基因總覽
BRS3 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因,產物名稱為 bombesin receptor subtype 3。此蛋白質歸屬於 G protein-coupled receptor 1 family,是一種多次穿越細胞膜的受體。其序列長 399 個胺基酸,包含七段跨膜螺旋,並由胞外與胞質區段交錯連接;這些結構特色構成其膜受體的基本架構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370648 ★ | 136,487,947–136,493,780 | 3 |
| ENST00001134388 | 136,487,947–136,493,784 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
bombesin receptor subtype 3 的功能與精子細胞的分裂、成熟或功能有關。來源將這些生物學面向列為其相關角色,但沒有進一步說明受體在各過程中的具體作用,也未指出影響方向或作用階段,因此不宜將其解讀為已確立的單一機制。
此受體透過與 G proteins 結合來傳遞作用。G proteins 進而啟動 phosphatidylinositol-calcium 第二信使系統,將受體所介導的訊息連結到細胞內的訊號傳遞。來源支持這項受體與 G proteins 的功能性關聯及其下游訊息系統,但未提供更細節的分子步驟或特定細胞反應。
因此,現有資料呈現兩個層面的功能資訊:一是與精子細胞分裂、成熟或功能相關,二是透過 G proteins 啟動 phosphatidylinositol-calcium 第二信使系統。來源未說明這條訊號途徑如何分別參與上述精子細胞過程,也未提供其他生理功能或實驗條件;這些關聯應依來源範圍理解。
Promoter 與基因調控
>BRS3 ENST00000370648 GRCh38 chrX:136486947-136488047 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCCCTTTAACCATTTCTAGAGAGAAAAATCCTAAACAGCCCCTTAAAAGAAAACATGGCATTAAAACAGA CAGTCAAACAGTAAAAAGTGGTTTTATTAGGACATTTAGAGACAAAGCAACTGGTGCTGTGCCTGGATTT TTCATCTCTTAAAAGGTTGTTTTGGCTGGGTGTGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGC TGAGGCAGGCGGATTGCCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTCT ACTAAAAATACAAAAATTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGACTGAGG CAGGAGAATTGCTTGAACCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCGAGCCACTGCACTCCAGCCT GGGTGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAAAGGTTGTTTTGATAGTGTACAGC ACAGCCTGGATAACTGCAAAGTTGGGGTTTACCACGTGACAGAGCTAGGTATTAAGCCCAAGTGACCTGA ATGATCACTCCTTGGAGGTGACATAAACCCTGTCGAAGTGTAAATGATCTGTTGCTTCACCATCTCTCTG ATATTAAATTTTGAGGAGTGGGTTCAAGGTTGTGCTTCAGGGGACACCTACACTTATTTATCATGTAAAA CAAAATGCACTAGACTACCATGTGATTGCAGGGGGATAAATGGTTTTTTTCTTAAAAAAAATTGACAAAA CCTATATAGACCATCCTGGGTAGATATGAAAACAGGGTGATTCTAATAATAAATAAGACGATTTAATAGG GTCTAGTTGGTCCCAAGATTCCCCAACAGGGAAGAATAAGCAACTGCAGAGCATTTCCCCAGCCCCCTCC CTCTCCTTATGACAGGACACGCCAATAAAACTCCACCTCCTACTCTTCAGTGCCAGATGGGTAAGCATTT AGCCAAGCATGCTGGGAGACACACAGAACTGAAGCAAAGGAGTATCTGGATGTCTTGGATTTTCTTCCCA TTCTGTTCTGTTCTGTTCTCCTAATACCATCTCGTTACTAGACGTAGGCAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| BRS3_1 ↗ | X:136,487,947 | 正股 | 136,487,898–136,487,957 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_5374RG3 · CTCF_binding_site · 136488889–136488910 · regulatory
ENSRX_5374RZH · CTCF_binding_site · 136492011–136492032 · regulatory
· motif · 136488891–136488907 · motif
· motif · 136492013–136492029 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:399 aa
bombesin receptor subtype 3 長 399 個胺基酸,具有七段跨膜螺旋。序列拓樸由胞外區、跨膜區與胞質區交替構成,C 端為胞質區段。這些區域與跨膜架構的註解描述其蛋白質結構;它並屬於 G protein-coupled receptor 1 family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
bombesin receptor subtype 3 定位於細胞膜,並註記為多次穿膜蛋白。 來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
來源指出 BRS3 與 C6orf89 互相作用。此資訊支持兩者存在互作關係,但未說明互作是否代表直接實體結合、是否形成特定複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 此受體與精子細胞的分裂、成熟或功能有關。它透過與 G proteins 結合介導作用,並由 G proteins 啟動 phosphatidylinositol-calcium 第二信使系統;來源未進一步界定各項精子細胞過程中的具體作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Role in sperm cell division, maturation, or function. This receptor mediates its action by association with G proteins that activate a phosphatidylinositol-calcium second messenger system |
| 交互作用 | BRS3 與 C6orf89 有互作關係;來源沒有說明這是否為直接結合、是否形成複合體,或互作所造成的功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | BRS3 是位於細胞膜的多次穿膜蛋白;此項資訊未描述定位改變的條件或其他動態。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACACAGAACTGAAGCAAAGGAGTATCTGGATGTCTTGGAT40TTTCTTCCCATTCTGTTCTGTTCTGTTCTCCTAATACCAT80CTCGTTACTAGACGTAGGCATTGGACGTGACAATCAACTG120CATTTGAACTGAGAAGAAGAAATATTAAAGACACAGTCTT160CAGAAGAAATGGCTCAAAGGCAGCCTCACTCACCTAATCA200GACTTTAATTTCAATCACAAATGACACAGAATCATCAAGC240TCTGTGGTTTCTAACGATAACACAAATAAAGGATGGAGCG280GGGACAACTCTCCAGGAATAGAAGCATTGTGTGCCATCTA320TATTACTTATGCTGTGATCATTTCAGTGGGCATCCTTGGA360AATGCTATTCTCATCAAAGTCTTTTTCAAGACCAAATCCA400TGCAAACAGTTCCAAATATTTTCATCACCAGCCTGGCTTT440TGGAGATCTTTTACTTCTGCTAACTTGTGTGCCAGTGGAT480GCAACTCACTACCTTGCAGAAGGATGGCTGTTCGGAAGAA520TTGGTTGTAAGGTGCTCTCTTTCATCCGGCTCACTTCTGT560TGGTGTGTCAGTGTTCACATTAACAATTCTCAGCGCTGAC600AGATACAAGGCAGTTGTGAAGCCACTTGAGCGACAGCCCT640CCAATGCCATCCTGAAGACTTGTGTAAAAGCTGGCTGCGT680CTGGATCGTGTCTATGATATTTGCTCTACCTGAGGCTATA720TTTTCAAATGTATACACTTTTCGAGATCCCAATAAAAATA760TGACATTTGAATCATGTACCTCTTATCCTGTCTCTAAGAA800GCTCTTGCAAGAAATACATTCTCTGCTGTGCTTCTTAGTG840TTCTACATTATTCCACTCTCTATTATCTCTGTCTACTATT880CCTTGATTGCTAGGACCCTTTACAAAAGCACCCTGAACAT920ACCTACTGAGGAACAAAGCCATGCCCGTAAGCAGATTGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。