACTCGCTGCTGCGGCGCCCAGGTCTTTGCCTCCGCGTCACTTTCTC
CTCATCGAGTCCCCGGAGGCAGAGAGCTGAGCGAGGTTCGCCTCCCCGGGCGGGACACGAGCTCCGGTCC
TCTCTTGGCGCAAACCCCCGCCCCCCGCGGAGGGACTACTTTTCGTCTCCCGCGGAGGAACTACTTCCTC
CCCCGCGGAGGCGTCGGTCCAGGCGGCGCGCACGGTATGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGCGCGCCT
GAGAAGAGGGGACGCCAGCCCGGTCAGGCCTCGGCGCGGCCTACACGCTCC
BRWD1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
BRWD1_1 ↗21:39,313,632負股39,313,622–39,313,681

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_5C8MXG · CTCF_binding_site · 39313173–39313194 · regulatory

ENSR21_9KLBH · promoter · 39313580–39313935 · regulatory

ENSR21_C5WBX · enhancer · 39313936–39315058 · regulatory

ENSR21_5C8N45 · CTCF_binding_site · 39313961–39313982 · regulatory

ENSR21_74BFC7 · promoter · 39315578–39315678 · regulatory

ENSR21_B9RN4 · enhancer · 39315679–39316496 · regulatory

ENSR21_B9RN9 · enhancer · 39317088–39317891 · regulatory

· motif · 39312546–39312556 · motif

· motif · 39312548–39312561 · motif

· motif · 39312578–39312588 · motif

· motif · 39312629–39312639 · motif

· motif · 39313175–39313191 · motif

· motif · 39313283–39313294 · motif

· motif · 39313412–39313425 · motif

· motif · 39313483–39313493 · motif

· motif · 39313603–39313616 · motif

· motif · 39313638–39313651 · motif

· motif · 39313644–39313657 · motif

· motif · 39313666–39313677 · motif

· motif · 39313942–39313955 · motif

· motif · 39313963–39313979 · motif

· motif · 39313966–39313979 · motif

· motif · 39314018–39314035 · motif

· motif · 39314178–39314195 · motif

· motif · 39314288–39314305 · motif

· motif · 39314405–39314421 · motif

· motif · 39317567–39317582 · motif

· motif · 39317567–39317582 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:2320 aa

1 aa2320 aa結構域功能區域重複區
依 Q9NSI6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

BRWD1 蛋白質長 2,320 個胺基酸。其序列含有八個 WD 重複區,分布於胺基酸 184–553;另有兩個 bromodomain,分別位於 1,157–1,264 與 1,313–1,418。資料亦預測多段無序區域,分布於蛋白質不同位置。

重複區WD 1184–223 aa
重複區WD 2226–265 aa
重複區WD 3268–311 aa
重複區WD 4322–365 aa
重複區WD 5366–405 aa
重複區WD 6424–463 aa
重複區WD 7466–506 aa
重複區WD 8514–553 aa
結構域Bromo 11157–1264 aa
結構域Bromo 21313–1418 aa
功能區域Disordered668–691 aa
功能區域Disordered809–867 aa
功能區域Disordered895–925 aa
功能區域Disordered1271–1304 aa
功能區域Disordered1434–1593 aa
功能區域Disordered1670–1805 aa
功能區域Disordered1817–1839 aa
功能區域Disordered1862–1899 aa
功能區域Disordered2014–2077 aa
功能區域Disordered2112–2184 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3Q2E…

PDB · 3Q2E

X-ray · 1.74 A · A=1310-1430

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus;Cell projection, cilium membrane;Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

BRWD1 的定位資料涵蓋細胞質與細胞核,也列於纖毛膜及細胞質中的鞭毛軸絲。 這些紀錄顯示其定位涉及不同細胞區域,但來源未說明各位置出現的條件、時間變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Cell projection, cilium membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 25 個夥伴 · 最多顯示 50 個
FLJ11315BRWD1ADRB2CASP6CCKCHATCHRNA7CYCSFGFR3FNDC3BGRIN2CHDAC7HIP1HMOX2HSPB1KIF1BLAMP2NRF1NUTF2OPTNRANRNF11SMARCD1TOR1AIP1UBQLN1WFS1Q9Y649
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 25 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

BRWD1 被記載為與 SMARCA4 有交互作用;此關係標示為依相似性推定。資料未進一步說明兩者是否形成特定複合體,或此交互作用對 BRWD1 功能的影響。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

BRWD1 相關變異可能導致原發性纖毛運動障礙 51(CILD51),但來源表述為可能致病,並非確立的因果結論。CILD51 為常染色體隱性疾病,與運動纖毛異常相關;患者可有反覆上、下呼吸道感染,部分病例伴隨右位心或內臟反位。男性不孕也可見於此病,與精子鞭毛多種形態異常及前進運動能力嚴重降低有關。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能BRWD1 可能具有轉錄活化作用,也可能參與染色質重塑;染色質重塑的說法是依相似性推定。另有研究指出,BRWD1 對細胞形態與細胞骨架組織的調節是必需的。含實驗來源
證據與來源

May be a transcriptional activator. May be involved in chromatin remodeling (By similarity). Required for regulation of cell morphology and cytoskeletal organization

PMID 21834987 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用BRWD1 與 SMARCA4 有交互作用,但此關係是依相似性推定;來源未提供進一步的作用情境或功能結果。推論支持
證據與來源

Interacts with SMARCA4 (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位BRWD1 的定位資料包括細胞質、細胞核、纖毛膜,以及細胞質中的鞭毛軸絲;來源未說明不同位置的條件或動態差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Cell projection, cilium membrane; Cytoplasm, cytoskeleton, flagellum axoneme

PMID 25593309 ↗ · PMID 33389130 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯BRWD1 相關變異可能造成原發性纖毛運動障礙 51(CILD51),但這是可能的疾病關聯。此常染色體隱性疾病涉及運動纖毛異常,可出現反覆呼吸道感染、慢性發炎與支氣管擴張;男性不孕則與精子鞭毛多種形態異常及前進運動能力嚴重降低有關。部分患者有右位心或內臟反位。含實驗來源
證據與來源

Ciliary dyskinesia, primary, 51 CILD51 A form of primary ciliary dyskinesia, a disorder characterized by abnormalities of motile cilia. Respiratory infections leading to chronic inflammation and bronchiectasis are recurrent, due to defects in the respiratory cilia. CILD51 is an autosomal recessive form characterized by male infertility due to multiple morphologic abnormalities of the sperm flagella, resulting in severely reduced progressive motility. Affected individuals have recurrent upper and lower respiratory infections, and some exhibit dextrocardia and/or situs inversus. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620438

PMID 33389130 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000342449 · 17,728 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGGCGGCGCGCACGGTATGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCG40
41GCGCGCGCCTGAGAAGAGGGGACGCCAGCCCGGTCAGGCC80
81TCGGCGCGGCCTACACGCTCCGCTCGCTCGCTCGCTCCCG120
121CCTCCCGCCCCGCGCCCGGCCATGGCGGAGCCGTCGTCCG160
161CCCGACGCCCGGTGCCTCTCATCGAGTCGGAGCTGTACTT200
201CCTTATCGCCCGGTACCTATCGGCGGGCCCGTGTCGGAGA240
241GCGGCCCAGGTGCTGGTGCAGGAGCTGGAGCAGTACCAGT280
281TGTTGCCGAAGAGATTGGACTGGGAGGGCAACGAGCACAA320
321CAGGAGCTACGAGGAGTTGGTCTTGTCCAATAAGCATGTG360
361GCTCCTGATCATCTTTTGCAAATCTGCCAGCGCATCGGTC400
401CTATGTTGGATAAAGAAATTCCACCCAGTATTTCAAGAGT440
441CACTTCTTTACTTGGTGCAGGAAGGCAGTCTTTGCTACGT480
481ACAGCAAAAGACTGCAGGCACACAGTTTGGAAGGGCTCTG520
521CCTTTGCTGCTCTTCATAGAGGAAGACCTCCTGAAATGCC560
561AGTGAATTATGGTTCCCCACCAAATCTTGTGGAGATACAT600
601CGAGGAAAACAACTCACAGGGTGTTCCACTTTTAGTACAG640
641CATTTCCAGGAACTATGTATCAGCATATAAAAATGCACAG680
681AAGGATTCTCGGACATCTATCTGCTGTTTACTGTGTAGCA720
721TTTGATAGGACAGGACATAGAATCTTTACAGGTTCAGATG760
761ACTGTTTGGTAAAGATTTGGTCAACACATAATGGCCGCTT800
801GTTATCTACATTAAGAGGTCATTCTGCAGAAATTTCAGAT840
841ATGGCAGTAAACTATGAGAATACAATGATTGCTGCGGGGA880
881GCTGTGATAAAATTATTAGAGTGTGGTGCTTGAGAACTTG920
921TGCCCCAGTTGCTGTGCTCCAAGGACACACAGGATCAATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。